MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 10093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010998	CGC	3	9	21566	21574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895332
502	NC_010998	CCA	2	6	21615	21620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_010998	CGA	2	6	21725	21730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895333
504	NC_010998	CTT	2	6	21890	21895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895333
505	NC_010998	TCGC	2	8	21964	21971	0 %	25 %	25 %	50 %	190895333
506	NC_010998	GT	3	6	22057	22062	0 %	50 %	50 %	0 %	190895333
507	NC_010998	CTT	2	6	22073	22078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895333
508	NC_010998	CTG	2	6	22095	22100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895333
509	NC_010998	CAC	2	6	22183	22188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895333
510	NC_010998	CGG	2	6	22190	22195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895333
511	NC_010998	GCT	2	6	22199	22204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895333
512	NC_010998	CCG	2	6	22267	22272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895333
513	NC_010998	CGT	2	6	22283	22288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895333
514	NC_010998	CGGC	2	8	22307	22314	0 %	0 %	50 %	50 %	190895333
515	NC_010998	CAG	2	6	22334	22339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895333
516	NC_010998	GAG	2	6	22341	22346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895333
517	NC_010998	CGAA	2	8	22358	22365	50 %	0 %	25 %	25 %	190895333
518	NC_010998	TCG	2	6	22423	22428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895333
519	NC_010998	CG	3	6	22432	22437	0 %	0 %	50 %	50 %	190895333
520	NC_010998	GCC	2	6	22662	22667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895333
521	NC_010998	CTG	3	9	22671	22679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895333
522	NC_010998	CGC	3	9	22727	22735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895333
523	NC_010998	C	6	6	22747	22752	0 %	0 %	0 %	100 %	190895333
524	NC_010998	GCG	2	6	22800	22805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895333
525	NC_010998	GCC	2	6	22815	22820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895333
526	NC_010998	TCGG	2	8	22827	22834	0 %	25 %	50 %	25 %	190895333
527	NC_010998	CGG	2	6	22841	22846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895333
528	NC_010998	TCG	2	6	22849	22854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895333
529	NC_010998	GCA	2	6	22891	22896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895333
530	NC_010998	TTC	2	6	22911	22916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895333
531	NC_010998	CGC	2	6	22919	22924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895333
532	NC_010998	GCC	2	6	22932	22937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895333
533	NC_010998	TCT	2	6	22951	22956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895333
534	NC_010998	GCG	2	6	22989	22994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895333
535	NC_010998	TGG	2	6	23124	23129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895334
536	NC_010998	AGG	2	6	23181	23186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895334
537	NC_010998	TG	3	6	23207	23212	0 %	50 %	50 %	0 %	190895334
538	NC_010998	CGA	2	6	23232	23237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895334
539	NC_010998	GAT	2	6	23317	23322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895334
540	NC_010998	GTC	2	6	23335	23340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895334
541	NC_010998	ATC	2	6	23342	23347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895334
542	NC_010998	GGCC	2	8	23358	23365	0 %	0 %	50 %	50 %	190895334
543	NC_010998	GCC	2	6	23371	23376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895334
544	NC_010998	AAGGC	2	10	23417	23426	40 %	0 %	40 %	20 %	190895334
545	NC_010998	GGA	2	6	23485	23490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895334
546	NC_010998	GGC	2	6	23494	23499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895334
547	NC_010998	CCG	2	6	23509	23514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895334
548	NC_010998	CGC	2	6	23541	23546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895334
549	NC_010998	GC	3	6	23545	23550	0 %	0 %	50 %	50 %	190895334
550	NC_010998	TCCA	2	8	23573	23580	25 %	25 %	0 %	50 %	190895334
551	NC_010998	GCC	2	6	23590	23595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895334
552	NC_010998	CGGT	2	8	23657	23664	0 %	25 %	50 %	25 %	190895334
553	NC_010998	GAT	2	6	23680	23685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895334
554	NC_010998	CGA	2	6	23694	23699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895334
555	NC_010998	GGC	2	6	23700	23705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895334
556	NC_010998	GC	3	6	23704	23709	0 %	0 %	50 %	50 %	190895334
557	NC_010998	TCG	2	6	23741	23746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895334
558	NC_010998	CAGGG	2	10	23748	23757	20 %	0 %	60 %	20 %	190895334
559	NC_010998	GAA	2	6	23821	23826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895334
560	NC_010998	GTC	2	6	23827	23832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895334
561	NC_010998	CGG	3	9	23940	23948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895334
562	NC_010998	CCG	2	6	23956	23961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895334
563	NC_010998	TTC	2	6	23968	23973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895334
564	NC_010998	TCC	2	6	24073	24078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_010998	GCG	2	6	24082	24087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_010998	CTT	2	6	24101	24106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_010998	GCC	2	6	24223	24228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895335
568	NC_010998	GGT	2	6	24281	24286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895335
569	NC_010998	CGT	2	6	24319	24324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895335
570	NC_010998	CCT	2	6	24367	24372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895335
571	NC_010998	CATC	2	8	24382	24389	25 %	25 %	0 %	50 %	190895335
572	NC_010998	AGA	2	6	24418	24423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895335
573	NC_010998	GCCC	2	8	24456	24463	0 %	0 %	25 %	75 %	190895335
574	NC_010998	CGC	2	6	24472	24477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895335
575	NC_010998	CGC	3	9	24493	24501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895335
576	NC_010998	AAGG	2	8	24542	24549	50 %	0 %	50 %	0 %	190895335
577	NC_010998	CCG	2	6	24591	24596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895335
578	NC_010998	GCC	2	6	24604	24609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895335
579	NC_010998	CGC	2	6	24635	24640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895335
580	NC_010998	ACG	2	6	24705	24710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895335
581	NC_010998	CGG	2	6	24752	24757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895335
582	NC_010998	GAT	3	9	24770	24778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895335
583	NC_010998	GCG	2	6	24813	24818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895335
584	NC_010998	AGC	2	6	24819	24824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895335
585	NC_010998	TGA	2	6	24847	24852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895335
586	NC_010998	TGC	2	6	24862	24867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895335
587	NC_010998	CGG	2	6	24870	24875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895335
588	NC_010998	GCG	2	6	24897	24902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895335
589	NC_010998	GC	3	6	24907	24912	0 %	0 %	50 %	50 %	190895335
590	NC_010998	CGA	2	6	24937	24942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895335
591	NC_010998	CGA	2	6	24946	24951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895335
592	NC_010998	GGC	2	6	24952	24957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895335
593	NC_010998	CGC	2	6	24973	24978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895335
594	NC_010998	GCA	2	6	25021	25026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895335
595	NC_010998	CG	3	6	25033	25038	0 %	0 %	50 %	50 %	190895335
596	NC_010998	CGCC	2	8	25096	25103	0 %	0 %	25 %	75 %	190895335
597	NC_010998	T	6	6	25145	25150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_010998	CGT	2	6	25162	25167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_010998	CAT	2	6	25177	25182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_010998	GCGGG	2	10	25231	25240	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
601	NC_010998	G	6	6	25238	25243	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010998	T	6	6	25245	25250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_010998	GTC	2	6	25261	25266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_010998	CCG	2	6	25274	25279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_010998	TGG	2	6	25347	25352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_010998	GCG	2	6	25367	25372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_010998	A	7	7	25405	25411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_010998	GCG	2	6	25448	25453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_010998	CAC	2	6	25467	25472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_010998	GCC	2	6	25521	25526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895336
611	NC_010998	GCC	3	9	25626	25634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895336
612	NC_010998	GCC	2	6	25647	25652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895336
613	NC_010998	GCC	2	6	25659	25664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895336
614	NC_010998	GAC	2	6	25665	25670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895336
615	NC_010998	CTG	2	6	25673	25678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895336
616	NC_010998	CCG	2	6	25684	25689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895336
617	NC_010998	TTG	2	6	25708	25713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895336
618	NC_010998	TGG	2	6	25714	25719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895336
619	NC_010998	CG	3	6	25729	25734	0 %	0 %	50 %	50 %	190895336
620	NC_010998	CAA	2	6	25757	25762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895336
621	NC_010998	GCT	2	6	25782	25787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895336
622	NC_010998	ATA	2	6	25801	25806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190895336
623	NC_010998	GCA	2	6	25849	25854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_010998	GTTC	2	8	25863	25870	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_010998	CGT	2	6	25935	25940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895337
626	NC_010998	CTC	2	6	25941	25946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895337
627	NC_010998	TCG	2	6	25966	25971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895337
628	NC_010998	TCA	2	6	26021	26026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895337
629	NC_010998	CGC	2	6	26039	26044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895337
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