MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 10093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010998	TGA	2	6	40354	40359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895347
1002	NC_010998	GGCC	2	8	40402	40409	0 %	0 %	50 %	50 %	190895347
1003	NC_010998	TCA	2	6	40432	40437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895347
1004	NC_010998	GCG	2	6	40482	40487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895347
1005	NC_010998	AGA	2	6	40522	40527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895347
1006	NC_010998	CGG	2	6	40579	40584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895347
1007	NC_010998	GCGG	2	8	40615	40622	0 %	0 %	75 %	25 %	190895347
1008	NC_010998	ATG	2	6	40671	40676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895347
1009	NC_010998	GCC	2	6	40689	40694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895347
1010	NC_010998	ATG	2	6	40721	40726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895347
1011	NC_010998	GCG	2	6	40760	40765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895347
1012	NC_010998	AGC	2	6	40782	40787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895347
1013	NC_010998	GAT	2	6	40808	40813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895347
1014	NC_010998	GCG	2	6	40860	40865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895347
1015	NC_010998	ACC	2	6	40887	40892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895347
1016	NC_010998	AGC	2	6	40914	40919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895347
1017	NC_010998	TTG	2	6	40976	40981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010998	GCA	2	6	41044	41049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_010998	ATC	2	6	41072	41077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_010998	TGA	2	6	41100	41105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010998	TGA	3	9	41237	41245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_010998	GAG	2	6	41328	41333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010998	TCG	3	9	41370	41378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1024	NC_010998	ACGCG	2	10	41384	41393	20 %	0 %	40 %	40 %	190895348
1025	NC_010998	ACG	2	6	41404	41409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1026	NC_010998	GCA	2	6	41428	41433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1027	NC_010998	GTG	2	6	41445	41450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895348
1028	NC_010998	TTC	2	6	41478	41483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895348
1029	NC_010998	GCCTC	2	10	41491	41500	0 %	20 %	20 %	60 %	190895348
1030	NC_010998	TCT	2	6	41575	41580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895348
1031	NC_010998	CGCT	2	8	41581	41588	0 %	25 %	25 %	50 %	190895348
1032	NC_010998	CCCGT	2	10	41596	41605	0 %	20 %	20 %	60 %	190895348
1033	NC_010998	CGT	2	6	41612	41617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1034	NC_010998	CGG	2	6	41681	41686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895348
1035	NC_010998	GAG	2	6	41721	41726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895348
1036	NC_010998	CGG	2	6	41786	41791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895348
1037	NC_010998	GCT	2	6	41813	41818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1038	NC_010998	GAT	2	6	41858	41863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895348
1039	NC_010998	GC	3	6	41875	41880	0 %	0 %	50 %	50 %	190895348
1040	NC_010998	TCG	2	6	41920	41925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1041	NC_010998	CTT	2	6	41972	41977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895348
1042	NC_010998	CGT	2	6	41996	42001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1043	NC_010998	GCT	2	6	42050	42055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1044	NC_010998	GGC	2	6	42074	42079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895348
1045	NC_010998	TGC	2	6	42094	42099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1046	NC_010998	TGG	2	6	42229	42234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895348
1047	NC_010998	GGT	2	6	42239	42244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895348
1048	NC_010998	TCG	2	6	42262	42267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1049	NC_010998	CAT	2	6	42269	42274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895348
1050	NC_010998	CGGC	2	8	42302	42309	0 %	0 %	50 %	50 %	190895348
1051	NC_010998	TCA	2	6	42334	42339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895348
1052	NC_010998	ACG	2	6	42394	42399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1053	NC_010998	TCA	2	6	42406	42411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895348
1054	NC_010998	TCG	2	6	42462	42467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1055	NC_010998	TGC	2	6	42497	42502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1056	NC_010998	CTGG	2	8	42521	42528	0 %	25 %	50 %	25 %	190895348
1057	NC_010998	TGG	2	6	42550	42555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895348
1058	NC_010998	TCG	2	6	42589	42594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895348
1059	NC_010998	GCA	3	9	42680	42688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_010998	TGC	2	6	42706	42711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_010998	GCG	2	6	42735	42740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895349
1062	NC_010998	CCG	2	6	42741	42746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895349
1063	NC_010998	TTG	2	6	42761	42766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895349
1064	NC_010998	TG	3	6	43046	43051	0 %	50 %	50 %	0 %	190895349
1065	NC_010998	TCA	2	6	43052	43057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895349
1066	NC_010998	CCA	2	6	43095	43100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895349
1067	NC_010998	GCC	2	6	43132	43137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895349
1068	NC_010998	AGC	2	6	43188	43193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895349
1069	NC_010998	CGC	2	6	43249	43254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895349
1070	NC_010998	ATT	2	6	43371	43376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_010998	ATTGC	2	10	43378	43387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1072	NC_010998	TAAT	2	8	43394	43401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_010998	GAG	2	6	43426	43431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_010998	GTC	2	6	43509	43514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895350
1075	NC_010998	CGG	2	6	43523	43528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895350
1076	NC_010998	CGT	2	6	43535	43540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895350
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1078	NC_010998	GT	3	6	43597	43602	0 %	50 %	50 %	0 %	190895350
1079	NC_010998	TCGATG	2	12	43657	43668	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190895350
1080	NC_010998	GCC	3	9	43710	43718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895350
1081	NC_010998	GGC	2	6	43736	43741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895350
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1083	NC_010998	GAT	2	6	43794	43799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895350
1084	NC_010998	CTG	2	6	43863	43868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895350
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1086	NC_010998	GAT	2	6	43982	43987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895351
1087	NC_010998	GTC	2	6	44043	44048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895351
1088	NC_010998	CTG	2	6	44090	44095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895351
1089	NC_010998	CTT	2	6	44141	44146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895351
1090	NC_010998	GCC	2	6	44164	44169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895351
1091	NC_010998	ATG	2	6	44249	44254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010998	TGC	2	6	44265	44270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_010998	AGC	2	6	44272	44277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_010998	ACC	2	6	44292	44297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_010998	AGT	2	6	44305	44310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010998	GCG	2	6	44319	44324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_010998	TCT	2	6	44511	44516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_010998	CAA	2	6	44518	44523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_010998	ATGC	2	8	44524	44531	25 %	25 %	25 %	25 %	190895352
1100	NC_010998	TC	3	6	44558	44563	0 %	50 %	0 %	50 %	190895352
1101	NC_010998	CG	3	6	44564	44569	0 %	0 %	50 %	50 %	190895352
1102	NC_010998	CATC	2	8	44580	44587	25 %	25 %	0 %	50 %	190895352
1103	NC_010998	AGGCA	2	10	44641	44650	40 %	0 %	40 %	20 %	190895352
1104	NC_010998	CCA	2	6	44660	44665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895352
1105	NC_010998	GCT	2	6	44706	44711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895352
1106	NC_010998	GAT	2	6	44730	44735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895352
1107	NC_010998	TGGC	2	8	44743	44750	0 %	25 %	50 %	25 %	190895352
1108	NC_010998	TTC	2	6	44767	44772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895352
1109	NC_010998	GCT	2	6	44886	44891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895352
1110	NC_010998	CGAT	2	8	44924	44931	25 %	25 %	25 %	25 %	190895352
1111	NC_010998	TTC	2	6	44976	44981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895352
1112	NC_010998	CAT	2	6	45009	45014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895352
1113	NC_010998	GC	3	6	45104	45109	0 %	0 %	50 %	50 %	190895352
1114	NC_010998	TCC	2	6	45167	45172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_010998	TGC	2	6	45212	45217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_010998	GCT	2	6	45258	45263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895353
1117	NC_010998	CGC	2	6	45265	45270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895353
1118	NC_010998	CCGCG	2	10	45271	45280	0 %	0 %	40 %	60 %	190895353
1119	NC_010998	GGT	2	6	45292	45297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895353
1120	NC_010998	AGC	2	6	45359	45364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895353
1121	NC_010998	GCA	2	6	45390	45395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895353
1122	NC_010998	GCG	2	6	45402	45407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895353
1123	NC_010998	GC	3	6	45413	45418	0 %	0 %	50 %	50 %	190895353
1124	NC_010998	CGA	2	6	45462	45467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895353
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1126	NC_010998	GAG	2	6	45512	45517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895353
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1251	NC_010998	GCA	2	6	50333	50338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895356
1252	NC_010998	GC	3	6	50347	50352	0 %	0 %	50 %	50 %	190895356
1253	NC_010998	AGC	2	6	50353	50358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895356
1254	NC_010998	CGT	2	6	50360	50365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895356
1255	NC_010998	CTT	2	6	50370	50375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895356
1256	NC_010998	CGG	2	6	50767	50772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895356
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1267	NC_010998	TGC	2	6	51194	51199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895357
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1275	NC_010998	CG	3	6	51350	51355	0 %	0 %	50 %	50 %	190895357
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1280	NC_010998	GCC	2	6	51526	51531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895357
1281	NC_010998	ACG	2	6	51550	51555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895357
1282	NC_010998	CGT	2	6	51602	51607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895357
1283	NC_010998	CGC	4	12	51626	51637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895357
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1286	NC_010998	CGA	2	6	51716	51721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895357
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1289	NC_010998	GCG	2	6	51869	51874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895357
1290	NC_010998	CGA	2	6	51977	51982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895357
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1292	NC_010998	TGA	2	6	52100	52105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895357
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1295	NC_010998	GGCCGA	2	12	52244	52255	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190895357
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1297	NC_010998	GCC	2	6	52388	52393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1298	NC_010998	AAC	2	6	52470	52475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895358
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1353	NC_010998	AT	3	6	54561	54566	50 %	50 %	0 %	0 %	190895359
1354	NC_010998	CCT	2	6	54583	54588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895360
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1356	NC_010998	GGC	2	6	54677	54682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895360
1357	NC_010998	CTG	2	6	54731	54736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895360
1358	NC_010998	CTC	2	6	54776	54781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895360
1359	NC_010998	ATTG	2	8	54802	54809	25 %	50 %	25 %	0 %	190895360
1360	NC_010998	GATC	2	8	54814	54821	25 %	25 %	25 %	25 %	190895360
1361	NC_010998	GCC	2	6	54828	54833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895360
1362	NC_010998	CCT	2	6	54856	54861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895360
1363	NC_010998	CGG	2	6	54865	54870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895360
1364	NC_010998	GTC	2	6	54908	54913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895360
1365	NC_010998	CAT	2	6	54986	54991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895360
1366	NC_010998	CGG	2	6	55120	55125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895360
1367	NC_010998	GC	3	6	55143	55148	0 %	0 %	50 %	50 %	190895360
1368	NC_010998	GCA	2	6	55159	55164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895360
1369	NC_010998	CGC	3	9	55177	55185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895360
1370	NC_010998	TCG	2	6	55203	55208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895360
1371	NC_010998	TCG	2	6	55224	55229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895360
1372	NC_010998	GCA	2	6	55285	55290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895360
1373	NC_010998	GGCGCA	2	12	55372	55383	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190895360
1374	NC_010998	TCG	2	6	55410	55415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895360
1375	NC_010998	GCA	2	6	55432	55437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895360
1376	NC_010998	CCT	2	6	55501	55506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895360
1377	NC_010998	GGC	2	6	55574	55579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895360
1378	NC_010998	GAT	2	6	55580	55585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895360
1379	NC_010998	CGA	2	6	55586	55591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895360
1380	NC_010998	GGA	2	6	55592	55597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895360
1381	NC_010998	CTGC	2	8	55631	55638	0 %	25 %	25 %	50 %	190895360
1382	NC_010998	TCG	2	6	55644	55649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895360
1383	NC_010998	GAA	2	6	55658	55663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895360
1384	NC_010998	CGT	2	6	55703	55708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895360
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1388	NC_010998	CAT	2	6	55811	55816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895360
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1390	NC_010998	CTT	2	6	55847	55852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895360
1391	NC_010998	CCG	2	6	56019	56024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895360
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1393	NC_010998	TCG	2	6	56076	56081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895360
1394	NC_010998	GTGAAG	2	12	56127	56138	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	190895360
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1397	NC_010998	GAT	2	6	56261	56266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895360
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1401	NC_010998	CTGC	2	8	56367	56374	0 %	25 %	25 %	50 %	190895360
1402	NC_010998	CCG	2	6	56428	56433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895360
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1405	NC_010998	CGG	2	6	56562	56567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895361
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1412	NC_010998	CGA	2	6	56745	56750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895361
1413	NC_010998	GCGAT	2	10	56771	56780	20 %	20 %	40 %	20 %	190895361
1414	NC_010998	CGA	2	6	56793	56798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895361
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1418	NC_010998	CTTGCG	2	12	57049	57060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895361
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1424	NC_010998	CGT	2	6	57292	57297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895361
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1432	NC_010998	GA	3	6	57434	57439	50 %	0 %	50 %	0 %	190895361
1433	NC_010998	TTG	2	6	57440	57445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895361
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1439	NC_010998	CGA	2	6	57690	57695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895361
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1442	NC_010998	GCA	2	6	57753	57758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895361
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1453	NC_010998	CG	3	6	58107	58112	0 %	0 %	50 %	50 %	190895361
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1461	NC_010998	TGA	2	6	58446	58451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1492	NC_010998	CGC	2	6	59651	59656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895362
1493	NC_010998	GC	3	6	59659	59664	0 %	0 %	50 %	50 %	190895362
1494	NC_010998	CGT	2	6	59684	59689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895362
1495	NC_010998	GCA	2	6	59699	59704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895362
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1497	NC_010998	TCG	2	6	59788	59793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895362
1498	NC_010998	GAA	2	6	59803	59808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895362
1499	NC_010998	GGCC	2	8	59926	59933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1500	NC_010998	GCA	2	6	60010	60015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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