MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 2931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012633	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	229586231
2	NC_012633	TC	3	6	1480	1485	0 %	50 %	0 %	50 %	229586233
3	NC_012633	AT	3	6	1605	1610	50 %	50 %	0 %	0 %	229586233
4	NC_012633	TA	3	6	1723	1728	50 %	50 %	0 %	0 %	229586233
5	NC_012633	GA	3	6	2291	2296	50 %	0 %	50 %	0 %	229586234
6	NC_012633	TA	3	6	2455	2460	50 %	50 %	0 %	0 %	229586234
7	NC_012633	TG	3	6	2571	2576	0 %	50 %	50 %	0 %	229586234
8	NC_012633	AT	3	6	2715	2720	50 %	50 %	0 %	0 %	229586234
9	NC_012633	TC	3	6	3028	3033	0 %	50 %	0 %	50 %	229586235
10	NC_012633	TG	3	6	3396	3401	0 %	50 %	50 %	0 %	229586235
11	NC_012633	GA	3	6	3503	3508	50 %	0 %	50 %	0 %	229586235
12	NC_012633	AT	3	6	3965	3970	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
13	NC_012633	AT	3	6	4275	4280	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
14	NC_012633	AG	3	6	4294	4299	50 %	0 %	50 %	0 %	229586235
15	NC_012633	TA	3	6	4382	4387	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
16	NC_012633	TA	3	6	4634	4639	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
17	NC_012633	AT	3	6	4826	4831	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
18	NC_012633	AT	3	6	5860	5865	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
19	NC_012633	TA	3	6	6206	6211	50 %	50 %	0 %	0 %	229586236
20	NC_012633	AT	3	6	6435	6440	50 %	50 %	0 %	0 %	229586237
21	NC_012633	TA	3	6	8689	8694	50 %	50 %	0 %	0 %	229586240
22	NC_012633	TA	3	6	9120	9125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012633	AT	3	6	9402	9407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012633	TA	3	6	9672	9677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012633	TA	3	6	11254	11259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012633	AG	3	6	12028	12033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012633	AT	3	6	12441	12446	50 %	50 %	0 %	0 %	229586243
28	NC_012633	TA	3	6	12854	12859	50 %	50 %	0 %	0 %	229586244
29	NC_012633	TA	3	6	12883	12888	50 %	50 %	0 %	0 %	229586244
30	NC_012633	AT	3	6	14356	14361	50 %	50 %	0 %	0 %	229586245
31	NC_012633	TG	3	6	14895	14900	0 %	50 %	50 %	0 %	229586245
32	NC_012633	TG	3	6	15024	15029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012633	CA	3	6	15170	15175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012633	AT	3	6	16104	16109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012633	AC	3	6	16537	16542	50 %	0 %	0 %	50 %	229586246
36	NC_012633	TA	3	6	16735	16740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012633	AT	3	6	16979	16984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012633	TA	3	6	17263	17268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012633	TA	3	6	17642	17647	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
40	NC_012633	AG	3	6	19859	19864	50 %	0 %	50 %	0 %	229586247
41	NC_012633	AG	4	8	19962	19969	50 %	0 %	50 %	0 %	229586247
42	NC_012633	TC	3	6	20174	20179	0 %	50 %	0 %	50 %	229586247
43	NC_012633	TA	3	6	20417	20422	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
44	NC_012633	CT	3	6	20424	20429	0 %	50 %	0 %	50 %	229586247
45	NC_012633	TA	3	6	20553	20558	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
46	NC_012633	AT	3	6	20596	20601	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
47	NC_012633	TA	3	6	21328	21333	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
48	NC_012633	TA	3	6	21445	21450	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
49	NC_012633	TA	3	6	22532	22537	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
50	NC_012633	AT	3	6	22589	22594	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
51	NC_012633	TA	3	6	22945	22950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012633	AT	3	6	23797	23802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012633	AG	3	6	24212	24217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012633	AT	3	6	25173	25178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012633	AT	4	8	25396	25403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57	NC_012633	AT	4	8	25744	25751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_012633	AT	3	6	27224	27229	50 %	50 %	0 %	0 %	229586252
61	NC_012633	AT	3	6	29035	29040	50 %	50 %	0 %	0 %	229586255
62	NC_012633	AT	3	6	29845	29850	50 %	50 %	0 %	0 %	229586256
63	NC_012633	AT	3	6	30575	30580	50 %	50 %	0 %	0 %	229586257
64	NC_012633	AT	3	6	31133	31138	50 %	50 %	0 %	0 %	229586257
65	NC_012633	AT	3	6	31282	31287	50 %	50 %	0 %	0 %	229586257
66	NC_012633	AT	3	6	32033	32038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012633	TA	3	6	32040	32045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_012633	TG	3	6	33119	33124	0 %	50 %	50 %	0 %	229586258
70	NC_012633	AT	3	6	34858	34863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012633	AT	3	6	34868	34873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012633	AT	3	6	34977	34982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012633	AG	3	6	35451	35456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012633	AT	3	6	36073	36078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012633	GA	3	6	36206	36211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012633	AT	3	6	37554	37559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012633	AT	3	6	37706	37711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012633	TA	3	6	37913	37918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012633	AT	3	6	38038	38043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012633	AT	3	6	38184	38189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012633	TA	4	8	38286	38293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012633	AT	3	6	38529	38534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_012633	AT	3	6	41130	41135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012633	AT	3	6	41314	41319	50 %	50 %	0 %	0 %	229586264
91	NC_012633	AT	3	6	41338	41343	50 %	50 %	0 %	0 %	229586264
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94	NC_012633	AT	3	6	44168	44173	50 %	50 %	0 %	0 %	229586265
95	NC_012633	TA	4	8	44241	44248	50 %	50 %	0 %	0 %	229586265
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102	NC_012633	TA	3	6	46851	46856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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105	NC_012633	AT	3	6	48394	48399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012633	AT	3	6	49852	49857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_012633	AT	3	6	52900	52905	50 %	50 %	0 %	0 %	229586270
110	NC_012633	AT	3	6	52907	52912	50 %	50 %	0 %	0 %	229586270
111	NC_012633	AT	3	6	53131	53136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012633	AT	3	6	53393	53398	50 %	50 %	0 %	0 %	229586271
113	NC_012633	AT	3	6	55676	55681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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116	NC_012633	TA	3	6	56595	56600	50 %	50 %	0 %	0 %	229586274
117	NC_012633	AT	3	6	57605	57610	50 %	50 %	0 %	0 %	229586276
118	NC_012633	AT	3	6	58449	58454	50 %	50 %	0 %	0 %	229586277
119	NC_012633	TA	3	6	58590	58595	50 %	50 %	0 %	0 %	229586277
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123	NC_012633	CT	3	6	59602	59607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012633	TA	3	6	61869	61874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012633	AT	4	8	61958	61965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012633	AG	3	6	62449	62454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_012633	AT	3	6	64561	64566	50 %	50 %	0 %	0 %	229586282
130	NC_012633	CT	3	6	64851	64856	0 %	50 %	0 %	50 %	229586282
131	NC_012633	TA	3	6	65587	65592	50 %	50 %	0 %	0 %	229586283
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133	NC_012633	TA	3	6	66355	66360	50 %	50 %	0 %	0 %	229586284
134	NC_012633	AT	4	8	66521	66528	50 %	50 %	0 %	0 %	229586284
135	NC_012633	AG	3	6	66832	66837	50 %	0 %	50 %	0 %	229586284
136	NC_012633	TA	3	6	66909	66914	50 %	50 %	0 %	0 %	229586284
137	NC_012633	TA	3	6	66988	66993	50 %	50 %	0 %	0 %	229586284
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139	NC_012633	AT	3	6	67220	67225	50 %	50 %	0 %	0 %	229586284
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