MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011004	GCT	2	6	579344	579349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288961
15002	NC_011004	CTT	2	6	579357	579362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288961
15003	NC_011004	GCC	2	6	579441	579446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288961
15004	NC_011004	TCG	2	6	579466	579471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288961
15005	NC_011004	CGG	2	6	579486	579491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288961
15006	NC_011004	CTG	2	6	579516	579521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288961
15007	NC_011004	GCG	2	6	579537	579542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288961
15008	NC_011004	GCG	2	6	579557	579562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288961
15009	NC_011004	CG	3	6	579617	579622	0 %	0 %	50 %	50 %	192288961
15010	NC_011004	ATCG	2	8	579630	579637	25 %	25 %	25 %	25 %	192288961
15011	NC_011004	CAC	2	6	579657	579662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288961
15012	NC_011004	GAAG	2	8	579701	579708	50 %	0 %	50 %	0 %	192288961
15013	NC_011004	GAT	2	6	579753	579758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288961
15014	NC_011004	GTC	2	6	579783	579788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288961
15015	NC_011004	CGT	2	6	579800	579805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288961
15016	NC_011004	T	6	6	579903	579908	0 %	100 %	0 %	0 %	192288961
15017	NC_011004	CA	4	8	579945	579952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15018	NC_011004	GGA	2	6	579954	579959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_011004	CGC	2	6	579969	579974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15020	NC_011004	CAG	2	6	579982	579987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_011004	GCAAT	2	10	579996	580005	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15022	NC_011004	GCG	2	6	580045	580050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_011004	CGC	2	6	580053	580058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15024	NC_011004	GTG	2	6	580062	580067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_011004	CGC	2	6	580089	580094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15026	NC_011004	CGC	3	9	580121	580129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15027	NC_011004	CCG	2	6	580175	580180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15028	NC_011004	GTC	2	6	580232	580237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288962
15029	NC_011004	CGCA	2	8	580249	580256	25 %	0 %	25 %	50 %	192288962
15030	NC_011004	GCG	2	6	580341	580346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288962
15031	NC_011004	CCG	2	6	580395	580400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288962
15032	NC_011004	AGGC	2	8	580421	580428	25 %	0 %	50 %	25 %	192288962
15033	NC_011004	GCC	2	6	580436	580441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288962
15034	NC_011004	TGA	2	6	580527	580532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288962
15035	NC_011004	CGG	2	6	580558	580563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288962
15036	NC_011004	GCG	3	9	580605	580613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288962
15037	NC_011004	TCG	2	6	580635	580640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288962
15038	NC_011004	CCG	2	6	580698	580703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288962
15039	NC_011004	CG	3	6	580711	580716	0 %	0 %	50 %	50 %	192288962
15040	NC_011004	CAG	2	6	580739	580744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288962
15041	NC_011004	GCA	2	6	580765	580770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288962
15042	NC_011004	CGA	2	6	580864	580869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288962
15043	NC_011004	CGG	2	6	580944	580949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288962
15044	NC_011004	ACG	2	6	580968	580973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288962
15045	NC_011004	GGT	2	6	580984	580989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288962
15046	NC_011004	TGA	2	6	580992	580997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288962
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15049	NC_011004	GCG	2	6	581111	581116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288962
15050	NC_011004	GAA	2	6	581119	581124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288962
15051	NC_011004	GGCT	2	8	581125	581132	0 %	25 %	50 %	25 %	192288962
15052	NC_011004	GGTC	2	8	581133	581140	0 %	25 %	50 %	25 %	192288962
15053	NC_011004	CGATCT	2	12	581143	581154	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	192288962
15054	NC_011004	GC	3	6	581282	581287	0 %	0 %	50 %	50 %	192288962
15055	NC_011004	GCT	2	6	581299	581304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288962
15056	NC_011004	GAA	2	6	581329	581334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288962
15057	NC_011004	CGG	2	6	581356	581361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288962
15058	NC_011004	CG	4	8	581386	581393	0 %	0 %	50 %	50 %	192288962
15059	NC_011004	GT	3	6	581404	581409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_011004	CGA	2	6	581412	581417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_011004	CGAG	2	8	581506	581513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15062	NC_011004	A	6	6	581552	581557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_011004	GAG	2	6	581568	581573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_011004	G	6	6	581605	581610	0 %	0 %	100 %	0 %	192288963
15065	NC_011004	CG	3	6	581612	581617	0 %	0 %	50 %	50 %	192288963
15066	NC_011004	GCA	2	6	581626	581631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288963
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15069	NC_011004	GTTC	2	8	581750	581757	0 %	50 %	25 %	25 %	192288963
15070	NC_011004	CAA	2	6	581820	581825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288963
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15072	NC_011004	TCG	2	6	581977	581982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288963
15073	NC_011004	GGCG	2	8	582033	582040	0 %	0 %	75 %	25 %	192288963
15074	NC_011004	GCGCTG	2	12	582058	582069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192288963
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15076	NC_011004	GGC	2	6	582082	582087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288963
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15079	NC_011004	GTG	2	6	582226	582231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288963
15080	NC_011004	CGA	2	6	582243	582248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288963
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15082	NC_011004	GT	3	6	582340	582345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_011004	GGCG	2	8	582370	582377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15084	NC_011004	CG	3	6	582390	582395	0 %	0 %	50 %	50 %	192288964
15085	NC_011004	GCT	2	6	582436	582441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288964
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15090	NC_011004	GTCGGC	2	12	582590	582601	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192288964
15091	NC_011004	GCCG	2	8	582652	582659	0 %	0 %	50 %	50 %	192288964
15092	NC_011004	GCT	2	6	582688	582693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288964
15093	NC_011004	GCT	2	6	582712	582717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288964
15094	NC_011004	GCGA	2	8	582723	582730	25 %	0 %	50 %	25 %	192288964
15095	NC_011004	CAT	2	6	582740	582745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288964
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15099	NC_011004	AGTGC	2	10	582896	582905	20 %	20 %	40 %	20 %	192288964
15100	NC_011004	GCT	2	6	582943	582948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288964
15101	NC_011004	TCG	2	6	583017	583022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288964
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15105	NC_011004	GCG	2	6	583187	583192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288964
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15115	NC_011004	GATGCT	2	12	583623	583634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192288965
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15119	NC_011004	GCG	2	6	583765	583770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288965
15120	NC_011004	ATG	2	6	583777	583782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288965
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15122	NC_011004	CGC	2	6	583813	583818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15123	NC_011004	CG	3	6	583832	583837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15124	NC_011004	GCG	2	6	583942	583947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288966
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15228	NC_011004	CGA	2	6	587660	587665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15235	NC_011004	GC	4	8	587880	587887	0 %	0 %	50 %	50 %	192288968
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15244	NC_011004	GCC	2	6	588136	588141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288968
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15247	NC_011004	CTG	2	6	588271	588276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288968
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15263	NC_011004	GATG	2	8	588957	588964	25 %	25 %	50 %	0 %	192288968
15264	NC_011004	TCGGA	2	10	589008	589017	20 %	20 %	40 %	20 %	192288968
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15272	NC_011004	CG	3	6	589531	589536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15273	NC_011004	GCAGG	2	10	589564	589573	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15274	NC_011004	CGA	2	6	589592	589597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15275	NC_011004	CTT	2	6	589720	589725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15364	NC_011004	TGC	2	6	593833	593838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15365	NC_011004	GCGCA	2	10	593854	593863	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15366	NC_011004	CG	3	6	594022	594027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15367	NC_011004	GC	3	6	594050	594055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15368	NC_011004	CGG	2	6	594089	594094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15369	NC_011004	CCGTCG	2	12	594273	594284	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288972
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15485	NC_011004	AG	3	6	598364	598369	50 %	0 %	50 %	0 %	192288978
15486	NC_011004	CG	3	6	598382	598387	0 %	0 %	50 %	50 %	192288978
15487	NC_011004	GCCG	2	8	598434	598441	0 %	0 %	50 %	50 %	192288978
15488	NC_011004	GGC	2	6	598496	598501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288978
15489	NC_011004	CCG	2	6	598544	598549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288978
15490	NC_011004	AGC	2	6	598558	598563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288978
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15492	NC_011004	AGC	2	6	598663	598668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288978
15493	NC_011004	GATC	2	8	598679	598686	25 %	25 %	25 %	25 %	192288978
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