MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011369	ACT	2	6	166545	166550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_011369	AG	3	6	166608	166613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011369	CCG	2	6	166616	166621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_011369	A	6	6	166625	166630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011369	CA	3	6	166663	166668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_011369	CGCT	2	8	166721	166728	0 %	25 %	25 %	50 %	209547777
4007	NC_011369	CCG	2	6	166733	166738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547777
4008	NC_011369	CGG	2	6	166872	166877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547777
4009	NC_011369	CAA	2	6	166956	166961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547777
4010	NC_011369	CGAAGC	2	12	166965	166976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547777
4011	NC_011369	GTC	3	9	167110	167118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547777
4012	NC_011369	TCG	2	6	167129	167134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547777
4013	NC_011369	AAG	2	6	167146	167151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547777
4014	NC_011369	GCT	2	6	167353	167358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547777
4015	NC_011369	CGC	2	6	167400	167405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547777
4016	NC_011369	CAA	2	6	167406	167411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547777
4017	NC_011369	CGGCGT	2	12	167415	167426	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209547777
4018	NC_011369	CCCG	2	8	167534	167541	0 %	0 %	25 %	75 %	209547777
4019	NC_011369	TTC	2	6	167545	167550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547777
4020	NC_011369	AAG	2	6	167557	167562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547777
4021	NC_011369	CTT	2	6	167604	167609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547777
4022	NC_011369	GAT	2	6	167622	167627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547777
4023	NC_011369	TCG	2	6	167645	167650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547777
4024	NC_011369	CGGCG	2	10	167737	167746	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4025	NC_011369	GC	3	6	167782	167787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_011369	TGC	2	6	167800	167805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_011369	ATTC	2	8	167814	167821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_011369	AGGC	2	8	167840	167847	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_011369	TGA	2	6	167848	167853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011369	CATC	2	8	167903	167910	25 %	25 %	0 %	50 %	209547778
4031	NC_011369	GCC	3	9	167938	167946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547778
4032	NC_011369	CG	3	6	167955	167960	0 %	0 %	50 %	50 %	209547778
4033	NC_011369	TCC	2	6	167992	167997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547778
4034	NC_011369	GCATT	2	10	167998	168007	20 %	40 %	20 %	20 %	209547778
4035	NC_011369	CGGC	2	8	168010	168017	0 %	0 %	50 %	50 %	209547778
4036	NC_011369	GCG	2	6	168034	168039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547778
4037	NC_011369	TTC	2	6	168050	168055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547778
4038	NC_011369	CAT	2	6	168099	168104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547778
4039	NC_011369	GAC	2	6	168133	168138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547778
4040	NC_011369	TGG	2	6	168182	168187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547778
4041	NC_011369	CGC	2	6	168231	168236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547778
4042	NC_011369	GCC	2	6	168253	168258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547778
4043	NC_011369	CGC	2	6	168324	168329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547778
4044	NC_011369	GCC	2	6	168359	168364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547778
4045	NC_011369	CGG	2	6	168374	168379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547778
4046	NC_011369	GC	3	6	168420	168425	0 %	0 %	50 %	50 %	209547778
4047	NC_011369	CGCGC	2	10	168429	168438	0 %	0 %	40 %	60 %	209547778
4048	NC_011369	CTG	2	6	168481	168486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547778
4049	NC_011369	TCG	2	6	168493	168498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547778
4050	NC_011369	GAC	2	6	168510	168515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547778
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4052	NC_011369	CTT	2	6	168555	168560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547778
4053	NC_011369	GCC	2	6	168562	168567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547778
4054	NC_011369	CGC	2	6	168573	168578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547778
4055	NC_011369	CTT	3	9	168582	168590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547778
4056	NC_011369	GCCGGC	2	12	168616	168627	0 %	0 %	50 %	50 %	209547778
4057	NC_011369	GCT	3	9	168660	168668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547778
4058	NC_011369	GCC	2	6	168727	168732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547778
4059	NC_011369	CGA	2	6	168809	168814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547778
4060	NC_011369	CTT	2	6	168825	168830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547778
4061	NC_011369	TTCA	2	8	168910	168917	25 %	50 %	0 %	25 %	209547778
4062	NC_011369	CCG	2	6	168935	168940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547778
4063	NC_011369	CAT	2	6	168954	168959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547778
4064	NC_011369	GAC	2	6	168988	168993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547778
4065	NC_011369	ATC	2	6	168994	168999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547778
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4067	NC_011369	TCG	2	6	169100	169105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547778
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4069	NC_011369	TGA	2	6	169115	169120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547778
4070	NC_011369	CG	3	6	169127	169132	0 %	0 %	50 %	50 %	209547778
4071	NC_011369	TCG	2	6	169151	169156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547778
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4082	NC_011369	CGC	2	6	169655	169660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547779
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4090	NC_011369	GTGCTG	2	12	170067	170078	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209547779
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4093	NC_011369	GAG	2	6	170115	170120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547779
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4103	NC_011369	CG	3	6	170311	170316	0 %	0 %	50 %	50 %	209547779
4104	NC_011369	GC	3	6	170324	170329	0 %	0 %	50 %	50 %	209547779
4105	NC_011369	GCC	2	6	170333	170338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547779
4106	NC_011369	GCA	2	6	170349	170354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547779
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4114	NC_011369	TCG	2	6	170593	170598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547779
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4119	NC_011369	TAC	2	6	170805	170810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547780
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4121	NC_011369	CGT	2	6	171005	171010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547780
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4366	NC_011369	TTG	2	6	182504	182509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547791
4367	NC_011369	CGTGA	2	10	182566	182575	20 %	20 %	40 %	20 %	209547791
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4374	NC_011369	GAG	2	6	183013	183018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547791
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4468	NC_011369	ATT	2	6	187207	187212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4470	NC_011369	CGGC	2	8	187240	187247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4471	NC_011369	GTC	3	9	187256	187264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4475	NC_011369	GC	3	6	187473	187478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4476	NC_011369	GAG	2	6	187487	187492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4479	NC_011369	GCC	2	6	187530	187535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4480	NC_011369	CCA	2	6	187567	187572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4481	NC_011369	CCG	2	6	187579	187584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4482	NC_011369	CAG	2	6	187748	187753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547795
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4489	NC_011369	CGGT	2	8	188160	188167	0 %	25 %	50 %	25 %	209547795
4490	NC_011369	GCC	2	6	188201	188206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547795
4491	NC_011369	TTGC	2	8	188252	188259	0 %	50 %	25 %	25 %	209547795
4492	NC_011369	GCC	2	6	188285	188290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547795
4493	NC_011369	TCG	2	6	188324	188329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547795
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4499	NC_011369	CGC	2	6	188577	188582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547796
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