MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 15243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011004	CGTC	2	8	535	542	0 %	25 %	25 %	50 %	192288434
2	NC_011004	CTCG	2	8	873	880	0 %	25 %	25 %	50 %	192288434
3	NC_011004	GCCG	2	8	994	1001	0 %	0 %	50 %	50 %	192288434
4	NC_011004	CACC	2	8	1158	1165	25 %	0 %	0 %	75 %	192288434
5	NC_011004	CGAC	2	8	2008	2015	25 %	0 %	25 %	50 %	192288435
6	NC_011004	GCCG	2	8	2042	2049	0 %	0 %	50 %	50 %	192288435
7	NC_011004	GCCG	2	8	2175	2182	0 %	0 %	50 %	50 %	192288435
8	NC_011004	GATC	2	8	2288	2295	25 %	25 %	25 %	25 %	192288435
9	NC_011004	TATC	2	8	2345	2352	25 %	50 %	0 %	25 %	192288435
10	NC_011004	CGAC	2	8	2398	2405	25 %	0 %	25 %	50 %	192288435
11	NC_011004	ATCC	2	8	3062	3069	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011004	TCCG	2	8	3902	3909	0 %	25 %	25 %	50 %	192288436
13	NC_011004	TGGA	2	8	3930	3937	25 %	25 %	50 %	0 %	192288436
14	NC_011004	TCTA	2	8	4465	4472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011004	GCCG	2	8	4637	4644	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
16	NC_011004	GGCC	2	8	4790	4797	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
17	NC_011004	CTGG	2	8	5711	5718	0 %	25 %	50 %	25 %	192288437
18	NC_011004	TCCG	2	8	5726	5733	0 %	25 %	25 %	50 %	192288437
19	NC_011004	GGAA	2	8	6745	6752	50 %	0 %	50 %	0 %	192288437
20	NC_011004	GCCG	2	8	6804	6811	0 %	0 %	50 %	50 %	192288437
21	NC_011004	CGCT	2	8	6897	6904	0 %	25 %	25 %	50 %	192288437
22	NC_011004	CCAT	2	8	7107	7114	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011004	TCGA	2	8	7262	7269	25 %	25 %	25 %	25 %	192288438
24	NC_011004	GCCG	2	8	7990	7997	0 %	0 %	50 %	50 %	192288438
25	NC_011004	CGAG	2	8	8007	8014	25 %	0 %	50 %	25 %	192288438
26	NC_011004	GCCC	2	8	8375	8382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_011004	ACCA	2	8	8520	8527	50 %	0 %	0 %	50 %	192288439
28	NC_011004	CGGA	2	8	8723	8730	25 %	0 %	50 %	25 %	192288439
29	NC_011004	ATCG	2	8	8870	8877	25 %	25 %	25 %	25 %	192288439
30	NC_011004	CCGG	2	8	9420	9427	0 %	0 %	50 %	50 %	192288440
31	NC_011004	CGGC	2	8	9853	9860	0 %	0 %	50 %	50 %	192288440
32	NC_011004	GAGC	2	8	10155	10162	25 %	0 %	50 %	25 %	192288440
33	NC_011004	CATC	2	8	10244	10251	25 %	25 %	0 %	50 %	192288440
34	NC_011004	CGCT	2	8	10785	10792	0 %	25 %	25 %	50 %	192288442
35	NC_011004	CAGC	2	8	11441	11448	25 %	0 %	25 %	50 %	192288442
36	NC_011004	ACCG	2	8	11462	11469	25 %	0 %	25 %	50 %	192288442
37	NC_011004	TCGG	2	8	12114	12121	0 %	25 %	50 %	25 %	192288442
38	NC_011004	CGAG	2	8	12184	12191	25 %	0 %	50 %	25 %	192288442
39	NC_011004	CCTA	2	8	12539	12546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011004	AACT	2	8	12554	12561	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011004	ATCA	2	8	12618	12625	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011004	TCGA	2	8	13068	13075	25 %	25 %	25 %	25 %	192288443
43	NC_011004	GAAA	2	8	13367	13374	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011004	CGGA	2	8	13790	13797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011004	TCGG	2	8	13930	13937	0 %	25 %	50 %	25 %	192288445
46	NC_011004	CGGT	2	8	14025	14032	0 %	25 %	50 %	25 %	192288445
47	NC_011004	GCGA	2	8	14542	14549	25 %	0 %	50 %	25 %	192288447
48	NC_011004	CGGC	2	8	14630	14637	0 %	0 %	50 %	50 %	192288447
49	NC_011004	CCGG	2	8	15036	15043	0 %	0 %	50 %	50 %	192288447
50	NC_011004	CGGC	2	8	15536	15543	0 %	0 %	50 %	50 %	192288447
51	NC_011004	GCAC	2	8	15655	15662	25 %	0 %	25 %	50 %	192288447
52	NC_011004	TGAT	2	8	15847	15854	25 %	50 %	25 %	0 %	192288447
53	NC_011004	GCCG	2	8	16641	16648	0 %	0 %	50 %	50 %	192288448
54	NC_011004	GGCC	2	8	16674	16681	0 %	0 %	50 %	50 %	192288448
55	NC_011004	GGCT	2	8	16803	16810	0 %	25 %	50 %	25 %	192288448
56	NC_011004	TCCG	2	8	17279	17286	0 %	25 %	25 %	50 %	192288449
57	NC_011004	GATG	2	8	17455	17462	25 %	25 %	50 %	0 %	192288449
58	NC_011004	GCCG	2	8	18799	18806	0 %	0 %	50 %	50 %	192288450
59	NC_011004	CCGG	2	8	18819	18826	0 %	0 %	50 %	50 %	192288450
60	NC_011004	CGAA	3	12	18844	18855	50 %	0 %	25 %	25 %	192288450
61	NC_011004	CGAG	2	8	19140	19147	25 %	0 %	50 %	25 %	192288450
62	NC_011004	TCGG	2	8	19707	19714	0 %	25 %	50 %	25 %	192288452
63	NC_011004	CGGA	2	8	20123	20130	25 %	0 %	50 %	25 %	192288452
64	NC_011004	CGAC	2	8	20521	20528	25 %	0 %	25 %	50 %	192288453
65	NC_011004	CGAG	2	8	20554	20561	25 %	0 %	50 %	25 %	192288453
66	NC_011004	CGAC	2	8	20860	20867	25 %	0 %	25 %	50 %	192288453
67	NC_011004	CGGA	2	8	21635	21642	25 %	0 %	50 %	25 %	192288453
68	NC_011004	GCCG	2	8	21643	21650	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
69	NC_011004	GGCC	2	8	21709	21716	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
70	NC_011004	GGAC	2	8	22221	22228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011004	ATCA	2	8	22410	22417	50 %	25 %	0 %	25 %	192288454
72	NC_011004	ACCG	2	8	22632	22639	25 %	0 %	25 %	50 %	192288454
73	NC_011004	GAGC	2	8	22823	22830	25 %	0 %	50 %	25 %	192288454
74	NC_011004	GCCG	2	8	23192	23199	0 %	0 %	50 %	50 %	192288454
75	NC_011004	GCCC	2	8	23710	23717	0 %	0 %	25 %	75 %	192288455
76	NC_011004	CGAG	3	12	23874	23885	25 %	0 %	50 %	25 %	192288455
77	NC_011004	CGGC	2	8	23951	23958	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
78	NC_011004	GCGA	2	8	24085	24092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011004	CCAC	2	8	24409	24416	25 %	0 %	0 %	75 %	192288456
80	NC_011004	GACA	2	8	24969	24976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011004	CGGC	2	8	25227	25234	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
82	NC_011004	CGCC	2	8	25599	25606	0 %	0 %	25 %	75 %	192288457
83	NC_011004	GTCG	2	8	26324	26331	0 %	25 %	50 %	25 %	192288458
84	NC_011004	CATC	2	8	26850	26857	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011004	ATCG	2	8	28441	28448	25 %	25 %	25 %	25 %	192288459
86	NC_011004	CCGG	2	8	28744	28751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011004	GGAA	2	8	28753	28760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011004	GGGC	2	8	31018	31025	0 %	0 %	75 %	25 %	192288461
89	NC_011004	GCCA	2	8	31172	31179	25 %	0 %	25 %	50 %	192288461
90	NC_011004	GCGG	2	8	31763	31770	0 %	0 %	75 %	25 %	192288462
91	NC_011004	GCGG	2	8	31775	31782	0 %	0 %	75 %	25 %	192288462
92	NC_011004	TCGG	2	8	31908	31915	0 %	25 %	50 %	25 %	192288462
93	NC_011004	CCAT	2	8	32922	32929	25 %	25 %	0 %	50 %	192288462
94	NC_011004	GGCC	2	8	32974	32981	0 %	0 %	50 %	50 %	192288462
95	NC_011004	GGAA	2	8	33140	33147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011004	GGCG	2	8	33330	33337	0 %	0 %	75 %	25 %	192288463
97	NC_011004	TCGA	2	8	33407	33414	25 %	25 %	25 %	25 %	192288463
98	NC_011004	GCCA	2	8	33460	33467	25 %	0 %	25 %	50 %	192288463
99	NC_011004	GGCG	2	8	34039	34046	0 %	0 %	75 %	25 %	192288463
100	NC_011004	AGCG	2	8	34709	34716	25 %	0 %	50 %	25 %	192288463
101	NC_011004	CAGC	2	8	34762	34769	25 %	0 %	25 %	50 %	192288463
102	NC_011004	CGGC	2	8	34868	34875	0 %	0 %	50 %	50 %	192288463
103	NC_011004	ACGG	2	8	35110	35117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011004	GATC	2	8	35500	35507	25 %	25 %	25 %	25 %	192288464
105	NC_011004	AGCG	2	8	35657	35664	25 %	0 %	50 %	25 %	192288464
106	NC_011004	TCCA	2	8	36393	36400	25 %	25 %	0 %	50 %	192288464
107	NC_011004	TCGG	2	8	36450	36457	0 %	25 %	50 %	25 %	192288464
108	NC_011004	GAAC	2	8	37185	37192	50 %	0 %	25 %	25 %	192288466
109	NC_011004	CTTC	2	8	38575	38582	0 %	50 %	0 %	50 %	192288467
110	NC_011004	GCCG	2	8	38762	38769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011004	GCCG	2	8	38915	38922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011004	GGGC	3	12	39054	39065	0 %	0 %	75 %	25 %	192288468
113	NC_011004	CGGC	2	8	39713	39720	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
114	NC_011004	GCCC	2	8	40394	40401	0 %	0 %	25 %	75 %	192288468
115	NC_011004	CAGC	2	8	40977	40984	25 %	0 %	25 %	50 %	192288469
116	NC_011004	GCCG	2	8	41043	41050	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
117	NC_011004	GCGA	2	8	41912	41919	25 %	0 %	50 %	25 %	192288469
118	NC_011004	GCGA	2	8	42069	42076	25 %	0 %	50 %	25 %	192288469
119	NC_011004	ACCG	2	8	42418	42425	25 %	0 %	25 %	50 %	192288469
120	NC_011004	CGGC	2	8	42432	42439	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
121	NC_011004	CCGC	2	8	43723	43730	0 %	0 %	25 %	75 %	192288471
122	NC_011004	CGAT	2	8	43837	43844	25 %	25 %	25 %	25 %	192288471
123	NC_011004	CCAG	2	8	43937	43944	25 %	0 %	25 %	50 %	192288471
124	NC_011004	CTTC	2	8	44294	44301	0 %	50 %	0 %	50 %	192288471
125	NC_011004	CATC	2	8	44838	44845	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011004	GGCC	2	8	45166	45173	0 %	0 %	50 %	50 %	192288472
127	NC_011004	GTTC	2	8	45882	45889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011004	GGCC	2	8	46660	46667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011004	AACC	2	8	46744	46751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011004	GCTG	2	8	47029	47036	0 %	25 %	50 %	25 %	192288475
131	NC_011004	GCTG	2	8	47438	47445	0 %	25 %	50 %	25 %	192288475
132	NC_011004	CCGA	2	8	47454	47461	25 %	0 %	25 %	50 %	192288475
133	NC_011004	GGCG	2	8	47615	47622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011004	GATT	2	8	47695	47702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011004	CCGC	2	8	47742	47749	0 %	0 %	25 %	75 %	192288476
136	NC_011004	AGGC	2	8	48260	48267	25 %	0 %	50 %	25 %	192288476
137	NC_011004	CGGA	2	8	48936	48943	25 %	0 %	50 %	25 %	192288477
138	NC_011004	ATCG	2	8	49020	49027	25 %	25 %	25 %	25 %	192288477
139	NC_011004	CAGC	2	8	49101	49108	25 %	0 %	25 %	50 %	192288477
140	NC_011004	CATC	2	8	49157	49164	25 %	25 %	0 %	50 %	192288477
141	NC_011004	CGCC	2	8	50001	50008	0 %	0 %	25 %	75 %	192288478
142	NC_011004	GTGG	2	8	50100	50107	0 %	25 %	75 %	0 %	192288478
143	NC_011004	GCCG	2	8	51526	51533	0 %	0 %	50 %	50 %	192288479
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