MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011004	AAG	2	6	211611	211616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288625
5502	NC_011004	GCA	2	6	211705	211710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288625
5503	NC_011004	GC	3	6	211771	211776	0 %	0 %	50 %	50 %	192288625
5504	NC_011004	CCCACA	2	12	211777	211788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288625
5505	NC_011004	GCA	2	6	211810	211815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288625
5506	NC_011004	CGC	2	6	211816	211821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288625
5507	NC_011004	CGG	2	6	211907	211912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288625
5508	NC_011004	GTG	2	6	211914	211919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288625
5509	NC_011004	GCG	2	6	211942	211947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288625
5510	NC_011004	GCG	2	6	211987	211992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288625
5511	NC_011004	GGC	2	6	212062	212067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288625
5512	NC_011004	CGG	2	6	212113	212118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288625
5513	NC_011004	GCC	2	6	212142	212147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288625
5514	NC_011004	GCC	2	6	212205	212210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288625
5515	NC_011004	GTG	3	9	212214	212222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288625
5516	NC_011004	TGG	2	6	212230	212235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288625
5517	NC_011004	GCGCG	2	10	212337	212346	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5518	NC_011004	CT	3	6	212356	212361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_011004	CCGT	2	8	212469	212476	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_011004	GGC	2	6	212506	212511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_011004	TTC	2	6	212573	212578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_011004	GGCCG	2	10	212689	212698	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5523	NC_011004	GC	3	6	212736	212741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_011004	TGC	2	6	212747	212752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_011004	GGC	2	6	212796	212801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_011004	ACC	2	6	212827	212832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_011004	GCC	2	6	212845	212850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_011004	CGC	2	6	212930	212935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_011004	GCT	2	6	212994	212999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_011004	GTC	2	6	213036	213041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_011004	TTC	2	6	213082	213087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_011004	CCG	3	9	213092	213100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_011004	GATGAC	2	12	213216	213227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5534	NC_011004	GC	3	6	213283	213288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_011004	AAC	2	6	213324	213329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_011004	A	6	6	213395	213400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_011004	CAG	2	6	213535	213540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_011004	GTAC	2	8	213556	213563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5539	NC_011004	A	8	8	213773	213780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_011004	AT	3	6	213783	213788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_011004	ACA	2	6	213825	213830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_011004	ATA	2	6	213974	213979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_011004	TTAA	2	8	214015	214022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_011004	G	7	7	214070	214076	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_011004	AAT	2	6	214098	214103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_011004	GCT	2	6	214145	214150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_011004	GCAG	2	8	214260	214267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5548	NC_011004	GCC	2	6	214398	214403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_011004	GCC	2	6	214564	214569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288626
5550	NC_011004	GACC	2	8	214614	214621	25 %	0 %	25 %	50 %	192288626
5551	NC_011004	TGAA	2	8	214634	214641	50 %	25 %	25 %	0 %	192288626
5552	NC_011004	TGGC	2	8	214669	214676	0 %	25 %	50 %	25 %	192288626
5553	NC_011004	ACG	2	6	214678	214683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288626
5554	NC_011004	GCT	2	6	214737	214742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288626
5555	NC_011004	CAT	2	6	214806	214811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288626
5556	NC_011004	GCG	2	6	214824	214829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288626
5557	NC_011004	ACC	2	6	214865	214870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288626
5558	NC_011004	CATCG	2	10	214879	214888	20 %	20 %	20 %	40 %	192288626
5559	NC_011004	GAT	2	6	214930	214935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288626
5560	NC_011004	TCG	2	6	215015	215020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288626
5561	NC_011004	TGG	2	6	215054	215059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288626
5562	NC_011004	CGC	2	6	215202	215207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288626
5563	NC_011004	CTT	2	6	215239	215244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288626
5564	NC_011004	TTC	2	6	215251	215256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288626
5565	NC_011004	GGC	2	6	215284	215289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_011004	ACC	2	6	215390	215395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_011004	GTTC	2	8	215418	215425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5568	NC_011004	CGT	2	6	215446	215451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_011004	TCG	2	6	215475	215480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_011004	TCG	2	6	215483	215488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_011004	TGC	2	6	215490	215495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_011004	GGT	2	6	215509	215514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_011004	GAA	2	6	215563	215568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_011004	CTACGG	2	12	215578	215589	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_011004	GCG	2	6	215598	215603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_011004	GCC	2	6	215618	215623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5577	NC_011004	GC	3	6	215631	215636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5578	NC_011004	TCA	2	6	215655	215660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_011004	GCT	3	9	215671	215679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_011004	GCT	2	6	215683	215688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_011004	TCC	2	6	215710	215715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5582	NC_011004	CGC	2	6	215836	215841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_011004	CCG	2	6	215890	215895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288627
5584	NC_011004	CCTG	2	8	215897	215904	0 %	25 %	25 %	50 %	192288627
5585	NC_011004	CCCG	2	8	215963	215970	0 %	0 %	25 %	75 %	192288627
5586	NC_011004	GCC	2	6	216030	216035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288627
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5588	NC_011004	CGGCCG	2	12	216081	216092	0 %	0 %	50 %	50 %	192288627
5589	NC_011004	CGG	2	6	216133	216138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288627
5590	NC_011004	CCG	2	6	216143	216148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288627
5591	NC_011004	GC	3	6	216160	216165	0 %	0 %	50 %	50 %	192288627
5592	NC_011004	TGC	2	6	216166	216171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288627
5593	NC_011004	GAT	2	6	216212	216217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288627
5594	NC_011004	CGC	2	6	216242	216247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288627
5595	NC_011004	GCTG	2	8	216322	216329	0 %	25 %	50 %	25 %	192288627
5596	NC_011004	CGG	2	6	216362	216367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288627
5597	NC_011004	GCAC	2	8	216410	216417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5598	NC_011004	CAG	2	6	216479	216484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288628
5599	NC_011004	CTTG	2	8	216550	216557	0 %	50 %	25 %	25 %	192288628
5600	NC_011004	GCG	2	6	216608	216613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288628
5601	NC_011004	GCCG	2	8	216671	216678	0 %	0 %	50 %	50 %	192288628
5602	NC_011004	GCGGT	2	10	216748	216757	0 %	20 %	60 %	20 %	192288628
5603	NC_011004	CCT	2	6	216823	216828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5604	NC_011004	ACG	2	6	216832	216837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_011004	AGC	2	6	216882	216887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_011004	GCC	2	6	216948	216953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_011004	GC	4	8	216967	216974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_011004	CTTCGG	2	12	217018	217029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_011004	C	6	6	217046	217051	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5610	NC_011004	CCT	2	6	217093	217098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_011004	T	6	6	217119	217124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_011004	GCA	3	9	217178	217186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_011004	GCT	2	6	217190	217195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_011004	GGC	2	6	217239	217244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288629
5615	NC_011004	CCG	3	9	217292	217300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288629
5616	NC_011004	CGA	2	6	217316	217321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288629
5617	NC_011004	CAG	2	6	217377	217382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288629
5618	NC_011004	GCCG	2	8	217412	217419	0 %	0 %	50 %	50 %	192288629
5619	NC_011004	CGC	2	6	217427	217432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288629
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5622	NC_011004	GGT	2	6	217590	217595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288629
5623	NC_011004	TGC	2	6	217625	217630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288629
5624	NC_011004	CGA	2	6	217631	217636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288629
5625	NC_011004	GAC	3	9	217653	217661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288629
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5627	NC_011004	GAT	2	6	217821	217826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288629
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5745	NC_011004	GCTC	2	8	221907	221914	0 %	25 %	25 %	50 %	192288632
5746	NC_011004	TGA	2	6	221925	221930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288632
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5748	NC_011004	CTGG	2	8	221977	221984	0 %	25 %	50 %	25 %	192288632
5749	NC_011004	TCG	2	6	222003	222008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288632
5750	NC_011004	GCT	2	6	222073	222078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288632
5751	NC_011004	GCG	2	6	222139	222144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288632
5752	NC_011004	CGG	2	6	222145	222150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288632
5753	NC_011004	CTG	3	9	222152	222160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288632
5754	NC_011004	GTGCTG	2	12	222164	222175	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	192288632
5755	NC_011004	TCG	2	6	222228	222233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288632
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5758	NC_011004	CCG	2	6	222353	222358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5759	NC_011004	CGC	2	6	222377	222382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5760	NC_011004	CGTCA	2	10	222390	222399	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5761	NC_011004	CTG	2	6	222490	222495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288633
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5763	NC_011004	GGC	2	6	222528	222533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288633
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5766	NC_011004	G	6	6	222638	222643	0 %	0 %	100 %	0 %	192288633
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5769	NC_011004	GGC	2	6	222677	222682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288633
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5867	NC_011004	CGG	2	6	225745	225750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288638
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5980	NC_011004	GCCG	2	8	230160	230167	0 %	0 %	50 %	50 %	192288641
5981	NC_011004	CGG	2	6	230301	230306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288641
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5985	NC_011004	T	6	6	230451	230456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5986	NC_011004	GCG	3	9	230483	230491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288642
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5988	NC_011004	GGC	3	9	230506	230514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288642
5989	NC_011004	TGC	2	6	230517	230522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288642
5990	NC_011004	GCC	2	6	230526	230531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288642
5991	NC_011004	AGC	2	6	230536	230541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288642
5992	NC_011004	CGG	2	6	230566	230571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288642
5993	NC_011004	CGGC	2	8	230642	230649	0 %	0 %	50 %	50 %	192288642
5994	NC_011004	CTG	2	6	230658	230663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288642
5995	NC_011004	GCC	2	6	230680	230685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288642
5996	NC_011004	CGA	2	6	230692	230697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288642
5997	NC_011004	CGACAG	2	12	230700	230711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288642
5998	NC_011004	GATC	2	8	230876	230883	25 %	25 %	25 %	25 %	192288642
5999	NC_011004	CCG	2	6	230903	230908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288642
6000	NC_011004	CGG	2	6	230958	230963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288642

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