MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011004	GAA	2	6	172555	172560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288591
4502	NC_011004	CGG	2	6	172561	172566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288591
4503	NC_011004	CTG	2	6	172600	172605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288591
4504	NC_011004	GC	3	6	172611	172616	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4505	NC_011004	CCA	2	6	172649	172654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288591
4506	NC_011004	GGC	2	6	172686	172691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288591
4507	NC_011004	GC	3	6	172690	172695	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4508	NC_011004	CCA	2	6	172700	172705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288591
4509	NC_011004	CTG	2	6	172720	172725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288591
4510	NC_011004	CTG	2	6	172729	172734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288591
4511	NC_011004	CCG	2	6	172814	172819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288591
4512	NC_011004	CG	3	6	172859	172864	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4513	NC_011004	GGC	2	6	172887	172892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288591
4514	NC_011004	CCG	2	6	172907	172912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288591
4515	NC_011004	GATC	2	8	172941	172948	25 %	25 %	25 %	25 %	192288591
4516	NC_011004	GC	3	6	173087	173092	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4517	NC_011004	GC	3	6	173094	173099	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4518	NC_011004	CTG	2	6	173110	173115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288591
4519	NC_011004	CCGG	2	8	173116	173123	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4520	NC_011004	ACG	2	6	173216	173221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288591
4521	NC_011004	TCG	2	6	173251	173256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288591
4522	NC_011004	TGA	3	9	173264	173272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288591
4523	NC_011004	GAT	2	6	173298	173303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288591
4524	NC_011004	CGA	2	6	173310	173315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288591
4525	NC_011004	GTC	2	6	173320	173325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288591
4526	NC_011004	AGCA	2	8	173376	173383	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_011004	TCG	2	6	173434	173439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_011004	ACG	2	6	173589	173594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288592
4529	NC_011004	TGA	2	6	173596	173601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288592
4530	NC_011004	CGC	3	9	173624	173632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288592
4531	NC_011004	GCC	2	6	173651	173656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288592
4532	NC_011004	AGA	2	6	173662	173667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288592
4533	NC_011004	GGC	2	6	173723	173728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288592
4534	NC_011004	CGA	2	6	173744	173749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288592
4535	NC_011004	CTGACG	2	12	173790	173801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288592
4536	NC_011004	CG	4	8	173804	173811	0 %	0 %	50 %	50 %	192288592
4537	NC_011004	GGT	2	6	173837	173842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288592
4538	NC_011004	GTG	2	6	173934	173939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288592
4539	NC_011004	GCG	2	6	174022	174027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288592
4540	NC_011004	CG	3	6	174051	174056	0 %	0 %	50 %	50 %	192288592
4541	NC_011004	CTC	2	6	174153	174158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288592
4542	NC_011004	CG	3	6	174193	174198	0 %	0 %	50 %	50 %	192288592
4543	NC_011004	CG	4	8	174215	174222	0 %	0 %	50 %	50 %	192288592
4544	NC_011004	AAGCG	2	10	174227	174236	40 %	0 %	40 %	20 %	192288592
4545	NC_011004	GCG	2	6	174355	174360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288592
4546	NC_011004	GCT	2	6	174371	174376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288592
4547	NC_011004	GATC	2	8	174377	174384	25 %	25 %	25 %	25 %	192288592
4548	NC_011004	GCC	2	6	174390	174395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288592
4549	NC_011004	GCG	2	6	174451	174456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288592
4550	NC_011004	CGC	2	6	174539	174544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288592
4551	NC_011004	CAC	2	6	174600	174605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288592
4552	NC_011004	GGC	3	9	174635	174643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288592
4553	NC_011004	TGC	2	6	174676	174681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288592
4554	NC_011004	GAC	2	6	174791	174796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288592
4555	NC_011004	TGC	2	6	174840	174845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_011004	GCC	2	6	174849	174854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_011004	GAC	2	6	174866	174871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288593
4558	NC_011004	CGC	2	6	174878	174883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288593
4559	NC_011004	CGC	2	6	174888	174893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288593
4560	NC_011004	CGG	2	6	174935	174940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288593
4561	NC_011004	CCG	2	6	174951	174956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288593
4562	NC_011004	CG	3	6	174969	174974	0 %	0 %	50 %	50 %	192288593
4563	NC_011004	TCAG	2	8	174976	174983	25 %	25 %	25 %	25 %	192288593
4564	NC_011004	GTG	2	6	175016	175021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288593
4565	NC_011004	GTC	2	6	175129	175134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288593
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4567	NC_011004	GCA	2	6	175265	175270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288593
4568	NC_011004	CCG	2	6	175308	175313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288593
4569	NC_011004	CGC	2	6	175340	175345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288593
4570	NC_011004	ATGCGA	2	12	175356	175367	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	192288593
4571	NC_011004	CCTG	2	8	175410	175417	0 %	25 %	25 %	50 %	192288593
4572	NC_011004	GTC	2	6	175448	175453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288593
4573	NC_011004	ATG	2	6	175490	175495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288593
4574	NC_011004	CGGCG	2	10	175515	175524	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4575	NC_011004	TG	3	6	175539	175544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_011004	CGG	2	6	175557	175562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_011004	GGC	2	6	175563	175568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_011004	GAAAG	2	10	175664	175673	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_011004	CGA	2	6	175857	175862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288594
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4581	NC_011004	GTC	2	6	175927	175932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288594
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4585	NC_011004	GCG	2	6	176060	176065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288594
4586	NC_011004	GTG	2	6	176068	176073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288594
4587	NC_011004	CGA	2	6	176330	176335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288595
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4589	NC_011004	GCC	2	6	176427	176432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288595
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4592	NC_011004	GCA	2	6	176500	176505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288595
4593	NC_011004	CGC	2	6	176513	176518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288595
4594	NC_011004	CGG	2	6	176570	176575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288595
4595	NC_011004	GCG	2	6	176600	176605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288595
4596	NC_011004	G	7	7	176631	176637	0 %	0 %	100 %	0 %	192288595
4597	NC_011004	TGC	2	6	176668	176673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288595
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4599	NC_011004	ATC	2	6	176719	176724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288595
4600	NC_011004	ATGC	2	8	176752	176759	25 %	25 %	25 %	25 %	192288596
4601	NC_011004	GGC	2	6	176804	176809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288596
4602	NC_011004	ACG	2	6	176855	176860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288596
4603	NC_011004	GCCG	2	8	176910	176917	0 %	0 %	50 %	50 %	192288596
4604	NC_011004	ACG	2	6	176920	176925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288596
4605	NC_011004	ACA	2	6	176955	176960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288596
4606	NC_011004	CG	5	10	176979	176988	0 %	0 %	50 %	50 %	192288596
4607	NC_011004	CAG	2	6	176989	176994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288596
4608	NC_011004	GCC	2	6	177001	177006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288596
4609	NC_011004	AGC	2	6	177008	177013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288596
4610	NC_011004	CGC	2	6	177087	177092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288596
4611	NC_011004	GCGG	2	8	177099	177106	0 %	0 %	75 %	25 %	192288596
4612	NC_011004	GC	3	6	177133	177138	0 %	0 %	50 %	50 %	192288596
4613	NC_011004	CGCC	2	8	177186	177193	0 %	0 %	25 %	75 %	192288596
4614	NC_011004	GCTG	2	8	177213	177220	0 %	25 %	50 %	25 %	192288596
4615	NC_011004	GC	3	6	177228	177233	0 %	0 %	50 %	50 %	192288596
4616	NC_011004	GCT	2	6	177255	177260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288596
4617	NC_011004	GTG	2	6	177316	177321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288596
4618	NC_011004	CGC	2	6	177393	177398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288596
4619	NC_011004	CGC	2	6	177414	177419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288596
4620	NC_011004	ACC	2	6	177436	177441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288596
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4622	NC_011004	GAG	2	6	177469	177474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288596
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4624	NC_011004	CGC	2	6	177600	177605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288596
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4724	NC_011004	TTCG	2	8	181465	181472	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4741	NC_011004	GATC	2	8	181991	181998	25 %	25 %	25 %	25 %	192288600
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4744	NC_011004	CAGG	2	8	182030	182037	25 %	0 %	50 %	25 %	192288600
4745	NC_011004	CGC	2	6	182044	182049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288600
4746	NC_011004	GAA	2	6	182079	182084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288600
4747	NC_011004	TCT	2	6	182096	182101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288600
4748	NC_011004	GC	3	6	182124	182129	0 %	0 %	50 %	50 %	192288600
4749	NC_011004	GCT	2	6	182310	182315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288600
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4752	NC_011004	CG	3	6	182447	182452	0 %	0 %	50 %	50 %	192288600
4753	NC_011004	ACC	2	6	182494	182499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288600
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4761	NC_011004	GCC	3	9	182649	182657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288600
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4763	NC_011004	GCA	2	6	182728	182733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4764	NC_011004	GTC	2	6	182777	182782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4765	NC_011004	CGC	2	6	182795	182800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4766	NC_011004	GCA	2	6	182803	182808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4767	NC_011004	GCG	2	6	182859	182864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4768	NC_011004	GCC	2	6	182872	182877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4769	NC_011004	CCGT	2	8	182892	182899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4770	NC_011004	GCGAT	2	10	182967	182976	20 %	20 %	40 %	20 %	192288601
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4784	NC_011004	CGCC	2	8	183923	183930	0 %	0 %	25 %	75 %	192288602
4785	NC_011004	CGC	2	6	183950	183955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288602
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4845	NC_011004	TCG	2	6	186265	186270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288604
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4851	NC_011004	CGT	2	6	186636	186641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288605
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4861	NC_011004	GCT	2	6	186940	186945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288605
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4865	NC_011004	GCT	2	6	187132	187137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288605
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4989	NC_011004	GC	3	6	192275	192280	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4990	NC_011004	TCC	2	6	192283	192288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288609
4991	NC_011004	CGA	2	6	192317	192322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4992	NC_011004	GC	4	8	192363	192370	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4993	NC_011004	ACG	2	6	192376	192381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4994	NC_011004	CGG	2	6	192392	192397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
4995	NC_011004	GC	4	8	192414	192421	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4996	NC_011004	ATCAGG	2	12	192520	192531	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	192288609
4997	NC_011004	GCC	2	6	192616	192621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288609
4998	NC_011004	GCC	2	6	192627	192632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288609
4999	NC_011004	CGGC	2	8	192689	192696	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
5000	NC_011004	CG	3	6	192731	192736	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609

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