MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic plasmid pRPR

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012732	T	6	6	516	521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012732	T	6	6	581	586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012732	A	6	6	925	930	100 %	0 %	0 %	0 %	238651160
4	NC_012732	T	6	6	1325	1330	0 %	100 %	0 %	0 %	238651160
5	NC_012732	A	6	6	1343	1348	100 %	0 %	0 %	0 %	238651161
6	NC_012732	A	6	6	1368	1373	100 %	0 %	0 %	0 %	238651161
7	NC_012732	T	7	7	1732	1738	0 %	100 %	0 %	0 %	238651162
8	NC_012732	T	8	8	1765	1772	0 %	100 %	0 %	0 %	238651162
9	NC_012732	A	6	6	2012	2017	100 %	0 %	0 %	0 %	238651162
10	NC_012732	A	6	6	2046	2051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012732	A	6	6	2165	2170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012732	T	7	7	2433	2439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012732	A	6	6	2691	2696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012732	A	6	6	3155	3160	100 %	0 %	0 %	0 %	238651163
15	NC_012732	A	6	6	3802	3807	100 %	0 %	0 %	0 %	238651163
16	NC_012732	A	6	6	3824	3829	100 %	0 %	0 %	0 %	238651163
17	NC_012732	A	6	6	4006	4011	100 %	0 %	0 %	0 %	238651163
18	NC_012732	A	6	6	5117	5122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012732	A	7	7	5135	5141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012732	A	6	6	5252	5257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012732	A	8	8	5388	5395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012732	A	6	6	5566	5571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012732	A	6	6	5804	5809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012732	T	6	6	6072	6077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012732	A	6	6	6288	6293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012732	A	6	6	6555	6560	100 %	0 %	0 %	0 %	238651164
27	NC_012732	A	6	6	8564	8569	100 %	0 %	0 %	0 %	238651166
28	NC_012732	T	6	6	11020	11025	0 %	100 %	0 %	0 %	238651168
29	NC_012732	A	7	7	11527	11533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012732	T	9	9	11534	11542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012732	T	6	6	11593	11598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012732	A	6	6	11626	11631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012732	T	8	8	12995	13002	0 %	100 %	0 %	0 %	238651170
34	NC_012732	A	6	6	13464	13469	100 %	0 %	0 %	0 %	238651170
35	NC_012732	A	6	6	13526	13531	100 %	0 %	0 %	0 %	238651170
36	NC_012732	A	6	6	13612	13617	100 %	0 %	0 %	0 %	238651170
37	NC_012732	T	6	6	15223	15228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012732	T	6	6	15264	15269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012732	T	6	6	15538	15543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012732	A	7	7	15897	15903	100 %	0 %	0 %	0 %	238651171
41	NC_012732	A	6	6	16197	16202	100 %	0 %	0 %	0 %	238651171
42	NC_012732	A	6	6	16262	16267	100 %	0 %	0 %	0 %	238651171
43	NC_012732	T	6	6	16364	16369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012732	A	6	6	16689	16694	100 %	0 %	0 %	0 %	238651172
45	NC_012732	A	6	6	16845	16850	100 %	0 %	0 %	0 %	238651172
46	NC_012732	A	7	7	16866	16872	100 %	0 %	0 %	0 %	238651172
47	NC_012732	A	7	7	17253	17259	100 %	0 %	0 %	0 %	238651173
48	NC_012732	A	6	6	17369	17374	100 %	0 %	0 %	0 %	238651173
49	NC_012732	T	7	7	17743	17749	0 %	100 %	0 %	0 %	238651173
50	NC_012732	A	6	6	18010	18015	100 %	0 %	0 %	0 %	238651173
51	NC_012732	T	6	6	19234	19239	0 %	100 %	0 %	0 %	238651174
52	NC_012732	A	6	6	19330	19335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012732	A	6	6	19554	19559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012732	T	6	6	20216	20221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012732	T	7	7	20366	20372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012732	T	6	6	20561	20566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012732	T	6	6	21206	21211	0 %	100 %	0 %	0 %	238651175
58	NC_012732	T	6	6	21626	21631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012732	T	6	6	21668	21673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012732	A	6	6	21767	21772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012732	T	6	6	21986	21991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012732	T	6	6	25097	25102	0 %	100 %	0 %	0 %	238651179
63	NC_012732	T	6	6	26184	26189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.