MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 10093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010998	GAT	2	6	248273	248278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895543
6002	NC_010998	GC	3	6	248291	248296	0 %	0 %	50 %	50 %	190895543
6003	NC_010998	GAC	2	6	248324	248329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895543
6004	NC_010998	TCG	2	6	248412	248417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895543
6005	NC_010998	AGC	2	6	248418	248423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895543
6006	NC_010998	CAT	2	6	248447	248452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895543
6007	NC_010998	GC	3	6	248463	248468	0 %	0 %	50 %	50 %	190895543
6008	NC_010998	CGC	2	6	248476	248481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895543
6009	NC_010998	CGA	2	6	248494	248499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895543
6010	NC_010998	GCTT	2	8	248561	248568	0 %	50 %	25 %	25 %	190895543
6011	NC_010998	CGTGC	2	10	248582	248591	0 %	20 %	40 %	40 %	190895543
6012	NC_010998	GCC	2	6	248706	248711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895543
6013	NC_010998	GCGA	2	8	248753	248760	25 %	0 %	50 %	25 %	190895543
6014	NC_010998	CCA	2	6	248800	248805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895543
6015	NC_010998	GGAT	2	8	248851	248858	25 %	25 %	50 %	0 %	190895543
6016	NC_010998	CCCT	2	8	248957	248964	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6017	NC_010998	GGCG	2	8	249022	249029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6018	NC_010998	TCAA	2	8	249042	249049	50 %	25 %	0 %	25 %	190895544
6019	NC_010998	GAC	2	6	249118	249123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895544
6020	NC_010998	CGC	2	6	249126	249131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895544
6021	NC_010998	TGA	2	6	249147	249152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895544
6022	NC_010998	GC	3	6	249153	249158	0 %	0 %	50 %	50 %	190895544
6023	NC_010998	CAT	2	6	249249	249254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895544
6024	NC_010998	CGGC	2	8	249263	249270	0 %	0 %	50 %	50 %	190895544
6025	NC_010998	GCG	2	6	249285	249290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895544
6026	NC_010998	GCC	2	6	249292	249297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895544
6027	NC_010998	CAG	2	6	249373	249378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895544
6028	NC_010998	CAG	2	6	249415	249420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895544
6029	NC_010998	GCG	2	6	249618	249623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895544
6030	NC_010998	CGGC	2	8	249705	249712	0 %	0 %	50 %	50 %	190895544
6031	NC_010998	TCC	2	6	249731	249736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895544
6032	NC_010998	GC	4	8	249777	249784	0 %	0 %	50 %	50 %	190895544
6033	NC_010998	AGC	2	6	249848	249853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_010998	CCGG	2	8	249981	249988	0 %	0 %	50 %	50 %	190895545
6035	NC_010998	CGGC	2	8	250052	250059	0 %	0 %	50 %	50 %	190895545
6036	NC_010998	CGG	2	6	250062	250067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895545
6037	NC_010998	AGC	2	6	250070	250075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
6038	NC_010998	CGA	3	9	250110	250118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
6039	NC_010998	AGGC	2	8	250145	250152	25 %	0 %	50 %	25 %	190895545
6040	NC_010998	TCA	2	6	250158	250163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895545
6041	NC_010998	AGGC	2	8	250175	250182	25 %	0 %	50 %	25 %	190895545
6042	NC_010998	GGC	3	9	250180	250188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895545
6043	NC_010998	CG	3	6	250198	250203	0 %	0 %	50 %	50 %	190895545
6044	NC_010998	GCA	3	9	250275	250283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
6045	NC_010998	CGC	2	6	250312	250317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895545
6046	NC_010998	GGC	2	6	250321	250326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895545
6047	NC_010998	CCCG	2	8	250371	250378	0 %	0 %	25 %	75 %	190895545
6048	NC_010998	GGAC	2	8	250398	250405	25 %	0 %	50 %	25 %	190895545
6049	NC_010998	GAT	2	6	250452	250457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895545
6050	NC_010998	CGC	2	6	250464	250469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895545
6051	NC_010998	GAC	2	6	250504	250509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
6052	NC_010998	GCA	2	6	250542	250547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
6053	NC_010998	GCA	2	6	250623	250628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
6054	NC_010998	GA	3	6	250747	250752	50 %	0 %	50 %	0 %	190895545
6055	NC_010998	GGC	2	6	250765	250770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895545
6056	NC_010998	TGG	2	6	250815	250820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895545
6057	NC_010998	TCT	2	6	250851	250856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895545
6058	NC_010998	GC	3	6	250869	250874	0 %	0 %	50 %	50 %	190895545
6059	NC_010998	GCG	2	6	250899	250904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895545
6060	NC_010998	TCG	2	6	250913	250918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895545
6061	NC_010998	AGG	2	6	250920	250925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895545
6062	NC_010998	TGCGGC	2	12	251020	251031	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190895545
6063	NC_010998	GTGG	2	8	251035	251042	0 %	25 %	75 %	0 %	190895545
6064	NC_010998	ACG	2	6	251207	251212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
6065	NC_010998	CGA	2	6	251252	251257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
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6069	NC_010998	GATG	2	8	251450	251457	25 %	25 %	50 %	0 %	190895546
6070	NC_010998	TCG	2	6	251512	251517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895546
6071	NC_010998	GCG	2	6	251609	251614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895547
6072	NC_010998	GAT	2	6	251618	251623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895547
6073	NC_010998	TGA	3	9	251638	251646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895547
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6078	NC_010998	GAC	2	6	251801	251806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895547
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6081	NC_010998	CAG	2	6	251897	251902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895547
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6085	NC_010998	TCG	2	6	251995	252000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895547
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6089	NC_010998	GAC	2	6	252179	252184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895547
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6093	NC_010998	GAT	2	6	252326	252331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895547
6094	NC_010998	AG	3	6	252341	252346	50 %	0 %	50 %	0 %	190895547
6095	NC_010998	AGC	2	6	252369	252374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895547
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6102	NC_010998	TGC	2	6	252592	252597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895547
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6104	NC_010998	GAT	2	6	252637	252642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895548
6105	NC_010998	ATG	2	6	252689	252694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895548
6106	NC_010998	TGA	2	6	252756	252761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895548
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6111	NC_010998	CCGG	2	8	252967	252974	0 %	0 %	50 %	50 %	190895548
6112	NC_010998	CGG	3	9	252993	253001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895548
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6119	NC_010998	ACG	2	6	253229	253234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895548
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6121	NC_010998	GCG	2	6	253286	253291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895548
6122	NC_010998	ACG	2	6	253319	253324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895548
6123	NC_010998	GCG	2	6	253343	253348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895548
6124	NC_010998	TCA	2	6	253350	253355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895548
6125	NC_010998	GGC	2	6	253387	253392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895548
6126	NC_010998	GA	3	6	253397	253402	50 %	0 %	50 %	0 %	190895548
6127	NC_010998	TCGA	2	8	253403	253410	25 %	25 %	25 %	25 %	190895548
6128	NC_010998	CGG	2	6	253506	253511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895548
6129	NC_010998	ATC	2	6	253532	253537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895548
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6132	NC_010998	GC	3	6	253620	253625	0 %	0 %	50 %	50 %	190895549
6133	NC_010998	CCTT	2	8	253677	253684	0 %	50 %	0 %	50 %	190895549
6134	NC_010998	GAT	2	6	253712	253717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895549
6135	NC_010998	ATG	2	6	253740	253745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895549
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6138	NC_010998	TCG	2	6	253819	253824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895549
6139	NC_010998	TCG	2	6	253827	253832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895549
6140	NC_010998	ATG	2	6	253836	253841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895549
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6149	NC_010998	ATCGGC	2	12	254046	254057	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190895549
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6155	NC_010998	GCC	2	6	254324	254329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895549
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6234	NC_010998	CTC	3	9	257068	257076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6235	NC_010998	ATTT	2	8	257084	257091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6236	NC_010998	GCA	2	6	257146	257151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6237	NC_010998	GC	3	6	257217	257222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6238	NC_010998	GGA	2	6	257252	257257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6239	NC_010998	GGC	2	6	257264	257269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895552
6240	NC_010998	GAT	2	6	257298	257303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895552
6241	NC_010998	CGG	2	6	257311	257316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895552
6242	NC_010998	CGA	2	6	257321	257326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895552
6243	NC_010998	GCT	2	6	257336	257341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895552
6244	NC_010998	CGG	3	9	257387	257395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895552
6245	NC_010998	GGC	2	6	257436	257441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895552
6246	NC_010998	CGG	2	6	257471	257476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895552
6247	NC_010998	CGAAGA	2	12	257561	257572	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190895552
6248	NC_010998	GCCGC	2	10	257617	257626	0 %	0 %	40 %	60 %	190895552
6249	NC_010998	TCGA	2	8	257628	257635	25 %	25 %	25 %	25 %	190895552
6250	NC_010998	CGC	2	6	257638	257643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895552
6251	NC_010998	CAT	2	6	257693	257698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895552
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6253	NC_010998	GCA	2	6	257735	257740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895552
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6264	NC_010998	GC	3	6	258142	258147	0 %	0 %	50 %	50 %	190895552
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6272	NC_010998	CGG	2	6	258587	258592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895552
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6274	NC_010998	TCG	2	6	258628	258633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895552
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6286	NC_010998	TGC	2	6	259123	259128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895552
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6291	NC_010998	GAT	2	6	259194	259199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895552
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6300	NC_010998	CGA	2	6	259828	259833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895553
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6302	NC_010998	GCTC	2	8	260013	260020	0 %	25 %	25 %	50 %	190895553
6303	NC_010998	CCTCG	2	10	260179	260188	0 %	20 %	20 %	60 %	190895553
6304	NC_010998	CGA	2	6	260215	260220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895553
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6322	NC_010998	TGAGTT	2	12	260873	260884	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	190895553
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6324	NC_010998	CGA	3	9	260999	261007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895554
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6326	NC_010998	TCG	2	6	261058	261063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895554
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6329	NC_010998	AGC	2	6	261277	261282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895554
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6332	NC_010998	CGA	2	6	261412	261417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6333	NC_010998	CCGG	2	8	261436	261443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6334	NC_010998	ACGCA	2	10	261465	261474	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6335	NC_010998	GGA	2	6	261477	261482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6336	NC_010998	A	6	6	261501	261506	100 %	0 %	0 %	0 %	190895555
6337	NC_010998	TGGC	2	8	261507	261514	0 %	25 %	50 %	25 %	190895555
6338	NC_010998	GCTCG	2	10	261566	261575	0 %	20 %	40 %	40 %	190895555
6339	NC_010998	GGA	2	6	261587	261592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895555
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6341	NC_010998	CGG	2	6	261653	261658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895555
6342	NC_010998	GAC	2	6	261665	261670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895555
6343	NC_010998	GC	3	6	261678	261683	0 %	0 %	50 %	50 %	190895555
6344	NC_010998	TGC	2	6	261697	261702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895555
6345	NC_010998	GC	3	6	261701	261706	0 %	0 %	50 %	50 %	190895555
6346	NC_010998	GAG	2	6	261723	261728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895555
6347	NC_010998	ATGC	2	8	261744	261751	25 %	25 %	25 %	25 %	190895555
6348	NC_010998	CCGG	2	8	261765	261772	0 %	0 %	50 %	50 %	190895555
6349	NC_010998	AGC	2	6	261788	261793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895555
6350	NC_010998	GCT	2	6	261818	261823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895555
6351	NC_010998	GTG	2	6	261825	261830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895555
6352	NC_010998	GCCG	2	8	261845	261852	0 %	0 %	50 %	50 %	190895555
6353	NC_010998	TGC	2	6	261868	261873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895555
6354	NC_010998	ATC	2	6	261912	261917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895555
6355	NC_010998	CCG	3	9	261928	261936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895555
6356	NC_010998	CGCC	2	8	261956	261963	0 %	0 %	25 %	75 %	190895555
6357	NC_010998	CGT	2	6	262091	262096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895555
6358	NC_010998	CCGG	2	8	262100	262107	0 %	0 %	50 %	50 %	190895555
6359	NC_010998	CG	3	6	262141	262146	0 %	0 %	50 %	50 %	190895555
6360	NC_010998	GGGCC	2	10	262175	262184	0 %	0 %	60 %	40 %	190895555
6361	NC_010998	GGC	2	6	262187	262192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895555
6362	NC_010998	CGA	2	6	262274	262279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895555
6363	NC_010998	TCG	2	6	262288	262293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895555
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6365	NC_010998	AGG	2	6	262394	262399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6367	NC_010998	GCG	2	6	262521	262526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6368	NC_010998	GAAAG	2	10	262585	262594	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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6487	NC_010998	GC	3	6	267171	267176	0 %	0 %	50 %	50 %	190895561
6488	NC_010998	CTT	2	6	267186	267191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895561
6489	NC_010998	ACGCTG	2	12	267198	267209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190895561
6490	NC_010998	GC	4	8	267220	267227	0 %	0 %	50 %	50 %	190895561
6491	NC_010998	GTT	2	6	267256	267261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895561
6492	NC_010998	GCG	2	6	267288	267293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895561
6493	NC_010998	GC	3	6	267447	267452	0 %	0 %	50 %	50 %	190895562
6494	NC_010998	CGA	2	6	267524	267529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895562
6495	NC_010998	CGC	2	6	267533	267538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895562
6496	NC_010998	TCG	2	6	267590	267595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895563
6497	NC_010998	CGCAG	2	10	267753	267762	20 %	0 %	40 %	40 %	190895563
6498	NC_010998	GGC	3	9	267796	267804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895563
6499	NC_010998	CGA	2	6	267954	267959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895563
6500	NC_010998	CTG	2	6	268011	268016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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