MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG201

Total Repeats: 928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011368	GCGCC	2	10	472	481	0 %	0 %	40 %	60 %	209546451
2	NC_011368	CAGGG	2	10	517	526	20 %	0 %	60 %	20 %	209546451
3	NC_011368	TGCGG	2	10	6769	6778	0 %	20 %	60 %	20 %	209546456
4	NC_011368	AAGGC	2	10	6900	6909	40 %	0 %	40 %	20 %	209546457
5	NC_011368	TCGCG	2	10	7066	7075	0 %	20 %	40 %	40 %	209546457
6	NC_011368	GGCAG	2	10	8032	8041	20 %	0 %	60 %	20 %	209546457
7	NC_011368	GTTCT	2	10	8379	8388	0 %	60 %	20 %	20 %	209546457
8	NC_011368	GCTGT	2	10	9681	9690	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011368	GGCGA	2	10	9954	9963	20 %	0 %	60 %	20 %	209546459
10	NC_011368	AGCCG	2	10	10852	10861	20 %	0 %	40 %	40 %	209546461
11	NC_011368	AGCGC	2	10	11125	11134	20 %	0 %	40 %	40 %	209546461
12	NC_011368	GCGCA	2	10	11138	11147	20 %	0 %	40 %	40 %	209546461
13	NC_011368	GCCAC	2	10	13189	13198	20 %	0 %	20 %	60 %	209546463
14	NC_011368	GCGCG	2	10	13967	13976	0 %	0 %	60 %	40 %	209546464
15	NC_011368	ATCGC	2	10	14241	14250	20 %	20 %	20 %	40 %	209546464
16	NC_011368	CTCGC	2	10	17361	17370	0 %	20 %	20 %	60 %	209546467
17	NC_011368	CGACG	2	10	18410	18419	20 %	0 %	40 %	40 %	209546468
18	NC_011368	GGAAA	2	10	19752	19761	60 %	0 %	40 %	0 %	209546469
19	NC_011368	TCGCC	2	10	22022	22031	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_011368	TGCAT	2	10	22334	22343	20 %	40 %	20 %	20 %	209546471
21	NC_011368	GCGCC	2	10	25471	25480	0 %	0 %	40 %	60 %	209546474
22	NC_011368	GCATC	2	10	27623	27632	20 %	20 %	20 %	40 %	209546476
23	NC_011368	GATCA	2	10	27999	28008	40 %	20 %	20 %	20 %	209546476
24	NC_011368	CGGAT	2	10	30524	30533	20 %	20 %	40 %	20 %	209546479
25	NC_011368	GAGCG	2	10	31841	31850	20 %	0 %	60 %	20 %	209546481
26	NC_011368	CGAGC	2	10	32502	32511	20 %	0 %	40 %	40 %	209546481
27	NC_011368	TTGCC	2	10	33997	34006	0 %	40 %	20 %	40 %	209546483
28	NC_011368	GCAAG	2	10	35833	35842	40 %	0 %	40 %	20 %	209546485
29	NC_011368	GCGCT	2	10	36347	36356	0 %	20 %	40 %	40 %	209546486
30	NC_011368	CGGGC	2	10	37982	37991	0 %	0 %	60 %	40 %	209546488
31	NC_011368	AGGGC	2	10	38203	38212	20 %	0 %	60 %	20 %	209546488
32	NC_011368	CGTAG	2	10	38326	38335	20 %	20 %	40 %	20 %	209546488
33	NC_011368	TCGCG	2	10	38955	38964	0 %	20 %	40 %	40 %	209546488
34	NC_011368	ACGGC	2	10	41300	41309	20 %	0 %	40 %	40 %	209546490
35	NC_011368	CGATG	2	10	41384	41393	20 %	20 %	40 %	20 %	209546490
36	NC_011368	TCCTT	2	10	42816	42825	0 %	60 %	0 %	40 %	209546492
37	NC_011368	GCCGC	2	10	43755	43764	0 %	0 %	40 %	60 %	209546492
38	NC_011368	CGGCG	2	10	44414	44423	0 %	0 %	60 %	40 %	209546493
39	NC_011368	TGAAT	2	10	45899	45908	40 %	40 %	20 %	0 %	209546494
40	NC_011368	GCTCA	2	10	46210	46219	20 %	20 %	20 %	40 %	209546495
41	NC_011368	GTTTC	2	10	48344	48353	0 %	60 %	20 %	20 %	209546496
42	NC_011368	GTTCC	2	10	52846	52855	0 %	40 %	20 %	40 %	209546499
43	NC_011368	TGGAA	2	10	53926	53935	40 %	20 %	40 %	0 %	209546500
44	NC_011368	CGAGG	2	10	54055	54064	20 %	0 %	60 %	20 %	209546500
45	NC_011368	ACAAA	2	10	55693	55702	80 %	0 %	0 %	20 %	209546502
46	NC_011368	CCGGG	2	10	56890	56899	0 %	0 %	60 %	40 %	209546503
47	NC_011368	GCGCA	2	10	59610	59619	20 %	0 %	40 %	40 %	209546506
48	NC_011368	CGGCT	2	10	60127	60136	0 %	20 %	40 %	40 %	209546506
49	NC_011368	TTGCG	2	10	61296	61305	0 %	40 %	40 %	20 %	209546507
50	NC_011368	CGCGA	2	10	61875	61884	20 %	0 %	40 %	40 %	209546508
51	NC_011368	GACCG	2	10	64369	64378	20 %	0 %	40 %	40 %	209546510
52	NC_011368	GCTCG	2	10	64747	64756	0 %	20 %	40 %	40 %	209546510
53	NC_011368	GCCTT	2	10	67346	67355	0 %	40 %	20 %	40 %	209546512
54	NC_011368	TCCAC	2	10	68389	68398	20 %	20 %	0 %	60 %	209546513
55	NC_011368	TCGGT	2	10	68659	68668	0 %	40 %	40 %	20 %	209546513
56	NC_011368	GCGCC	2	10	68840	68849	0 %	0 %	40 %	60 %	209546513
57	NC_011368	GCGCC	2	10	69232	69241	0 %	0 %	40 %	60 %	209546514
58	NC_011368	TCGCC	2	10	72903	72912	0 %	20 %	20 %	60 %	209546517
59	NC_011368	GAGCT	2	10	73697	73706	20 %	20 %	40 %	20 %	209546518
60	NC_011368	GCGCG	2	10	76738	76747	0 %	0 %	60 %	40 %	209546521
61	NC_011368	GTCGT	2	10	77426	77435	0 %	40 %	40 %	20 %	209546521
62	NC_011368	GCCAG	2	10	80314	80323	20 %	0 %	40 %	40 %	209546524
63	NC_011368	GCCGG	2	10	80872	80881	0 %	0 %	60 %	40 %	209546525
64	NC_011368	CCGGC	2	10	81627	81636	0 %	0 %	40 %	60 %	209546526
65	NC_011368	CGGTG	2	10	84772	84781	0 %	20 %	60 %	20 %	209546530
66	NC_011368	GGTCC	2	10	88274	88283	0 %	20 %	40 %	40 %	209546534
67	NC_011368	CAGAC	2	10	89912	89921	40 %	0 %	20 %	40 %	209546535
68	NC_011368	GGGCC	2	10	89999	90008	0 %	0 %	60 %	40 %	209546535
69	NC_011368	GCCGG	2	10	90078	90087	0 %	0 %	60 %	40 %	209546535
70	NC_011368	CTTCG	2	10	93029	93038	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_011368	GCATA	2	10	93208	93217	40 %	20 %	20 %	20 %	209546538
72	NC_011368	ATCCG	2	10	93496	93505	20 %	20 %	20 %	40 %	209546539
73	NC_011368	TGGCA	2	10	96801	96810	20 %	20 %	40 %	20 %	209546542
74	NC_011368	CGCCT	2	10	98357	98366	0 %	20 %	20 %	60 %	209546544
75	NC_011368	GTGCC	2	10	99180	99189	0 %	20 %	40 %	40 %	209546544
76	NC_011368	CGATG	2	10	100245	100254	20 %	20 %	40 %	20 %	209546545
77	NC_011368	GCGCA	2	10	102205	102214	20 %	0 %	40 %	40 %	209546547
78	NC_011368	TGCAC	2	10	103237	103246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011368	CGATC	2	10	105361	105370	20 %	20 %	20 %	40 %	209546549
80	NC_011368	GTCCC	2	10	106537	106546	0 %	20 %	20 %	60 %	209546550
81	NC_011368	TGCAT	2	10	107644	107653	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011368	GCCGA	2	10	108941	108950	20 %	0 %	40 %	40 %	209546553
83	NC_011368	AGGCG	2	10	111452	111461	20 %	0 %	60 %	20 %	209546556
84	NC_011368	CGTGC	2	10	113015	113024	0 %	20 %	40 %	40 %	209546557
85	NC_011368	CGGCA	2	10	113625	113634	20 %	0 %	40 %	40 %	209546558
86	NC_011368	TTGCC	2	10	114634	114643	0 %	40 %	20 %	40 %	209546560
87	NC_011368	TCACG	2	10	115870	115879	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_011368	ATCGC	2	10	115897	115906	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011368	TCCGC	2	10	117782	117791	0 %	20 %	20 %	60 %	209546562
90	NC_011368	GCAAG	2	10	117971	117980	40 %	0 %	40 %	20 %	209546562
91	NC_011368	CGTCG	2	10	118167	118176	0 %	20 %	40 %	40 %	209546562
92	NC_011368	GGTAT	2	10	119146	119155	20 %	40 %	40 %	0 %	209546563
93	NC_011368	GCGAT	2	10	125172	125181	20 %	20 %	40 %	20 %	209546569
94	NC_011368	GGCGA	2	10	127516	127525	20 %	0 %	60 %	20 %	209546571
95	NC_011368	GCCCT	2	10	128587	128596	0 %	20 %	20 %	60 %	209546572
96	NC_011368	GAAGC	2	10	131776	131785	40 %	0 %	40 %	20 %	209546574
97	NC_011368	TCGAT	2	10	132633	132642	20 %	40 %	20 %	20 %	209546575
98	NC_011368	CGACA	2	10	134908	134917	40 %	0 %	20 %	40 %	209546577
99	NC_011368	GAAGC	2	10	138155	138164	40 %	0 %	40 %	20 %	209546580
100	NC_011368	GGCGA	2	10	140471	140480	20 %	0 %	60 %	20 %	209546581
101	NC_011368	CGGCA	2	10	140737	140746	20 %	0 %	40 %	40 %	209546581
102	NC_011368	TGCGC	2	10	140884	140893	0 %	20 %	40 %	40 %	209546581
103	NC_011368	ACGGC	2	10	140946	140955	20 %	0 %	40 %	40 %	209546581
104	NC_011368	GCCGA	2	10	141722	141731	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_011368	GCAAG	2	10	142170	142179	40 %	0 %	40 %	20 %	209546582
106	NC_011368	TGGCA	2	10	143977	143986	20 %	20 %	40 %	20 %	209546584
107	NC_011368	CCTTC	2	10	145793	145802	0 %	40 %	0 %	60 %	209546585
108	NC_011368	GCGAT	2	10	146181	146190	20 %	20 %	40 %	20 %	209546585
109	NC_011368	GTGCG	2	10	150403	150412	0 %	20 %	60 %	20 %	209546589
110	NC_011368	GGCCA	2	10	155163	155172	20 %	0 %	40 %	40 %	209546594
111	NC_011368	CGATG	2	10	155336	155345	20 %	20 %	40 %	20 %	209546594
112	NC_011368	AGCGC	2	10	156245	156254	20 %	0 %	40 %	40 %	209546595
113	NC_011368	AAGAT	2	10	156401	156410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011368	TCGGT	2	10	156901	156910	0 %	40 %	40 %	20 %	209546596
115	NC_011368	CATTC	2	10	157672	157681	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_011368	TGCGC	2	10	158256	158265	0 %	20 %	40 %	40 %	209546597
117	NC_011368	GGTCT	2	10	158524	158533	0 %	40 %	40 %	20 %	209546597
118	NC_011368	CCCCT	2	10	160340	160349	0 %	20 %	0 %	80 %	209546599
119	NC_011368	CGATG	2	10	160497	160506	20 %	20 %	40 %	20 %	209546599
120	NC_011368	TCGAA	2	10	163097	163106	40 %	20 %	20 %	20 %	209546601
121	NC_011368	GCCGT	2	10	167567	167576	0 %	20 %	40 %	40 %	209546603
122	NC_011368	GTCCA	2	10	170635	170644	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011368	CACCG	2	10	171120	171129	20 %	0 %	20 %	60 %	209546608
124	NC_011368	CTCCG	2	10	174501	174510	0 %	20 %	20 %	60 %	209546612
125	NC_011368	TCGGA	2	10	175823	175832	20 %	20 %	40 %	20 %	209546614
126	NC_011368	GATCG	2	10	175998	176007	20 %	20 %	40 %	20 %	209546614
127	NC_011368	TGTCC	2	10	177766	177775	0 %	40 %	20 %	40 %	209546616
128	NC_011368	GCATC	2	10	177961	177970	20 %	20 %	20 %	40 %	209546616
129	NC_011368	AGCGG	2	10	178026	178035	20 %	0 %	60 %	20 %	209546616
130	NC_011368	TTGCC	2	10	178741	178750	0 %	40 %	20 %	40 %	209546617
131	NC_011368	CACCT	2	10	178760	178769	20 %	20 %	0 %	60 %	209546617
132	NC_011368	GCGCC	2	10	179377	179386	0 %	0 %	40 %	60 %	209546618
133	NC_011368	GGATC	2	10	180482	180491	20 %	20 %	40 %	20 %	209546619
134	NC_011368	GGCCG	2	10	183274	183283	0 %	0 %	60 %	40 %	209546621
135	NC_011368	CTGAA	2	10	184020	184029	40 %	20 %	20 %	20 %	209546622
136	NC_011368	GCGAA	2	10	184216	184225	40 %	0 %	40 %	20 %	209546622
137	NC_011368	CGCAG	2	10	184249	184258	20 %	0 %	40 %	40 %	209546622
138	NC_011368	AGGTC	2	10	185359	185368	20 %	20 %	40 %	20 %	209546624
139	NC_011368	GCGTC	2	10	187529	187538	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_011368	CGCGT	2	10	187543	187552	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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149	NC_011368	CTGGC	2	10	196924	196933	0 %	20 %	40 %	40 %	209546638
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156	NC_011368	CGGCG	2	10	208122	208131	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
157	NC_011368	GGCCG	2	10	208875	208884	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
158	NC_011368	GCAGA	2	10	211492	211501	40 %	0 %	40 %	20 %	209546651
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165	NC_011368	TGCCC	2	10	225319	225328	0 %	20 %	20 %	60 %	209546667
166	NC_011368	GCAGC	2	10	228151	228160	20 %	0 %	40 %	40 %	209546670
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168	NC_011368	CGCGG	2	10	231913	231922	0 %	0 %	60 %	40 %	209546674
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170	NC_011368	GACCT	2	10	233927	233936	20 %	20 %	20 %	40 %	209546675
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173	NC_011368	GCCGT	2	10	236955	236964	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
174	NC_011368	ACCTC	2	10	237710	237719	20 %	20 %	0 %	60 %	209546678
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233	NC_011368	GGCGG	2	10	313728	313737	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
234	NC_011368	TCGGC	2	10	316238	316247	0 %	20 %	40 %	40 %	209546751
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248	NC_011368	TGCCC	2	10	327382	327391	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
249	NC_011368	TTGAC	2	10	329137	329146	20 %	40 %	20 %	20 %	209546761
250	NC_011368	AGGGG	2	10	331117	331126	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
251	NC_011368	AAGGC	2	10	335285	335294	40 %	0 %	40 %	20 %	209546767
252	NC_011368	CAGGG	2	10	336092	336101	20 %	0 %	60 %	20 %	209546767
253	NC_011368	TTTGA	2	10	337811	337820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_011368	GCTGA	2	10	339116	339125	20 %	20 %	40 %	20 %	209546769
255	NC_011368	TGACG	2	10	340029	340038	20 %	20 %	40 %	20 %	209546770
256	NC_011368	GTTCA	2	10	340501	340510	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
257	NC_011368	CGTCA	2	10	341412	341421	20 %	20 %	20 %	40 %	209546772
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259	NC_011368	TCATA	2	10	344381	344390	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
260	NC_011368	GAAGA	2	10	344967	344976	60 %	0 %	40 %	0 %	209546776
261	NC_011368	CGATG	2	10	344987	344996	20 %	20 %	40 %	20 %	209546776
262	NC_011368	ATCAA	2	10	346339	346348	60 %	20 %	0 %	20 %	209546778
263	NC_011368	GACCA	2	10	350298	350307	40 %	0 %	20 %	40 %	209546781
264	NC_011368	GGCCC	2	10	350869	350878	0 %	0 %	40 %	60 %	209546782
265	NC_011368	GCTTC	2	10	350978	350987	0 %	40 %	20 %	40 %	209546782
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267	NC_011368	CGGCG	2	10	351784	351793	0 %	0 %	60 %	40 %	209546783
268	NC_011368	CGCCA	2	10	353190	353199	20 %	0 %	20 %	60 %	209546786
269	NC_011368	CGCAT	2	10	354271	354280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_011368	GAACC	2	10	372116	372125	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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303	NC_011368	ACGTC	2	10	396831	396840	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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394	NC_011368	CGGGA	2	10	532462	532471	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
395	NC_011368	GGCGA	2	10	534641	534650	20 %	0 %	60 %	20 %	209546953
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