MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131B

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011960	GC	3	6	77	82	0 %	0 %	50 %	50 %	221634493
2	NC_011960	GC	3	6	146	151	0 %	0 %	50 %	50 %	221634493
3	NC_011960	GC	4	8	207	214	0 %	0 %	50 %	50 %	221634493
4	NC_011960	GC	3	6	355	360	0 %	0 %	50 %	50 %	221634493
5	NC_011960	GC	3	6	446	451	0 %	0 %	50 %	50 %	221634493
6	NC_011960	CG	3	6	548	553	0 %	0 %	50 %	50 %	221634493
7	NC_011960	TC	3	6	624	629	0 %	50 %	0 %	50 %	221634493
8	NC_011960	GC	3	6	721	726	0 %	0 %	50 %	50 %	221634494
9	NC_011960	CG	3	6	838	843	0 %	0 %	50 %	50 %	221634494
10	NC_011960	CG	3	6	1159	1164	0 %	0 %	50 %	50 %	221634494
11	NC_011960	CG	3	6	1371	1376	0 %	0 %	50 %	50 %	221634494
12	NC_011960	CG	3	6	1771	1776	0 %	0 %	50 %	50 %	221634495
13	NC_011960	GC	3	6	2106	2111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011960	GC	3	6	2465	2470	0 %	0 %	50 %	50 %	221634496
15	NC_011960	GC	3	6	2948	2953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011960	CG	3	6	3084	3089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011960	GC	3	6	3163	3168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011960	GC	5	10	3204	3213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011960	GC	3	6	3235	3240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011960	TC	3	6	4453	4458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011960	GC	3	6	4599	4604	0 %	0 %	50 %	50 %	221634499
22	NC_011960	GC	3	6	4880	4885	0 %	0 %	50 %	50 %	221634499
23	NC_011960	GC	3	6	4904	4909	0 %	0 %	50 %	50 %	221634499
24	NC_011960	GC	3	6	5208	5213	0 %	0 %	50 %	50 %	221634499
25	NC_011960	CG	3	6	5273	5278	0 %	0 %	50 %	50 %	221634499
26	NC_011960	CG	3	6	5612	5617	0 %	0 %	50 %	50 %	221634500
27	NC_011960	CG	3	6	5948	5953	0 %	0 %	50 %	50 %	221634500
28	NC_011960	GC	3	6	6249	6254	0 %	0 %	50 %	50 %	221634500
29	NC_011960	GC	3	6	6333	6338	0 %	0 %	50 %	50 %	221634501
30	NC_011960	CG	3	6	6526	6531	0 %	0 %	50 %	50 %	221634501
31	NC_011960	CG	3	6	7224	7229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011960	GC	3	6	7230	7235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011960	CG	3	6	7310	7315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011960	GC	3	6	7358	7363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011960	CG	3	6	7446	7451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011960	CG	3	6	8073	8078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011960	GC	3	6	8194	8199	0 %	0 %	50 %	50 %	221634504
38	NC_011960	GC	3	6	8409	8414	0 %	0 %	50 %	50 %	221634504
39	NC_011960	CG	3	6	8418	8423	0 %	0 %	50 %	50 %	221634504
40	NC_011960	GC	3	6	8593	8598	0 %	0 %	50 %	50 %	221634504
41	NC_011960	CG	4	8	8833	8840	0 %	0 %	50 %	50 %	221634504
42	NC_011960	CG	3	6	8933	8938	0 %	0 %	50 %	50 %	221634504
43	NC_011960	CG	3	6	9485	9490	0 %	0 %	50 %	50 %	221634505
44	NC_011960	CG	4	8	9662	9669	0 %	0 %	50 %	50 %	221634505
45	NC_011960	AT	4	8	9797	9804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011960	CG	3	6	9834	9839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011960	GC	4	8	10106	10113	0 %	0 %	50 %	50 %	221634506
48	NC_011960	GC	3	6	10151	10156	0 %	0 %	50 %	50 %	221634506
49	NC_011960	CG	4	8	10213	10220	0 %	0 %	50 %	50 %	221634506
50	NC_011960	GC	4	8	10501	10508	0 %	0 %	50 %	50 %	221634506
51	NC_011960	GC	3	6	11441	11446	0 %	0 %	50 %	50 %	221634507
52	NC_011960	GC	3	6	11571	11576	0 %	0 %	50 %	50 %	221634508
53	NC_011960	GC	3	6	11720	11725	0 %	0 %	50 %	50 %	221634508
54	NC_011960	GC	3	6	11977	11982	0 %	0 %	50 %	50 %	221634508
55	NC_011960	CG	3	6	12197	12202	0 %	0 %	50 %	50 %	221634508
56	NC_011960	CG	3	6	13485	13490	0 %	0 %	50 %	50 %	221634509
57	NC_011960	CG	3	6	13985	13990	0 %	0 %	50 %	50 %	221634510
58	NC_011960	CG	3	6	14040	14045	0 %	0 %	50 %	50 %	221634510
59	NC_011960	CG	3	6	15527	15532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011960	GC	3	6	15667	15672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011960	CT	3	6	17483	17488	0 %	50 %	0 %	50 %	221634514
62	NC_011960	AT	3	6	18228	18233	50 %	50 %	0 %	0 %	221634514
63	NC_011960	CT	3	6	18336	18341	0 %	50 %	0 %	50 %	221634514
64	NC_011960	GC	3	6	18490	18495	0 %	0 %	50 %	50 %	221634514
65	NC_011960	CG	3	6	19059	19064	0 %	0 %	50 %	50 %	221634514
66	NC_011960	CA	3	6	19218	19223	50 %	0 %	0 %	50 %	221634515
67	NC_011960	GC	3	6	19858	19863	0 %	0 %	50 %	50 %	221634515
68	NC_011960	GC	3	6	21604	21609	0 %	0 %	50 %	50 %	221634516
69	NC_011960	CG	3	6	21990	21995	0 %	0 %	50 %	50 %	221634517
70	NC_011960	TA	3	6	23634	23639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011960	GC	4	8	23978	23985	0 %	0 %	50 %	50 %	221634519
72	NC_011960	GC	3	6	24282	24287	0 %	0 %	50 %	50 %	221634519
73	NC_011960	CG	3	6	25383	25388	0 %	0 %	50 %	50 %	221634520
74	NC_011960	CG	3	6	25702	25707	0 %	0 %	50 %	50 %	221634520
75	NC_011960	CG	3	6	25793	25798	0 %	0 %	50 %	50 %	221634520
76	NC_011960	CG	4	8	25958	25965	0 %	0 %	50 %	50 %	221634520
77	NC_011960	CG	3	6	26129	26134	0 %	0 %	50 %	50 %	221634521
78	NC_011960	GC	3	6	26542	26547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011960	CG	3	6	26761	26766	0 %	0 %	50 %	50 %	221634522
80	NC_011960	GC	3	6	26889	26894	0 %	0 %	50 %	50 %	221634522
81	NC_011960	GC	3	6	27659	27664	0 %	0 %	50 %	50 %	221634523
82	NC_011960	CG	3	6	27848	27853	0 %	0 %	50 %	50 %	221634523
83	NC_011960	GC	3	6	27914	27919	0 %	0 %	50 %	50 %	221634523
84	NC_011960	CG	3	6	28367	28372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011960	CG	3	6	28406	28411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011960	GC	3	6	28556	28561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011960	GC	3	6	29187	29192	0 %	0 %	50 %	50 %	221634524
88	NC_011960	GC	4	8	29794	29801	0 %	0 %	50 %	50 %	221634524
89	NC_011960	GC	3	6	30250	30255	0 %	0 %	50 %	50 %	221634525
90	NC_011960	GC	3	6	30533	30538	0 %	0 %	50 %	50 %	221634525
91	NC_011960	CG	3	6	30708	30713	0 %	0 %	50 %	50 %	221634525
92	NC_011960	GC	3	6	30722	30727	0 %	0 %	50 %	50 %	221634525
93	NC_011960	GC	3	6	30781	30786	0 %	0 %	50 %	50 %	221634525
94	NC_011960	GC	4	8	31808	31815	0 %	0 %	50 %	50 %	221634527
95	NC_011960	TA	3	6	32121	32126	50 %	50 %	0 %	0 %	221634527
96	NC_011960	GC	3	6	32715	32720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011960	GC	3	6	32836	32841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011960	GC	3	6	33498	33503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011960	CG	3	6	33863	33868	0 %	0 %	50 %	50 %	221634529
100	NC_011960	GA	3	6	34065	34070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011960	CG	3	6	34186	34191	0 %	0 %	50 %	50 %	221634530
102	NC_011960	GC	3	6	34356	34361	0 %	0 %	50 %	50 %	221634531
103	NC_011960	CT	3	6	35272	35277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011960	CG	3	6	36245	36250	0 %	0 %	50 %	50 %	221634533
105	NC_011960	GC	3	6	36321	36326	0 %	0 %	50 %	50 %	221634533
106	NC_011960	GC	3	6	36574	36579	0 %	0 %	50 %	50 %	221634533
107	NC_011960	CG	3	6	36776	36781	0 %	0 %	50 %	50 %	221634533
108	NC_011960	GC	3	6	36915	36920	0 %	0 %	50 %	50 %	221634533
109	NC_011960	AG	3	6	37649	37654	50 %	0 %	50 %	0 %	221634533
110	NC_011960	GC	3	6	38522	38527	0 %	0 %	50 %	50 %	221634533
111	NC_011960	GC	3	6	38668	38673	0 %	0 %	50 %	50 %	221634533
112	NC_011960	CG	3	6	38699	38704	0 %	0 %	50 %	50 %	221634533
113	NC_011960	GC	3	6	40564	40569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011960	GC	3	6	40580	40585	0 %	0 %	50 %	50 %	221634534
115	NC_011960	CG	4	8	41339	41346	0 %	0 %	50 %	50 %	221634535
116	NC_011960	CG	3	6	42589	42594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011960	GC	3	6	42961	42966	0 %	0 %	50 %	50 %	221634537
118	NC_011960	AT	3	6	43118	43123	50 %	50 %	0 %	0 %	221634538
119	NC_011960	CA	4	8	43362	43369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011960	CA	3	6	43378	43383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011960	AT	3	6	43727	43732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011960	CT	3	6	44075	44080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011960	CG	3	6	44321	44326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011960	TC	3	6	44330	44335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011960	AT	3	6	44387	44392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011960	CT	3	6	44845	44850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011960	GC	3	6	45460	45465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011960	GA	3	6	45469	45474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011960	GC	3	6	45554	45559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011960	AG	3	6	46391	46396	50 %	0 %	50 %	0 %	221634544
131	NC_011960	CG	4	8	46842	46849	0 %	0 %	50 %	50 %	221634545
132	NC_011960	CG	3	6	46871	46876	0 %	0 %	50 %	50 %	221634545
133	NC_011960	CG	3	6	46904	46909	0 %	0 %	50 %	50 %	221634545
134	NC_011960	GC	3	6	46996	47001	0 %	0 %	50 %	50 %	221634545
135	NC_011960	GC	3	6	47074	47079	0 %	0 %	50 %	50 %	221634545
136	NC_011960	CG	3	6	47092	47097	0 %	0 %	50 %	50 %	221634545
137	NC_011960	CG	4	8	47103	47110	0 %	0 %	50 %	50 %	221634545
138	NC_011960	GC	3	6	47206	47211	0 %	0 %	50 %	50 %	221634546
139	NC_011960	GC	3	6	47494	47499	0 %	0 %	50 %	50 %	221634546
140	NC_011960	GC	3	6	47668	47673	0 %	0 %	50 %	50 %	221634546
141	NC_011960	GC	3	6	47813	47818	0 %	0 %	50 %	50 %	221634546
142	NC_011960	CG	3	6	48185	48190	0 %	0 %	50 %	50 %	221634546
143	NC_011960	CG	3	6	48518	48523	0 %	0 %	50 %	50 %	221634547
144	NC_011960	CG	4	8	48701	48708	0 %	0 %	50 %	50 %	221634547
145	NC_011960	CG	3	6	48794	48799	0 %	0 %	50 %	50 %	221634547
146	NC_011960	CG	4	8	48845	48852	0 %	0 %	50 %	50 %	221634547
147	NC_011960	GC	3	6	49568	49573	0 %	0 %	50 %	50 %	221634549
148	NC_011960	CG	3	6	49955	49960	0 %	0 %	50 %	50 %	221634550
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.