MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012633	AT	3	6	158608	158613	50 %	50 %	0 %	0 %	229586355
4002	NC_012633	GTAAAA	2	12	158665	158676	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	229586355
4003	NC_012633	AACA	2	8	158684	158691	75 %	0 %	0 %	25 %	229586355
4004	NC_012633	AAG	2	6	158711	158716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586355
4005	NC_012633	GCA	2	6	158728	158733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586355
4006	NC_012633	AG	3	6	158792	158797	50 %	0 %	50 %	0 %	229586356
4007	NC_012633	GCC	2	6	158825	158830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586356
4008	NC_012633	TTA	2	6	158960	158965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586356
4009	NC_012633	AAT	2	6	158971	158976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586356
4010	NC_012633	ACT	2	6	159014	159019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586356
4011	NC_012633	ATT	2	6	159026	159031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586356
4012	NC_012633	TAT	2	6	159037	159042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586356
4013	NC_012633	ATT	2	6	159170	159175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586356
4014	NC_012633	TGA	2	6	159193	159198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586356
4015	NC_012633	ATA	2	6	159207	159212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586356
4016	NC_012633	T	6	6	159304	159309	0 %	100 %	0 %	0 %	229586356
4017	NC_012633	ATC	2	6	159318	159323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586356
4018	NC_012633	GCTT	2	8	159330	159337	0 %	50 %	25 %	25 %	229586356
4019	NC_012633	AT	3	6	159385	159390	50 %	50 %	0 %	0 %	229586356
4020	NC_012633	GAC	2	6	159431	159436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586356
4021	NC_012633	GCA	2	6	159464	159469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586356
4022	NC_012633	AG	3	6	159479	159484	50 %	0 %	50 %	0 %	229586356
4023	NC_012633	AGAA	2	8	159504	159511	75 %	0 %	25 %	0 %	229586356
4024	NC_012633	TAG	2	6	159588	159593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586356
4025	NC_012633	AG	4	8	159599	159606	50 %	0 %	50 %	0 %	229586356
4026	NC_012633	GA	3	6	159680	159685	50 %	0 %	50 %	0 %	229586356
4027	NC_012633	T	6	6	159686	159691	0 %	100 %	0 %	0 %	229586356
4028	NC_012633	ATTT	2	8	159705	159712	25 %	75 %	0 %	0 %	229586356
4029	NC_012633	AAT	2	6	159743	159748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586356
4030	NC_012633	TTG	2	6	159806	159811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_012633	ATA	3	9	159861	159869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_012633	AAT	2	6	159888	159893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012633	ATA	2	6	159898	159903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586357
4034	NC_012633	AGT	2	6	159942	159947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586357
4035	NC_012633	TAT	2	6	159987	159992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586357
4036	NC_012633	TCA	2	6	160017	160022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586357
4037	NC_012633	TTA	2	6	160034	160039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586357
4038	NC_012633	GAA	2	6	160093	160098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586357
4039	NC_012633	CTT	2	6	160124	160129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586357
4040	NC_012633	A	8	8	160215	160222	100 %	0 %	0 %	0 %	229586357
4041	NC_012633	TGA	2	6	160311	160316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586357
4042	NC_012633	A	6	6	160356	160361	100 %	0 %	0 %	0 %	229586357
4043	NC_012633	TTA	2	6	160362	160367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586357
4044	NC_012633	AAT	3	9	160378	160386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586358
4045	NC_012633	GAA	2	6	160438	160443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586358
4046	NC_012633	AGCA	2	8	160497	160504	50 %	0 %	25 %	25 %	229586358
4047	NC_012633	GTA	2	6	160506	160511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586358
4048	NC_012633	CTA	2	6	160599	160604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586358
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4050	NC_012633	GAA	2	6	160724	160729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586358
4051	NC_012633	TAA	2	6	160741	160746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586358
4052	NC_012633	TTA	3	9	160800	160808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586358
4053	NC_012633	GTT	2	6	160819	160824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586358
4054	NC_012633	AG	3	6	160841	160846	50 %	0 %	50 %	0 %	229586358
4055	NC_012633	CTA	2	6	160872	160877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586358
4056	NC_012633	AAG	2	6	160878	160883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586358
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4058	NC_012633	TTC	2	6	160934	160939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586358
4059	NC_012633	A	7	7	160952	160958	100 %	0 %	0 %	0 %	229586358
4060	NC_012633	CAA	2	6	160967	160972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586358
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4062	NC_012633	TC	3	6	161005	161010	0 %	50 %	0 %	50 %	229586358
4063	NC_012633	TAT	2	6	161038	161043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586358
4064	NC_012633	TA	3	6	161108	161113	50 %	50 %	0 %	0 %	229586359
4065	NC_012633	TAC	2	6	161156	161161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586359
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4067	NC_012633	CAA	2	6	161210	161215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586359
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4070	NC_012633	TAG	2	6	161324	161329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586359
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4073	NC_012633	AT	3	6	161431	161436	50 %	50 %	0 %	0 %	229586359
4074	NC_012633	T	8	8	161439	161446	0 %	100 %	0 %	0 %	229586359
4075	NC_012633	AT	3	6	161453	161458	50 %	50 %	0 %	0 %	229586359
4076	NC_012633	TTA	2	6	161666	161671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_012633	AT	4	8	161676	161683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_012633	TAA	2	6	161731	161736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586360
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4080	NC_012633	TCT	2	6	161821	161826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586360
4081	NC_012633	CTA	2	6	161830	161835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586360
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4087	NC_012633	TA	3	6	161981	161986	50 %	50 %	0 %	0 %	229586360
4088	NC_012633	TTCG	2	8	162005	162012	0 %	50 %	25 %	25 %	229586360
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4093	NC_012633	GT	3	6	162066	162071	0 %	50 %	50 %	0 %	229586360
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4096	NC_012633	T	6	6	162106	162111	0 %	100 %	0 %	0 %	229586360
4097	NC_012633	TA	3	6	162118	162123	50 %	50 %	0 %	0 %	229586360
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4101	NC_012633	T	6	6	162176	162181	0 %	100 %	0 %	0 %	229586360
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4104	NC_012633	GTT	2	6	162275	162280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586360
4105	NC_012633	GAT	2	6	162299	162304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586360
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4107	NC_012633	A	6	6	162359	162364	100 %	0 %	0 %	0 %	229586360
4108	NC_012633	ATT	2	6	162465	162470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586360
4109	NC_012633	T	6	6	162498	162503	0 %	100 %	0 %	0 %	229586360
4110	NC_012633	TTC	3	9	162526	162534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586360
4111	NC_012633	TATCA	2	10	162545	162554	40 %	40 %	0 %	20 %	229586360
4112	NC_012633	ATA	2	6	162608	162613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586360
4113	NC_012633	TAGCT	2	10	162632	162641	20 %	40 %	20 %	20 %	229586360
4114	NC_012633	TTG	2	6	162664	162669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586360
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4118	NC_012633	TGTGA	2	10	162827	162836	20 %	40 %	40 %	0 %	229586361
4119	NC_012633	TATAT	2	10	162859	162868	40 %	60 %	0 %	0 %	229586361
4120	NC_012633	TAT	2	6	162891	162896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586361
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4122	NC_012633	T	6	6	162993	162998	0 %	100 %	0 %	0 %	229586361
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4124	NC_012633	ATT	2	6	163013	163018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586361
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4143	NC_012633	TA	3	6	163755	163760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_012633	AT	4	8	163766	163773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_012633	A	6	6	163824	163829	100 %	0 %	0 %	0 %	229586362
4146	NC_012633	A	7	7	163844	163850	100 %	0 %	0 %	0 %	229586362
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4497	NC_012633	CAT	2	6	177261	177266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586376
4498	NC_012633	GTG	2	6	177342	177347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229586376
4499	NC_012633	AGA	2	6	177403	177408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586376
4500	NC_012633	AGA	3	9	177412	177420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586376

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