MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG201

Total Repeats: 28465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011368	GCC	2	6	232891	232896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546674
5502	NC_011368	CAT	2	6	232908	232913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546674
5503	NC_011368	GC	3	6	232939	232944	0 %	0 %	50 %	50 %	209546674
5504	NC_011368	ATCT	2	8	233024	233031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_011368	CTG	2	6	233055	233060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_011368	ATG	2	6	233116	233121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_011368	ATA	2	6	233142	233147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_011368	TCT	2	6	233166	233171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_011368	TCG	2	6	233205	233210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_011368	CCGG	2	8	233240	233247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_011368	TAT	2	6	233293	233298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209546675
5512	NC_011368	TTC	2	6	233327	233332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546675
5513	NC_011368	GCG	2	6	233351	233356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546675
5514	NC_011368	GCC	2	6	233375	233380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546675
5515	NC_011368	TCG	2	6	233400	233405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546675
5516	NC_011368	AGGC	2	8	233439	233446	25 %	0 %	50 %	25 %	209546675
5517	NC_011368	GAA	2	6	233449	233454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546675
5518	NC_011368	GCAG	2	8	233458	233465	25 %	0 %	50 %	25 %	209546675
5519	NC_011368	GGC	2	6	233506	233511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546675
5520	NC_011368	CAG	2	6	233522	233527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546675
5521	NC_011368	CAA	2	6	233611	233616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546675
5522	NC_011368	CAC	2	6	233641	233646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546675
5523	NC_011368	TTC	2	6	233689	233694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546675
5524	NC_011368	GCC	2	6	233717	233722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546675
5525	NC_011368	AAG	2	6	233732	233737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546675
5526	NC_011368	GGT	2	6	233750	233755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546675
5527	NC_011368	TCG	2	6	233769	233774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546675
5528	NC_011368	GAAG	2	8	233818	233825	50 %	0 %	50 %	0 %	209546675
5529	NC_011368	GAC	2	6	233867	233872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546675
5530	NC_011368	CG	3	6	233883	233888	0 %	0 %	50 %	50 %	209546675
5531	NC_011368	AAG	2	6	233891	233896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546675
5532	NC_011368	TGG	2	6	233913	233918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546675
5533	NC_011368	GACCT	2	10	233927	233936	20 %	20 %	20 %	40 %	209546675
5534	NC_011368	ACA	2	6	233958	233963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546675
5535	NC_011368	CGC	2	6	233964	233969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546675
5536	NC_011368	CGT	2	6	234016	234021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546675
5537	NC_011368	GAC	2	6	234029	234034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546675
5538	NC_011368	CGG	2	6	234049	234054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546675
5539	NC_011368	AAGG	2	8	234059	234066	50 %	0 %	50 %	0 %	209546675
5540	NC_011368	CAG	2	6	234089	234094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546675
5541	NC_011368	GCC	2	6	234131	234136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546675
5542	NC_011368	CCG	2	6	234165	234170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546675
5543	NC_011368	ATC	3	9	234179	234187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546675
5544	NC_011368	ATC	2	6	234197	234202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546675
5545	NC_011368	GCC	2	6	234227	234232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546675
5546	NC_011368	GCG	2	6	234267	234272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_011368	GCC	2	6	234282	234287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_011368	CAG	2	6	234315	234320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_011368	CGT	2	6	234420	234425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546676
5550	NC_011368	CAT	2	6	234450	234455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546676
5551	NC_011368	TGA	2	6	234509	234514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546676
5552	NC_011368	TCG	2	6	234713	234718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546676
5553	NC_011368	GC	3	6	234767	234772	0 %	0 %	50 %	50 %	209546676
5554	NC_011368	AC	3	6	234785	234790	50 %	0 %	0 %	50 %	209546676
5555	NC_011368	AGC	2	6	234815	234820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546676
5556	NC_011368	TGG	2	6	234824	234829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546676
5557	NC_011368	CGA	2	6	234873	234878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546676
5558	NC_011368	GCT	2	6	234915	234920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546676
5559	NC_011368	TGC	2	6	235016	235021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546676
5560	NC_011368	TGA	2	6	235085	235090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546676
5561	NC_011368	TGCG	2	8	235162	235169	0 %	25 %	50 %	25 %	209546676
5562	NC_011368	GA	3	6	235217	235222	50 %	0 %	50 %	0 %	209546676
5563	NC_011368	TCG	2	6	235241	235246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546676
5564	NC_011368	TCT	2	6	235274	235279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546676
5565	NC_011368	TCCG	2	8	235333	235340	0 %	25 %	25 %	50 %	209546676
5566	NC_011368	GGA	2	6	235383	235388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546676
5567	NC_011368	TTC	2	6	235406	235411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546676
5568	NC_011368	CGG	3	9	235496	235504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546676
5569	NC_011368	CGG	2	6	235572	235577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546676
5570	NC_011368	CAG	2	6	235582	235587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546676
5571	NC_011368	GGT	2	6	235590	235595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546676
5572	NC_011368	TGA	2	6	235628	235633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546676
5573	NC_011368	TGA	2	6	235727	235732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546676
5574	NC_011368	ATCGC	2	10	235769	235778	20 %	20 %	20 %	40 %	209546676
5575	NC_011368	TGCT	2	8	235847	235854	0 %	50 %	25 %	25 %	209546676
5576	NC_011368	A	6	6	235923	235928	100 %	0 %	0 %	0 %	209546677
5577	NC_011368	CTG	2	6	235938	235943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5578	NC_011368	TCG	4	12	235951	235962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5579	NC_011368	TCG	3	9	235966	235974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5580	NC_011368	CAT	2	6	235976	235981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546677
5581	NC_011368	CTG	2	6	235995	236000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5582	NC_011368	TCA	2	6	236071	236076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546677
5583	NC_011368	CGG	2	6	236081	236086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546677
5584	NC_011368	GCTC	2	8	236104	236111	0 %	25 %	25 %	50 %	209546677
5585	NC_011368	TCG	2	6	236134	236139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5586	NC_011368	GGCT	2	8	236223	236230	0 %	25 %	50 %	25 %	209546677
5587	NC_011368	TCG	2	6	236257	236262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5588	NC_011368	CTG	2	6	236277	236282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5589	NC_011368	GC	3	6	236298	236303	0 %	0 %	50 %	50 %	209546677
5590	NC_011368	CCG	2	6	236311	236316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546677
5591	NC_011368	CGG	2	6	236323	236328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546677
5592	NC_011368	GCTTT	2	10	236329	236338	0 %	60 %	20 %	20 %	209546677
5593	NC_011368	CCG	2	6	236371	236376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546677
5594	NC_011368	TGC	2	6	236443	236448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5595	NC_011368	GCT	2	6	236561	236566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5596	NC_011368	ATTT	2	8	236583	236590	25 %	75 %	0 %	0 %	209546677
5597	NC_011368	AC	3	6	236599	236604	50 %	0 %	0 %	50 %	209546677
5598	NC_011368	GCC	3	9	236655	236663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546677
5599	NC_011368	CGG	2	6	236669	236674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546677
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5601	NC_011368	CGT	2	6	236711	236716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5602	NC_011368	TCG	2	6	236775	236780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5603	NC_011368	GCG	2	6	236800	236805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546677
5604	NC_011368	GCC	2	6	236860	236865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546677
5605	NC_011368	CCG	2	6	236872	236877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546677
5606	NC_011368	CGT	2	6	236895	236900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546677
5607	NC_011368	CGAA	2	8	236902	236909	50 %	0 %	25 %	25 %	209546677
5608	NC_011368	GAC	2	6	236947	236952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_011368	GCCGT	2	10	236955	236964	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5610	NC_011368	GCCG	2	8	237021	237028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5611	NC_011368	A	6	6	237091	237096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_011368	CCGA	2	8	237155	237162	25 %	0 %	25 %	50 %	209546678
5613	NC_011368	GC	3	6	237211	237216	0 %	0 %	50 %	50 %	209546678
5614	NC_011368	GAC	2	6	237224	237229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546678
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5617	NC_011368	CCT	2	6	237407	237412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546678
5618	NC_011368	GCC	2	6	237434	237439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546678
5619	NC_011368	GC	3	6	237547	237552	0 %	0 %	50 %	50 %	209546678
5620	NC_011368	GATC	2	8	237643	237650	25 %	25 %	25 %	25 %	209546678
5621	NC_011368	CTG	2	6	237676	237681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546678
5622	NC_011368	ACCTC	2	10	237710	237719	20 %	20 %	0 %	60 %	209546678
5623	NC_011368	TGA	2	6	237749	237754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546678
5624	NC_011368	ATC	2	6	237796	237801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546678
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5626	NC_011368	CAA	2	6	237960	237965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546678
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5628	NC_011368	CA	3	6	238101	238106	50 %	0 %	0 %	50 %	209546678
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5633	NC_011368	GCC	2	6	238440	238445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5634	NC_011368	A	6	6	238518	238523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5635	NC_011368	GCC	2	6	238580	238585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546680
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5643	NC_011368	CGT	2	6	238774	238779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546680
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5662	NC_011368	CT	3	6	239696	239701	0 %	50 %	0 %	50 %	209546681
5663	NC_011368	GCCG	2	8	239711	239718	0 %	0 %	50 %	50 %	209546681
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5697	NC_011368	GCC	2	6	241073	241078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5702	NC_011368	GCT	2	6	241477	241482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5709	NC_011368	AGG	2	6	242043	242048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546684
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5734	NC_011368	CGA	2	6	243146	243151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546684
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5745	NC_011368	TCA	2	6	243696	243701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546684
5746	NC_011368	ACG	2	6	243810	243815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546684
5747	NC_011368	GCC	2	6	243854	243859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546684
5748	NC_011368	GATC	2	8	243871	243878	25 %	25 %	25 %	25 %	209546684
5749	NC_011368	TTG	2	6	243891	243896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546684
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5772	NC_011368	TAT	2	6	245971	245976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5774	NC_011368	ATG	2	6	245992	245997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5841	NC_011368	GGACC	2	10	248626	248635	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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5853	NC_011368	GAT	2	6	249204	249209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546689
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5855	NC_011368	TGA	2	6	249248	249253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546689
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5857	NC_011368	CGA	2	6	249389	249394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546689
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5861	NC_011368	GGA	2	6	249486	249491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546689
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5990	NC_011368	ACC	2	6	254971	254976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546694
5991	NC_011368	GAA	2	6	255034	255039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546694
5992	NC_011368	ACC	2	6	255084	255089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546694
5993	NC_011368	CAG	2	6	255104	255109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546694
5994	NC_011368	TGG	2	6	255120	255125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546694
5995	NC_011368	ACA	2	6	255141	255146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546694
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5997	NC_011368	CATC	2	8	255235	255242	25 %	25 %	0 %	50 %	209546694
5998	NC_011368	CGC	2	6	255310	255315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546694
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