MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG201

Total Repeats: 28465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011368	CCG	2	6	20850	20855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546470
502	NC_011368	GCA	2	6	20950	20955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546470
503	NC_011368	AGG	3	9	20976	20984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546470
504	NC_011368	GCC	2	6	20990	20995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546470
505	NC_011368	CAT	2	6	21059	21064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546470
506	NC_011368	GAT	2	6	21068	21073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546470
507	NC_011368	CGG	2	6	21148	21153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546470
508	NC_011368	GACC	2	8	21175	21182	25 %	0 %	25 %	50 %	209546470
509	NC_011368	CGT	2	6	21361	21366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546470
510	NC_011368	GCT	2	6	21406	21411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546470
511	NC_011368	CTT	2	6	21431	21436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546470
512	NC_011368	CCG	2	6	21453	21458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546470
513	NC_011368	CGC	2	6	21488	21493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546470
514	NC_011368	CGA	2	6	21583	21588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546470
515	NC_011368	CG	3	6	21620	21625	0 %	0 %	50 %	50 %	209546470
516	NC_011368	GCC	2	6	21653	21658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546470
517	NC_011368	GT	3	6	21661	21666	0 %	50 %	50 %	0 %	209546470
518	NC_011368	GAT	2	6	21677	21682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546470
519	NC_011368	GAC	2	6	21770	21775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546470
520	NC_011368	AGC	2	6	21776	21781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546470
521	NC_011368	GCC	2	6	21789	21794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546470
522	NC_011368	GCG	2	6	21801	21806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546470
523	NC_011368	AGC	2	6	21822	21827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546470
524	NC_011368	ACA	2	6	21832	21837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546470
525	NC_011368	ATGT	2	8	21913	21920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011368	AAAGAA	2	12	21931	21942	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011368	TCGCC	2	10	22022	22031	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
528	NC_011368	TAC	2	6	22143	22148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_011368	T	6	6	22196	22201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011368	GTT	2	6	22226	22231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011368	T	8	8	22235	22242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011368	GAT	2	6	22245	22250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011368	TGCAT	2	10	22334	22343	20 %	40 %	20 %	20 %	209546471
534	NC_011368	ACG	2	6	22461	22466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546471
535	NC_011368	ACC	2	6	22475	22480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546471
536	NC_011368	GCGG	2	8	22534	22541	0 %	0 %	75 %	25 %	209546471
537	NC_011368	GCC	2	6	22565	22570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546471
538	NC_011368	CCG	2	6	22590	22595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546471
539	NC_011368	CAG	2	6	22634	22639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546471
540	NC_011368	TGA	2	6	22791	22796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546471
541	NC_011368	TGCCGT	2	12	22859	22870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011368	CGC	2	6	22882	22887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_011368	C	6	6	22892	22897	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
544	NC_011368	GCC	2	6	23122	23127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546472
545	NC_011368	GC	3	6	23217	23222	0 %	0 %	50 %	50 %	209546472
546	NC_011368	CGTT	2	8	23270	23277	0 %	50 %	25 %	25 %	209546472
547	NC_011368	CAC	2	6	23278	23283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546472
548	NC_011368	CATC	2	8	23298	23305	25 %	25 %	0 %	50 %	209546472
549	NC_011368	CGT	2	6	23325	23330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546472
550	NC_011368	GTC	2	6	23344	23349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546472
551	NC_011368	CCG	2	6	23439	23444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546472
552	NC_011368	CAGG	2	8	23481	23488	25 %	0 %	50 %	25 %	209546472
553	NC_011368	CGA	2	6	23505	23510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546472
554	NC_011368	AC	3	6	23681	23686	50 %	0 %	0 %	50 %	209546473
555	NC_011368	CGA	2	6	23756	23761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546473
556	NC_011368	GAT	2	6	23780	23785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546473
557	NC_011368	AAG	2	6	23789	23794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546473
558	NC_011368	CCGCTG	2	12	23860	23871	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209546473
559	NC_011368	AT	3	6	23893	23898	50 %	50 %	0 %	0 %	209546473
560	NC_011368	TCG	2	6	23899	23904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
561	NC_011368	CG	3	6	23903	23908	0 %	0 %	50 %	50 %	209546473
562	NC_011368	CGC	2	6	23941	23946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546473
563	NC_011368	TCG	2	6	23956	23961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
564	NC_011368	TCG	2	6	23984	23989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
565	NC_011368	ACC	2	6	23995	24000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546473
566	NC_011368	CTT	2	6	24024	24029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546473
567	NC_011368	GCG	2	6	24098	24103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546473
568	NC_011368	GGC	2	6	24113	24118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546473
569	NC_011368	GTC	2	6	24123	24128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
570	NC_011368	CGC	2	6	24140	24145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546473
571	NC_011368	ATGG	2	8	24159	24166	25 %	25 %	50 %	0 %	209546473
572	NC_011368	CCG	2	6	24187	24192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546473
573	NC_011368	CCCG	2	8	24228	24235	0 %	0 %	25 %	75 %	209546473
574	NC_011368	CGG	2	6	24250	24255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546473
575	NC_011368	TGA	2	6	24341	24346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546473
576	NC_011368	GCC	2	6	24351	24356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546473
577	NC_011368	TTTCCG	2	12	24427	24438	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209546473
578	NC_011368	TCG	2	6	24559	24564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
579	NC_011368	TGGA	2	8	24565	24572	25 %	25 %	50 %	0 %	209546473
580	NC_011368	ATTGGC	2	12	24629	24640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209546473
581	NC_011368	CG	3	6	24722	24727	0 %	0 %	50 %	50 %	209546473
582	NC_011368	CGC	2	6	24846	24851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546473
583	NC_011368	ATG	2	6	24931	24936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546473
584	NC_011368	CGT	2	6	24938	24943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
585	NC_011368	CCG	2	6	24991	24996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546474
586	NC_011368	AAG	2	6	25011	25016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546474
587	NC_011368	GAC	2	6	25020	25025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546474
588	NC_011368	ACG	2	6	25033	25038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546474
589	NC_011368	GAACGA	2	12	25040	25051	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209546474
590	NC_011368	TGA	2	6	25052	25057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546474
591	NC_011368	AAGG	2	8	25071	25078	50 %	0 %	50 %	0 %	209546474
592	NC_011368	GCA	3	9	25088	25096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546474
593	NC_011368	TCC	2	6	25123	25128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546474
594	NC_011368	CTC	2	6	25200	25205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546474
595	NC_011368	GCCG	2	8	25289	25296	0 %	0 %	50 %	50 %	209546474
596	NC_011368	CAT	2	6	25311	25316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546474
597	NC_011368	CGA	2	6	25352	25357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546474
598	NC_011368	CGC	3	9	25377	25385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546474
599	NC_011368	GGC	2	6	25445	25450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546474
600	NC_011368	GCGCC	2	10	25471	25480	0 %	0 %	40 %	60 %	209546474
601	NC_011368	GGT	2	6	25638	25643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546474
602	NC_011368	CGG	2	6	25652	25657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546474
603	NC_011368	GCCC	2	8	25665	25672	0 %	0 %	25 %	75 %	209546474
604	NC_011368	TCG	2	6	25772	25777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546474
605	NC_011368	CTC	2	6	25794	25799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546474
606	NC_011368	A	6	6	25851	25856	100 %	0 %	0 %	0 %	209546474
607	NC_011368	GGC	2	6	25866	25871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546474
608	NC_011368	GAA	2	6	25893	25898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546474
609	NC_011368	ACTC	2	8	25919	25926	25 %	25 %	0 %	50 %	209546474
610	NC_011368	CAG	2	6	25996	26001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546475
611	NC_011368	CAC	2	6	26008	26013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546475
612	NC_011368	ATC	2	6	26072	26077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546475
613	NC_011368	CCG	2	6	26216	26221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546475
614	NC_011368	CGACGC	2	12	26268	26279	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209546475
615	NC_011368	CG	3	6	26376	26381	0 %	0 %	50 %	50 %	209546475
616	NC_011368	CCA	2	6	26382	26387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546475
617	NC_011368	CGC	2	6	26395	26400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546475
618	NC_011368	GCG	2	6	26479	26484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546475
619	NC_011368	GAC	2	6	26500	26505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546475
620	NC_011368	GAG	2	6	26518	26523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546475
621	NC_011368	GCA	2	6	26667	26672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546475
622	NC_011368	GCC	2	6	26694	26699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546475
623	NC_011368	GCG	2	6	26708	26713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546475
624	NC_011368	GAT	2	6	26748	26753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546475
625	NC_011368	GCG	2	6	26852	26857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546475
626	NC_011368	CGA	2	6	26972	26977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546476
627	NC_011368	CCGC	2	8	27018	27025	0 %	0 %	25 %	75 %	209546476
628	NC_011368	CGA	2	6	27168	27173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546476
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753	NC_011368	TCG	2	6	32416	32421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546481
754	NC_011368	TTC	2	6	32434	32439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546481
755	NC_011368	A	6	6	32442	32447	100 %	0 %	0 %	0 %	209546481
756	NC_011368	TGC	2	6	32459	32464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546481
757	NC_011368	CGT	2	6	32468	32473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546481
758	NC_011368	CGAGC	2	10	32502	32511	20 %	0 %	40 %	40 %	209546481
759	NC_011368	GCC	2	6	32523	32528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546481
760	NC_011368	TCG	2	6	32590	32595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546481
761	NC_011368	TGC	3	9	32666	32674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546481
762	NC_011368	GCATGG	2	12	32711	32722	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209546481
763	NC_011368	GAT	2	6	32753	32758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546481
764	NC_011368	GAC	2	6	32821	32826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
765	NC_011368	GC	3	6	32852	32857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
766	NC_011368	GCC	2	6	32859	32864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
767	NC_011368	CCG	2	6	32945	32950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546482
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770	NC_011368	CGG	2	6	33019	33024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546482
771	NC_011368	ATGG	2	8	33040	33047	25 %	25 %	50 %	0 %	209546482
772	NC_011368	CGG	2	6	33132	33137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546482
773	NC_011368	CAA	2	6	33175	33180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546482
774	NC_011368	GAC	2	6	33309	33314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546483
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781	NC_011368	CG	4	8	33557	33564	0 %	0 %	50 %	50 %	209546483
782	NC_011368	TGA	2	6	33637	33642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546483
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787	NC_011368	TGA	2	6	33847	33852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546483
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792	NC_011368	GTT	2	6	34013	34018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546483
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802	NC_011368	ACA	2	6	34701	34706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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813	NC_011368	GATC	2	8	35321	35328	25 %	25 %	25 %	25 %	209546484
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849	NC_011368	GC	4	8	36838	36845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
850	NC_011368	GGC	2	6	36879	36884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
851	NC_011368	AGCCGA	2	12	36917	36928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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853	NC_011368	CA	3	6	37012	37017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
854	NC_011368	CGG	2	6	37053	37058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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865	NC_011368	GCG	2	6	37494	37499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
866	NC_011368	CG	3	6	37514	37519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
867	NC_011368	GA	3	6	37617	37622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
868	NC_011368	ATT	2	6	37674	37679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
869	NC_011368	GTC	2	6	37694	37699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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872	NC_011368	ACTGGC	2	12	37790	37801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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874	NC_011368	AGGG	2	8	37844	37851	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
875	NC_011368	CATT	2	8	37901	37908	25 %	50 %	0 %	25 %	209546488
876	NC_011368	CGGGC	2	10	37982	37991	0 %	0 %	60 %	40 %	209546488
877	NC_011368	GCG	2	6	38066	38071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546488
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880	NC_011368	TTG	2	6	38148	38153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546488
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