MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG201

Total Repeats: 20846

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011368	CGA	3	9	145	153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546451
2	NC_011368	GAC	2	6	163	168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546451
3	NC_011368	GAA	2	6	191	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546451
4	NC_011368	CGT	2	6	205	210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546451
5	NC_011368	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546451
6	NC_011368	ATC	2	6	266	271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546451
7	NC_011368	CAT	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546451
8	NC_011368	CGA	2	6	409	414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546451
9	NC_011368	GGC	2	6	448	453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546451
10	NC_011368	CGG	2	6	489	494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546451
11	NC_011368	GCA	2	6	546	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546451
12	NC_011368	GCG	2	6	567	572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546451
13	NC_011368	CAG	2	6	718	723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546451
14	NC_011368	TTC	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546452
15	NC_011368	ATC	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546452
16	NC_011368	TCA	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546452
17	NC_011368	GCG	2	6	939	944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546452
18	NC_011368	GGT	2	6	948	953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546452
19	NC_011368	CGC	2	6	996	1001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546452
20	NC_011368	GAA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546452
21	NC_011368	ACC	2	6	1099	1104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546452
22	NC_011368	CGT	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546452
23	NC_011368	GCC	2	6	1384	1389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546452
24	NC_011368	GCA	2	6	1413	1418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546452
25	NC_011368	ACG	2	6	1430	1435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546452
26	NC_011368	CGG	2	6	1595	1600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546452
27	NC_011368	GCT	2	6	1644	1649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546452
28	NC_011368	ACG	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546452
29	NC_011368	CGT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546452
30	NC_011368	CGG	2	6	2031	2036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546452
31	NC_011368	GGC	2	6	2063	2068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546452
32	NC_011368	ATC	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546453
33	NC_011368	CGC	2	6	2260	2265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546453
34	NC_011368	CTG	2	6	2282	2287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
35	NC_011368	GAA	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546453
36	NC_011368	GTG	2	6	2392	2397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546453
37	NC_011368	TGG	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546453
38	NC_011368	CAC	2	6	2587	2592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546453
39	NC_011368	CAC	2	6	2599	2604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546453
40	NC_011368	ACG	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546453
41	NC_011368	GCT	2	6	2638	2643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
42	NC_011368	TTC	2	6	2648	2653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546453
43	NC_011368	TCG	2	6	2662	2667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
44	NC_011368	GCC	2	6	2699	2704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546453
45	NC_011368	TCG	2	6	2748	2753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
46	NC_011368	CAG	2	6	2822	2827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546453
47	NC_011368	GCT	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
48	NC_011368	CGA	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546453
49	NC_011368	GCT	2	6	2974	2979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
50	NC_011368	GGC	2	6	3118	3123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546453
51	NC_011368	ATC	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546453
52	NC_011368	CGG	2	6	3280	3285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546453
53	NC_011368	TCG	2	6	3497	3502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
54	NC_011368	GCC	2	6	3557	3562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546453
55	NC_011368	CAG	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546453
56	NC_011368	GCA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546453
57	NC_011368	GGC	2	6	3777	3782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
58	NC_011368	GGC	3	9	3786	3794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
59	NC_011368	CAT	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546454
60	NC_011368	CGG	3	9	3974	3982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
61	NC_011368	GGC	2	6	4024	4029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
62	NC_011368	GTC	2	6	4057	4062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546454
63	NC_011368	GCG	2	6	4228	4233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
64	NC_011368	GCA	2	6	4247	4252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546454
65	NC_011368	GGC	2	6	4281	4286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
66	NC_011368	CGG	2	6	4346	4351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
67	NC_011368	AGC	2	6	4498	4503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546454
68	NC_011368	GCG	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546455
69	NC_011368	GAC	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546455
70	NC_011368	CAG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546455
71	NC_011368	TCG	2	6	4944	4949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546455
72	NC_011368	CTC	2	6	4969	4974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546456
73	NC_011368	CGA	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546456
74	NC_011368	CAG	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546456
75	NC_011368	TCG	2	6	5276	5281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546456
76	NC_011368	TCG	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546456
77	NC_011368	CGA	2	6	5448	5453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546456
78	NC_011368	GGC	2	6	5605	5610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
79	NC_011368	ATC	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546456
80	NC_011368	CGC	2	6	5709	5714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546456
81	NC_011368	CGG	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
82	NC_011368	CGC	2	6	5862	5867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546456
83	NC_011368	CCT	2	6	6108	6113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546456
84	NC_011368	GTC	2	6	6247	6252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546456
85	NC_011368	AGG	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546456
86	NC_011368	CGG	2	6	6275	6280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
87	NC_011368	AGG	2	6	6282	6287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546456
88	NC_011368	GAG	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546456
89	NC_011368	GCC	4	12	6337	6348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546456
90	NC_011368	TGA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546456
91	NC_011368	GGC	2	6	6475	6480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
92	NC_011368	GGC	2	6	6622	6627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
93	NC_011368	CGG	2	6	6670	6675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
94	NC_011368	GCG	2	6	6784	6789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
95	NC_011368	CAT	2	6	6826	6831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546456
96	NC_011368	CGC	2	6	6832	6837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011368	GAT	2	6	6938	6943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546457
98	NC_011368	CGT	2	6	6946	6951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546457
99	NC_011368	ATA	2	6	6971	6976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209546457
100	NC_011368	TCG	2	6	7032	7037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546457
101	NC_011368	CGC	2	6	7051	7056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546457
102	NC_011368	TGG	2	6	7081	7086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546457
103	NC_011368	GCC	2	6	7098	7103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546457
104	NC_011368	CGC	2	6	7108	7113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546457
105	NC_011368	GCC	2	6	7205	7210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546457
106	NC_011368	CGG	2	6	7249	7254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546457
107	NC_011368	GCC	2	6	7283	7288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546457
108	NC_011368	GCC	2	6	7301	7306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546457
109	NC_011368	AGC	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546457
110	NC_011368	GTT	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546457
111	NC_011368	CGT	2	6	7472	7477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546457
112	NC_011368	CGA	2	6	7516	7521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546457
113	NC_011368	CAT	2	6	7561	7566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546457
114	NC_011368	CGG	2	6	7604	7609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546457
115	NC_011368	GCG	2	6	7612	7617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546457
116	NC_011368	AGC	2	6	7680	7685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546457
117	NC_011368	TCG	2	6	7692	7697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546457
118	NC_011368	CGA	2	6	7714	7719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546457
119	NC_011368	GCG	2	6	7727	7732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546457
120	NC_011368	GCC	2	6	7748	7753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546457
121	NC_011368	TTC	2	6	7757	7762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546457
122	NC_011368	GAT	2	6	7769	7774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546457
123	NC_011368	GGC	2	6	7784	7789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546457
124	NC_011368	GCG	2	6	7798	7803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546457
125	NC_011368	TCG	2	6	7848	7853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546457
126	NC_011368	GCC	2	6	7874	7879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546457
127	NC_011368	AGA	2	6	7948	7953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546457
128	NC_011368	GCC	2	6	8009	8014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546457
129	NC_011368	TTC	2	6	8079	8084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546457
130	NC_011368	GCC	2	6	8105	8110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546457
131	NC_011368	CGA	2	6	8131	8136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546457
132	NC_011368	TCA	2	6	8137	8142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546457
133	NC_011368	GAT	2	6	8174	8179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546457
134	NC_011368	TCG	2	6	8196	8201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546457
135	NC_011368	GGC	2	6	8216	8221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546457
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137	NC_011368	TCG	2	6	8367	8372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546457
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140	NC_011368	CGG	2	6	8634	8639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546458
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144	NC_011368	GAT	2	6	9031	9036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546458
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153	NC_011368	TTC	2	6	9415	9420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546458
154	NC_011368	TCG	2	6	9491	9496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546458
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157	NC_011368	ATT	2	6	9739	9744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_011368	GGC	2	6	14798	14803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546465
256	NC_011368	ATC	2	6	14903	14908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546465
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265	NC_011368	CTT	2	6	15271	15276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546465
266	NC_011368	GCG	2	6	15362	15367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546465
267	NC_011368	CGG	2	6	15390	15395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546465
268	NC_011368	CAA	2	6	15463	15468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546465
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284	NC_011368	GCT	2	6	16132	16137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546466
285	NC_011368	TCG	2	6	16165	16170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546466
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