MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011004	CTT	2	6	56759	56764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288485
1502	NC_011004	CG	3	6	56845	56850	0 %	0 %	50 %	50 %	192288485
1503	NC_011004	CAA	2	6	56858	56863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288485
1504	NC_011004	TTC	2	6	56904	56909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288485
1505	NC_011004	CCG	2	6	56926	56931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288485
1506	NC_011004	CGG	2	6	56933	56938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288485
1507	NC_011004	GAT	2	6	57018	57023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288485
1508	NC_011004	TCG	2	6	57028	57033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288485
1509	NC_011004	CG	3	6	57062	57067	0 %	0 %	50 %	50 %	192288485
1510	NC_011004	CA	3	6	57149	57154	50 %	0 %	0 %	50 %	192288485
1511	NC_011004	AGCATC	2	12	57279	57290	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	192288486
1512	NC_011004	GAG	2	6	57327	57332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288486
1513	NC_011004	TGC	2	6	57334	57339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288486
1514	NC_011004	CGGCTT	2	12	57389	57400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288486
1515	NC_011004	CGA	2	6	57635	57640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288486
1516	NC_011004	ATC	2	6	57672	57677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288486
1517	NC_011004	CCA	2	6	57685	57690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288486
1518	NC_011004	GGT	2	6	57722	57727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288486
1519	NC_011004	GGT	3	9	57752	57760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288486
1520	NC_011004	CAT	2	6	57791	57796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288486
1521	NC_011004	CGC	2	6	57801	57806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288486
1522	NC_011004	CCG	2	6	57834	57839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288486
1523	NC_011004	ACC	2	6	57882	57887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1524	NC_011004	CCG	2	6	57941	57946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_011004	CGG	2	6	57952	57957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_011004	GCC	2	6	57978	57983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_011004	CG	3	6	58049	58054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_011004	CCG	2	6	58088	58093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_011004	TGA	2	6	58134	58139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288487
1530	NC_011004	AAG	2	6	58196	58201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288487
1531	NC_011004	TGC	3	9	58272	58280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288487
1532	NC_011004	CAC	2	6	58297	58302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288487
1533	NC_011004	CG	3	6	58372	58377	0 %	0 %	50 %	50 %	192288487
1534	NC_011004	CGAT	2	8	58389	58396	25 %	25 %	25 %	25 %	192288487
1535	NC_011004	CTG	3	9	58436	58444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288487
1536	NC_011004	ACC	2	6	58467	58472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288487
1537	NC_011004	CGCC	2	8	58492	58499	0 %	0 %	25 %	75 %	192288487
1538	NC_011004	TGC	2	6	58500	58505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288487
1539	NC_011004	AAG	2	6	58523	58528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288487
1540	NC_011004	GC	3	6	58531	58536	0 %	0 %	50 %	50 %	192288487
1541	NC_011004	GCG	2	6	58589	58594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288487
1542	NC_011004	CCGGG	2	10	58615	58624	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1543	NC_011004	TGA	2	6	58736	58741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011004	TGA	2	6	58756	58761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011004	CGA	2	6	58828	58833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_011004	GAG	2	6	58862	58867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011004	G	6	6	58899	58904	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_011004	GAT	2	6	58917	58922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011004	CTC	2	6	58939	58944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_011004	TCA	2	6	58981	58986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_011004	CGT	3	9	59031	59039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_011004	GC	3	6	59046	59051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_011004	GTT	2	6	59058	59063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_011004	CTG	2	6	59106	59111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_011004	CAG	2	6	59142	59147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_011004	CGCGT	2	10	59172	59181	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1557	NC_011004	CGC	2	6	59251	59256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288488
1558	NC_011004	GTA	2	6	59450	59455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288488
1559	NC_011004	CTC	2	6	59478	59483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_011004	ATT	2	6	59519	59524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192288489
1561	NC_011004	TCCGGC	2	12	59560	59571	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288489
1562	NC_011004	TCGA	2	8	59581	59588	25 %	25 %	25 %	25 %	192288489
1563	NC_011004	CAA	2	6	59589	59594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288489
1564	NC_011004	TTC	2	6	59599	59604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288489
1565	NC_011004	CTG	2	6	59706	59711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288489
1566	NC_011004	TGC	2	6	59816	59821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288489
1567	NC_011004	TGT	2	6	59837	59842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288489
1568	NC_011004	G	6	6	59845	59850	0 %	0 %	100 %	0 %	192288489
1569	NC_011004	GAC	2	6	59868	59873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288489
1570	NC_011004	TCG	2	6	59896	59901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288489
1571	NC_011004	CAG	2	6	59907	59912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288489
1572	NC_011004	GTCCA	2	10	60015	60024	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1573	NC_011004	AAG	2	6	60056	60061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011004	CCA	2	6	60078	60083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_011004	CGG	2	6	60112	60117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288490
1576	NC_011004	CGG	2	6	60125	60130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288490
1577	NC_011004	TG	3	6	60146	60151	0 %	50 %	50 %	0 %	192288490
1578	NC_011004	CGG	2	6	60183	60188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288490
1579	NC_011004	C	7	7	60221	60227	0 %	0 %	0 %	100 %	192288490
1580	NC_011004	ACC	2	6	60253	60258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288490
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1582	NC_011004	TCC	2	6	60385	60390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288490
1583	NC_011004	CCG	2	6	60416	60421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288490
1584	NC_011004	CAG	2	6	60462	60467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288490
1585	NC_011004	CGG	2	6	60474	60479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288490
1586	NC_011004	GTC	2	6	60505	60510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288490
1587	NC_011004	GCG	2	6	60533	60538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288490
1588	NC_011004	TCA	2	6	60566	60571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288490
1589	NC_011004	GTG	2	6	60631	60636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288490
1590	NC_011004	TCG	2	6	60712	60717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288490
1591	NC_011004	CG	3	6	60747	60752	0 %	0 %	50 %	50 %	192288490
1592	NC_011004	GCC	2	6	60777	60782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288490
1593	NC_011004	GC	3	6	60831	60836	0 %	0 %	50 %	50 %	192288490
1594	NC_011004	CG	3	6	60850	60855	0 %	0 %	50 %	50 %	192288490
1595	NC_011004	TGT	3	9	60902	60910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288490
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1597	NC_011004	CGT	2	6	60980	60985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288490
1598	NC_011004	GAC	2	6	60987	60992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288490
1599	NC_011004	GCC	2	6	60996	61001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288490
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1602	NC_011004	CGG	2	6	61256	61261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288491
1603	NC_011004	GTC	2	6	61361	61366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288491
1604	NC_011004	GTG	2	6	61371	61376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288491
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1606	NC_011004	GCC	2	6	61434	61439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288491
1607	NC_011004	GCA	2	6	61459	61464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288491
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1609	NC_011004	GAA	2	6	61541	61546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288491
1610	NC_011004	CAG	2	6	61556	61561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288491
1611	NC_011004	CAG	2	6	61613	61618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288491
1612	NC_011004	CGG	2	6	61627	61632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288491
1613	NC_011004	GCA	2	6	61669	61674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288491
1614	NC_011004	TGA	2	6	61681	61686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288491
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1616	NC_011004	AGA	2	6	61696	61701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288491
1617	NC_011004	CGGAA	2	10	61710	61719	40 %	0 %	40 %	20 %	192288491
1618	NC_011004	GAT	2	6	61748	61753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288491
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1620	NC_011004	GTG	2	6	61833	61838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288491
1621	NC_011004	GGA	2	6	61841	61846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288491
1622	NC_011004	CGA	2	6	61849	61854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288491
1623	NC_011004	GTA	2	6	61865	61870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288491
1624	NC_011004	AGC	2	6	61896	61901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288491
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1626	NC_011004	CGA	2	6	61945	61950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288491
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