MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_011004	GCCA	2	8	94359	94366	25 %	0 %	25 %	50 %	192288518
2503	NC_011004	GC	3	6	94367	94372	0 %	0 %	50 %	50 %	192288518
2504	NC_011004	CAC	2	6	94419	94424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288518
2505	NC_011004	ACC	3	9	94483	94491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288518
2506	NC_011004	TCT	2	6	94496	94501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288518
2507	NC_011004	GCA	2	6	94502	94507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288518
2508	NC_011004	CCGG	2	8	94517	94524	0 %	0 %	50 %	50 %	192288518
2509	NC_011004	AGC	3	9	94555	94563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288518
2510	NC_011004	CAG	2	6	94566	94571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288518
2511	NC_011004	GGCGA	2	10	94593	94602	20 %	0 %	60 %	20 %	192288518
2512	NC_011004	ATG	2	6	94656	94661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288518
2513	NC_011004	CGG	2	6	94662	94667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288518
2514	NC_011004	TGA	2	6	94718	94723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288518
2515	NC_011004	GCA	2	6	94763	94768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288518
2516	NC_011004	ATG	2	6	94777	94782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288518
2517	NC_011004	GAA	2	6	94851	94856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288518
2518	NC_011004	CTT	2	6	94928	94933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288518
2519	NC_011004	CGC	2	6	95067	95072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288518
2520	NC_011004	TCCATC	2	12	95092	95103	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	192288518
2521	NC_011004	TGA	2	6	95126	95131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288518
2522	NC_011004	CCG	2	6	95148	95153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288518
2523	NC_011004	AGA	2	6	95192	95197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288518
2524	NC_011004	CGA	2	6	95223	95228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288518
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2527	NC_011004	CGG	2	6	95325	95330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288518
2528	NC_011004	CGG	2	6	95409	95414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288518
2529	NC_011004	CGA	2	6	95459	95464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288518
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2531	NC_011004	CGG	2	6	95600	95605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288518
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2533	NC_011004	CG	4	8	95645	95652	0 %	0 %	50 %	50 %	192288518
2534	NC_011004	GGC	2	6	95661	95666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288518
2535	NC_011004	TGAG	2	8	95686	95693	25 %	25 %	50 %	0 %	192288518
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2539	NC_011004	TCA	2	6	95743	95748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288519
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2541	NC_011004	CAT	2	6	95783	95788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288519
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2555	NC_011004	ATC	2	6	96300	96305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288519
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2557	NC_011004	TCA	2	6	96349	96354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288519
2558	NC_011004	CGGC	2	8	96363	96370	0 %	0 %	50 %	50 %	192288519
2559	NC_011004	CGT	2	6	96385	96390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288519
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2561	NC_011004	GCC	2	6	96504	96509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_011004	CGG	2	6	96523	96528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_011004	CGG	2	6	96533	96538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_011004	GC	3	6	96547	96552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2565	NC_011004	ACG	2	6	96613	96618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_011004	CGG	2	6	96627	96632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_011004	CGC	2	6	96648	96653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2568	NC_011004	CGAG	2	8	96696	96703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2572	NC_011004	CGGC	2	8	96865	96872	0 %	0 %	50 %	50 %	192288520
2573	NC_011004	CTG	2	6	96884	96889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288520
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2582	NC_011004	CCGA	2	8	97343	97350	25 %	0 %	25 %	50 %	192288520
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2598	NC_011004	GCA	2	6	98004	98009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288521
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2602	NC_011004	GACA	2	8	98127	98134	50 %	0 %	25 %	25 %	192288521
2603	NC_011004	CGA	2	6	98179	98184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288521
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2626	NC_011004	GGC	2	6	98936	98941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288521
2627	NC_011004	CGA	2	6	98947	98952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288521
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2731	NC_011004	AGTT	2	8	102859	102866	25 %	50 %	25 %	0 %	192288527
2732	NC_011004	GC	4	8	102870	102877	0 %	0 %	50 %	50 %	192288527
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2747	NC_011004	GCC	2	6	103313	103318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2748	NC_011004	CTGC	2	8	103335	103342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2749	NC_011004	TGG	2	6	103370	103375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288528
2750	NC_011004	GCT	2	6	103443	103448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288528
2751	NC_011004	CGA	2	6	103524	103529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288528
2752	NC_011004	CGG	2	6	103554	103559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288528
2753	NC_011004	GGC	2	6	103572	103577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288528
2754	NC_011004	CGG	2	6	103580	103585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288528
2755	NC_011004	CAC	2	6	103623	103628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288528
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2760	NC_011004	CTA	2	6	103801	103806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2761	NC_011004	CAC	2	6	103834	103839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2762	NC_011004	CG	3	6	103842	103847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2763	NC_011004	CGG	2	6	103866	103871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2764	NC_011004	CGAC	2	8	103896	103903	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2765	NC_011004	TCA	2	6	103928	103933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2766	NC_011004	AAC	2	6	103968	103973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2767	NC_011004	CGT	2	6	103989	103994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2768	NC_011004	GAT	2	6	104067	104072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2769	NC_011004	CGA	2	6	104092	104097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2770	NC_011004	TCGCGG	2	12	104197	104208	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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2772	NC_011004	TGC	2	6	104299	104304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288529
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2780	NC_011004	CG	3	6	104618	104623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2781	NC_011004	GCCCC	2	10	104634	104643	0 %	0 %	20 %	80 %	192288530
2782	NC_011004	AGC	2	6	104648	104653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288530
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2851	NC_011004	GCGCA	2	10	106746	106755	20 %	0 %	40 %	40 %	192288532
2852	NC_011004	CCG	2	6	106756	106761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288532
2853	NC_011004	GGCGCA	2	12	106778	106789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192288532
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2860	NC_011004	CGGC	2	8	107039	107046	0 %	0 %	50 %	50 %	192288532
2861	NC_011004	TCG	2	6	107074	107079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288532
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2864	NC_011004	CAT	2	6	107108	107113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288532
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2866	NC_011004	CGG	3	9	107147	107155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288532
2867	NC_011004	CG	3	6	107209	107214	0 %	0 %	50 %	50 %	192288532
2868	NC_011004	GACC	2	8	107246	107253	25 %	0 %	25 %	50 %	192288532
2869	NC_011004	CTACGT	2	12	107264	107275	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	192288532
2870	NC_011004	GCG	2	6	107300	107305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288532
2871	NC_011004	TCG	2	6	107380	107385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288532
2872	NC_011004	GC	3	6	107400	107405	0 %	0 %	50 %	50 %	192288532
2873	NC_011004	CGCC	2	8	107428	107435	0 %	0 %	25 %	75 %	192288532
2874	NC_011004	GCC	3	9	107433	107441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288532
2875	NC_011004	CGC	2	6	107507	107512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288533
2876	NC_011004	GCT	2	6	107552	107557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2877	NC_011004	CGC	2	6	107593	107598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288533
2878	NC_011004	CGA	2	6	107611	107616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2879	NC_011004	CCG	2	6	107632	107637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288533
2880	NC_011004	GTC	2	6	107679	107684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2881	NC_011004	ACG	2	6	107725	107730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288533
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2883	NC_011004	TCCG	2	8	107828	107835	0 %	25 %	25 %	50 %	192288533
2884	NC_011004	TCG	3	9	107871	107879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2885	NC_011004	TGC	2	6	107881	107886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
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2889	NC_011004	CGT	2	6	108083	108088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2890	NC_011004	CGC	2	6	108089	108094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288533
2891	NC_011004	GC	4	8	108136	108143	0 %	0 %	50 %	50 %	192288533
2892	NC_011004	CGA	2	6	108152	108157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2893	NC_011004	GGA	2	6	108206	108211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288533
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2896	NC_011004	CATCGG	2	12	108335	108346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288533
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2899	NC_011004	TGC	2	6	108496	108501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2900	NC_011004	ATC	2	6	108582	108587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288533
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2915	NC_011004	TGGCGG	2	12	109090	109101	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	192288533
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2939	NC_011004	CCGGC	2	10	109891	109900	0 %	0 %	40 %	60 %	192288533
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2949	NC_011004	GGCGC	2	10	110453	110462	0 %	0 %	60 %	40 %	192288533
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2954	NC_011004	TGT	2	6	110690	110695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2961	NC_011004	TGG	2	6	111034	111039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288534
2962	NC_011004	CCTCG	2	10	111110	111119	0 %	20 %	20 %	60 %	192288534
2963	NC_011004	GCT	2	6	111149	111154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288534
2964	NC_011004	GGC	2	6	111189	111194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2966	NC_011004	GCG	2	6	111261	111266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2967	NC_011004	GAC	2	6	111293	111298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2974	NC_011004	CGCGG	2	10	111596	111605	0 %	0 %	60 %	40 %	192288535
2975	NC_011004	TCG	2	6	111665	111670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288535
2976	NC_011004	CTG	2	6	111676	111681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288535
2977	NC_011004	CGCGCT	2	12	111723	111734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288535
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2980	NC_011004	GC	4	8	111833	111840	0 %	0 %	50 %	50 %	192288535
2981	NC_011004	GCCGCT	2	12	111849	111860	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288535
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2984	NC_011004	CGG	2	6	111901	111906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288535
2985	NC_011004	AGC	2	6	111923	111928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288535
2986	NC_011004	CGGCG	2	10	112002	112011	0 %	0 %	60 %	40 %	192288535
2987	NC_011004	ATG	2	6	112097	112102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288535
2988	NC_011004	CGC	2	6	112107	112112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288535
2989	NC_011004	ACC	2	6	112118	112123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288535
2990	NC_011004	GGT	2	6	112165	112170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288535
2991	NC_011004	CGA	2	6	112194	112199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288535
2992	NC_011004	GGT	2	6	112207	112212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288535
2993	NC_011004	CAC	2	6	112300	112305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288535
2994	NC_011004	ATC	2	6	112364	112369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288535
2995	NC_011004	GCG	2	6	112372	112377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288536
2996	NC_011004	GCG	2	6	112430	112435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288536
2997	NC_011004	CGAC	2	8	112446	112453	25 %	0 %	25 %	50 %	192288536
2998	NC_011004	GC	3	6	112476	112481	0 %	0 %	50 %	50 %	192288536
2999	NC_011004	CTC	2	6	112554	112559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288536
3000	NC_011004	CG	3	6	112607	112612	0 %	0 %	50 %	50 %	192288536

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