MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012633	AG	4	8	19962	19969	50 %	0 %	50 %	0 %	229586247
502	NC_012633	TAGT	2	8	20021	20028	25 %	50 %	25 %	0 %	229586247
503	NC_012633	A	6	6	20037	20042	100 %	0 %	0 %	0 %	229586247
504	NC_012633	AAC	2	6	20094	20099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586247
505	NC_012633	AGA	2	6	20113	20118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586247
506	NC_012633	AGTT	2	8	20121	20128	25 %	50 %	25 %	0 %	229586247
507	NC_012633	AAG	2	6	20159	20164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586247
508	NC_012633	TC	3	6	20174	20179	0 %	50 %	0 %	50 %	229586247
509	NC_012633	CAG	2	6	20188	20193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586247
510	NC_012633	A	8	8	20243	20250	100 %	0 %	0 %	0 %	229586247
511	NC_012633	AGCAG	2	10	20266	20275	40 %	0 %	40 %	20 %	229586247
512	NC_012633	TAA	2	6	20286	20291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586247
513	NC_012633	AGATGT	2	12	20301	20312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586247
514	NC_012633	TA	3	6	20417	20422	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
515	NC_012633	CT	3	6	20424	20429	0 %	50 %	0 %	50 %	229586247
516	NC_012633	CAA	2	6	20437	20442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586247
517	NC_012633	TAA	2	6	20468	20473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586247
518	NC_012633	A	6	6	20518	20523	100 %	0 %	0 %	0 %	229586247
519	NC_012633	CTA	2	6	20549	20554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586247
520	NC_012633	TA	3	6	20553	20558	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
521	NC_012633	GTTA	2	8	20566	20573	25 %	50 %	25 %	0 %	229586247
522	NC_012633	AT	3	6	20596	20601	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
523	NC_012633	AGA	2	6	20706	20711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586247
524	NC_012633	A	6	6	20861	20866	100 %	0 %	0 %	0 %	229586247
525	NC_012633	TGA	2	6	20946	20951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586247
526	NC_012633	A	6	6	21071	21076	100 %	0 %	0 %	0 %	229586247
527	NC_012633	TAA	2	6	21090	21095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586247
528	NC_012633	TAAA	2	8	21116	21123	75 %	25 %	0 %	0 %	229586247
529	NC_012633	ATG	3	9	21245	21253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586247
530	NC_012633	AGT	2	6	21259	21264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586247
531	NC_012633	TGT	2	6	21270	21275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586247
532	NC_012633	TAA	2	6	21306	21311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586247
533	NC_012633	TA	3	6	21328	21333	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
534	NC_012633	A	6	6	21356	21361	100 %	0 %	0 %	0 %	229586247
535	NC_012633	AGA	2	6	21363	21368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586247
536	NC_012633	A	6	6	21374	21379	100 %	0 %	0 %	0 %	229586247
537	NC_012633	AGA	2	6	21381	21386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586247
538	NC_012633	AAG	2	6	21431	21436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586247
539	NC_012633	TA	3	6	21445	21450	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
540	NC_012633	A	6	6	21485	21490	100 %	0 %	0 %	0 %	229586247
541	NC_012633	ATG	2	6	21524	21529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586247
542	NC_012633	A	6	6	21530	21535	100 %	0 %	0 %	0 %	229586247
543	NC_012633	TTC	2	6	21537	21542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586247
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545	NC_012633	TACCT	2	10	21624	21633	20 %	40 %	0 %	40 %	229586247
546	NC_012633	GAA	2	6	21643	21648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586247
547	NC_012633	AAG	2	6	21650	21655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586247
548	NC_012633	AAGT	2	8	21662	21669	50 %	25 %	25 %	0 %	229586247
549	NC_012633	GCATTA	2	12	21715	21726	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229586247
550	NC_012633	TAG	2	6	21765	21770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586247
551	NC_012633	GAA	2	6	21778	21783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586247
552	NC_012633	GAA	3	9	21808	21816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586247
553	NC_012633	TCCGAT	2	12	21832	21843	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229586247
554	NC_012633	A	7	7	21900	21906	100 %	0 %	0 %	0 %	229586247
555	NC_012633	GTT	2	6	21958	21963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586247
556	NC_012633	ATA	2	6	21977	21982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586247
557	NC_012633	TAA	2	6	22020	22025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586247
558	NC_012633	TGA	2	6	22047	22052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586247
559	NC_012633	AGA	2	6	22053	22058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586247
560	NC_012633	TAA	2	6	22104	22109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586247
561	NC_012633	CTA	2	6	22160	22165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586247
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565	NC_012633	AAT	2	6	22252	22257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586247
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573	NC_012633	AT	3	6	22589	22594	50 %	50 %	0 %	0 %	229586247
574	NC_012633	TAA	2	6	22650	22655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586247
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578	NC_012633	CAT	2	6	22753	22758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586247
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580	NC_012633	TAC	2	6	22827	22832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586247
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582	NC_012633	TAAA	2	8	22859	22866	75 %	25 %	0 %	0 %	229586247
583	NC_012633	TCA	2	6	22878	22883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586247
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585	NC_012633	ACTA	2	8	22995	23002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_012633	ACC	2	6	23049	23054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_012633	TATAA	2	10	23112	23121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012633	AAT	2	6	23129	23134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012633	CAC	2	6	23148	23153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_012633	AGAAAA	2	12	23234	23245	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012633	TAC	2	6	23365	23370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_012633	AAT	2	6	23507	23512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586248
593	NC_012633	AAC	2	6	23703	23708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_012633	TTAT	2	8	23709	23716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012633	TAA	2	6	23754	23759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_012633	TTA	2	6	23773	23778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_012633	AGCA	2	8	23784	23791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_012633	AT	3	6	23797	23802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_012633	CTT	2	6	23832	23837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_012633	AAT	2	6	23911	23916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012633	AAG	2	6	23999	24004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012633	CAAATA	2	12	24026	24037	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
603	NC_012633	AGT	2	6	24046	24051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012633	A	6	6	24092	24097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012633	TAA	2	6	24111	24116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012633	TAA	2	6	24132	24137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012633	A	7	7	24136	24142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012633	TAAAGT	2	12	24190	24201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012633	GAT	2	6	24203	24208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012633	AG	3	6	24212	24217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012633	AAGT	2	8	24237	24244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012633	ACA	2	6	24283	24288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586249
613	NC_012633	AGA	2	6	24292	24297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586249
614	NC_012633	TTA	2	6	24414	24419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586249
615	NC_012633	GAA	2	6	24500	24505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586249
616	NC_012633	ATA	2	6	24509	24514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586249
617	NC_012633	TAT	2	6	24555	24560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586249
618	NC_012633	TAAT	2	8	24615	24622	50 %	50 %	0 %	0 %	229586249
619	NC_012633	TAC	2	6	24652	24657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586249
620	NC_012633	ATA	2	6	24663	24668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586249
621	NC_012633	TGA	2	6	24676	24681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586249
622	NC_012633	ATATT	2	10	24690	24699	40 %	60 %	0 %	0 %	229586249
623	NC_012633	A	6	6	24716	24721	100 %	0 %	0 %	0 %	229586249
624	NC_012633	ATATT	2	10	24728	24737	40 %	60 %	0 %	0 %	229586249
625	NC_012633	A	6	6	24751	24756	100 %	0 %	0 %	0 %	229586249
626	NC_012633	AAGA	2	8	24767	24774	75 %	0 %	25 %	0 %	229586249
627	NC_012633	TAG	2	6	24786	24791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586249
628	NC_012633	GTA	2	6	24801	24806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586249
629	NC_012633	TGC	2	6	24811	24816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586249
630	NC_012633	AAAT	2	8	24859	24866	75 %	25 %	0 %	0 %	229586249
631	NC_012633	ATTA	2	8	24888	24895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012633	GAT	2	6	24912	24917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012633	TAC	2	6	24937	24942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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636	NC_012633	GAA	2	6	25052	25057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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