MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_012633	TAC	2	6	1270250	1270255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32503	NC_012633	A	6	6	1270278	1270283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32504	NC_012633	AAT	2	6	1270414	1270419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32505	NC_012633	AC	3	6	1270454	1270459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32506	NC_012633	A	6	6	1270554	1270559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32507	NC_012633	TGA	2	6	1270571	1270576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32508	NC_012633	A	6	6	1270608	1270613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32509	NC_012633	CAT	2	6	1270615	1270620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32510	NC_012633	GGC	2	6	1270650	1270655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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32512	NC_012633	TTAT	2	8	1270691	1270698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32513	NC_012633	TAAC	2	8	1270706	1270713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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32520	NC_012633	GAA	2	6	1270919	1270924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32523	NC_012633	ATT	2	6	1271012	1271017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32543	NC_012633	TATAT	2	10	1271938	1271947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32544	NC_012633	AT	4	8	1271944	1271951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32552	NC_012633	TTA	2	6	1272189	1272194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32553	NC_012633	AT	3	6	1272312	1272317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32554	NC_012633	CAT	2	6	1272319	1272324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32604	NC_012633	AATTT	2	10	1274540	1274549	40 %	60 %	0 %	0 %	229587257
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32607	NC_012633	ATTC	2	8	1274728	1274735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32608	NC_012633	ATTT	2	8	1274773	1274780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32613	NC_012633	T	7	7	1275005	1275011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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32615	NC_012633	TTC	2	6	1275091	1275096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32618	NC_012633	ACT	2	6	1275144	1275149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32620	NC_012633	TTA	2	6	1275165	1275170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32621	NC_012633	TTC	2	6	1275178	1275183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32622	NC_012633	TTA	2	6	1275213	1275218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32623	NC_012633	TAT	2	6	1275229	1275234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.