MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012633	CAC	2	6	138036	138041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229586345
3502	NC_012633	ATA	2	6	138063	138068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586345
3503	NC_012633	A	6	6	138080	138085	100 %	0 %	0 %	0 %	229586345
3504	NC_012633	ATA	2	6	138093	138098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586345
3505	NC_012633	TAG	2	6	138291	138296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586345
3506	NC_012633	GGA	3	9	138302	138310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586345
3507	NC_012633	AAG	2	6	138324	138329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586345
3508	NC_012633	GAG	2	6	138330	138335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586345
3509	NC_012633	ACG	2	6	138346	138351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586345
3510	NC_012633	GCG	2	6	138390	138395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229586345
3511	NC_012633	A	8	8	138405	138412	100 %	0 %	0 %	0 %	229586345
3512	NC_012633	ATA	2	6	138414	138419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586345
3513	NC_012633	TTA	2	6	138454	138459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_012633	TAGC	2	8	138484	138491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3515	NC_012633	ACT	2	6	138528	138533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_012633	TA	3	6	138570	138575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_012633	GTTTT	2	10	138638	138647	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_012633	GTA	3	9	138661	138669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_012633	ATA	2	6	138733	138738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_012633	A	6	6	138789	138794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_012633	CCT	2	6	138882	138887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_012633	TTAA	2	8	138951	138958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_012633	TAA	2	6	138998	139003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_012633	T	6	6	139008	139013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_012633	TGC	2	6	139064	139069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_012633	T	6	6	139134	139139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_012633	A	6	6	139181	139186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_012633	TAA	2	6	139199	139204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_012633	TTG	2	6	139214	139219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_012633	GCG	2	6	139256	139261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_012633	AGC	2	6	139317	139322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_012633	GAT	2	6	139338	139343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_012633	GCA	2	6	139351	139356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_012633	GATT	2	8	139431	139438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_012633	TTA	2	6	139449	139454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_012633	CTTGG	2	10	139456	139465	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3537	NC_012633	TAA	2	6	139530	139535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_012633	T	6	6	139612	139617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_012633	TTA	2	6	139652	139657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_012633	GCA	2	6	139663	139668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_012633	TTA	2	6	139712	139717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_012633	ATT	2	6	139721	139726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_012633	AT	3	6	139758	139763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_012633	TATT	2	8	139772	139779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_012633	GTAT	2	8	139831	139838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_012633	AGT	2	6	139860	139865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_012633	TAA	2	6	139886	139891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_012633	TATG	2	8	139893	139900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_012633	TGT	2	6	140109	140114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_012633	T	6	6	140159	140164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_012633	AAAG	2	8	140265	140272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_012633	AGC	2	6	140274	140279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_012633	TGC	2	6	140292	140297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_012633	AGC	2	6	140366	140371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_012633	TTA	2	6	140431	140436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586346
3556	NC_012633	TAG	2	6	140459	140464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3557	NC_012633	GCA	2	6	140488	140493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586346
3558	NC_012633	GCT	2	6	140528	140533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586346
3559	NC_012633	AGG	2	6	140559	140564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586346
3560	NC_012633	TAATGC	2	12	140595	140606	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229586346
3561	NC_012633	ACT	2	6	140620	140625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586346
3562	NC_012633	TGT	2	6	140630	140635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586346
3563	NC_012633	TAG	2	6	140702	140707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3564	NC_012633	GGTC	2	8	140736	140743	0 %	25 %	50 %	25 %	229586346
3565	NC_012633	TA	3	6	140764	140769	50 %	50 %	0 %	0 %	229586346
3566	NC_012633	AAT	2	6	140857	140862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586346
3567	NC_012633	TC	3	6	140870	140875	0 %	50 %	0 %	50 %	229586346
3568	NC_012633	TAA	2	6	140876	140881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586346
3569	NC_012633	A	6	6	140889	140894	100 %	0 %	0 %	0 %	229586346
3570	NC_012633	AATG	2	8	140896	140903	50 %	25 %	25 %	0 %	229586346
3571	NC_012633	ACT	2	6	141037	141042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586346
3572	NC_012633	AGCA	2	8	141158	141165	50 %	0 %	25 %	25 %	229586346
3573	NC_012633	GAT	2	6	141280	141285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3574	NC_012633	ACA	2	6	141311	141316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586346
3575	NC_012633	ATT	2	6	141324	141329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586346
3576	NC_012633	TCC	2	6	141372	141377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586346
3577	NC_012633	TCG	2	6	141408	141413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586346
3578	NC_012633	AAAGAT	2	12	141418	141429	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	229586346
3579	NC_012633	CGG	2	6	141506	141511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229586346
3580	NC_012633	AGG	2	6	141519	141524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586346
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3582	NC_012633	ATGA	2	8	141553	141560	50 %	25 %	25 %	0 %	229586346
3583	NC_012633	TTG	2	6	141611	141616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586346
3584	NC_012633	TAAAGA	2	12	141642	141653	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	229586346
3585	NC_012633	TA	3	6	141665	141670	50 %	50 %	0 %	0 %	229586346
3586	NC_012633	TA	4	8	141675	141682	50 %	50 %	0 %	0 %	229586346
3587	NC_012633	TAG	2	6	141753	141758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3588	NC_012633	GGA	2	6	141769	141774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586346
3589	NC_012633	TGA	2	6	141840	141845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3590	NC_012633	CAT	2	6	141864	141869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586346
3591	NC_012633	TA	3	6	141976	141981	50 %	50 %	0 %	0 %	229586346
3592	NC_012633	TAA	2	6	142008	142013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586346
3593	NC_012633	GCT	2	6	142141	142146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586346
3594	NC_012633	T	6	6	142207	142212	0 %	100 %	0 %	0 %	229586346
3595	NC_012633	TGA	2	6	142244	142249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3596	NC_012633	TGA	2	6	142340	142345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3597	NC_012633	ATT	2	6	142411	142416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586346
3598	NC_012633	GTTT	2	8	142436	142443	0 %	75 %	25 %	0 %	229586346
3599	NC_012633	CTA	2	6	142448	142453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586346
3600	NC_012633	T	6	6	142504	142509	0 %	100 %	0 %	0 %	229586346
3601	NC_012633	CTT	2	6	142540	142545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586346
3602	NC_012633	TAT	2	6	142563	142568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586346
3603	NC_012633	AT	3	6	142567	142572	50 %	50 %	0 %	0 %	229586346
3604	NC_012633	ATT	2	6	142606	142611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586346
3605	NC_012633	TAT	2	6	142638	142643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586346
3606	NC_012633	TTTA	2	8	142683	142690	25 %	75 %	0 %	0 %	229586346
3607	NC_012633	TTA	2	6	142699	142704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586346
3608	NC_012633	TATT	2	8	142720	142727	25 %	75 %	0 %	0 %	229586346
3609	NC_012633	ATG	2	6	142777	142782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3610	NC_012633	TAT	2	6	142788	142793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586346
3611	NC_012633	GT	3	6	142846	142851	0 %	50 %	50 %	0 %	229586346
3612	NC_012633	TCT	2	6	142925	142930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586346
3613	NC_012633	ATG	2	6	142975	142980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3614	NC_012633	TTA	2	6	143012	143017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586346
3615	NC_012633	GTA	2	6	143062	143067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3616	NC_012633	TGG	2	6	143106	143111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229586346
3617	NC_012633	ATG	2	6	143123	143128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3618	NC_012633	GAT	2	6	143161	143166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586346
3619	NC_012633	ACAAG	2	10	143170	143179	60 %	0 %	20 %	20 %	229586346
3620	NC_012633	AAC	2	6	143210	143215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586346
3621	NC_012633	AAG	2	6	143264	143269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586346
3622	NC_012633	GAA	2	6	143287	143292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586346
3623	NC_012633	AAT	2	6	143358	143363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_012633	GCT	2	6	143415	143420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3626	NC_012633	GAT	2	6	143553	143558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586347
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