MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012633	TCA	2	6	198608	198613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586387
5002	NC_012633	T	6	6	198623	198628	0 %	100 %	0 %	0 %	229586387
5003	NC_012633	GGC	2	6	198631	198636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229586387
5004	NC_012633	ATA	2	6	198691	198696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_012633	T	6	6	198718	198723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012633	ATTA	2	8	198732	198739	50 %	50 %	0 %	0 %	229586388
5007	NC_012633	ATT	2	6	198858	198863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586388
5008	NC_012633	CCA	2	6	198909	198914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229586388
5009	NC_012633	CTT	2	6	198945	198950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586388
5010	NC_012633	T	6	6	198986	198991	0 %	100 %	0 %	0 %	229586388
5011	NC_012633	AGCA	2	8	199007	199014	50 %	0 %	25 %	25 %	229586388
5012	NC_012633	CAG	2	6	199018	199023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586388
5013	NC_012633	T	6	6	199040	199045	0 %	100 %	0 %	0 %	229586388
5014	NC_012633	ATC	2	6	199082	199087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586388
5015	NC_012633	CTT	2	6	199102	199107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586388
5016	NC_012633	GCT	2	6	199176	199181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586388
5017	NC_012633	TAT	2	6	199240	199245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586388
5018	NC_012633	TAAT	3	12	199257	199268	50 %	50 %	0 %	0 %	229586388
5019	NC_012633	GAT	2	6	199298	199303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586388
5020	NC_012633	ATC	2	6	199334	199339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586388
5021	NC_012633	ATT	2	6	199343	199348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586388
5022	NC_012633	TGC	2	6	199364	199369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586388
5023	NC_012633	TC	3	6	199397	199402	0 %	50 %	0 %	50 %	229586388
5024	NC_012633	TCC	2	6	199412	199417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586388
5025	NC_012633	ATA	2	6	199507	199512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586389
5026	NC_012633	TATT	2	8	199540	199547	25 %	75 %	0 %	0 %	229586389
5027	NC_012633	AAG	2	6	199585	199590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586389
5028	NC_012633	TTA	2	6	199596	199601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586389
5029	NC_012633	TTA	2	6	199627	199632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586389
5030	NC_012633	TTA	2	6	199647	199652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586389
5031	NC_012633	TTA	2	6	199680	199685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586389
5032	NC_012633	T	6	6	199759	199764	0 %	100 %	0 %	0 %	229586389
5033	NC_012633	TTA	2	6	199791	199796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586389
5034	NC_012633	ATA	2	6	199804	199809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586389
5035	NC_012633	CGG	2	6	199814	199819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229586389
5036	NC_012633	TGT	2	6	199880	199885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586389
5037	NC_012633	T	6	6	199957	199962	0 %	100 %	0 %	0 %	229586389
5038	NC_012633	T	7	7	199987	199993	0 %	100 %	0 %	0 %	229586390
5039	NC_012633	ATTA	2	8	200020	200027	50 %	50 %	0 %	0 %	229586390
5040	NC_012633	TTC	2	6	200071	200076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586390
5041	NC_012633	ATT	2	6	200101	200106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586390
5042	NC_012633	T	6	6	200116	200121	0 %	100 %	0 %	0 %	229586390
5043	NC_012633	ATA	2	6	200141	200146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586390
5044	NC_012633	TTC	2	6	200170	200175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586390
5045	NC_012633	T	8	8	200242	200249	0 %	100 %	0 %	0 %	229586390
5046	NC_012633	CTA	2	6	200274	200279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586390
5047	NC_012633	TAT	2	6	200310	200315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586390
5048	NC_012633	TA	3	6	200325	200330	50 %	50 %	0 %	0 %	229586390
5049	NC_012633	AT	3	6	200372	200377	50 %	50 %	0 %	0 %	229586390
5050	NC_012633	T	6	6	200468	200473	0 %	100 %	0 %	0 %	229586390
5051	NC_012633	T	6	6	200482	200487	0 %	100 %	0 %	0 %	229586390
5052	NC_012633	ATA	2	6	200513	200518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586390
5053	NC_012633	CAA	2	6	200532	200537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586390
5054	NC_012633	TC	3	6	200538	200543	0 %	50 %	0 %	50 %	229586390
5055	NC_012633	AGG	2	6	200563	200568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586390
5056	NC_012633	T	6	6	200598	200603	0 %	100 %	0 %	0 %	229586390
5057	NC_012633	T	8	8	200611	200618	0 %	100 %	0 %	0 %	229586390
5058	NC_012633	AAT	2	6	200671	200676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_012633	TTG	2	6	200723	200728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_012633	GTA	2	6	200764	200769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_012633	GCT	2	6	200820	200825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_012633	CCG	2	6	200933	200938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586391
5063	NC_012633	T	7	7	200940	200946	0 %	100 %	0 %	0 %	229586391
5064	NC_012633	AAT	2	6	200972	200977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586391
5065	NC_012633	TTA	2	6	201056	201061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586391
5066	NC_012633	TCT	2	6	201086	201091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586391
5067	NC_012633	CATT	2	8	201218	201225	25 %	50 %	0 %	25 %	229586391
5068	NC_012633	TTTA	2	8	201241	201248	25 %	75 %	0 %	0 %	229586391
5069	NC_012633	AAT	2	6	201257	201262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586391
5070	NC_012633	CATT	2	8	201299	201306	25 %	50 %	0 %	25 %	229586391
5071	NC_012633	TGC	2	6	201307	201312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586391
5072	NC_012633	CTA	2	6	201345	201350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586391
5073	NC_012633	CAT	2	6	201360	201365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586391
5074	NC_012633	TCA	2	6	201452	201457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586391
5075	NC_012633	TAA	2	6	201472	201477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586391
5076	NC_012633	CTT	3	9	201510	201518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586391
5077	NC_012633	CGC	2	6	201540	201545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586391
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5079	NC_012633	CAAG	2	8	201594	201601	50 %	0 %	25 %	25 %	229586391
5080	NC_012633	ATG	2	6	201638	201643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586391
5081	NC_012633	GAATT	2	10	201648	201657	40 %	40 %	20 %	0 %	229586391
5082	NC_012633	CGC	2	6	201693	201698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586391
5083	NC_012633	T	6	6	201791	201796	0 %	100 %	0 %	0 %	229586391
5084	NC_012633	GCT	2	6	201806	201811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586391
5085	NC_012633	TGA	2	6	201820	201825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586391
5086	NC_012633	TGAT	2	8	201898	201905	25 %	50 %	25 %	0 %	229586391
5087	NC_012633	AAT	2	6	202062	202067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586391
5088	NC_012633	ATTT	3	12	202089	202100	25 %	75 %	0 %	0 %	229586391
5089	NC_012633	TGC	2	6	202177	202182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586391
5090	NC_012633	TGC	2	6	202213	202218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586391
5091	NC_012633	TAC	2	6	202227	202232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586391
5092	NC_012633	A	6	6	202239	202244	100 %	0 %	0 %	0 %	229586391
5093	NC_012633	AT	3	6	202319	202324	50 %	50 %	0 %	0 %	229586391
5094	NC_012633	A	6	6	202334	202339	100 %	0 %	0 %	0 %	229586392
5095	NC_012633	CAG	2	6	202466	202471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586392
5096	NC_012633	TAAA	2	8	202514	202521	75 %	25 %	0 %	0 %	229586392
5097	NC_012633	ATA	2	6	202534	202539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586392
5098	NC_012633	TAA	2	6	202593	202598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586392
5099	NC_012633	ATT	2	6	202623	202628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586392
5100	NC_012633	ACG	2	6	202647	202652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586392
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5102	NC_012633	GAT	2	6	202693	202698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586392
5103	NC_012633	ATA	2	6	202717	202722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586392
5104	NC_012633	TCC	2	6	202735	202740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586392
5105	NC_012633	GAA	2	6	202843	202848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586392
5106	NC_012633	TAA	2	6	202870	202875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586392
5107	NC_012633	AGT	2	6	202939	202944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586392
5108	NC_012633	ATA	2	6	202969	202974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586392
5109	NC_012633	AAT	2	6	202983	202988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586392
5110	NC_012633	CAT	2	6	203109	203114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586392
5111	NC_012633	GCC	2	6	203271	203276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586392
5112	NC_012633	AGC	2	6	203292	203297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586392
5113	NC_012633	CTG	2	6	203318	203323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586392
5114	NC_012633	GAA	2	6	203338	203343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586392
5115	NC_012633	ATC	2	6	203367	203372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586392
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5119	NC_012633	GTTT	2	8	203795	203802	0 %	75 %	25 %	0 %	229586392
5120	NC_012633	ATT	2	6	203815	203820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586393
5121	NC_012633	CAA	2	6	203821	203826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586393
5122	NC_012633	CTT	2	6	203851	203856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586393
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5124	NC_012633	A	6	6	204038	204043	100 %	0 %	0 %	0 %	229586393
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5254	NC_012633	ATA	2	6	208520	208525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5380	NC_012633	ATT	2	6	213732	213737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586403
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