MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia peacockii str. Rustic

Total Repeats: 32761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012730	TGC	2	6	18765	18770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650226
502	NC_012730	TTA	2	6	18810	18815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012730	TTG	2	6	18855	18860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012730	CAA	2	6	18932	18937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_012730	T	6	6	18979	18984	0 %	100 %	0 %	0 %	238650227
506	NC_012730	TCA	2	6	18989	18994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650227
507	NC_012730	CAA	2	6	19011	19016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650227
508	NC_012730	ACT	2	6	19040	19045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650227
509	NC_012730	ACCT	2	8	19141	19148	25 %	25 %	0 %	50 %	238650227
510	NC_012730	CGT	2	6	19187	19192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650227
511	NC_012730	TCT	2	6	19193	19198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650227
512	NC_012730	TACG	2	8	19302	19309	25 %	25 %	25 %	25 %	238650227
513	NC_012730	GTA	2	6	19319	19324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650227
514	NC_012730	CCA	2	6	19337	19342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238650227
515	NC_012730	TGC	2	6	19432	19437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650227
516	NC_012730	CT	3	6	19476	19481	0 %	50 %	0 %	50 %	238650227
517	NC_012730	CTT	2	6	19551	19556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650227
518	NC_012730	GCA	2	6	19649	19654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650227
519	NC_012730	CTT	2	6	19665	19670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650227
520	NC_012730	CCG	2	6	19673	19678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238650227
521	NC_012730	AAT	2	6	19696	19701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650227
522	NC_012730	CAT	2	6	19719	19724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650227
523	NC_012730	TAA	2	6	19732	19737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650227
524	NC_012730	ATT	2	6	19846	19851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650227
525	NC_012730	CTT	2	6	19854	19859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650227
526	NC_012730	TTA	2	6	19877	19882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650227
527	NC_012730	ACA	2	6	19901	19906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238650227
528	NC_012730	GT	3	6	19971	19976	0 %	50 %	50 %	0 %	238650227
529	NC_012730	TTATT	2	10	20033	20042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012730	CGA	2	6	20098	20103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_012730	GCT	2	6	20146	20151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_012730	GAC	2	6	20158	20163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_012730	CT	3	6	20186	20191	0 %	50 %	0 %	50 %	238650228
534	NC_012730	TGC	2	6	20206	20211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238650228
535	NC_012730	CTA	2	6	20238	20243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650228
536	NC_012730	TTG	2	6	20277	20282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650228
537	NC_012730	TGG	2	6	20353	20358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238650228
538	NC_012730	TTC	2	6	20431	20436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650228
539	NC_012730	TAT	2	6	20448	20453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650228
540	NC_012730	CTTT	2	8	20460	20467	0 %	75 %	0 %	25 %	238650228
541	NC_012730	TTTCA	2	10	20476	20485	20 %	60 %	0 %	20 %	238650228
542	NC_012730	T	7	7	20504	20510	0 %	100 %	0 %	0 %	238650228
543	NC_012730	CGCTAC	2	12	20554	20565	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238650228
544	NC_012730	ATT	2	6	20578	20583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650228
545	NC_012730	TCT	2	6	20600	20605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650228
546	NC_012730	CTT	2	6	20631	20636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650228
547	NC_012730	ATA	2	6	20660	20665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650228
548	NC_012730	TTG	2	6	20685	20690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650228
549	NC_012730	TTA	2	6	20711	20716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650228
550	NC_012730	TCT	2	6	20720	20725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650228
551	NC_012730	ACATT	2	10	20747	20756	40 %	40 %	0 %	20 %	238650228
552	NC_012730	ATAA	2	8	20763	20770	75 %	25 %	0 %	0 %	238650228
553	NC_012730	TGTT	2	8	20782	20789	0 %	75 %	25 %	0 %	238650228
554	NC_012730	ATT	3	9	20827	20835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650228
555	NC_012730	TTC	2	6	20851	20856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650228
556	NC_012730	TAT	2	6	20877	20882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650228
557	NC_012730	CAT	2	6	21021	21026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650228
558	NC_012730	TTC	2	6	21046	21051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650228
559	NC_012730	CGGTGA	2	12	21100	21111	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238650228
560	NC_012730	TAT	2	6	21117	21122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650228
561	NC_012730	T	6	6	21122	21127	0 %	100 %	0 %	0 %	238650228
562	NC_012730	T	6	6	21150	21155	0 %	100 %	0 %	0 %	238650228
563	NC_012730	CTT	2	6	21324	21329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650228
564	NC_012730	T	7	7	21328	21334	0 %	100 %	0 %	0 %	238650228
565	NC_012730	ACC	2	6	21336	21341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238650228
566	NC_012730	TTCC	2	8	21351	21358	0 %	50 %	0 %	50 %	238650228
567	NC_012730	TTG	2	6	21427	21432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012730	TTA	2	6	21433	21438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012730	GAG	2	6	21450	21455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012730	CT	3	6	21513	21518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_012730	ATC	2	6	21582	21587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650229
572	NC_012730	GACC	2	8	21667	21674	25 %	0 %	25 %	50 %	238650229
573	NC_012730	GAA	2	6	21682	21687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238650229
574	NC_012730	TC	3	6	21688	21693	0 %	50 %	0 %	50 %	238650229
575	NC_012730	ATTTC	2	10	21799	21808	20 %	60 %	0 %	20 %	238650229
576	NC_012730	GAT	2	6	21818	21823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238650229
577	NC_012730	T	6	6	21823	21828	0 %	100 %	0 %	0 %	238650229
578	NC_012730	T	6	6	21830	21835	0 %	100 %	0 %	0 %	238650229
579	NC_012730	T	6	6	21854	21859	0 %	100 %	0 %	0 %	238650229
580	NC_012730	ACAG	2	8	21896	21903	50 %	0 %	25 %	25 %	238650229
581	NC_012730	ACG	2	6	21981	21986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238650229
582	NC_012730	CTA	2	6	22009	22014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238650229
583	NC_012730	ATT	2	6	22058	22063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012730	TAT	2	6	22085	22090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012730	TAAA	2	8	22096	22103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012730	TA	3	6	22104	22109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012730	TTATT	2	10	22121	22130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012730	TAAA	2	8	22143	22150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012730	TTTA	2	8	22167	22174	25 %	75 %	0 %	0 %	238650230
590	NC_012730	A	8	8	22184	22191	100 %	0 %	0 %	0 %	238650230
591	NC_012730	TAA	2	6	22220	22225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238650230
592	NC_012730	T	6	6	22269	22274	0 %	100 %	0 %	0 %	238650230
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595	NC_012730	T	6	6	22397	22402	0 %	100 %	0 %	0 %	238650230
596	NC_012730	ATT	2	6	22412	22417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650230
597	NC_012730	TTTA	2	8	22454	22461	25 %	75 %	0 %	0 %	238650230
598	NC_012730	TAT	2	6	22465	22470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650230
599	NC_012730	A	7	7	22478	22484	100 %	0 %	0 %	0 %	238650230
600	NC_012730	T	6	6	22514	22519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012730	TA	3	6	22526	22531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012730	AT	3	6	22532	22537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012730	T	6	6	22548	22553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012730	AATT	2	8	22563	22570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012730	T	9	9	22578	22586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012730	TGT	2	6	22589	22594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012730	TAT	2	6	22612	22617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012730	ATT	2	6	22726	22731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012730	AATCA	2	10	22831	22840	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
610	NC_012730	CCG	2	6	22894	22899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238650231
611	NC_012730	CTT	2	6	22970	22975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238650231
612	NC_012730	A	7	7	22999	23005	100 %	0 %	0 %	0 %	238650231
613	NC_012730	CT	4	8	23006	23013	0 %	50 %	0 %	50 %	238650231
614	NC_012730	TGT	2	6	23158	23163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238650232
615	NC_012730	CTAT	2	8	23193	23200	25 %	50 %	0 %	25 %	238650232
616	NC_012730	ATT	2	6	23318	23323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650232
617	NC_012730	TAT	2	6	23341	23346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238650232
618	NC_012730	TCGT	2	8	23366	23373	0 %	50 %	25 %	25 %	238650232
619	NC_012730	AT	3	6	23393	23398	50 %	50 %	0 %	0 %	238650232
620	NC_012730	ATTT	2	8	23413	23420	25 %	75 %	0 %	0 %	238650232
621	NC_012730	A	6	6	23516	23521	100 %	0 %	0 %	0 %	238650232
622	NC_012730	AGG	2	6	23696	23701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012730	ATA	2	6	23746	23751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012730	GT	3	6	23760	23765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012730	TATATT	2	12	23766	23777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012730	T	6	6	23798	23803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012730	CTA	2	6	23823	23828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_012730	TTA	3	9	23843	23851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012730	TTA	2	6	23917	23922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012730	GAA	2	6	23923	23928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_012730	T	6	6	23931	23936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012730	GTT	2	6	23994	23999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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634	NC_012730	TTA	2	6	24019	24024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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