MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_011369	CCG	2	6	207493	207498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547817
5003	NC_011369	ACAT	2	8	207517	207524	50 %	25 %	0 %	25 %	209547817
5004	NC_011369	GAT	2	6	207531	207536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547817
5005	NC_011369	GC	3	6	207556	207561	0 %	0 %	50 %	50 %	209547817
5006	NC_011369	AGC	2	6	207562	207567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547817
5007	NC_011369	GCC	2	6	207603	207608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547817
5008	NC_011369	CGA	2	6	207678	207683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547817
5009	NC_011369	AGA	2	6	207737	207742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547817
5010	NC_011369	CAG	2	6	207744	207749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547817
5011	NC_011369	CCG	3	9	207766	207774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547817
5012	NC_011369	GCC	2	6	207805	207810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547817
5013	NC_011369	ATG	2	6	207823	207828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547817
5014	NC_011369	AGAT	2	8	207859	207866	50 %	25 %	25 %	0 %	209547817
5015	NC_011369	ATG	2	6	207885	207890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_011369	AGA	2	6	208005	208010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_011369	GGAT	2	8	208025	208032	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_011369	T	6	6	208052	208057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011369	CGGG	2	8	208070	208077	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5020	NC_011369	GCC	2	6	208110	208115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_011369	CCG	2	6	208185	208190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_011369	GCT	2	6	208273	208278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_011369	GGGT	2	8	208324	208331	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_011369	CCA	2	6	208380	208385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_011369	CCG	2	6	208410	208415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_011369	TTG	2	6	208447	208452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547818
5027	NC_011369	AGC	2	6	208459	208464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547818
5028	NC_011369	TTG	2	6	208591	208596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547818
5029	NC_011369	CTT	2	6	208623	208628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547818
5030	NC_011369	TGC	2	6	208691	208696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
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5032	NC_011369	GGCGCG	2	12	208734	208745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
5033	NC_011369	TCG	2	6	208780	208785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
5034	NC_011369	GGC	2	6	208818	208823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
5035	NC_011369	TTC	2	6	208845	208850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547818
5036	NC_011369	CCG	2	6	208856	208861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547818
5037	NC_011369	GGC	2	6	208926	208931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
5038	NC_011369	GCC	2	6	208948	208953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547818
5039	NC_011369	CTG	2	6	208965	208970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
5040	NC_011369	GC	3	6	208976	208981	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
5041	NC_011369	CGC	2	6	209034	209039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547818
5042	NC_011369	CTTGGC	2	12	209055	209066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
5043	NC_011369	TGC	2	6	209102	209107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
5044	NC_011369	CG	3	6	209212	209217	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
5045	NC_011369	CAGCGC	2	12	209229	209240	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209547818
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5048	NC_011369	GCA	2	6	209359	209364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547818
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5051	NC_011369	GCG	2	6	209411	209416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
5052	NC_011369	GAT	2	6	209429	209434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547818
5053	NC_011369	CGG	2	6	209445	209450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
5054	NC_011369	GCT	2	6	209452	209457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
5055	NC_011369	GCCG	2	8	209475	209482	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
5056	NC_011369	CGGC	2	8	209603	209610	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
5057	NC_011369	GCG	2	6	209615	209620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
5058	NC_011369	CGC	2	6	209627	209632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547818
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5062	NC_011369	TGCC	2	8	209732	209739	0 %	25 %	25 %	50 %	209547818
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5113	NC_011369	TCA	2	6	211181	211186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547818
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5122	NC_011369	CG	3	6	211571	211576	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
5123	NC_011369	AGCG	2	8	211591	211598	25 %	0 %	50 %	25 %	209547818
5124	NC_011369	CTC	2	6	211602	211607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547818
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5127	NC_011369	GTC	2	6	211701	211706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
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5132	NC_011369	CGGC	2	8	211948	211955	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
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5139	NC_011369	T	6	6	212456	212461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_011369	GGC	2	6	212489	212494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_011369	GGT	2	6	212526	212531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5145	NC_011369	GTC	2	6	212764	212769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547819
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5151	NC_011369	GCC	2	6	212974	212979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5152	NC_011369	GGC	2	6	212980	212985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5222	NC_011369	CTG	2	6	215780	215785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547822
5223	NC_011369	GAC	2	6	215825	215830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547822
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5225	NC_011369	TGA	2	6	215889	215894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547822
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5229	NC_011369	TCG	2	6	216042	216047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547822
5230	NC_011369	GCCGC	2	10	216072	216081	0 %	0 %	40 %	60 %	209547822
5231	NC_011369	GAG	2	6	216116	216121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547822
5232	NC_011369	CGA	2	6	216130	216135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547822
5233	NC_011369	CTT	2	6	216145	216150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547822
5234	NC_011369	GAA	2	6	216163	216168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547822
5235	NC_011369	ACG	2	6	216177	216182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547822
5236	NC_011369	GCCGGC	2	12	216236	216247	0 %	0 %	50 %	50 %	209547822
5237	NC_011369	CGAC	2	8	216249	216256	25 %	0 %	25 %	50 %	209547822
5238	NC_011369	TCG	2	6	216276	216281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547822
5239	NC_011369	GCC	2	6	216314	216319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547822
5240	NC_011369	TTC	2	6	216389	216394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547822
5241	NC_011369	CAT	2	6	216403	216408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547822
5242	NC_011369	GAT	2	6	216457	216462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547822
5243	NC_011369	CGA	2	6	216548	216553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5244	NC_011369	CG	3	6	216567	216572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5245	NC_011369	GC	3	6	216597	216602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5246	NC_011369	GCC	2	6	216663	216668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5247	NC_011369	GCC	2	6	216671	216676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5248	NC_011369	CGC	2	6	216725	216730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547823
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5370	NC_011369	CCG	2	6	221797	221802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547827
5371	NC_011369	TGC	2	6	221829	221834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547827
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5373	NC_011369	CGC	2	6	221944	221949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547827
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5378	NC_011369	TGT	2	6	222117	222122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5379	NC_011369	ACA	2	6	222147	222152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5402	NC_011369	AAT	2	6	223148	223153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209547829
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5478	NC_011369	GCC	2	6	225837	225842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547831
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5484	NC_011369	CAG	2	6	226010	226015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547831
5485	NC_011369	ATG	2	6	226047	226052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547831
5486	NC_011369	AGC	3	9	226113	226121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547831
5487	NC_011369	GGCCGA	2	12	226199	226210	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209547831
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5491	NC_011369	TGC	2	6	226291	226296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547831
5492	NC_011369	GGT	2	6	226298	226303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547831
5493	NC_011369	GCC	2	6	226454	226459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547831
5494	NC_011369	GCC	2	6	226485	226490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547831
5495	NC_011369	AGC	2	6	226491	226496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547831
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5500	NC_011369	CGAG	2	8	226657	226664	25 %	0 %	50 %	25 %	209547831

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