MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 12155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011366	GCA	2	6	20608	20613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546018
502	NC_011366	GC	3	6	20802	20807	0 %	0 %	50 %	50 %	209546018
503	NC_011366	AGG	2	6	20815	20820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546018
504	NC_011366	TTC	2	6	20859	20864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546018
505	NC_011366	GCG	2	6	20881	20886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546018
506	NC_011366	GC	3	6	20891	20896	0 %	0 %	50 %	50 %	209546018
507	NC_011366	GTC	2	6	20970	20975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546018
508	NC_011366	CGG	2	6	20986	20991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546018
509	NC_011366	CGC	2	6	20998	21003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
510	NC_011366	GC	3	6	21002	21007	0 %	0 %	50 %	50 %	209546018
511	NC_011366	GGTC	2	8	21052	21059	0 %	25 %	50 %	25 %	209546018
512	NC_011366	TGT	2	6	21071	21076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546018
513	NC_011366	CGT	2	6	21145	21150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546018
514	NC_011366	CGA	2	6	21160	21165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546018
515	NC_011366	CCG	2	6	21247	21252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
516	NC_011366	GGC	2	6	21275	21280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546018
517	NC_011366	GCG	2	6	21291	21296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546018
518	NC_011366	AGGC	2	8	21306	21313	25 %	0 %	50 %	25 %	209546018
519	NC_011366	CGGCAA	2	12	21343	21354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546018
520	NC_011366	CGGC	2	8	21367	21374	0 %	0 %	50 %	50 %	209546018
521	NC_011366	CGC	3	9	21383	21391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
522	NC_011366	GCC	2	6	21413	21418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
523	NC_011366	GGCA	2	8	21424	21431	25 %	0 %	50 %	25 %	209546018
524	NC_011366	GATG	2	8	21433	21440	25 %	25 %	50 %	0 %	209546018
525	NC_011366	GCC	2	6	21452	21457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
526	NC_011366	GCG	2	6	21485	21490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546018
527	NC_011366	CCG	2	6	21495	21500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
528	NC_011366	CGC	2	6	21517	21522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
529	NC_011366	GCC	2	6	21533	21538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
530	NC_011366	CGA	2	6	21616	21621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546018
531	NC_011366	CGC	2	6	21623	21628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
532	NC_011366	CGG	2	6	21640	21645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546018
533	NC_011366	CGG	2	6	21655	21660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546018
534	NC_011366	TGG	2	6	21682	21687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546018
535	NC_011366	CAT	2	6	21755	21760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546018
536	NC_011366	GCC	2	6	21779	21784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
537	NC_011366	GGCG	2	8	21829	21836	0 %	0 %	75 %	25 %	209546018
538	NC_011366	GTC	2	6	21923	21928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546018
539	NC_011366	GGC	2	6	21958	21963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546018
540	NC_011366	CAG	2	6	21992	21997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546018
541	NC_011366	CCG	2	6	22015	22020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
542	NC_011366	GCC	2	6	22055	22060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
543	NC_011366	TCG	2	6	22074	22079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546018
544	NC_011366	CG	4	8	22090	22097	0 %	0 %	50 %	50 %	209546018
545	NC_011366	CGGC	2	8	22104	22111	0 %	0 %	50 %	50 %	209546018
546	NC_011366	CAG	2	6	22154	22159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546018
547	NC_011366	AGG	2	6	22207	22212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546018
548	NC_011366	CGC	2	6	22226	22231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
549	NC_011366	GTA	2	6	22292	22297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546018
550	NC_011366	GA	3	6	22320	22325	50 %	0 %	50 %	0 %	209546018
551	NC_011366	GCC	2	6	22383	22388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
552	NC_011366	ATC	2	6	22407	22412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546018
553	NC_011366	CG	4	8	22415	22422	0 %	0 %	50 %	50 %	209546018
554	NC_011366	CGC	2	6	22441	22446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
555	NC_011366	GTC	2	6	22452	22457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546018
556	NC_011366	GTTCG	2	10	22466	22475	0 %	40 %	40 %	20 %	209546018
557	NC_011366	CG	3	6	22498	22503	0 %	0 %	50 %	50 %	209546018
558	NC_011366	AGC	2	6	22551	22556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546018
559	NC_011366	CCG	2	6	22641	22646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546018
560	NC_011366	GGC	2	6	22696	22701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546019
561	NC_011366	CGA	2	6	22743	22748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546019
562	NC_011366	CAGC	2	8	22750	22757	25 %	0 %	25 %	50 %	209546019
563	NC_011366	GGC	2	6	22758	22763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546019
564	NC_011366	GGA	2	6	22768	22773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546019
565	NC_011366	CGC	2	6	22881	22886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546019
566	NC_011366	TCC	2	6	22898	22903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546019
567	NC_011366	TGGGC	2	10	22971	22980	0 %	20 %	60 %	20 %	209546020
568	NC_011366	TCG	2	6	22994	22999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546020
569	NC_011366	GCG	2	6	23052	23057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546020
570	NC_011366	GCC	2	6	23113	23118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546020
571	NC_011366	GAT	2	6	23167	23172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546020
572	NC_011366	GGGAT	2	10	23238	23247	20 %	20 %	60 %	0 %	209546020
573	NC_011366	CGC	2	6	23328	23333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546020
574	NC_011366	GCCC	2	8	23343	23350	0 %	0 %	25 %	75 %	209546020
575	NC_011366	GAC	2	6	23392	23397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546020
576	NC_011366	GCA	2	6	23439	23444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546020
577	NC_011366	GGCC	2	8	23469	23476	0 %	0 %	50 %	50 %	209546020
578	NC_011366	GCCG	2	8	23500	23507	0 %	0 %	50 %	50 %	209546020
579	NC_011366	GCCAGC	2	12	23510	23521	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209546020
580	NC_011366	TGA	2	6	23607	23612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546020
581	NC_011366	CGC	2	6	23619	23624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546020
582	NC_011366	CG	3	6	23637	23642	0 %	0 %	50 %	50 %	209546020
583	NC_011366	GCC	2	6	23677	23682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546020
584	NC_011366	T	6	6	23746	23751	0 %	100 %	0 %	0 %	209546020
585	NC_011366	CGC	2	6	23862	23867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546020
586	NC_011366	TTG	2	6	23945	23950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546020
587	NC_011366	GCA	2	6	23955	23960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546020
588	NC_011366	TCG	2	6	23979	23984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546020
589	NC_011366	ATA	2	6	24064	24069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209546020
590	NC_011366	CCG	2	6	24089	24094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546020
591	NC_011366	CCA	2	6	24095	24100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546020
592	NC_011366	GAC	2	6	24106	24111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546020
593	NC_011366	GGCG	2	8	24145	24152	0 %	0 %	75 %	25 %	209546020
594	NC_011366	TTG	2	6	24161	24166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546020
595	NC_011366	ATG	2	6	24236	24241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011366	GGC	2	6	24396	24401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546021
597	NC_011366	CGGA	2	8	24449	24456	25 %	0 %	50 %	25 %	209546021
598	NC_011366	GC	3	6	24463	24468	0 %	0 %	50 %	50 %	209546021
599	NC_011366	CCG	2	6	24491	24496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546021
600	NC_011366	CGG	2	6	24546	24551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546021
601	NC_011366	CG	3	6	24557	24562	0 %	0 %	50 %	50 %	209546021
602	NC_011366	TGCC	2	8	24585	24592	0 %	25 %	25 %	50 %	209546021
603	NC_011366	CG	3	6	24605	24610	0 %	0 %	50 %	50 %	209546021
604	NC_011366	CGG	2	6	24624	24629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546021
605	NC_011366	GGC	2	6	24637	24642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546021
606	NC_011366	GCC	2	6	24658	24663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546021
607	NC_011366	CTG	2	6	24667	24672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546021
608	NC_011366	GCCG	2	8	24673	24680	0 %	0 %	50 %	50 %	209546021
609	NC_011366	GCC	2	6	24709	24714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546021
610	NC_011366	CGC	2	6	24740	24745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546021
611	NC_011366	GC	3	6	24751	24756	0 %	0 %	50 %	50 %	209546021
612	NC_011366	GCG	3	9	24785	24793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546021
613	NC_011366	ATG	2	6	24811	24816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546021
614	NC_011366	CGC	2	6	24856	24861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546021
615	NC_011366	CGC	2	6	24900	24905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546021
616	NC_011366	C	6	6	24905	24910	0 %	0 %	0 %	100 %	209546021
617	NC_011366	GC	3	6	24912	24917	0 %	0 %	50 %	50 %	209546021
618	NC_011366	CTCG	2	8	24918	24925	0 %	25 %	25 %	50 %	209546021
619	NC_011366	CCA	2	6	24942	24947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546021
620	NC_011366	GCT	2	6	24954	24959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546021
621	NC_011366	GGA	2	6	24978	24983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546021
622	NC_011366	CGC	2	6	25008	25013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546021
623	NC_011366	GC	3	6	25018	25023	0 %	0 %	50 %	50 %	209546021
624	NC_011366	GCA	2	6	25113	25118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546021
625	NC_011366	CTG	2	6	25129	25134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546021
626	NC_011366	GC	3	6	25243	25248	0 %	0 %	50 %	50 %	209546021
627	NC_011366	TTC	2	6	25261	25266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011366	AAC	2	6	25308	25313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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756	NC_011366	CGC	2	6	30783	30788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546027
757	NC_011366	TGC	2	6	30839	30844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546027
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759	NC_011366	TCG	2	6	30920	30925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546027
760	NC_011366	CGT	2	6	30927	30932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546027
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767	NC_011366	CCG	2	6	31241	31246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546027
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785	NC_011366	CCG	2	6	31917	31922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546028
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788	NC_011366	TGG	2	6	32087	32092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546028
789	NC_011366	CCG	2	6	32093	32098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546028
790	NC_011366	CGGC	2	8	32100	32107	0 %	0 %	50 %	50 %	209546028
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792	NC_011366	CGC	2	6	32322	32327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546028
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794	NC_011366	GCC	2	6	32372	32377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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797	NC_011366	AAAT	2	8	32418	32425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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866	NC_011366	ATG	2	6	35461	35466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546032
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868	NC_011366	CTG	2	6	35491	35496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546032
869	NC_011366	GGC	2	6	35508	35513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546032
870	NC_011366	CCGC	2	8	35571	35578	0 %	0 %	25 %	75 %	209546032
871	NC_011366	CGA	2	6	35586	35591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546032
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874	NC_011366	ACG	2	6	35722	35727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546032
875	NC_011366	GCA	2	6	35847	35852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546032
876	NC_011366	CGG	2	6	35866	35871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546032
877	NC_011366	GACGAT	2	12	35880	35891	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209546032
878	NC_011366	CAC	2	6	35946	35951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546032
879	NC_011366	TGA	2	6	36059	36064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546032
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