MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010998	A	7	7	3495	3501	100 %	0 %	0 %	0 %	190895322
2	NC_010998	T	6	6	8588	8593	0 %	100 %	0 %	0 %	190895325
3	NC_010998	C	6	6	17193	17198	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_010998	C	6	6	22747	22752	0 %	0 %	0 %	100 %	190895333
5	NC_010998	T	6	6	25145	25150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010998	G	6	6	25238	25243	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010998	T	6	6	25245	25250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010998	A	7	7	25405	25411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010998	T	6	6	29525	29530	0 %	100 %	0 %	0 %	190895338
10	NC_010998	T	6	6	29929	29934	0 %	100 %	0 %	0 %	190895338
11	NC_010998	T	6	6	31077	31082	0 %	100 %	0 %	0 %	190895340
12	NC_010998	T	6	6	48513	48518	0 %	100 %	0 %	0 %	190895354
13	NC_010998	C	6	6	54172	54177	0 %	0 %	0 %	100 %	190895359
14	NC_010998	T	7	7	60124	60130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010998	T	6	6	66829	66834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010998	A	6	6	67332	67337	100 %	0 %	0 %	0 %	190895369
17	NC_010998	A	6	6	69510	69515	100 %	0 %	0 %	0 %	190895370
18	NC_010998	A	6	6	74001	74006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010998	A	6	6	81585	81590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010998	T	7	7	81645	81651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010998	A	6	6	82638	82643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010998	A	6	6	85342	85347	100 %	0 %	0 %	0 %	190895390
23	NC_010998	T	6	6	86800	86805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010998	C	6	6	109021	109026	0 %	0 %	0 %	100 %	190895414
25	NC_010998	C	6	6	112088	112093	0 %	0 %	0 %	100 %	190895416
26	NC_010998	T	6	6	117891	117896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010998	A	6	6	120486	120491	100 %	0 %	0 %	0 %	190895422
28	NC_010998	C	6	6	121839	121844	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_010998	T	6	6	122153	122158	0 %	100 %	0 %	0 %	190895424
30	NC_010998	T	6	6	123054	123059	0 %	100 %	0 %	0 %	190895424
31	NC_010998	A	6	6	123229	123234	100 %	0 %	0 %	0 %	190895424
32	NC_010998	T	7	7	123343	123349	0 %	100 %	0 %	0 %	190895424
33	NC_010998	A	6	6	123619	123624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010998	A	7	7	123850	123856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010998	G	6	6	124459	124464	0 %	0 %	100 %	0 %	190895425
36	NC_010998	T	6	6	134574	134579	0 %	100 %	0 %	0 %	190895436
37	NC_010998	C	6	6	145500	145505	0 %	0 %	0 %	100 %	190895443
38	NC_010998	C	6	6	145773	145778	0 %	0 %	0 %	100 %	190895444
39	NC_010998	G	6	6	148928	148933	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010998	A	7	7	149137	149143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010998	A	6	6	149162	149167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010998	T	6	6	153223	153228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010998	A	6	6	183702	183707	100 %	0 %	0 %	0 %	190895477
44	NC_010998	T	6	6	185618	185623	0 %	100 %	0 %	0 %	190895480
45	NC_010998	T	6	6	192872	192877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010998	G	6	6	194911	194916	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010998	G	6	6	199889	199894	0 %	0 %	100 %	0 %	190895499
48	NC_010998	A	6	6	204408	204413	100 %	0 %	0 %	0 %	190895505
49	NC_010998	C	6	6	205687	205692	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_010998	T	6	6	207295	207300	0 %	100 %	0 %	0 %	190895507
51	NC_010998	A	6	6	209645	209650	100 %	0 %	0 %	0 %	190895509
52	NC_010998	A	6	6	211550	211555	100 %	0 %	0 %	0 %	190895511
53	NC_010998	T	6	6	211587	211592	0 %	100 %	0 %	0 %	190895511
54	NC_010998	T	6	6	215512	215517	0 %	100 %	0 %	0 %	190895513
55	NC_010998	A	6	6	218417	218422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010998	G	6	6	221347	221352	0 %	0 %	100 %	0 %	190895518
57	NC_010998	T	6	6	222582	222587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010998	T	6	6	224410	224415	0 %	100 %	0 %	0 %	190895522
59	NC_010998	G	6	6	233398	233403	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010998	A	6	6	240350	240355	100 %	0 %	0 %	0 %	190895535
61	NC_010998	A	6	6	241790	241795	100 %	0 %	0 %	0 %	190895536
62	NC_010998	A	6	6	261501	261506	100 %	0 %	0 %	0 %	190895555
63	NC_010998	A	7	7	266711	266717	100 %	0 %	0 %	0 %	190895561
64	NC_010998	A	6	6	268538	268543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010998	T	6	6	272527	272532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010998	A	6	6	274147	274152	100 %	0 %	0 %	0 %	190895569
67	NC_010998	A	6	6	274769	274774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010998	T	6	6	282213	282218	0 %	100 %	0 %	0 %	190895577
69	NC_010998	T	6	6	282978	282983	0 %	100 %	0 %	0 %	190895578
70	NC_010998	G	6	6	283693	283698	0 %	0 %	100 %	0 %	190895579
71	NC_010998	G	6	6	299496	299501	0 %	0 %	100 %	0 %	190895595
72	NC_010998	G	6	6	301344	301349	0 %	0 %	100 %	0 %	190895596
73	NC_010998	A	6	6	306679	306684	100 %	0 %	0 %	0 %	190895602
74	NC_010998	G	6	6	308504	308509	0 %	0 %	100 %	0 %	190895603
75	NC_010998	T	6	6	310141	310146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010998	A	6	6	316076	316081	100 %	0 %	0 %	0 %	190895611
77	NC_010998	A	6	6	319696	319701	100 %	0 %	0 %	0 %	190895613
78	NC_010998	G	7	7	322322	322328	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010998	T	6	6	340662	340667	0 %	100 %	0 %	0 %	190895631
80	NC_010998	A	6	6	348377	348382	100 %	0 %	0 %	0 %	190895637
81	NC_010998	A	6	6	353315	353320	100 %	0 %	0 %	0 %	190895643
82	NC_010998	C	6	6	356802	356807	0 %	0 %	0 %	100 %	190895644
83	NC_010998	A	6	6	359102	359107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010998	G	7	7	366226	366232	0 %	0 %	100 %	0 %	190895653
85	NC_010998	G	6	6	370012	370017	0 %	0 %	100 %	0 %	190895657
86	NC_010998	C	6	6	372845	372850	0 %	0 %	0 %	100 %	190895659
87	NC_010998	A	6	6	375807	375812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010998	A	6	6	375987	375992	100 %	0 %	0 %	0 %	190895661
89	NC_010998	C	6	6	380399	380404	0 %	0 %	0 %	100 %	190895663
90	NC_010998	T	6	6	392947	392952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010998	G	6	6	399276	399281	0 %	0 %	100 %	0 %	190895682
92	NC_010998	C	6	6	402109	402114	0 %	0 %	0 %	100 %	190895685
93	NC_010998	G	6	6	402285	402290	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010998	C	6	6	405641	405646	0 %	0 %	0 %	100 %	190895689
95	NC_010998	A	6	6	406657	406662	100 %	0 %	0 %	0 %	190895690
96	NC_010998	A	6	6	412732	412737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010998	A	6	6	412860	412865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010998	A	6	6	413603	413608	100 %	0 %	0 %	0 %	190895698

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.