MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011004	CAG	2	6	36728	36733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_011004	GAG	2	6	36734	36739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011004	CGC	2	6	36743	36748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_011004	CG	3	6	36756	36761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_011004	CGCCC	2	10	36834	36843	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1006	NC_011004	GAA	2	6	36847	36852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011004	CCG	2	6	36859	36864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_011004	CCA	2	6	36890	36895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288465
1009	NC_011004	GCC	2	6	36901	36906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288465
1010	NC_011004	CCG	2	6	36907	36912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288465
1011	NC_011004	GC	3	6	36939	36944	0 %	0 %	50 %	50 %	192288465
1012	NC_011004	GCCGAA	2	12	36949	36960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288465
1013	NC_011004	CCG	2	6	36963	36968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288465
1014	NC_011004	GCC	2	6	36976	36981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288465
1015	NC_011004	GC	4	8	36994	37001	0 %	0 %	50 %	50 %	192288465
1016	NC_011004	TCA	2	6	37105	37110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_011004	ATT	2	6	37130	37135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_011004	GAAC	2	8	37185	37192	50 %	0 %	25 %	25 %	192288466
1019	NC_011004	TGC	2	6	37272	37277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288466
1020	NC_011004	GCT	2	6	37291	37296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288466
1021	NC_011004	GCC	2	6	37315	37320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288466
1022	NC_011004	GGC	2	6	37359	37364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288466
1023	NC_011004	GC	3	6	37363	37368	0 %	0 %	50 %	50 %	192288466
1024	NC_011004	GCC	3	9	37544	37552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288466
1025	NC_011004	GCT	2	6	37567	37572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288466
1026	NC_011004	ACA	2	6	37596	37601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288466
1027	NC_011004	CGT	2	6	37627	37632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288466
1028	NC_011004	CGG	2	6	37684	37689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288466
1029	NC_011004	CGG	3	9	37705	37713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288466
1030	NC_011004	GCG	2	6	37731	37736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288466
1031	NC_011004	GGC	2	6	37770	37775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288467
1032	NC_011004	TCGGCT	2	12	37797	37808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288467
1033	NC_011004	CAC	2	6	37946	37951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288467
1034	NC_011004	CGCGC	3	15	38020	38034	0 %	0 %	40 %	60 %	192288467
1035	NC_011004	GAT	2	6	38111	38116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288467
1036	NC_011004	CGAGC	2	10	38132	38141	20 %	0 %	40 %	40 %	192288467
1037	NC_011004	ATC	2	6	38145	38150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288467
1038	NC_011004	GAT	2	6	38204	38209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288467
1039	NC_011004	AC	3	6	38297	38302	50 %	0 %	0 %	50 %	192288467
1040	NC_011004	GCG	2	6	38332	38337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288467
1041	NC_011004	GCG	2	6	38430	38435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288467
1042	NC_011004	TGA	2	6	38464	38469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288467
1043	NC_011004	CAG	2	6	38498	38503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288467
1044	NC_011004	ATG	2	6	38520	38525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288467
1045	NC_011004	CTTC	2	8	38575	38582	0 %	50 %	0 %	50 %	192288467
1046	NC_011004	CAC	2	6	38621	38626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288467
1047	NC_011004	TGC	2	6	38654	38659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_011004	GAT	2	6	38683	38688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011004	CAC	2	6	38748	38753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_011004	GCCG	2	8	38762	38769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_011004	GGCCG	2	10	38798	38807	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1052	NC_011004	CCG	2	6	38815	38820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_011004	CGG	2	6	38828	38833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_011004	ACG	2	6	38834	38839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_011004	GCCGT	2	10	38883	38892	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1056	NC_011004	CGC	2	6	38909	38914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_011004	GCCG	2	8	38915	38922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_011004	GCC	2	6	38951	38956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_011004	CCATG	2	10	38973	38982	20 %	20 %	20 %	40 %	192288468
1060	NC_011004	TGC	2	6	39041	39046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288468
1061	NC_011004	GGGC	3	12	39054	39065	0 %	0 %	75 %	25 %	192288468
1062	NC_011004	CGC	2	6	39069	39074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288468
1063	NC_011004	CG	3	6	39080	39085	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
1064	NC_011004	GTG	2	6	39097	39102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288468
1065	NC_011004	CGGCGC	2	12	39105	39116	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
1066	NC_011004	CGG	2	6	39128	39133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288468
1067	NC_011004	CGG	2	6	39136	39141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288468
1068	NC_011004	GGC	2	6	39147	39152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288468
1069	NC_011004	GCC	2	6	39178	39183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288468
1070	NC_011004	CGG	2	6	39192	39197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288468
1071	NC_011004	ACC	2	6	39214	39219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288468
1072	NC_011004	GC	4	8	39245	39252	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
1073	NC_011004	GC	3	6	39292	39297	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
1074	NC_011004	CGC	2	6	39352	39357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288468
1075	NC_011004	CG	3	6	39368	39373	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
1076	NC_011004	GGC	2	6	39390	39395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288468
1077	NC_011004	GCG	2	6	39490	39495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288468
1078	NC_011004	ACC	2	6	39523	39528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288468
1079	NC_011004	GC	4	8	39540	39547	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
1080	NC_011004	ACCGC	2	10	39578	39587	20 %	0 %	20 %	60 %	192288468
1081	NC_011004	GCT	2	6	39588	39593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288468
1082	NC_011004	CTG	2	6	39619	39624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288468
1083	NC_011004	CGGC	2	8	39713	39720	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
1084	NC_011004	GC	4	8	39730	39737	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
1085	NC_011004	CAT	2	6	39738	39743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288468
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1087	NC_011004	GCA	2	6	39842	39847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288468
1088	NC_011004	CG	3	6	39893	39898	0 %	0 %	50 %	50 %	192288468
1089	NC_011004	CAT	2	6	39906	39911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288468
1090	NC_011004	CGA	2	6	39921	39926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288468
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1093	NC_011004	CGC	2	6	40011	40016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288468
1094	NC_011004	CGG	3	9	40151	40159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288468
1095	NC_011004	CGG	2	6	40164	40169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288468
1096	NC_011004	CGC	2	6	40284	40289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288468
1097	NC_011004	CGC	2	6	40293	40298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288468
1098	NC_011004	GAA	2	6	40302	40307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288468
1099	NC_011004	AGC	2	6	40388	40393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288468
1100	NC_011004	GCCC	2	8	40394	40401	0 %	0 %	25 %	75 %	192288468
1101	NC_011004	CGT	2	6	40421	40426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288468
1102	NC_011004	GCC	2	6	40459	40464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288469
1103	NC_011004	TCT	2	6	40467	40472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288469
1104	NC_011004	CG	3	6	40536	40541	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
1105	NC_011004	CTT	2	6	40633	40638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288469
1106	NC_011004	GCGCG	2	10	40650	40659	0 %	0 %	60 %	40 %	192288469
1107	NC_011004	CGA	2	6	40689	40694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288469
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1109	NC_011004	GCT	2	6	40764	40769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1110	NC_011004	CCA	2	6	40806	40811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288469
1111	NC_011004	TTG	2	6	40934	40939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288469
1112	NC_011004	CAGC	2	8	40977	40984	25 %	0 %	25 %	50 %	192288469
1113	NC_011004	GCCG	2	8	41043	41050	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
1114	NC_011004	GGA	2	6	41059	41064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288469
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1120	NC_011004	CG	3	6	41337	41342	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
1121	NC_011004	GC	4	8	41349	41356	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
1122	NC_011004	GCG	2	6	41362	41367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288469
1123	NC_011004	CGC	2	6	41412	41417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288469
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1127	NC_011004	CAC	2	6	41527	41532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288469
1128	NC_011004	CGA	2	6	41544	41549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1129	NC_011004	CGG	2	6	41576	41581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288469
1130	NC_011004	GAT	2	6	41641	41646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288469
1131	NC_011004	GTC	2	6	41650	41655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1132	NC_011004	ACC	3	9	41672	41680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288469
1133	NC_011004	GCC	2	6	41695	41700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288469
1134	NC_011004	TGG	2	6	41721	41726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288469
1135	NC_011004	GCA	2	6	41742	41747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288469
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1137	NC_011004	GC	3	6	41782	41787	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
1138	NC_011004	GGT	2	6	41866	41871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288469
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1141	NC_011004	ATG	2	6	41903	41908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288469
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1143	NC_011004	TCG	2	6	41933	41938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288469
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1149	NC_011004	CGG	3	9	42303	42311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288469
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1151	NC_011004	GGC	2	6	42412	42417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288469
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1153	NC_011004	CGGC	2	8	42432	42439	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
1154	NC_011004	GAT	2	6	42445	42450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288469
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1161	NC_011004	GC	3	6	42609	42614	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
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1165	NC_011004	GAT	2	6	42822	42827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288469
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1167	NC_011004	GA	3	6	42883	42888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1168	NC_011004	TCG	2	6	42903	42908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1169	NC_011004	CACCC	2	10	42930	42939	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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1178	NC_011004	GCG	2	6	43548	43553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1179	NC_011004	ATC	2	6	43568	43573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1180	NC_011004	ATC	2	6	43584	43589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1181	NC_011004	CA	3	6	43689	43694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1191	NC_011004	CCGGG	2	10	44331	44340	0 %	0 %	60 %	40 %	192288471
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1204	NC_011004	GCC	2	6	44910	44915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1242	NC_011004	G	6	6	46423	46428	0 %	0 %	100 %	0 %	192288474
1243	NC_011004	GCT	2	6	46509	46514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1244	NC_011004	CG	3	6	46568	46573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1245	NC_011004	CG	3	6	46603	46608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1246	NC_011004	GAA	2	6	46619	46624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_011004	CCG	2	6	46625	46630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1248	NC_011004	GGCC	2	8	46660	46667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1249	NC_011004	GCA	2	6	46676	46681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1250	NC_011004	CAC	2	6	46688	46693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1251	NC_011004	CGC	3	9	46695	46703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1252	NC_011004	AACC	2	8	46744	46751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1253	NC_011004	GTT	2	6	46762	46767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_011004	CGG	2	6	46833	46838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288475
1255	NC_011004	CGG	2	6	46886	46891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288475
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1257	NC_011004	TCC	2	6	46995	47000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288475
1258	NC_011004	GCTG	2	8	47029	47036	0 %	25 %	50 %	25 %	192288475
1259	NC_011004	AG	3	6	47039	47044	50 %	0 %	50 %	0 %	192288475
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1261	NC_011004	GGC	2	6	47103	47108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288475
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1266	NC_011004	CGCCGG	2	12	47191	47202	0 %	0 %	50 %	50 %	192288475
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1269	NC_011004	CCGA	2	8	47454	47461	25 %	0 %	25 %	50 %	192288475
1270	NC_011004	GAT	2	6	47477	47482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288475
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1274	NC_011004	GGCG	2	8	47615	47622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1275	NC_011004	AG	3	6	47635	47640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_011004	GATT	2	8	47695	47702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1277	NC_011004	G	6	6	47703	47708	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1303	NC_011004	CCG	2	6	48860	48865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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