MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus opacus B4

Total Repeats: 206460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012522	CG	4	8	18610	18617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_012522	GCG	2	6	18684	18689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_012522	CGT	2	6	18722	18727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359437
504	NC_012522	CGG	2	6	18737	18742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359437
505	NC_012522	GCA	2	6	18785	18790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359437
506	NC_012522	GCG	2	6	18808	18813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359437
507	NC_012522	AGC	2	6	18892	18897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359437
508	NC_012522	GCC	2	6	18915	18920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359437
509	NC_012522	CCAG	2	8	18944	18951	25 %	0 %	25 %	50 %	226359437
510	NC_012522	TCG	2	6	18961	18966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359437
511	NC_012522	GCTCG	2	10	18968	18977	0 %	20 %	40 %	40 %	226359437
512	NC_012522	CGA	2	6	19043	19048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359437
513	NC_012522	CGA	2	6	19079	19084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359437
514	NC_012522	GCC	2	6	19095	19100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359437
515	NC_012522	CGG	2	6	19112	19117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359437
516	NC_012522	GAA	2	6	19119	19124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226359437
517	NC_012522	CGG	3	9	19214	19222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359437
518	NC_012522	CAC	2	6	19230	19235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226359437
519	NC_012522	TGG	2	6	19268	19273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359437
520	NC_012522	CCA	2	6	19299	19304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226359437
521	NC_012522	CGC	3	9	19308	19316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359437
522	NC_012522	GCA	2	6	19322	19327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359437
523	NC_012522	CGC	2	6	19371	19376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359437
524	NC_012522	AGGT	2	8	19399	19406	25 %	25 %	50 %	0 %	226359437
525	NC_012522	TCG	2	6	19417	19422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359437
526	NC_012522	AGA	2	6	19427	19432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226359437
527	NC_012522	TGACCG	2	12	19439	19450	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	226359437
528	NC_012522	GAG	2	6	19452	19457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226359437
529	NC_012522	GTC	2	6	19458	19463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359437
530	NC_012522	GAC	2	6	19464	19469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359437
531	NC_012522	CGGC	2	8	19499	19506	0 %	0 %	50 %	50 %	226359437
532	NC_012522	GTGC	2	8	19509	19516	0 %	25 %	50 %	25 %	226359437
533	NC_012522	CGGTGG	2	12	19553	19564	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	226359437
534	NC_012522	CGC	3	9	19586	19594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359437
535	NC_012522	CGA	2	6	19613	19618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359437
536	NC_012522	GCC	2	6	19641	19646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359437
537	NC_012522	CGA	2	6	19700	19705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359437
538	NC_012522	CGA	3	9	19727	19735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359437
539	NC_012522	AGA	3	9	19736	19744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226359437
540	NC_012522	CGG	2	6	19760	19765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359437
541	NC_012522	GGGC	2	8	19800	19807	0 %	0 %	75 %	25 %	226359437
542	NC_012522	GCG	2	6	19870	19875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359437
543	NC_012522	CCG	2	6	19900	19905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359437
544	NC_012522	CG	3	6	19936	19941	0 %	0 %	50 %	50 %	226359437
545	NC_012522	TCA	2	6	19994	19999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226359437
546	NC_012522	CACC	2	8	20018	20025	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
547	NC_012522	GA	3	6	20086	20091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012522	GCA	2	6	20111	20116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_012522	GTGTG	2	10	20139	20148	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012522	CGTT	2	8	20198	20205	0 %	50 %	25 %	25 %	226359438
551	NC_012522	GGT	2	6	20214	20219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359438
552	NC_012522	GCC	2	6	20232	20237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359438
553	NC_012522	GAA	2	6	20256	20261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226359438
554	NC_012522	GCC	2	6	20302	20307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359438
555	NC_012522	GCA	2	6	20329	20334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359438
556	NC_012522	ATC	2	6	20374	20379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226359438
557	NC_012522	TCG	2	6	20450	20455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359439
558	NC_012522	CGG	2	6	20466	20471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359439
559	NC_012522	CGG	2	6	20481	20486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359439
560	NC_012522	AGC	2	6	20498	20503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359439
561	NC_012522	CTC	2	6	20512	20517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226359439
562	NC_012522	CTC	2	6	20554	20559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226359439
563	NC_012522	GGT	2	6	20620	20625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359439
564	NC_012522	GAG	2	6	20647	20652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226359439
565	NC_012522	TCG	2	6	20663	20668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359439
566	NC_012522	CCG	2	6	20692	20697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359439
567	NC_012522	CAG	2	6	20704	20709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359439
568	NC_012522	CGTCGG	2	12	20718	20729	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	226359439
569	NC_012522	GCC	2	6	20743	20748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359439
570	NC_012522	TCG	2	6	20783	20788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359439
571	NC_012522	CTC	2	6	20891	20896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_012522	ATG	2	6	20920	20925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012522	GGA	2	6	20971	20976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226359440
574	NC_012522	CGA	2	6	20991	20996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
575	NC_012522	TGG	2	6	21027	21032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359440
576	NC_012522	GAA	2	6	21154	21159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226359440
577	NC_012522	CGC	2	6	21165	21170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359440
578	NC_012522	TCG	2	6	21194	21199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359440
579	NC_012522	CGA	2	6	21213	21218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
580	NC_012522	CGG	2	6	21239	21244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359440
581	NC_012522	CGA	2	6	21273	21278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
582	NC_012522	GGT	2	6	21337	21342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359440
583	NC_012522	CCGA	2	8	21401	21408	25 %	0 %	25 %	50 %	226359440
584	NC_012522	ATC	2	6	21416	21421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226359440
585	NC_012522	CGA	2	6	21426	21431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
586	NC_012522	GGC	2	6	21433	21438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359440
587	NC_012522	CGA	3	9	21471	21479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
588	NC_012522	CAG	2	6	21484	21489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
589	NC_012522	TGCGGG	2	12	21516	21527	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	226359440
590	NC_012522	ATC	2	6	21563	21568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226359440
591	NC_012522	GCC	2	6	21574	21579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359440
592	NC_012522	CCG	2	6	21584	21589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359440
593	NC_012522	GTC	2	6	21664	21669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359440
594	NC_012522	TCA	2	6	21684	21689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226359440
595	NC_012522	AGC	2	6	21698	21703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
596	NC_012522	GAT	2	6	21736	21741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226359440
597	NC_012522	TCG	2	6	21812	21817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359440
598	NC_012522	CGC	2	6	21853	21858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359440
599	NC_012522	AGC	2	6	21863	21868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
600	NC_012522	CCA	2	6	21876	21881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226359440
601	NC_012522	GCG	2	6	21882	21887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359440
602	NC_012522	CAC	2	6	21892	21897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226359440
603	NC_012522	GGT	2	6	21898	21903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359440
604	NC_012522	GCA	3	9	21912	21920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
605	NC_012522	CAG	2	6	21928	21933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
606	NC_012522	AAGATC	2	12	21998	22009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	226359440
607	NC_012522	GCA	2	6	22095	22100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
608	NC_012522	CGG	2	6	22116	22121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359440
609	NC_012522	ATC	2	6	22196	22201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226359440
610	NC_012522	GAC	2	6	22206	22211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
611	NC_012522	CGA	2	6	22215	22220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359440
612	NC_012522	AAC	2	6	22253	22258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226359440
613	NC_012522	GAT	2	6	22282	22287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226359440
614	NC_012522	ACC	2	6	22325	22330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226359440
615	NC_012522	GTG	2	6	22362	22367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359440
616	NC_012522	GGC	2	6	22375	22380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359440
617	NC_012522	GGC	2	6	22400	22405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359440
618	NC_012522	CA	3	6	22451	22456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_012522	CAC	2	6	22521	22526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_012522	GCA	2	6	22562	22567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_012522	CGGT	2	8	22629	22636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
622	NC_012522	CGGG	2	8	22654	22661	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
623	NC_012522	TCGG	2	8	22767	22774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
624	NC_012522	TCG	2	6	22785	22790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_012522	CGG	2	6	22844	22849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359441
626	NC_012522	CGG	2	6	22862	22867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359441
627	NC_012522	TCG	2	6	22909	22914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359441
628	NC_012522	CTG	2	6	23037	23042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359441
629	NC_012522	TCG	2	6	23053	23058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359441
630	NC_012522	TGGG	2	8	23064	23071	0 %	25 %	75 %	0 %	226359441
631	NC_012522	CGA	2	6	23083	23088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359441
632	NC_012522	TGC	2	6	23125	23130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359441
633	NC_012522	TGG	2	6	23131	23136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359441
634	NC_012522	GATCGC	2	12	23138	23149	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	226359441
635	NC_012522	GTC	2	6	23244	23249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359441
636	NC_012522	GCG	2	6	23250	23255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359441
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639	NC_012522	CGA	2	6	23290	23295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359441
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642	NC_012522	ATC	2	6	23457	23462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226359441
643	NC_012522	CGG	2	6	23474	23479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359441
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649	NC_012522	GGC	2	6	23560	23565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359441
650	NC_012522	TCG	2	6	23597	23602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_012522	GCG	2	6	23653	23658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359442
652	NC_012522	GTG	2	6	23662	23667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359442
653	NC_012522	CCG	2	6	23723	23728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359442
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698	NC_012522	CGG	2	6	25374	25379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359445
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722	NC_012522	CGT	2	6	26263	26268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
723	NC_012522	CTA	2	6	26416	26421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
724	NC_012522	A	6	6	26476	26481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
725	NC_012522	ATG	2	6	26506	26511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
726	NC_012522	GCCAC	2	10	26516	26525	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
727	NC_012522	ACC	2	6	26553	26558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
728	NC_012522	GCGCC	3	15	26567	26581	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
729	NC_012522	CGGG	2	8	26616	26623	0 %	0 %	75 %	25 %	226359446
730	NC_012522	TGC	2	6	26655	26660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359446
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742	NC_012522	AGA	2	6	27334	27339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226359446
743	NC_012522	GA	3	6	27583	27588	50 %	0 %	50 %	0 %	226359447
744	NC_012522	ATTTTG	2	12	27589	27600	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	226359447
745	NC_012522	GCA	2	6	27623	27628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359447
746	NC_012522	TCG	2	6	27663	27668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
747	NC_012522	GGCGC	2	10	27806	27815	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
748	NC_012522	GC	3	6	27884	27889	0 %	0 %	50 %	50 %	226359448
749	NC_012522	GCC	2	6	27907	27912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359448
750	NC_012522	AGC	3	9	27918	27926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359448
751	NC_012522	GAG	2	6	27935	27940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226359448
752	NC_012522	GTA	2	6	27962	27967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226359448
753	NC_012522	CAC	2	6	28079	28084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226359448
754	NC_012522	GGACCG	2	12	28090	28101	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	226359448
755	NC_012522	G	6	6	28111	28116	0 %	0 %	100 %	0 %	226359448
756	NC_012522	CAG	2	6	28160	28165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359448
757	NC_012522	TCG	2	6	28197	28202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226359448
758	NC_012522	GTG	2	6	28203	28208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359448
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761	NC_012522	ACG	2	6	28272	28277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359448
762	NC_012522	GCA	2	6	28309	28314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359448
763	NC_012522	GGC	2	6	28327	28332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359448
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766	NC_012522	CAG	3	9	28409	28417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359448
767	NC_012522	GCC	2	6	28552	28557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359448
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769	NC_012522	CGG	2	6	28588	28593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359448
770	NC_012522	ACG	2	6	28611	28616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359448
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772	NC_012522	GGT	2	6	28637	28642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359448
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782	NC_012522	CGC	3	9	28788	28796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359449
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786	NC_012522	CAG	2	6	28933	28938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359449
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788	NC_012522	TGTCGG	2	12	29052	29063	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	226359449
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797	NC_012522	GGT	2	6	29294	29299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226359450
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804	NC_012522	GTGGA	2	10	29465	29474	20 %	20 %	60 %	0 %	226359450
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845	NC_012522	GTG	2	6	30708	30713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
846	NC_012522	GCG	2	6	30765	30770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359451
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866	NC_012522	GCA	2	6	31222	31227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359451
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868	NC_012522	CGA	2	6	31333	31338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226359451
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873	NC_012522	TCC	2	6	31508	31513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
874	NC_012522	GCGCCC	2	12	31558	31569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359452
875	NC_012522	GGC	2	6	31581	31586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359452
876	NC_012522	GCG	2	6	31594	31599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226359452
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878	NC_012522	CGC	2	6	31616	31621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359452
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1000	NC_012522	CGC	2	6	36015	36020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226359457

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