MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012633	AG	3	6	217829	217834	50 %	0 %	50 %	0 %	229586407
5502	NC_012633	AAGT	2	8	217881	217888	50 %	25 %	25 %	0 %	229586407
5503	NC_012633	AGT	2	6	217923	217928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586407
5504	NC_012633	AAAT	2	8	217961	217968	75 %	25 %	0 %	0 %	229586407
5505	NC_012633	GAA	2	6	217978	217983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586407
5506	NC_012633	AAG	2	6	218021	218026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586407
5507	NC_012633	TAA	2	6	218049	218054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586407
5508	NC_012633	AT	4	8	218103	218110	50 %	50 %	0 %	0 %	229586407
5509	NC_012633	T	6	6	218179	218184	0 %	100 %	0 %	0 %	229586408
5510	NC_012633	TAA	2	6	218188	218193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586408
5511	NC_012633	T	6	6	218227	218232	0 %	100 %	0 %	0 %	229586408
5512	NC_012633	AT	3	6	218396	218401	50 %	50 %	0 %	0 %	229586408
5513	NC_012633	CAT	2	6	218404	218409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586408
5514	NC_012633	ATT	2	6	218492	218497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586408
5515	NC_012633	AAT	2	6	218504	218509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586408
5516	NC_012633	GT	3	6	218604	218609	0 %	50 %	50 %	0 %	229586408
5517	NC_012633	AAGGC	2	10	218612	218621	40 %	0 %	40 %	20 %	229586408
5518	NC_012633	TGC	2	6	218648	218653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586409
5519	NC_012633	TTTCTT	2	12	218697	218708	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	229586409
5520	NC_012633	TTTTCT	2	12	218717	218728	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	229586409
5521	NC_012633	AT	3	6	218730	218735	50 %	50 %	0 %	0 %	229586409
5522	NC_012633	TGC	2	6	218826	218831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586409
5523	NC_012633	CT	3	6	218854	218859	0 %	50 %	0 %	50 %	229586409
5524	NC_012633	TAT	2	6	218883	218888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586409
5525	NC_012633	T	6	6	218890	218895	0 %	100 %	0 %	0 %	229586409
5526	NC_012633	AT	3	6	218913	218918	50 %	50 %	0 %	0 %	229586410
5527	NC_012633	ATC	2	6	218984	218989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586410
5528	NC_012633	ATG	2	6	219029	219034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586410
5529	NC_012633	A	6	6	219129	219134	100 %	0 %	0 %	0 %	229586410
5530	NC_012633	TAA	2	6	219173	219178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586410
5531	NC_012633	AATA	2	8	219201	219208	75 %	25 %	0 %	0 %	229586410
5532	NC_012633	ATT	2	6	219235	219240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586410
5533	NC_012633	GGT	2	6	219254	219259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229586410
5534	NC_012633	A	6	6	219378	219383	100 %	0 %	0 %	0 %	229586410
5535	NC_012633	AAT	3	9	219385	219393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586410
5536	NC_012633	AGA	2	6	219423	219428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586410
5537	NC_012633	TCA	3	9	219448	219456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586410
5538	NC_012633	TAT	2	6	219477	219482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586410
5539	NC_012633	GGAG	2	8	219492	219499	25 %	0 %	75 %	0 %	229586410
5540	NC_012633	ATG	2	6	219509	219514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586410
5541	NC_012633	CTT	2	6	219523	219528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586410
5542	NC_012633	AT	3	6	219569	219574	50 %	50 %	0 %	0 %	229586410
5543	NC_012633	CAG	2	6	219587	219592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586410
5544	NC_012633	GTT	2	6	219618	219623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586410
5545	NC_012633	GCT	2	6	219712	219717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_012633	TA	3	6	219820	219825	50 %	50 %	0 %	0 %	229586411
5547	NC_012633	AAT	2	6	219838	219843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586411
5548	NC_012633	AAATTA	2	12	219872	219883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586411
5549	NC_012633	AAT	2	6	219884	219889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586411
5550	NC_012633	AGA	2	6	219919	219924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586411
5551	NC_012633	TAA	2	6	219925	219930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586411
5552	NC_012633	AGT	2	6	219937	219942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586411
5553	NC_012633	ATT	2	6	219952	219957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586411
5554	NC_012633	TATT	2	8	219963	219970	25 %	75 %	0 %	0 %	229586411
5555	NC_012633	TTG	2	6	220009	220014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_012633	TG	3	6	220013	220018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_012633	TAT	2	6	220084	220089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_012633	AAT	2	6	220172	220177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_012633	CTA	2	6	220202	220207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_012633	TTA	2	6	220227	220232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586412
5561	NC_012633	CTT	2	6	220236	220241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586412
5562	NC_012633	AT	3	6	220251	220256	50 %	50 %	0 %	0 %	229586412
5563	NC_012633	TCC	2	6	220299	220304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586412
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5567	NC_012633	TAT	2	6	220434	220439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586412
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5572	NC_012633	TAA	2	6	220529	220534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586412
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5574	NC_012633	ACC	2	6	220590	220595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229586412
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5577	NC_012633	AT	3	6	220747	220752	50 %	50 %	0 %	0 %	229586412
5578	NC_012633	CAT	2	6	220814	220819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586412
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5582	NC_012633	ATT	3	9	220941	220949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586412
5583	NC_012633	T	6	6	220948	220953	0 %	100 %	0 %	0 %	229586412
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5588	NC_012633	GAAT	2	8	221426	221433	50 %	25 %	25 %	0 %	229586412
5589	NC_012633	AT	3	6	221483	221488	50 %	50 %	0 %	0 %	229586412
5590	NC_012633	T	6	6	221507	221512	0 %	100 %	0 %	0 %	229586412
5591	NC_012633	CTT	2	6	221516	221521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586412
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5599	NC_012633	AT	3	6	221713	221718	50 %	50 %	0 %	0 %	229586412
5600	NC_012633	TAT	2	6	221777	221782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586412
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5603	NC_012633	CAA	2	6	221828	221833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586412
5604	NC_012633	AATA	2	8	221877	221884	75 %	25 %	0 %	0 %	229586412
5605	NC_012633	GCA	2	6	221929	221934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586412
5606	NC_012633	AAGC	2	8	221978	221985	50 %	0 %	25 %	25 %	229586412
5607	NC_012633	CAT	2	6	222053	222058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586412
5608	NC_012633	AT	3	6	222101	222106	50 %	50 %	0 %	0 %	229586412
5609	NC_012633	AAAT	2	8	222204	222211	75 %	25 %	0 %	0 %	229586412
5610	NC_012633	ACT	2	6	222223	222228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586412
5611	NC_012633	TGC	2	6	222288	222293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586412
5612	NC_012633	TTCT	2	8	222341	222348	0 %	75 %	0 %	25 %	229586412
5613	NC_012633	AAT	2	6	222525	222530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586412
5614	NC_012633	TTC	2	6	222540	222545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586412
5615	NC_012633	ATT	2	6	222582	222587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586412
5616	NC_012633	T	6	6	222681	222686	0 %	100 %	0 %	0 %	229586412
5617	NC_012633	TA	3	6	222708	222713	50 %	50 %	0 %	0 %	229586412
5618	NC_012633	CCG	2	6	222721	222726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586412
5619	NC_012633	CGA	2	6	222785	222790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586412
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5621	NC_012633	TAC	2	6	222986	222991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586412
5622	NC_012633	TA	3	6	223017	223022	50 %	50 %	0 %	0 %	229586412
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5624	NC_012633	A	8	8	223170	223177	100 %	0 %	0 %	0 %	229586412
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5634	NC_012633	TA	3	6	223565	223570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5747	NC_012633	T	6	6	228363	228368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5752	NC_012633	T	6	6	228673	228678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5753	NC_012633	T	6	6	228685	228690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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