MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 10093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010998	CGG	2	6	410248	410253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895694
10002	NC_010998	ATTG	2	8	410264	410271	25 %	50 %	25 %	0 %	190895694
10003	NC_010998	TGCCGA	2	12	410302	410313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190895694
10004	NC_010998	CGC	2	6	410379	410384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895695
10005	NC_010998	AGC	2	6	410393	410398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895695
10006	NC_010998	AGG	2	6	410426	410431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895695
10007	NC_010998	TTG	2	6	410444	410449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895695
10008	NC_010998	ACA	2	6	410537	410542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_010998	CGA	2	6	410552	410557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_010998	GCT	2	6	410607	410612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895696
10011	NC_010998	CCG	2	6	410629	410634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895696
10012	NC_010998	AGA	2	6	410642	410647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895696
10013	NC_010998	TCC	2	6	410662	410667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895696
10014	NC_010998	GAT	2	6	410682	410687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895696
10015	NC_010998	GGC	2	6	410852	410857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895696
10016	NC_010998	GAC	4	12	410916	410927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895696
10017	NC_010998	GCTG	2	8	410952	410959	0 %	25 %	50 %	25 %	190895696
10018	NC_010998	CTC	2	6	411003	411008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895696
10019	NC_010998	TC	3	6	411036	411041	0 %	50 %	0 %	50 %	190895696
10020	NC_010998	GCCG	2	8	411207	411214	0 %	0 %	50 %	50 %	190895696
10021	NC_010998	TTC	2	6	411220	411225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895696
10022	NC_010998	ACG	2	6	411266	411271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895696
10023	NC_010998	TGG	2	6	411272	411277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895696
10024	NC_010998	CGC	2	6	411290	411295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895696
10025	NC_010998	GCC	2	6	411328	411333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895696
10026	NC_010998	GCT	2	6	411339	411344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895696
10027	NC_010998	CCAT	2	8	411350	411357	25 %	25 %	0 %	50 %	190895696
10028	NC_010998	CTG	2	6	411394	411399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895696
10029	NC_010998	CGT	2	6	411420	411425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895696
10030	NC_010998	CGG	2	6	411435	411440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895696
10031	NC_010998	GCA	2	6	411447	411452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895696
10032	NC_010998	TCA	2	6	411458	411463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895696
10033	NC_010998	GTC	2	6	411469	411474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895696
10034	NC_010998	TTG	2	6	411512	411517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895696
10035	NC_010998	CGA	2	6	411540	411545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895696
10036	NC_010998	GCC	2	6	411676	411681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895696
10037	NC_010998	CGA	2	6	411758	411763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895697
10038	NC_010998	GTC	3	9	411800	411808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895697
10039	NC_010998	GGCCG	2	10	411818	411827	0 %	0 %	60 %	40 %	190895697
10040	NC_010998	GGA	2	6	411860	411865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895697
10041	NC_010998	AG	3	6	411866	411871	50 %	0 %	50 %	0 %	190895697
10042	NC_010998	AGG	2	6	411883	411888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895697
10043	NC_010998	TTG	2	6	411910	411915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895697
10044	NC_010998	TCC	2	6	411939	411944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895697
10045	NC_010998	CGTG	2	8	411947	411954	0 %	25 %	50 %	25 %	190895697
10046	NC_010998	CCG	2	6	412040	412045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895697
10047	NC_010998	GC	3	6	412062	412067	0 %	0 %	50 %	50 %	190895697
10048	NC_010998	GCT	2	6	412109	412114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895697
10049	NC_010998	GTC	2	6	412161	412166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895697
10050	NC_010998	GC	3	6	412191	412196	0 %	0 %	50 %	50 %	190895697
10051	NC_010998	TCA	2	6	412267	412272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895697
10052	NC_010998	CGAC	2	8	412285	412292	25 %	0 %	25 %	50 %	190895697
10053	NC_010998	AGC	2	6	412361	412366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895697
10054	NC_010998	ATGG	2	8	412388	412395	25 %	25 %	50 %	0 %	190895697
10055	NC_010998	CGG	2	6	412423	412428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895697
10056	NC_010998	AG	3	6	412472	412477	50 %	0 %	50 %	0 %	190895697
10057	NC_010998	CCG	2	6	412481	412486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895697
10058	NC_010998	GCG	2	6	412564	412569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895697
10059	NC_010998	GCCG	2	8	412578	412585	0 %	0 %	50 %	50 %	190895697
10060	NC_010998	CGA	2	6	412670	412675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895697
10061	NC_010998	A	6	6	412732	412737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_010998	A	6	6	412860	412865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_010998	GCG	2	6	412908	412913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895698
10064	NC_010998	CGCT	2	8	412999	413006	0 %	25 %	25 %	50 %	190895698
10065	NC_010998	GCT	2	6	413064	413069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895698
10066	NC_010998	GAA	2	6	413082	413087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895698
10067	NC_010998	TCG	2	6	413111	413116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895698
10068	NC_010998	AGC	2	6	413132	413137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895698
10069	NC_010998	GCATG	2	10	413151	413160	20 %	20 %	40 %	20 %	190895698
10070	NC_010998	GAC	2	6	413166	413171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895698
10071	NC_010998	GCG	2	6	413175	413180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895698
10072	NC_010998	TGG	2	6	413195	413200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895698
10073	NC_010998	CGC	2	6	413251	413256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895698
10074	NC_010998	GGC	2	6	413337	413342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895698
10075	NC_010998	TGGAA	2	10	413363	413372	40 %	20 %	40 %	0 %	190895698
10076	NC_010998	ATGG	2	8	413457	413464	25 %	25 %	50 %	0 %	190895698
10077	NC_010998	CGT	2	6	413506	413511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895698
10078	NC_010998	CGG	3	9	413516	413524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895698
10079	NC_010998	GAG	2	6	413529	413534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895698
10080	NC_010998	GAT	2	6	413565	413570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895698
10081	NC_010998	CGAAAA	2	12	413588	413599	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190895698
10082	NC_010998	A	6	6	413603	413608	100 %	0 %	0 %	0 %	190895698
10083	NC_010998	CATA	2	8	413640	413647	50 %	25 %	0 %	25 %	190895698
10084	NC_010998	GGA	2	6	413712	413717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895698
10085	NC_010998	GCC	2	6	413739	413744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895698
10086	NC_010998	TGC	2	6	413768	413773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895698
10087	NC_010998	CGC	2	6	413790	413795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895698
10088	NC_010998	GCG	2	6	413807	413812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895698
10089	NC_010998	CGC	2	6	413922	413927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895698
10090	NC_010998	GGC	2	6	413977	413982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895698
10091	NC_010998	CCG	2	6	414000	414005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895698
10092	NC_010998	GCG	2	6	414014	414019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895698
10093	NC_010998	GGCGA	2	10	414072	414081	20 %	0 %	60 %	20 %	190895698

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.