MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011369	GCT	2	6	125885	125890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547744
3002	NC_011369	GCC	3	9	125892	125900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547744
3003	NC_011369	AGG	2	6	125929	125934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547744
3004	NC_011369	AAG	2	6	125958	125963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547744
3005	NC_011369	TGC	2	6	126033	126038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_011369	GAC	2	6	126081	126086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547745
3007	NC_011369	TGG	2	6	126116	126121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547745
3008	NC_011369	GCC	2	6	126160	126165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547745
3009	NC_011369	GCT	2	6	126222	126227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547745
3010	NC_011369	TTCC	2	8	126228	126235	0 %	50 %	0 %	50 %	209547745
3011	NC_011369	CGC	2	6	126264	126269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547745
3012	NC_011369	CGG	2	6	126318	126323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547745
3013	NC_011369	CCG	2	6	126329	126334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547745
3014	NC_011369	CGC	2	6	126345	126350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547745
3015	NC_011369	GCT	2	6	126351	126356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547745
3016	NC_011369	GAT	2	6	126378	126383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547745
3017	NC_011369	AGC	2	6	126395	126400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547745
3018	NC_011369	CG	3	6	126452	126457	0 %	0 %	50 %	50 %	209547745
3019	NC_011369	GAC	2	6	126477	126482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547745
3020	NC_011369	GC	3	6	126519	126524	0 %	0 %	50 %	50 %	209547745
3021	NC_011369	CGG	2	6	126528	126533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547745
3022	NC_011369	TCG	2	6	126536	126541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547745
3023	NC_011369	TTC	2	6	126559	126564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547745
3024	NC_011369	CAG	2	6	126580	126585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547745
3025	NC_011369	CGA	2	6	126669	126674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547745
3026	NC_011369	GAG	2	6	126685	126690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547745
3027	NC_011369	GGC	2	6	126736	126741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547745
3028	NC_011369	TGA	2	6	126791	126796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_011369	GAT	2	6	126824	126829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547746
3030	NC_011369	TGC	2	6	126834	126839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547746
3031	NC_011369	TGC	2	6	126859	126864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547746
3032	NC_011369	ACC	2	6	126873	126878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547746
3033	NC_011369	CGG	2	6	126908	126913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547746
3034	NC_011369	GCC	2	6	126943	126948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547746
3035	NC_011369	CTT	2	6	126965	126970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547746
3036	NC_011369	CGA	2	6	126983	126988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547746
3037	NC_011369	ATG	2	6	126990	126995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547746
3038	NC_011369	CGA	2	6	127069	127074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547746
3039	NC_011369	ACG	2	6	127120	127125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547746
3040	NC_011369	CGGC	2	8	127132	127139	0 %	0 %	50 %	50 %	209547746
3041	NC_011369	GAT	2	6	127142	127147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547746
3042	NC_011369	CCTG	2	8	127160	127167	0 %	25 %	25 %	50 %	209547746
3043	NC_011369	GAT	2	6	127176	127181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547746
3044	NC_011369	GCG	2	6	127228	127233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547746
3045	NC_011369	GCT	2	6	127247	127252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547746
3046	NC_011369	TCA	2	6	127309	127314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547746
3047	NC_011369	GGC	2	6	127352	127357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547746
3048	NC_011369	CGA	2	6	127382	127387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547746
3049	NC_011369	CGC	2	6	127430	127435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547746
3050	NC_011369	TCG	2	6	127462	127467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547746
3051	NC_011369	TCA	2	6	127468	127473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547746
3052	NC_011369	GTC	2	6	127545	127550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547746
3053	NC_011369	CTG	2	6	127614	127619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547746
3054	NC_011369	CGC	2	6	127634	127639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547746
3055	NC_011369	CGA	2	6	127643	127648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547746
3056	NC_011369	GCC	3	9	127686	127694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547746
3057	NC_011369	CG	4	8	127820	127827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_011369	CAGC	2	8	127956	127963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_011369	GCCC	2	8	127984	127991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3060	NC_011369	GATG	2	8	128020	128027	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_011369	CGAT	2	8	128029	128036	25 %	25 %	25 %	25 %	209547747
3062	NC_011369	CGT	2	6	128122	128127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547747
3063	NC_011369	CAT	3	9	128144	128152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547747
3064	NC_011369	CAG	2	6	128240	128245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547747
3065	NC_011369	GCG	2	6	128319	128324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547747
3066	NC_011369	CGA	2	6	128338	128343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547747
3067	NC_011369	GCG	2	6	128362	128367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547747
3068	NC_011369	TCG	2	6	128380	128385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547747
3069	NC_011369	GATC	2	8	128420	128427	25 %	25 %	25 %	25 %	209547747
3070	NC_011369	GCCT	2	8	128483	128490	0 %	25 %	25 %	50 %	209547747
3071	NC_011369	TCT	2	6	128503	128508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547747
3072	NC_011369	TGA	2	6	128596	128601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547747
3073	NC_011369	ATG	2	6	128628	128633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547747
3074	NC_011369	AAT	2	6	128641	128646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209547747
3075	NC_011369	GAT	2	6	128663	128668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547747
3076	NC_011369	TGC	2	6	128686	128691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547747
3077	NC_011369	TCT	2	6	128698	128703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547747
3078	NC_011369	GTT	2	6	128714	128719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547747
3079	NC_011369	TGC	2	6	128738	128743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547747
3080	NC_011369	CCCG	2	8	128791	128798	0 %	0 %	25 %	75 %	209547747
3081	NC_011369	GTC	2	6	128825	128830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547747
3082	NC_011369	CCTTC	2	10	128838	128847	0 %	40 %	0 %	60 %	209547747
3083	NC_011369	CGA	2	6	128893	128898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547747
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3085	NC_011369	CGGC	2	8	128959	128966	0 %	0 %	50 %	50 %	209547747
3086	NC_011369	AGAA	2	8	128982	128989	75 %	0 %	25 %	0 %	209547747
3087	NC_011369	TTC	2	6	129000	129005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547747
3088	NC_011369	CCG	2	6	129025	129030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547747
3089	NC_011369	GGT	2	6	129043	129048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547747
3090	NC_011369	ATA	2	6	129063	129068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209547747
3091	NC_011369	GCG	2	6	129085	129090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547747
3092	NC_011369	GAA	2	6	129104	129109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547747
3093	NC_011369	TTCC	2	8	129137	129144	0 %	50 %	0 %	50 %	209547747
3094	NC_011369	GTCGGT	2	12	129227	129238	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	209547747
3095	NC_011369	GGTC	2	8	129241	129248	0 %	25 %	50 %	25 %	209547747
3096	NC_011369	CTG	2	6	129272	129277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547747
3097	NC_011369	CGC	2	6	129304	129309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547747
3098	NC_011369	ACC	2	6	129322	129327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547747
3099	NC_011369	GCC	2	6	129338	129343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547747
3100	NC_011369	CTGC	2	8	129358	129365	0 %	25 %	25 %	50 %	209547747
3101	NC_011369	GCC	2	6	129380	129385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547747
3102	NC_011369	GCA	3	9	129387	129395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547747
3103	NC_011369	ACG	2	6	129432	129437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547747
3104	NC_011369	CGT	2	6	129530	129535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_011369	TTCT	2	8	129621	129628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_011369	AGA	2	6	129642	129647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_011369	ACG	2	6	129667	129672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_011369	GCG	2	6	129674	129679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_011369	GC	3	6	129686	129691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_011369	GGC	2	6	129863	129868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_011369	ACTT	2	8	129879	129886	25 %	50 %	0 %	25 %	209547748
3112	NC_011369	CGA	2	6	129923	129928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547748
3113	NC_011369	CGA	2	6	129958	129963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547748
3114	NC_011369	GCA	2	6	129967	129972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547748
3115	NC_011369	CGA	2	6	130045	130050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547748
3116	NC_011369	GGC	2	6	130078	130083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547748
3117	NC_011369	GTC	2	6	130178	130183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547748
3118	NC_011369	GCT	2	6	130201	130206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547748
3119	NC_011369	TCA	2	6	130234	130239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547748
3120	NC_011369	CAG	2	6	130271	130276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547748
3121	NC_011369	GGC	2	6	130313	130318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547748
3122	NC_011369	GAT	2	6	130337	130342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547748
3123	NC_011369	GATG	2	8	130354	130361	25 %	25 %	50 %	0 %	209547748
3124	NC_011369	GAC	2	6	130406	130411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547748
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3152	NC_011369	GCC	2	6	131574	131579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3153	NC_011369	A	6	6	131591	131596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_011369	TCA	2	6	131628	131633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3234	NC_011369	GCG	2	6	135213	135218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547751
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3238	NC_011369	GCA	2	6	135459	135464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547751
3239	NC_011369	ATA	2	6	135472	135477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209547751
3240	NC_011369	TGA	2	6	135504	135509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547751
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3242	NC_011369	TCG	2	6	135527	135532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547751
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3328	NC_011369	CGA	2	6	139281	139286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547755
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3352	NC_011369	CCA	2	6	140067	140072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547755
3353	NC_011369	ATCAA	2	10	140120	140129	60 %	20 %	0 %	20 %	209547755
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3355	NC_011369	GAGC	2	8	140196	140203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3356	NC_011369	ACT	2	6	140208	140213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547756
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3360	NC_011369	GTC	2	6	140419	140424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547756
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3362	NC_011369	TCG	2	6	140520	140525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547756
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3483	NC_011369	AGC	2	6	145243	145248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547760
3484	NC_011369	CGA	2	6	145253	145258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547760
3485	NC_011369	GGC	2	6	145260	145265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547760
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3491	NC_011369	CG	3	6	145459	145464	0 %	0 %	50 %	50 %	209547760
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