MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011369	GCT	2	6	41265	41270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547650
1002	NC_011369	CGA	2	6	41280	41285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547650
1003	NC_011369	GCCC	2	8	41349	41356	0 %	0 %	25 %	75 %	209547650
1004	NC_011369	GCC	2	6	41372	41377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547650
1005	NC_011369	GGC	2	6	41404	41409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547650
1006	NC_011369	TCC	2	6	41498	41503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547650
1007	NC_011369	CTT	2	6	41509	41514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547650
1008	NC_011369	TGA	2	6	41538	41543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547650
1009	NC_011369	CTTC	2	8	41565	41572	0 %	50 %	0 %	50 %	209547650
1010	NC_011369	GC	3	6	41654	41659	0 %	0 %	50 %	50 %	209547651
1011	NC_011369	CGC	2	6	41720	41725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547651
1012	NC_011369	CGG	2	6	41907	41912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547651
1013	NC_011369	GAT	2	6	41922	41927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547651
1014	NC_011369	CTT	2	6	42051	42056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547651
1015	NC_011369	GCG	2	6	42091	42096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547651
1016	NC_011369	CGGC	3	12	42147	42158	0 %	0 %	50 %	50 %	209547651
1017	NC_011369	TC	3	6	42278	42283	0 %	50 %	0 %	50 %	209547651
1018	NC_011369	CCT	2	6	42290	42295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547651
1019	NC_011369	TCG	2	6	42325	42330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547651
1020	NC_011369	GCC	2	6	42386	42391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547651
1021	NC_011369	GAT	2	6	42414	42419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547651
1022	NC_011369	CGC	2	6	42530	42535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547651
1023	NC_011369	TCA	2	6	42542	42547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547651
1024	NC_011369	GGCA	2	8	42564	42571	25 %	0 %	50 %	25 %	209547651
1025	NC_011369	CG	3	6	42581	42586	0 %	0 %	50 %	50 %	209547651
1026	NC_011369	CG	3	6	42610	42615	0 %	0 %	50 %	50 %	209547651
1027	NC_011369	CGG	2	6	42624	42629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547651
1028	NC_011369	CCGG	2	8	42630	42637	0 %	0 %	50 %	50 %	209547651
1029	NC_011369	TCT	3	9	42677	42685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547651
1030	NC_011369	CGGC	2	8	42690	42697	0 %	0 %	50 %	50 %	209547651
1031	NC_011369	TGTC	2	8	42728	42735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_011369	GC	3	6	42791	42796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_011369	AG	4	8	42854	42861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011369	AGC	2	6	42933	42938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_011369	GCG	2	6	42942	42947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_011369	GAA	2	6	43135	43140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547652
1037	NC_011369	CGC	2	6	43146	43151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547652
1038	NC_011369	GTC	2	6	43162	43167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547652
1039	NC_011369	CGA	2	6	43256	43261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547652
1040	NC_011369	CTG	2	6	43279	43284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547652
1041	NC_011369	GCT	2	6	43302	43307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547652
1042	NC_011369	GGT	2	6	43363	43368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547652
1043	NC_011369	GCC	2	6	43390	43395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547652
1044	NC_011369	GAA	2	6	43408	43413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547652
1045	NC_011369	GCG	2	6	43415	43420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547652
1046	NC_011369	ACC	2	6	43426	43431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547652
1047	NC_011369	CGG	2	6	43458	43463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547652
1048	NC_011369	GCC	2	6	43543	43548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547652
1049	NC_011369	GTC	2	6	43549	43554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547652
1050	NC_011369	GGC	2	6	43563	43568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547652
1051	NC_011369	GCC	2	6	43656	43661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547653
1052	NC_011369	GCGG	2	8	43662	43669	0 %	0 %	75 %	25 %	209547653
1053	NC_011369	CGC	2	6	43761	43766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547653
1054	NC_011369	GGCC	2	8	43838	43845	0 %	0 %	50 %	50 %	209547653
1055	NC_011369	GAT	2	6	43846	43851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547653
1056	NC_011369	GCT	2	6	43908	43913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547653
1057	NC_011369	GAA	2	6	43965	43970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547653
1058	NC_011369	CGG	2	6	43972	43977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547653
1059	NC_011369	GGC	2	6	44238	44243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547654
1060	NC_011369	GAA	2	6	44289	44294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547654
1061	NC_011369	CCGG	2	8	44324	44331	0 %	0 %	50 %	50 %	209547654
1062	NC_011369	AGA	2	6	44375	44380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547654
1063	NC_011369	GCA	2	6	44402	44407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547654
1064	NC_011369	TCT	2	6	44426	44431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547654
1065	NC_011369	GCC	2	6	44464	44469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_011369	GCG	2	6	44478	44483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011369	CGC	2	6	44581	44586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_011369	GGC	2	6	44588	44593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_011369	TCG	2	6	44613	44618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547655
1070	NC_011369	GAA	2	6	44663	44668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547655
1071	NC_011369	CGA	2	6	44686	44691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547655
1072	NC_011369	TCG	2	6	44808	44813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547655
1073	NC_011369	GAT	2	6	44845	44850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547655
1074	NC_011369	GC	3	6	44864	44869	0 %	0 %	50 %	50 %	209547655
1075	NC_011369	CAA	2	6	44872	44877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547655
1076	NC_011369	ATT	2	6	44917	44922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_011369	CGA	2	6	45177	45182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547656
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1085	NC_011369	TCG	2	6	45242	45247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547656
1086	NC_011369	CG	3	6	45246	45251	0 %	0 %	50 %	50 %	209547656
1087	NC_011369	CGA	2	6	45279	45284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547656
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1089	NC_011369	CCT	2	6	45330	45335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547656
1090	NC_011369	CGCT	2	8	45336	45343	0 %	25 %	25 %	50 %	209547656
1091	NC_011369	GCG	2	6	45372	45377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547656
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1095	NC_011369	GGC	2	6	45526	45531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547656
1096	NC_011369	GAC	2	6	45550	45555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547656
1097	NC_011369	CG	3	6	45574	45579	0 %	0 %	50 %	50 %	209547656
1098	NC_011369	CGC	2	6	45600	45605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547656
1099	NC_011369	GGT	2	6	45610	45615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547656
1100	NC_011369	GCC	2	6	45616	45621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547656
1101	NC_011369	GAG	2	6	45626	45631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547656
1102	NC_011369	CTT	2	6	45673	45678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547656
1103	NC_011369	TCG	2	6	45701	45706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547656
1104	NC_011369	AGGCC	2	10	45783	45792	20 %	0 %	40 %	40 %	209547656
1105	NC_011369	CGA	2	6	45816	45821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547656
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1107	NC_011369	GCC	2	6	45849	45854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547656
1108	NC_011369	GAT	2	6	45865	45870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547656
1109	NC_011369	CGGCAT	2	12	45904	45915	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_011369	GCC	2	6	45916	45921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_011369	GATC	2	8	45922	45929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_011369	GCG	2	6	45947	45952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_011369	TTG	2	6	45993	45998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011369	A	6	6	46002	46007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011369	TAA	2	6	46029	46034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011369	GGC	2	6	46054	46059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_011369	GAA	2	6	46121	46126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547657
1118	NC_011369	GCC	2	6	46137	46142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547657
1119	NC_011369	CCGG	2	8	46153	46160	0 %	0 %	50 %	50 %	209547657
1120	NC_011369	GTT	2	6	46178	46183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547657
1121	NC_011369	CCGC	2	8	46189	46196	0 %	0 %	25 %	75 %	209547657
1122	NC_011369	GCG	2	6	46199	46204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547657
1123	NC_011369	TGC	2	6	46216	46221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547657
1124	NC_011369	TCA	2	6	46234	46239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547657
1125	NC_011369	GCT	2	6	46245	46250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547657
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1127	NC_011369	GCCG	2	8	46353	46360	0 %	0 %	50 %	50 %	209547657
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1253	NC_011369	ACG	2	6	51230	51235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_011369	AAG	2	6	51238	51243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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