MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 1152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012633	TTTTA	2	10	2495	2504	20 %	80 %	0 %	0 %	229586234
2	NC_012633	ATTTA	2	10	2848	2857	40 %	60 %	0 %	0 %	229586234
3	NC_012633	GGTCA	2	10	4095	4104	20 %	20 %	40 %	20 %	229586235
4	NC_012633	TAAAT	2	10	4804	4813	60 %	40 %	0 %	0 %	229586235
5	NC_012633	TCAAT	2	10	5074	5083	40 %	40 %	0 %	20 %	229586235
6	NC_012633	GTAGT	2	10	5130	5139	20 %	40 %	40 %	0 %	229586235
7	NC_012633	TAATA	2	10	5990	5999	60 %	40 %	0 %	0 %	229586235
8	NC_012633	ACTTT	2	10	6779	6788	20 %	60 %	0 %	20 %	229586238
9	NC_012633	AATAC	2	10	7320	7329	60 %	20 %	0 %	20 %	229586238
10	NC_012633	ATCCA	2	10	7817	7826	40 %	20 %	0 %	40 %	229586239
11	NC_012633	AATTA	2	10	9392	9401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012633	CGCTC	2	10	9743	9752	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_012633	AGCAG	2	10	10705	10714	40 %	0 %	40 %	20 %	229586241
14	NC_012633	TTAAT	2	10	10848	10857	40 %	60 %	0 %	0 %	229586241
15	NC_012633	AAATA	2	10	12046	12055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012633	TAACT	2	10	12138	12147	40 %	40 %	0 %	20 %	229586243
17	NC_012633	ATTTA	2	10	13792	13801	40 %	60 %	0 %	0 %	229586245
18	NC_012633	TTTTA	2	10	14560	14569	20 %	80 %	0 %	0 %	229586245
19	NC_012633	TTTAA	2	10	17322	17331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012633	TCAAG	2	10	18356	18365	40 %	20 %	20 %	20 %	229586247
21	NC_012633	ATAAA	2	10	18410	18419	80 %	20 %	0 %	0 %	229586247
22	NC_012633	AGAAA	2	10	18672	18681	80 %	0 %	20 %	0 %	229586247
23	NC_012633	AAAGC	2	10	18928	18937	60 %	0 %	20 %	20 %	229586247
24	NC_012633	TAATA	2	10	19848	19857	60 %	40 %	0 %	0 %	229586247
25	NC_012633	CAAAG	2	10	19940	19949	60 %	0 %	20 %	20 %	229586247
26	NC_012633	AGCAG	2	10	20266	20275	40 %	0 %	40 %	20 %	229586247
27	NC_012633	TACCT	2	10	21624	21633	20 %	40 %	0 %	40 %	229586247
28	NC_012633	TATAA	2	10	23112	23121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012633	ATATT	2	10	24690	24699	40 %	60 %	0 %	0 %	229586249
30	NC_012633	ATATT	2	10	24728	24737	40 %	60 %	0 %	0 %	229586249
31	NC_012633	AAATA	2	10	25179	25188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012633	ATGTT	2	10	25889	25898	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012633	TTTGT	2	10	26842	26851	0 %	80 %	20 %	0 %	229586251
34	NC_012633	TCATT	2	10	28619	28628	20 %	60 %	0 %	20 %	229586255
35	NC_012633	TGCTA	2	10	29537	29546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012633	ATACA	2	10	29615	29624	60 %	20 %	0 %	20 %	229586256
37	NC_012633	AAGTG	2	10	32077	32086	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012633	ATTTT	2	10	32089	32098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012633	TTAAT	2	10	33785	33794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012633	TGAGT	2	10	33812	33821	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012633	TTAGT	2	10	36354	36363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012633	CTTTT	2	10	38425	38434	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012633	TTATT	2	10	38837	38846	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012633	TTTTA	2	10	38941	38950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012633	TAAGT	2	10	42085	42094	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012633	GAGAG	2	10	42774	42783	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012633	CAAAC	2	10	42826	42835	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_012633	ACGTA	2	10	42990	42999	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012633	TAACT	2	10	43261	43270	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012633	AGAAA	2	10	43873	43882	80 %	0 %	20 %	0 %	229586265
51	NC_012633	GTTTC	2	10	44313	44322	0 %	60 %	20 %	20 %	229586265
52	NC_012633	ATTTT	2	10	44862	44871	20 %	80 %	0 %	0 %	229586265
53	NC_012633	AAGAG	2	10	46310	46319	60 %	0 %	40 %	0 %	229586267
54	NC_012633	AGTAC	2	10	46769	46778	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012633	TTTAA	2	10	46987	46996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012633	TTTCT	2	10	48067	48076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012633	CATTA	2	10	49130	49139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012633	TTGAT	2	10	51039	51048	20 %	60 %	20 %	0 %	229586269
59	NC_012633	TAAAG	2	10	52066	52075	60 %	20 %	20 %	0 %	229586269
60	NC_012633	ATTAT	2	10	52139	52148	40 %	60 %	0 %	0 %	229586269
61	NC_012633	ATTAT	2	10	55706	55715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012633	TCGGT	2	10	57560	57569	0 %	40 %	40 %	20 %	229586276
63	NC_012633	GCTTT	2	10	58983	58992	0 %	60 %	20 %	20 %	229586277
64	NC_012633	TAAAA	2	10	63209	63218	80 %	20 %	0 %	0 %	229586280
65	NC_012633	ACTTT	2	10	66266	66275	20 %	60 %	0 %	20 %	229586284
66	NC_012633	CATTT	2	10	67158	67167	20 %	60 %	0 %	20 %	229586284
67	NC_012633	TTAAA	2	10	67183	67192	60 %	40 %	0 %	0 %	229586284
68	NC_012633	TAAAT	2	10	67253	67262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012633	ACATA	2	10	69976	69985	60 %	20 %	0 %	20 %	229586288
70	NC_012633	GATTA	2	10	71620	71629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012633	TTTCT	2	10	73329	73338	0 %	80 %	0 %	20 %	229586292
72	NC_012633	ATTTA	2	10	73743	73752	40 %	60 %	0 %	0 %	229586293
73	NC_012633	AAAAG	2	10	74519	74528	80 %	0 %	20 %	0 %	229586293
74	NC_012633	GGGTT	2	10	74729	74738	0 %	40 %	60 %	0 %	229586293
75	NC_012633	TTTAT	2	10	75105	75114	20 %	80 %	0 %	0 %	229586293
76	NC_012633	GCTTA	2	10	76275	76284	20 %	40 %	20 %	20 %	229586294
77	NC_012633	ACAAT	2	10	76639	76648	60 %	20 %	0 %	20 %	229586295
78	NC_012633	ACCGT	2	10	76892	76901	20 %	20 %	20 %	40 %	229586295
79	NC_012633	GTTAT	2	10	77264	77273	20 %	60 %	20 %	0 %	229586296
80	NC_012633	GTAGA	2	10	77570	77579	40 %	20 %	40 %	0 %	229586296
81	NC_012633	CAATG	2	10	79922	79931	40 %	20 %	20 %	20 %	229586298
82	NC_012633	ATAAA	2	10	80385	80394	80 %	20 %	0 %	0 %	229586299
83	NC_012633	ATTAT	2	10	80820	80829	40 %	60 %	0 %	0 %	229586299
84	NC_012633	ATTAA	2	10	81091	81100	60 %	40 %	0 %	0 %	229586299
85	NC_012633	ATACA	2	10	81295	81304	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012633	GAAAA	2	10	81643	81652	80 %	0 %	20 %	0 %	229586300
87	NC_012633	TAAAT	2	10	85103	85112	60 %	40 %	0 %	0 %	229586303
88	NC_012633	CGCAT	3	15	89360	89374	20 %	20 %	20 %	40 %	229586306
89	NC_012633	TGAAA	2	10	92590	92599	60 %	20 %	20 %	0 %	229586309
90	NC_012633	TATAA	2	10	94799	94808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012633	TTGTA	2	10	94926	94935	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012633	ATTTA	2	10	95865	95874	40 %	60 %	0 %	0 %	229586313
93	NC_012633	AATTA	2	10	96228	96237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012633	TCAAA	2	10	97516	97525	60 %	20 %	0 %	20 %	229586315
95	NC_012633	TTAAT	2	10	98226	98235	40 %	60 %	0 %	0 %	229586316
96	NC_012633	AAACT	2	10	100799	100808	60 %	20 %	0 %	20 %	229586318
97	NC_012633	TTAGT	2	10	101150	101159	20 %	60 %	20 %	0 %	229586319
98	NC_012633	CCAAA	2	10	103589	103598	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_012633	TAATA	2	10	104893	104902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012633	ATTTT	2	10	105140	105149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012633	TTGAT	2	10	105590	105599	20 %	60 %	20 %	0 %	229586322
102	NC_012633	ATTAT	2	10	105771	105780	40 %	60 %	0 %	0 %	229586322
103	NC_012633	TTGAA	2	10	108387	108396	40 %	40 %	20 %	0 %	229586322
104	NC_012633	TTTGA	2	10	109897	109906	20 %	60 %	20 %	0 %	229586322
105	NC_012633	GCAAA	2	10	111874	111883	60 %	0 %	20 %	20 %	229586323
106	NC_012633	AACTA	2	10	115730	115739	60 %	20 %	0 %	20 %	229586326
107	NC_012633	TTAGT	2	10	116585	116594	20 %	60 %	20 %	0 %	229586327
108	NC_012633	TTGTC	2	10	117715	117724	0 %	60 %	20 %	20 %	229586327
109	NC_012633	ATAAA	2	10	117802	117811	80 %	20 %	0 %	0 %	229586327
110	NC_012633	AAGTA	2	10	118408	118417	60 %	20 %	20 %	0 %	229586328
111	NC_012633	ATTCG	2	10	120187	120196	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012633	TAAAA	2	10	120532	120541	80 %	20 %	0 %	0 %	229586330
113	NC_012633	AAAAC	2	10	121228	121237	80 %	0 %	0 %	20 %	229586330
114	NC_012633	TTTAA	2	10	121304	121313	40 %	60 %	0 %	0 %	229586330
115	NC_012633	TGAAA	2	10	122754	122763	60 %	20 %	20 %	0 %	229586332
116	NC_012633	GCAAG	2	10	123408	123417	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012633	CTTGT	2	10	125830	125839	0 %	60 %	20 %	20 %	229586334
118	NC_012633	TTTGA	2	10	126154	126163	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012633	ATGAT	2	10	126895	126904	40 %	40 %	20 %	0 %	229586335
120	NC_012633	CTTGT	2	10	127233	127242	0 %	60 %	20 %	20 %	229586336
121	NC_012633	TATTT	2	10	127659	127668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012633	TCTTT	2	10	128803	128812	0 %	80 %	0 %	20 %	229586338
123	NC_012633	AACCT	2	10	129840	129849	40 %	20 %	0 %	40 %	229586339
124	NC_012633	TGGTT	2	10	130634	130643	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012633	AAATC	2	10	130978	130987	60 %	20 %	0 %	20 %	229586341
126	NC_012633	TTAAC	2	10	132115	132124	40 %	40 %	0 %	20 %	229586342
127	NC_012633	TATAA	2	10	132207	132216	60 %	40 %	0 %	0 %	229586342
128	NC_012633	TTATA	2	10	132581	132590	40 %	60 %	0 %	0 %	229586343
129	NC_012633	TTTTA	2	10	134108	134117	20 %	80 %	0 %	0 %	229586344
130	NC_012633	GCTTT	2	10	135684	135693	0 %	60 %	20 %	20 %	229586345
131	NC_012633	TATGT	2	10	136334	136343	20 %	60 %	20 %	0 %	229586345
132	NC_012633	GTTTT	2	10	138638	138647	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012633	CTTGG	2	10	139456	139465	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012633	ACAAG	2	10	143170	143179	60 %	0 %	20 %	20 %	229586346
135	NC_012633	AGTTT	2	10	143508	143517	20 %	60 %	20 %	0 %	229586347
136	NC_012633	TTAGT	2	10	144031	144040	20 %	60 %	20 %	0 %	229586347
137	NC_012633	ATATA	2	10	144937	144946	60 %	40 %	0 %	0 %	229586347
138	NC_012633	TGCAG	2	10	145025	145034	20 %	20 %	40 %	20 %	229586347
139	NC_012633	ATGGT	2	10	146605	146614	20 %	40 %	40 %	0 %	229586348
140	NC_012633	AGGAG	2	10	146860	146869	40 %	0 %	60 %	0 %	229586348
141	NC_012633	TATTT	2	10	147536	147545	20 %	80 %	0 %	0 %	229586348
142	NC_012633	AAAGA	2	10	153034	153043	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012633	AATTT	2	10	154870	154879	40 %	60 %	0 %	0 %	229586352
144	NC_012633	AGGTG	2	10	154976	154985	20 %	20 %	60 %	0 %	229586352
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196	NC_012633	TTTCT	2	10	214594	214603	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_012633	GTGAA	2	10	295463	295472	40 %	20 %	40 %	0 %	229586460
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271	NC_012633	TATGA	2	10	305000	305009	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012633	AAAGA	2	10	307781	307790	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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