MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia africae ESF-5 plasmid pRAF

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012634	AGTA	2	8	453	460	50 %	25 %	25 %	0 %	228478452
2	NC_012634	CTTT	2	8	652	659	0 %	75 %	0 %	25 %	228478452
3	NC_012634	ACTT	2	8	1517	1524	25 %	50 %	0 %	25 %	228478452
4	NC_012634	AGCG	2	8	1735	1742	25 %	0 %	50 %	25 %	228478452
5	NC_012634	GAAA	2	8	1852	1859	75 %	0 %	25 %	0 %	228478452
6	NC_012634	ATAA	2	8	2241	2248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012634	AAAG	2	8	2857	2864	75 %	0 %	25 %	0 %	228478453
8	NC_012634	GTAA	2	8	2961	2968	50 %	25 %	25 %	0 %	228478453
9	NC_012634	GCAG	2	8	3256	3263	25 %	0 %	50 %	25 %	228478454
10	NC_012634	TTTC	2	8	3430	3437	0 %	75 %	0 %	25 %	228478454
11	NC_012634	TAGG	2	8	3639	3646	25 %	25 %	50 %	0 %	228478454
12	NC_012634	TTTA	2	8	4595	4602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012634	AGCT	2	8	4605	4612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012634	ATGA	2	8	4627	4634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012634	TAAA	2	8	4667	4674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012634	TCTT	2	8	5491	5498	0 %	75 %	0 %	25 %	228478456
17	NC_012634	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	228478456
18	NC_012634	CTAA	2	8	5851	5858	50 %	25 %	0 %	25 %	228478457
19	NC_012634	TAGT	2	8	5911	5918	25 %	50 %	25 %	0 %	228478457
20	NC_012634	TAAT	2	8	5950	5957	50 %	50 %	0 %	0 %	228478457
21	NC_012634	AGAA	2	8	5974	5981	75 %	0 %	25 %	0 %	228478457
22	NC_012634	AAGA	2	8	6015	6022	75 %	0 %	25 %	0 %	228478457
23	NC_012634	ATAG	2	8	6081	6088	50 %	25 %	25 %	0 %	228478457
24	NC_012634	TTCT	2	8	6168	6175	0 %	75 %	0 %	25 %	228478457
25	NC_012634	TTAG	2	8	6417	6424	25 %	50 %	25 %	0 %	228478458
26	NC_012634	AAGA	2	8	6777	6784	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012634	ATCC	2	8	7022	7029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012634	AATG	2	8	7320	7327	50 %	25 %	25 %	0 %	228478459
29	NC_012634	TGAA	2	8	7979	7986	50 %	25 %	25 %	0 %	228478460
30	NC_012634	ACTT	2	8	8184	8191	25 %	50 %	0 %	25 %	228478460
31	NC_012634	TGTT	2	8	8584	8591	0 %	75 %	25 %	0 %	228478460
32	NC_012634	GCTA	2	8	8667	8674	25 %	25 %	25 %	25 %	228478460
33	NC_012634	TACA	2	8	9143	9150	50 %	25 %	0 %	25 %	228478460
34	NC_012634	TGCT	2	8	9729	9736	0 %	50 %	25 %	25 %	228478460
35	NC_012634	AAAT	2	8	10527	10534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012634	ATTT	2	8	10552	10559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012634	CTAG	3	12	11059	11070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012634	CTAG	2	8	11075	11082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012634	TATT	2	8	11680	11687	25 %	75 %	0 %	0 %	228478462
40	NC_012634	TTGC	2	8	11829	11836	0 %	50 %	25 %	25 %	228478462

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.