MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011004	TCG	2	6	132602	132607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288553
3502	NC_011004	GCT	2	6	132618	132623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288553
3503	NC_011004	GCAG	2	8	132624	132631	25 %	0 %	50 %	25 %	192288553
3504	NC_011004	CAC	2	6	132685	132690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288553
3505	NC_011004	CGA	2	6	132699	132704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288553
3506	NC_011004	CAC	2	6	132817	132822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288553
3507	NC_011004	GGT	2	6	132837	132842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288553
3508	NC_011004	CAA	2	6	132858	132863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288553
3509	NC_011004	ATC	2	6	132907	132912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288553
3510	NC_011004	GCT	3	9	132999	133007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288553
3511	NC_011004	CGC	2	6	133008	133013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288553
3512	NC_011004	GCG	2	6	133019	133024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288553
3513	NC_011004	CGA	2	6	133104	133109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288553
3514	NC_011004	GCG	2	6	133123	133128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288553
3515	NC_011004	TCG	2	6	133157	133162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288553
3516	NC_011004	ACG	2	6	133178	133183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288553
3517	NC_011004	CGAT	2	8	133193	133200	25 %	25 %	25 %	25 %	192288553
3518	NC_011004	GC	3	6	133234	133239	0 %	0 %	50 %	50 %	192288553
3519	NC_011004	CGA	2	6	133248	133253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288553
3520	NC_011004	ACA	2	6	133286	133291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288553
3521	NC_011004	GTG	2	6	133296	133301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288553
3522	NC_011004	GCG	2	6	133356	133361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288553
3523	NC_011004	CAA	2	6	133369	133374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_011004	ACA	2	6	133473	133478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288554
3525	NC_011004	TCG	2	6	133488	133493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288554
3526	NC_011004	GC	3	6	133578	133583	0 %	0 %	50 %	50 %	192288554
3527	NC_011004	ACT	2	6	133791	133796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288554
3528	NC_011004	CGC	3	9	133800	133808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288554
3529	NC_011004	GCC	2	6	133903	133908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288554
3530	NC_011004	ACT	2	6	133926	133931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288554
3531	NC_011004	TCG	2	6	133951	133956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288555
3532	NC_011004	GTC	2	6	133963	133968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288555
3533	NC_011004	GC	3	6	133997	134002	0 %	0 %	50 %	50 %	192288555
3534	NC_011004	ATC	2	6	134022	134027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288555
3535	NC_011004	CTG	2	6	134028	134033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288555
3536	NC_011004	CCGG	2	8	134036	134043	0 %	0 %	50 %	50 %	192288555
3537	NC_011004	CGAG	2	8	134062	134069	25 %	0 %	50 %	25 %	192288555
3538	NC_011004	GTC	2	6	134106	134111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288555
3539	NC_011004	TGC	2	6	134114	134119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288555
3540	NC_011004	CGAC	2	8	134242	134249	25 %	0 %	25 %	50 %	192288555
3541	NC_011004	CCG	2	6	134266	134271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288555
3542	NC_011004	AGC	2	6	134272	134277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288555
3543	NC_011004	GC	3	6	134342	134347	0 %	0 %	50 %	50 %	192288555
3544	NC_011004	CCT	2	6	134386	134391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288555
3545	NC_011004	CTGGCC	2	12	134433	134444	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288555
3546	NC_011004	GGT	2	6	134465	134470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288555
3547	NC_011004	GC	3	6	134497	134502	0 %	0 %	50 %	50 %	192288555
3548	NC_011004	CGT	2	6	134528	134533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288555
3549	NC_011004	CTG	2	6	134541	134546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288555
3550	NC_011004	CGC	2	6	134636	134641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288555
3551	NC_011004	AGC	2	6	134648	134653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288555
3552	NC_011004	CGG	2	6	134654	134659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288555
3553	NC_011004	CGA	2	6	134719	134724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288555
3554	NC_011004	GGC	2	6	134782	134787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288555
3555	NC_011004	GCT	2	6	134813	134818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288555
3556	NC_011004	TAT	2	6	134947	134952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192288556
3557	NC_011004	TGA	2	6	134966	134971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288556
3558	NC_011004	CCG	2	6	135008	135013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288556
3559	NC_011004	CCA	2	6	135027	135032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288556
3560	NC_011004	TCA	2	6	135113	135118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288556
3561	NC_011004	TCG	2	6	135131	135136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288556
3562	NC_011004	GCT	2	6	135198	135203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288556
3563	NC_011004	CGC	2	6	135210	135215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288556
3564	NC_011004	CGT	2	6	135276	135281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288556
3565	NC_011004	CG	3	6	135303	135308	0 %	0 %	50 %	50 %	192288556
3566	NC_011004	TCGA	2	8	135310	135317	25 %	25 %	25 %	25 %	192288556
3567	NC_011004	CGT	2	6	135381	135386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288556
3568	NC_011004	CTG	2	6	135588	135593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288556
3569	NC_011004	GAG	2	6	135598	135603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288556
3570	NC_011004	CGGTT	2	10	135613	135622	0 %	40 %	40 %	20 %	192288556
3571	NC_011004	CGG	2	6	135678	135683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288556
3572	NC_011004	GGC	2	6	135699	135704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288556
3573	NC_011004	GCC	2	6	135724	135729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_011004	CGG	2	6	135745	135750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_011004	GCT	2	6	135757	135762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_011004	GAA	2	6	135807	135812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288557
3577	NC_011004	GC	3	6	135877	135882	0 %	0 %	50 %	50 %	192288557
3578	NC_011004	GATC	2	8	135891	135898	25 %	25 %	25 %	25 %	192288557
3579	NC_011004	GCA	2	6	135909	135914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288557
3580	NC_011004	CGC	2	6	135936	135941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288557
3581	NC_011004	CCGG	2	8	135959	135966	0 %	0 %	50 %	50 %	192288557
3582	NC_011004	CG	3	6	135967	135972	0 %	0 %	50 %	50 %	192288557
3583	NC_011004	CGAT	2	8	136004	136011	25 %	25 %	25 %	25 %	192288557
3584	NC_011004	GAC	2	6	136081	136086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288557
3585	NC_011004	CGC	2	6	136089	136094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288557
3586	NC_011004	GC	3	6	136137	136142	0 %	0 %	50 %	50 %	192288557
3587	NC_011004	AGA	2	6	136160	136165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288557
3588	NC_011004	CAT	2	6	136209	136214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288557
3589	NC_011004	GC	3	6	136223	136228	0 %	0 %	50 %	50 %	192288557
3590	NC_011004	GAT	2	6	136276	136281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288557
3591	NC_011004	CGC	2	6	136289	136294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288557
3592	NC_011004	CGAG	2	8	136340	136347	25 %	0 %	50 %	25 %	192288557
3593	NC_011004	ATG	2	6	136375	136380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288557
3594	NC_011004	CGG	3	9	136446	136454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288557
3595	NC_011004	CAG	2	6	136498	136503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288557
3596	NC_011004	GTG	2	6	136633	136638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288557
3597	NC_011004	GCT	2	6	136644	136649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288557
3598	NC_011004	GCC	2	6	136680	136685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288557
3599	NC_011004	TGAG	2	8	136770	136777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_011004	GCG	2	6	136801	136806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288558
3601	NC_011004	CGA	2	6	136904	136909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288558
3602	NC_011004	TGC	2	6	136924	136929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288558
3603	NC_011004	GCG	2	6	136947	136952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288558
3604	NC_011004	GCC	2	6	136964	136969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288558
3605	NC_011004	CGC	2	6	136994	136999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288558
3606	NC_011004	GGGC	2	8	137008	137015	0 %	0 %	75 %	25 %	192288558
3607	NC_011004	GCTCG	2	10	137027	137036	0 %	20 %	40 %	40 %	192288558
3608	NC_011004	TCCT	2	8	137085	137092	0 %	50 %	0 %	50 %	192288558
3609	NC_011004	GCG	2	6	137131	137136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288558
3610	NC_011004	ATC	2	6	137142	137147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288558
3611	NC_011004	ACG	2	6	137184	137189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288558
3612	NC_011004	TTC	2	6	137256	137261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288558
3613	NC_011004	CGAGG	2	10	137354	137363	20 %	0 %	60 %	20 %	192288558
3614	NC_011004	GAT	2	6	137367	137372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288558
3615	NC_011004	CGAC	2	8	137404	137411	25 %	0 %	25 %	50 %	192288558
3616	NC_011004	CGG	2	6	137427	137432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288558
3617	NC_011004	CTG	2	6	137490	137495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288558
3618	NC_011004	GCG	2	6	137496	137501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288558
3619	NC_011004	CGC	2	6	137506	137511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288558
3620	NC_011004	CCGGT	2	10	137518	137527	0 %	20 %	40 %	40 %	192288558
3621	NC_011004	GAA	2	6	137582	137587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288558
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3651	NC_011004	GCCG	2	8	138682	138689	0 %	0 %	50 %	50 %	192288558
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3743	NC_011004	CGT	2	6	142656	142661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288562
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3770	NC_011004	GTTGG	2	10	143706	143715	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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3982	NC_011004	CG	3	6	151869	151874	0 %	0 %	50 %	50 %	192288570
3983	NC_011004	CAGGA	2	10	151875	151884	40 %	0 %	40 %	20 %	192288570
3984	NC_011004	CGG	2	6	151945	151950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288570
3985	NC_011004	GAC	2	6	152028	152033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288571
3986	NC_011004	AGC	2	6	152048	152053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288571
3987	NC_011004	GGC	2	6	152079	152084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288571
3988	NC_011004	CGA	2	6	152186	152191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288571
3989	NC_011004	GAA	2	6	152247	152252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288571
3990	NC_011004	TCG	2	6	152278	152283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288571
3991	NC_011004	GC	3	6	152289	152294	0 %	0 %	50 %	50 %	192288571
3992	NC_011004	CGC	2	6	152351	152356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288571
3993	NC_011004	CGGT	2	8	152392	152399	0 %	25 %	50 %	25 %	192288571
3994	NC_011004	CTG	2	6	152463	152468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288571
3995	NC_011004	CGC	2	6	152536	152541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288571
3996	NC_011004	GCTC	2	8	152555	152562	0 %	25 %	25 %	50 %	192288571
3997	NC_011004	CAC	2	6	152580	152585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288571
3998	NC_011004	CGGC	2	8	152618	152625	0 %	0 %	50 %	50 %	192288571
3999	NC_011004	GC	4	8	152656	152663	0 %	0 %	50 %	50 %	192288571
4000	NC_011004	CGGC	2	8	152684	152691	0 %	0 %	50 %	50 %	192288571

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