MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011369	GGCG	2	8	247794	247801	0 %	0 %	75 %	25 %	209547852
6002	NC_011369	AGA	2	6	247838	247843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547852
6003	NC_011369	ACA	2	6	247996	248001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547853
6004	NC_011369	GCC	3	9	248004	248012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547853
6005	NC_011369	GC	3	6	248034	248039	0 %	0 %	50 %	50 %	209547853
6006	NC_011369	TC	3	6	248114	248119	0 %	50 %	0 %	50 %	209547853
6007	NC_011369	GCTG	2	8	248122	248129	0 %	25 %	50 %	25 %	209547853
6008	NC_011369	CGA	3	9	248156	248164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547853
6009	NC_011369	A	6	6	248260	248265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_011369	CGCT	2	8	248310	248317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_011369	T	6	6	248346	248351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_011369	AGC	2	6	248400	248405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_011369	CAC	2	6	248449	248454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_011369	GCC	2	6	248540	248545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547854
6015	NC_011369	GCC	2	6	248581	248586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547854
6016	NC_011369	GCAT	2	8	248591	248598	25 %	25 %	25 %	25 %	209547854
6017	NC_011369	TCT	2	6	248629	248634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547854
6018	NC_011369	GTC	3	9	248787	248795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547854
6019	NC_011369	GCT	2	6	248884	248889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6020	NC_011369	ATA	2	6	248989	248994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209547855
6021	NC_011369	CGACC	2	10	249042	249051	20 %	0 %	20 %	60 %	209547855
6022	NC_011369	CAG	2	6	249055	249060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6023	NC_011369	CGC	2	6	249068	249073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547855
6024	NC_011369	GAA	2	6	249084	249089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547855
6025	NC_011369	TCC	2	6	249131	249136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547855
6026	NC_011369	AGA	2	6	249179	249184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547855
6027	NC_011369	CGA	2	6	249186	249191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6028	NC_011369	TG	3	6	249223	249228	0 %	50 %	50 %	0 %	209547855
6029	NC_011369	GTC	2	6	249289	249294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6030	NC_011369	GC	4	8	249425	249432	0 %	0 %	50 %	50 %	209547855
6031	NC_011369	CTG	2	6	249454	249459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6032	NC_011369	TC	3	6	249508	249513	0 %	50 %	0 %	50 %	209547855
6033	NC_011369	TTC	2	6	249550	249555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547855
6034	NC_011369	GCC	2	6	249584	249589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547855
6035	NC_011369	CGA	2	6	249606	249611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6036	NC_011369	T	6	6	249633	249638	0 %	100 %	0 %	0 %	209547855
6037	NC_011369	CGG	2	6	249671	249676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547855
6038	NC_011369	TCG	2	6	249752	249757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6039	NC_011369	CGC	2	6	249774	249779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547855
6040	NC_011369	GGCG	2	8	249798	249805	0 %	0 %	75 %	25 %	209547855
6041	NC_011369	CTTC	2	8	249809	249816	0 %	50 %	0 %	50 %	209547855
6042	NC_011369	GTC	2	6	249868	249873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6043	NC_011369	CCG	2	6	249928	249933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547855
6044	NC_011369	CGA	2	6	250047	250052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6045	NC_011369	CAG	2	6	250066	250071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6046	NC_011369	ACG	2	6	250085	250090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6047	NC_011369	GCG	2	6	250118	250123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547855
6048	NC_011369	CGG	2	6	250150	250155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547855
6049	NC_011369	GCTGTC	2	12	250172	250183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
6050	NC_011369	TCCC	2	8	250271	250278	0 %	25 %	0 %	75 %	209547856
6051	NC_011369	GGT	2	6	250297	250302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547856
6052	NC_011369	CGCT	2	8	250324	250331	0 %	25 %	25 %	50 %	209547856
6053	NC_011369	ATG	2	6	250363	250368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547856
6054	NC_011369	TTG	2	6	250375	250380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547856
6055	NC_011369	ACG	2	6	250417	250422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547856
6056	NC_011369	ATC	2	6	250500	250505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547856
6057	NC_011369	GCC	2	6	250534	250539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547856
6058	NC_011369	CGT	2	6	250634	250639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547856
6059	NC_011369	GCG	2	6	250657	250662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547856
6060	NC_011369	TTGCC	2	10	250667	250676	0 %	40 %	20 %	40 %	209547856
6061	NC_011369	TCC	2	6	250683	250688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547856
6062	NC_011369	GCCG	2	8	250694	250701	0 %	0 %	50 %	50 %	209547856
6063	NC_011369	CCG	2	6	250720	250725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547856
6064	NC_011369	C	6	6	250767	250772	0 %	0 %	0 %	100 %	209547856
6065	NC_011369	CCG	2	6	250801	250806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547856
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6067	NC_011369	ATG	2	6	250846	250851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547856
6068	NC_011369	TCCCGA	2	12	250869	250880	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209547856
6069	NC_011369	GCAAT	2	10	250894	250903	40 %	20 %	20 %	20 %	209547856
6070	NC_011369	GC	3	6	251076	251081	0 %	0 %	50 %	50 %	209547856
6071	NC_011369	AGC	2	6	251140	251145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547856
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6075	NC_011369	CAT	2	6	251211	251216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547856
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6079	NC_011369	CTC	2	6	251404	251409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547856
6080	NC_011369	GCG	2	6	251435	251440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547856
6081	NC_011369	CAG	3	9	251472	251480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547856
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6085	NC_011369	GCG	2	6	251611	251616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547856
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6087	NC_011369	CCAG	2	8	251708	251715	25 %	0 %	25 %	50 %	209547856
6088	NC_011369	CGACC	2	10	251760	251769	20 %	0 %	20 %	60 %	209547856
6089	NC_011369	GGCGAT	2	12	251775	251786	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209547856
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6092	NC_011369	GAA	2	6	251873	251878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547856
6093	NC_011369	CAA	2	6	251942	251947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547856
6094	NC_011369	GGT	2	6	251959	251964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547856
6095	NC_011369	GGT	2	6	251968	251973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547856
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6097	NC_011369	AAG	2	6	252023	252028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_011369	GCC	2	6	252047	252052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_011369	GTC	2	6	252076	252081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_011369	TGA	2	6	252128	252133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547857
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6102	NC_011369	CGA	2	6	252189	252194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547857
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6104	NC_011369	GCC	2	6	252225	252230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547857
6105	NC_011369	GCC	2	6	252234	252239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547857
6106	NC_011369	TGG	2	6	252254	252259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547857
6107	NC_011369	GTC	2	6	252298	252303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547857
6108	NC_011369	CGC	3	9	252326	252334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547857
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6110	NC_011369	GCC	2	6	252378	252383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547857
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6112	NC_011369	CTC	2	6	252671	252676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_011369	CGTG	2	8	252687	252694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_011369	T	6	6	252699	252704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_011369	GCG	2	6	252718	252723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_011369	GGA	2	6	252760	252765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_011369	GGC	2	6	252879	252884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_011369	GGC	2	6	253080	253085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_011369	CGC	2	6	253090	253095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_011369	CGC	2	6	253196	253201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547858
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6122	NC_011369	CAG	2	6	253319	253324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547858
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6248	NC_011369	CGT	2	6	259013	259018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547862
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6353	NC_011369	GC	3	6	263844	263849	0 %	0 %	50 %	50 %	209547867
6354	NC_011369	TCC	2	6	263878	263883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6355	NC_011369	A	7	7	263924	263930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6356	NC_011369	TGT	2	6	263947	263952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6357	NC_011369	TGC	2	6	264042	264047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6360	NC_011369	GGA	2	6	264153	264158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6361	NC_011369	CATT	2	8	264184	264191	25 %	50 %	0 %	25 %	209547868
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6489	NC_011369	TGG	2	6	268746	268751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547872
6490	NC_011369	GC	3	6	268798	268803	0 %	0 %	50 %	50 %	209547872
6491	NC_011369	CGG	2	6	268918	268923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547872
6492	NC_011369	CGAT	2	8	268950	268957	25 %	25 %	25 %	25 %	209547872
6493	NC_011369	CTCAAT	2	12	268964	268975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547872
6494	NC_011369	GTC	2	6	268982	268987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547872
6495	NC_011369	GTC	2	6	269045	269050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547872
6496	NC_011369	TCG	2	6	269102	269107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547872
6497	NC_011369	GCG	2	6	269140	269145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547872
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6500	NC_011369	ATC	2	6	269291	269296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547872

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