MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011004	CCA	2	6	19330	19335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288450
502	NC_011004	GCG	2	6	19344	19349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288450
503	NC_011004	GTC	2	6	19442	19447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_011004	TCG	2	6	19479	19484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288451
505	NC_011004	CGA	2	6	19528	19533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288451
506	NC_011004	GCG	2	6	19549	19554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288451
507	NC_011004	CCA	2	6	19556	19561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288451
508	NC_011004	TGT	2	6	19585	19590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288451
509	NC_011004	GAT	2	6	19598	19603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288451
510	NC_011004	CGC	2	6	19615	19620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_011004	TCG	2	6	19641	19646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288452
512	NC_011004	TCGG	2	8	19707	19714	0 %	25 %	50 %	25 %	192288452
513	NC_011004	CAC	2	6	19742	19747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288452
514	NC_011004	CGG	2	6	19780	19785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288452
515	NC_011004	GCC	3	9	19818	19826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288452
516	NC_011004	TCG	2	6	19839	19844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288452
517	NC_011004	TTG	2	6	19908	19913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288452
518	NC_011004	TTC	2	6	19968	19973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288452
519	NC_011004	GTC	2	6	19991	19996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288452
520	NC_011004	GCC	2	6	20006	20011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288452
521	NC_011004	AG	3	6	20085	20090	50 %	0 %	50 %	0 %	192288452
522	NC_011004	CGGA	2	8	20123	20130	25 %	0 %	50 %	25 %	192288452
523	NC_011004	AGC	2	6	20152	20157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288452
524	NC_011004	CGA	2	6	20263	20268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288452
525	NC_011004	ACC	2	6	20270	20275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288452
526	NC_011004	CGA	2	6	20299	20304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288452
527	NC_011004	GAC	2	6	20309	20314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288452
528	NC_011004	GC	3	6	20458	20463	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
529	NC_011004	GCC	3	9	20477	20485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288453
530	NC_011004	GGC	2	6	20486	20491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288453
531	NC_011004	CGAC	2	8	20521	20528	25 %	0 %	25 %	50 %	192288453
532	NC_011004	CGAG	2	8	20554	20561	25 %	0 %	50 %	25 %	192288453
533	NC_011004	GCT	2	6	20680	20685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288453
534	NC_011004	GC	3	6	20752	20757	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
535	NC_011004	CAT	2	6	20822	20827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288453
536	NC_011004	CGAC	2	8	20860	20867	25 %	0 %	25 %	50 %	192288453
537	NC_011004	ACC	2	6	20868	20873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288453
538	NC_011004	GCA	2	6	20881	20886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288453
539	NC_011004	TCA	2	6	20926	20931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288453
540	NC_011004	GCC	2	6	20945	20950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288453
541	NC_011004	AGG	2	6	20953	20958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288453
542	NC_011004	GGT	2	6	21028	21033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288453
543	NC_011004	GAT	2	6	21077	21082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288453
544	NC_011004	AGT	2	6	21130	21135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288453
545	NC_011004	ATG	2	6	21138	21143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288453
546	NC_011004	CGG	2	6	21154	21159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288453
547	NC_011004	GAA	2	6	21164	21169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288453
548	NC_011004	ACC	2	6	21190	21195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288453
549	NC_011004	GTT	2	6	21272	21277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288453
550	NC_011004	GCA	2	6	21286	21291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288453
551	NC_011004	TGA	3	9	21301	21309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288453
552	NC_011004	TCA	2	6	21358	21363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288453
553	NC_011004	CAG	2	6	21380	21385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288453
554	NC_011004	CGATGA	2	12	21484	21495	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	192288453
555	NC_011004	TCT	2	6	21559	21564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288453
556	NC_011004	CAC	2	6	21566	21571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288453
557	NC_011004	AGC	2	6	21588	21593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288453
558	NC_011004	GCC	2	6	21599	21604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288453
559	NC_011004	CCG	2	6	21619	21624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288453
560	NC_011004	CGGA	2	8	21635	21642	25 %	0 %	50 %	25 %	192288453
561	NC_011004	GCCG	2	8	21643	21650	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
562	NC_011004	GGCC	2	8	21709	21716	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
563	NC_011004	GCG	2	6	21805	21810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288453
564	NC_011004	GAT	2	6	21839	21844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288453
565	NC_011004	CGC	2	6	21920	21925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288453
566	NC_011004	ACC	2	6	21968	21973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288453
567	NC_011004	CGG	2	6	22033	22038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011004	ACG	3	9	22110	22118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_011004	CG	3	6	22117	22122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_011004	TGC	2	6	22146	22151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_011004	GGAC	2	8	22221	22228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
572	NC_011004	AAT	2	6	22278	22283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011004	TCG	2	6	22399	22404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288454
574	NC_011004	ATCA	2	8	22410	22417	50 %	25 %	0 %	25 %	192288454
575	NC_011004	CGC	2	6	22554	22559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
576	NC_011004	TCG	2	6	22579	22584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288454
577	NC_011004	CCG	2	6	22609	22614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
578	NC_011004	CCA	2	6	22619	22624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288454
579	NC_011004	ACCG	2	8	22632	22639	25 %	0 %	25 %	50 %	192288454
580	NC_011004	CGC	2	6	22640	22645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
581	NC_011004	GCC	2	6	22743	22748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
582	NC_011004	CGA	2	6	22779	22784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288454
583	NC_011004	GAGC	2	8	22823	22830	25 %	0 %	50 %	25 %	192288454
584	NC_011004	GCC	2	6	22878	22883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
585	NC_011004	CGC	3	9	22973	22981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
586	NC_011004	CGT	2	6	22997	23002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288454
587	NC_011004	CAC	2	6	23028	23033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288454
588	NC_011004	GGA	2	6	23074	23079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288454
589	NC_011004	TCG	2	6	23087	23092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288454
590	NC_011004	CG	3	6	23126	23131	0 %	0 %	50 %	50 %	192288454
591	NC_011004	CCG	2	6	23138	23143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
592	NC_011004	GGCCG	2	10	23147	23156	0 %	0 %	60 %	40 %	192288454
593	NC_011004	GCCG	2	8	23192	23199	0 %	0 %	50 %	50 %	192288454
594	NC_011004	GCC	2	6	23208	23213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
595	NC_011004	TCC	2	6	23251	23256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_011004	TGC	2	6	23286	23291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011004	CAC	2	6	23321	23326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288455
598	NC_011004	GCT	2	6	23376	23381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288455
599	NC_011004	CGG	2	6	23416	23421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288455
600	NC_011004	CAG	2	6	23425	23430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288455
601	NC_011004	TTC	2	6	23534	23539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288455
602	NC_011004	CG	3	6	23550	23555	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
603	NC_011004	CG	3	6	23572	23577	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
604	NC_011004	CGC	2	6	23602	23607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288455
605	NC_011004	GCC	2	6	23617	23622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288455
606	NC_011004	ACG	2	6	23628	23633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288455
607	NC_011004	GAA	2	6	23647	23652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288455
608	NC_011004	TGCCC	2	10	23658	23667	0 %	20 %	20 %	60 %	192288455
609	NC_011004	GC	3	6	23668	23673	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
610	NC_011004	GCCC	2	8	23710	23717	0 %	0 %	25 %	75 %	192288455
611	NC_011004	GGT	2	6	23755	23760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288455
612	NC_011004	GCG	2	6	23814	23819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288455
613	NC_011004	CTT	2	6	23856	23861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288455
614	NC_011004	CGAG	3	12	23874	23885	25 %	0 %	50 %	25 %	192288455
615	NC_011004	GCC	2	6	23896	23901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288455
616	NC_011004	GGC	2	6	23902	23907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288455
617	NC_011004	CCA	2	6	23919	23924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288455
618	NC_011004	CGGC	2	8	23951	23958	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
619	NC_011004	CGG	2	6	23976	23981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288455
620	NC_011004	CTT	2	6	23986	23991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288455
621	NC_011004	GTG	2	6	24048	24053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288455
622	NC_011004	GCGA	2	8	24085	24092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
623	NC_011004	AGCAA	2	10	24093	24102	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
624	NC_011004	CGG	2	6	24118	24123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_011004	TCG	2	6	24136	24141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011004	GAA	2	6	24218	24223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288456
627	NC_011004	CGA	2	6	24235	24240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288456
628	NC_011004	CGC	2	6	24262	24267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288456
629	NC_011004	GGA	2	6	24356	24361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288456
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642	NC_011004	GCG	2	6	24793	24798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_011004	GTC	2	6	24817	24822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_011004	CCG	2	6	24846	24851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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669	NC_011004	CG	3	6	25618	25623	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
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672	NC_011004	TCGCT	2	10	25738	25747	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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753	NC_011004	GCG	2	6	28678	28683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
754	NC_011004	CCGG	2	8	28744	28751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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