MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 12155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011366	TGCC	2	8	40792	40799	0 %	25 %	25 %	50 %	209546038
1002	NC_011366	GAG	2	6	40840	40845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546038
1003	NC_011366	GCG	2	6	40865	40870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546038
1004	NC_011366	CGA	2	6	40874	40879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546038
1005	NC_011366	TAT	2	6	41017	41022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011366	ATC	2	6	41039	41044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011366	CGG	2	6	41085	41090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546039
1008	NC_011366	GC	3	6	41162	41167	0 %	0 %	50 %	50 %	209546039
1009	NC_011366	TTC	2	6	41182	41187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546039
1010	NC_011366	CG	3	6	41191	41196	0 %	0 %	50 %	50 %	209546039
1011	NC_011366	CCGC	2	8	41241	41248	0 %	0 %	25 %	75 %	209546039
1012	NC_011366	TG	4	8	41262	41269	0 %	50 %	50 %	0 %	209546039
1013	NC_011366	CG	3	6	41305	41310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_011366	TGC	2	6	41348	41353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_011366	CTT	2	6	41391	41396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_011366	GCA	2	6	41536	41541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_011366	CAA	2	6	41585	41590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_011366	TCT	2	6	41699	41704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546040
1019	NC_011366	CGA	2	6	41711	41716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546040
1020	NC_011366	GC	3	6	41731	41736	0 %	0 %	50 %	50 %	209546040
1021	NC_011366	GCC	2	6	41769	41774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546040
1022	NC_011366	TCA	2	6	41776	41781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546040
1023	NC_011366	TGAA	2	8	41785	41792	50 %	25 %	25 %	0 %	209546040
1024	NC_011366	TGG	2	6	41804	41809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546040
1025	NC_011366	ACG	2	6	41886	41891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011366	GAT	2	6	41892	41897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011366	TCT	2	6	42153	42158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546041
1028	NC_011366	TGG	2	6	42206	42211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546041
1029	NC_011366	TGCA	2	8	42250	42257	25 %	25 %	25 %	25 %	209546041
1030	NC_011366	GAC	2	6	42319	42324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1031	NC_011366	CGA	2	6	42396	42401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1032	NC_011366	GCCT	2	8	42547	42554	0 %	25 %	25 %	50 %	209546041
1033	NC_011366	CTGCC	2	10	42607	42616	0 %	20 %	20 %	60 %	209546041
1034	NC_011366	AGA	2	6	42660	42665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546041
1035	NC_011366	GAC	3	9	42703	42711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1036	NC_011366	CCG	2	6	42728	42733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546041
1037	NC_011366	TCG	2	6	42774	42779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1038	NC_011366	GGCGC	2	10	42783	42792	0 %	0 %	60 %	40 %	209546041
1039	NC_011366	GAT	2	6	42799	42804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546041
1040	NC_011366	ATCTG	2	10	42854	42863	20 %	40 %	20 %	20 %	209546041
1041	NC_011366	CTT	2	6	42892	42897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546041
1042	NC_011366	CTG	2	6	42904	42909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1043	NC_011366	CGC	2	6	42921	42926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546041
1044	NC_011366	ATC	2	6	42931	42936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546041
1045	NC_011366	GCC	2	6	42937	42942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546041
1046	NC_011366	GCC	2	6	42997	43002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546041
1047	NC_011366	GAC	2	6	43027	43032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1048	NC_011366	CTC	2	6	43084	43089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546041
1049	NC_011366	GA	3	6	43127	43132	50 %	0 %	50 %	0 %	209546041
1050	NC_011366	GCG	2	6	43142	43147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546041
1051	NC_011366	CGG	2	6	43185	43190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546041
1052	NC_011366	CG	3	6	43233	43238	0 %	0 %	50 %	50 %	209546041
1053	NC_011366	CG	3	6	43272	43277	0 %	0 %	50 %	50 %	209546041
1054	NC_011366	CGC	2	6	43384	43389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546041
1055	NC_011366	TCG	2	6	43397	43402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1056	NC_011366	GAG	2	6	43412	43417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546041
1057	NC_011366	TCG	2	6	43478	43483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1058	NC_011366	GTT	2	6	43495	43500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546041
1059	NC_011366	AAT	2	6	43524	43529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209546041
1060	NC_011366	CGGC	2	8	43550	43557	0 %	0 %	50 %	50 %	209546041
1061	NC_011366	AGC	2	6	43763	43768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1062	NC_011366	GCGG	2	8	43819	43826	0 %	0 %	75 %	25 %	209546041
1063	NC_011366	GAT	2	6	43867	43872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546041
1064	NC_011366	GCAC	2	8	43889	43896	25 %	0 %	25 %	50 %	209546041
1065	NC_011366	CGC	2	6	43915	43920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546041
1066	NC_011366	CGG	2	6	43947	43952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546041
1067	NC_011366	CGA	2	6	44067	44072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1068	NC_011366	CAG	2	6	44074	44079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1069	NC_011366	GCC	2	6	44153	44158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546041
1070	NC_011366	GCA	2	6	44201	44206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1071	NC_011366	GAA	2	6	44223	44228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546041
1072	NC_011366	TCG	2	6	44297	44302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1073	NC_011366	ACG	2	6	44375	44380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546041
1074	NC_011366	CCG	2	6	44387	44392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546041
1075	NC_011366	CAGG	2	8	44421	44428	25 %	0 %	50 %	25 %	209546041
1076	NC_011366	GGA	2	6	44519	44524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011366	GCAC	2	8	44540	44547	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_011366	AAAGT	2	10	44574	44583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011366	A	6	6	44600	44605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_011366	ATC	2	6	44665	44670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_011366	CGGG	2	8	44671	44678	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_011366	CG	3	6	44812	44817	0 %	0 %	50 %	50 %	209546042
1083	NC_011366	GCC	2	6	44856	44861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1084	NC_011366	CGG	2	6	44880	44885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1085	NC_011366	ACG	2	6	44896	44901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1086	NC_011366	ATT	2	6	44926	44931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209546042
1087	NC_011366	CAA	2	6	44991	44996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546042
1088	NC_011366	CGG	2	6	45000	45005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1089	NC_011366	CGC	2	6	45056	45061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1090	NC_011366	CGC	2	6	45120	45125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1091	NC_011366	CTT	2	6	45144	45149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546042
1092	NC_011366	CGG	3	9	45158	45166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1093	NC_011366	CTGGA	2	10	45181	45190	20 %	20 %	40 %	20 %	209546042
1094	NC_011366	AT	3	6	45240	45245	50 %	50 %	0 %	0 %	209546042
1095	NC_011366	CAC	2	6	45261	45266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546042
1096	NC_011366	GCT	2	6	45288	45293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1097	NC_011366	CGC	2	6	45309	45314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1098	NC_011366	CTTCAG	2	12	45345	45356	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209546042
1099	NC_011366	CTT	2	6	45393	45398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546042
1100	NC_011366	CGG	2	6	45402	45407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1101	NC_011366	ATC	2	6	45421	45426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546042
1102	NC_011366	TGGC	2	8	45475	45482	0 %	25 %	50 %	25 %	209546042
1103	NC_011366	ATC	2	6	45484	45489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546042
1104	NC_011366	GCT	2	6	45501	45506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1105	NC_011366	GCC	2	6	45547	45552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1106	NC_011366	CCG	2	6	45571	45576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1107	NC_011366	GCC	2	6	45580	45585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1108	NC_011366	CGG	2	6	45615	45620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1109	NC_011366	CGG	2	6	45636	45641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1110	NC_011366	CGC	2	6	45651	45656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1111	NC_011366	CCG	2	6	45680	45685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1112	NC_011366	TCT	2	6	45737	45742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546042
1113	NC_011366	CTG	2	6	45756	45761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1114	NC_011366	TTC	3	9	45766	45774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546042
1115	NC_011366	TCG	2	6	45833	45838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1116	NC_011366	CGG	2	6	45864	45869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1117	NC_011366	GCCG	2	8	45880	45887	0 %	0 %	50 %	50 %	209546042
1118	NC_011366	CGT	2	6	45888	45893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1119	NC_011366	TCG	2	6	45905	45910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1120	NC_011366	TGA	2	6	45914	45919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546042
1121	NC_011366	CAT	2	6	45939	45944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546042
1122	NC_011366	GTC	2	6	45960	45965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1123	NC_011366	GGCT	2	8	45994	46001	0 %	25 %	50 %	25 %	209546042
1124	NC_011366	CGG	2	6	46104	46109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1125	NC_011366	CTT	2	6	46113	46118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546042
1126	NC_011366	CAT	2	6	46146	46151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546042
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1239	NC_011366	CGCATC	2	12	50029	50040	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209546045
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1243	NC_011366	TCCGA	2	10	50293	50302	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1244	NC_011366	CAA	2	6	50348	50353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1245	NC_011366	TA	3	6	50369	50374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1246	NC_011366	CGAA	2	8	50388	50395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1247	NC_011366	ATC	2	6	50441	50446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1248	NC_011366	GC	3	6	50519	50524	0 %	0 %	50 %	50 %	209546046
1249	NC_011366	GAC	2	6	50531	50536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546046
1250	NC_011366	TCGC	2	8	50568	50575	0 %	25 %	25 %	50 %	209546046
1251	NC_011366	GCTTT	2	10	50654	50663	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1252	NC_011366	ATT	2	6	50772	50777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_011366	CCT	2	6	50795	50800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1254	NC_011366	TCC	3	9	50831	50839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1255	NC_011366	GTC	2	6	50844	50849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_011366	GCA	2	6	50860	50865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1257	NC_011366	CTC	3	9	50866	50874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1258	NC_011366	T	7	7	50890	50896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_011366	CCT	2	6	50912	50917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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