MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010997	GCGCC	2	10	284	293	0 %	0 %	40 %	60 %	190894341
2	NC_010997	GCGCT	2	10	967	976	0 %	20 %	40 %	40 %	190894341
3	NC_010997	GATCA	2	10	1891	1900	40 %	20 %	20 %	20 %	190894342
4	NC_010997	CCGGC	2	10	4334	4343	0 %	0 %	40 %	60 %	190894344
5	NC_010997	CCGAT	2	10	6982	6991	20 %	20 %	20 %	40 %	190894347
6	NC_010997	ATTGG	2	10	9696	9705	20 %	40 %	40 %	0 %	190894349
7	NC_010997	AGGAC	2	10	10514	10523	40 %	0 %	40 %	20 %	190894350
8	NC_010997	GGCCG	2	10	10562	10571	0 %	0 %	60 %	40 %	190894350
9	NC_010997	GCCGA	2	10	10918	10927	20 %	0 %	40 %	40 %	190894350
10	NC_010997	CCGCT	2	10	11364	11373	0 %	20 %	20 %	60 %	190894351
11	NC_010997	CGTGA	2	10	11446	11455	20 %	20 %	40 %	20 %	190894351
12	NC_010997	GCCTC	2	10	11562	11571	0 %	20 %	20 %	60 %	190894351
13	NC_010997	TCGCC	2	10	13520	13529	0 %	20 %	20 %	60 %	190894354
14	NC_010997	GGAAG	2	10	14642	14651	40 %	0 %	60 %	0 %	190894356
15	NC_010997	GGACC	2	10	15542	15551	20 %	0 %	40 %	40 %	190894356
16	NC_010997	CGCCA	2	10	16080	16089	20 %	0 %	20 %	60 %	190894358
17	NC_010997	GCCGA	2	10	16551	16560	20 %	0 %	40 %	40 %	190894358
18	NC_010997	CGGCG	2	10	18820	18829	0 %	0 %	60 %	40 %	190894360
19	NC_010997	TTCGC	2	10	18844	18853	0 %	40 %	20 %	40 %	190894360
20	NC_010997	ATCCG	2	10	19429	19438	20 %	20 %	20 %	40 %	190894360
21	NC_010997	CGGAC	2	10	20299	20308	20 %	0 %	40 %	40 %	190894361
22	NC_010997	TGATC	2	10	24147	24156	20 %	40 %	20 %	20 %	190894365
23	NC_010997	CGGCC	2	10	24426	24435	0 %	0 %	40 %	60 %	190894365
24	NC_010997	AGTTT	2	10	24749	24758	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010997	GACTT	2	10	24980	24989	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010997	GCAGC	2	10	26208	26217	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010997	AGGCC	2	10	33386	33395	20 %	0 %	40 %	40 %	190894370
28	NC_010997	ACGCC	2	10	34733	34742	20 %	0 %	20 %	60 %	190894372
29	NC_010997	GTCCT	2	10	36071	36080	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_010997	CAAGC	2	10	39259	39268	40 %	0 %	20 %	40 %	190894377
31	NC_010997	CGGCA	2	10	41139	41148	20 %	0 %	40 %	40 %	190894378
32	NC_010997	AGATC	2	10	43462	43471	40 %	20 %	20 %	20 %	190894380
33	NC_010997	GGCTT	2	10	44006	44015	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010997	GGCGA	2	10	46235	46244	20 %	0 %	60 %	20 %	190894384
35	NC_010997	TCGGC	2	10	46814	46823	0 %	20 %	40 %	40 %	190894385
36	NC_010997	GACCG	2	10	49097	49106	20 %	0 %	40 %	40 %	190894387
37	NC_010997	TCTAC	2	10	49357	49366	20 %	40 %	0 %	40 %	190894388
38	NC_010997	GCGCC	2	10	53516	53525	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_010997	AGGGC	2	10	53958	53967	20 %	0 %	60 %	20 %	190894394
40	NC_010997	GCCGC	2	10	56835	56844	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_010997	CCGCG	2	10	56889	56898	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_010997	CTCCG	2	10	59983	59992	0 %	20 %	20 %	60 %	190894400
43	NC_010997	TCGCT	2	10	61209	61218	0 %	40 %	20 %	40 %	190894400
44	NC_010997	GGGAA	2	10	62197	62206	40 %	0 %	60 %	0 %	190894401
45	NC_010997	GCGCA	2	10	62932	62941	20 %	0 %	40 %	40 %	190894402
46	NC_010997	AACGG	2	10	66340	66349	40 %	0 %	40 %	20 %	190894405
47	NC_010997	CGTCA	2	10	69000	69009	20 %	20 %	20 %	40 %	190894410
48	NC_010997	CGAAA	2	10	69943	69952	60 %	0 %	20 %	20 %	190894411
49	NC_010997	CAACC	2	10	71205	71214	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_010997	TCCGC	2	10	71672	71681	0 %	20 %	20 %	60 %	190894413
51	NC_010997	AGGCA	2	10	73773	73782	40 %	0 %	40 %	20 %	190894416
52	NC_010997	CGCGC	2	10	74100	74109	0 %	0 %	40 %	60 %	190894416
53	NC_010997	GCGGG	2	10	77026	77035	0 %	0 %	80 %	20 %	190894420
54	NC_010997	TGGCG	2	10	78046	78055	0 %	20 %	60 %	20 %	190894420
55	NC_010997	CATCG	2	10	78938	78947	20 %	20 %	20 %	40 %	190894421
56	NC_010997	CCTGC	2	10	78951	78960	0 %	20 %	20 %	60 %	190894421
57	NC_010997	ACGGC	2	10	80334	80343	20 %	0 %	40 %	40 %	190894422
58	NC_010997	CAAGG	2	10	80840	80849	40 %	0 %	40 %	20 %	190894422
59	NC_010997	GCCGC	2	10	83214	83223	0 %	0 %	40 %	60 %	190894425
60	NC_010997	CGAAC	2	10	88446	88455	40 %	0 %	20 %	40 %	190894430
61	NC_010997	TGGCC	2	10	91176	91185	0 %	20 %	40 %	40 %	190894433
62	NC_010997	TTCGC	2	10	92409	92418	0 %	40 %	20 %	40 %	190894434
63	NC_010997	GCCTT	2	10	93726	93735	0 %	40 %	20 %	40 %	190894436
64	NC_010997	GAGGT	2	10	94936	94945	20 %	20 %	60 %	0 %	190894437
65	NC_010997	GTTGC	2	10	95560	95569	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010997	GTTCG	2	10	99247	99256	0 %	40 %	40 %	20 %	190894440
67	NC_010997	TGGCG	2	10	101516	101525	0 %	20 %	60 %	20 %	190894441
68	NC_010997	CCGGC	2	10	101583	101592	0 %	0 %	40 %	60 %	190894441
69	NC_010997	TCGCC	2	10	104255	104264	0 %	20 %	20 %	60 %	190894443
70	NC_010997	AGCCG	2	10	106003	106012	20 %	0 %	40 %	40 %	190894445
71	NC_010997	TCGAC	2	10	107001	107010	20 %	20 %	20 %	40 %	190894446
72	NC_010997	TGAAC	2	10	109024	109033	40 %	20 %	20 %	20 %	190894447
73	NC_010997	TGGCA	2	10	109923	109932	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010997	GCGAG	2	10	110228	110237	20 %	0 %	60 %	20 %	190894448
75	NC_010997	CTGGT	2	10	110452	110461	0 %	40 %	40 %	20 %	190894448
76	NC_010997	AGTGG	2	10	112628	112637	20 %	20 %	60 %	0 %	190894451
77	NC_010997	AGCGG	2	10	115464	115473	20 %	0 %	60 %	20 %	190894455
78	NC_010997	GCCGA	2	10	117610	117619	20 %	0 %	40 %	40 %	190894457
79	NC_010997	TGGCT	2	10	119048	119057	0 %	40 %	40 %	20 %	190894458
80	NC_010997	GCCGC	2	10	119923	119932	0 %	0 %	40 %	60 %	190894459
81	NC_010997	CTTTC	2	10	119980	119989	0 %	60 %	0 %	40 %	190894459
82	NC_010997	TTGAC	2	10	124276	124285	20 %	40 %	20 %	20 %	190894463
83	NC_010997	GTCTT	2	10	125028	125037	0 %	60 %	20 %	20 %	190894464
84	NC_010997	CGATG	2	10	126419	126428	20 %	20 %	40 %	20 %	190894465
85	NC_010997	GACGA	2	10	127570	127579	40 %	0 %	40 %	20 %	190894466
86	NC_010997	CGACG	2	10	127995	128004	20 %	0 %	40 %	40 %	190894467
87	NC_010997	GAGCT	2	10	128240	128249	20 %	20 %	40 %	20 %	190894467
88	NC_010997	CCGCC	2	10	131101	131110	0 %	0 %	20 %	80 %	190894470
89	NC_010997	CGGCG	2	10	131124	131133	0 %	0 %	60 %	40 %	190894470
90	NC_010997	CTGTG	2	10	133163	133172	0 %	40 %	40 %	20 %	190894472
91	NC_010997	CCGTC	2	10	134259	134268	0 %	20 %	20 %	60 %	190894475
92	NC_010997	AAAGG	2	10	137977	137986	60 %	0 %	40 %	0 %	190894480
93	NC_010997	GATAC	2	10	138000	138009	40 %	20 %	20 %	20 %	190894480
94	NC_010997	GCTTT	2	10	138568	138577	0 %	60 %	20 %	20 %	190894480
95	NC_010997	ATTGA	2	10	139144	139153	40 %	40 %	20 %	0 %	190894481
96	NC_010997	ATGGC	2	10	141853	141862	20 %	20 %	40 %	20 %	190894484
97	NC_010997	CTCAT	2	10	142035	142044	20 %	40 %	0 %	40 %	190894484
98	NC_010997	CATCG	2	10	149416	149425	20 %	20 %	20 %	40 %	190894493
99	NC_010997	GGCGA	2	10	151982	151991	20 %	0 %	60 %	20 %	190894494
100	NC_010997	TTCGG	2	10	153663	153672	0 %	40 %	40 %	20 %	190894496
101	NC_010997	CCTCG	2	10	154106	154115	0 %	20 %	20 %	60 %	190894496
102	NC_010997	TCGCG	2	10	156465	156474	0 %	20 %	40 %	40 %	190894498
103	NC_010997	GGCCG	2	10	158107	158116	0 %	0 %	60 %	40 %	190894500
104	NC_010997	GCGGG	2	10	162289	162298	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010997	GCCGT	2	10	164144	164153	0 %	20 %	40 %	40 %	190894504
106	NC_010997	CCGTT	2	10	164876	164885	0 %	40 %	20 %	40 %	190894505
107	NC_010997	CTATG	2	10	167306	167315	20 %	40 %	20 %	20 %	190894508
108	NC_010997	TCGCT	2	10	167575	167584	0 %	40 %	20 %	40 %	190894508
109	NC_010997	CGATC	2	10	172838	172847	20 %	20 %	20 %	40 %	190894511
110	NC_010997	GACCG	2	10	173944	173953	20 %	0 %	40 %	40 %	190894512
111	NC_010997	CGAGG	2	10	175441	175450	20 %	0 %	60 %	20 %	190894513
112	NC_010997	CGAGC	2	10	175720	175729	20 %	0 %	40 %	40 %	190894513
113	NC_010997	CAGCG	2	10	179105	179114	20 %	0 %	40 %	40 %	190894515
114	NC_010997	AGAGC	2	10	180110	180119	40 %	0 %	40 %	20 %	190894516
115	NC_010997	TTTCA	2	10	180459	180468	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010997	CAATT	2	10	181208	181217	40 %	40 %	0 %	20 %	190894518
117	NC_010997	GATCT	2	10	181454	181463	20 %	40 %	20 %	20 %	190894519
118	NC_010997	GGCGT	2	10	183280	183289	0 %	20 %	60 %	20 %	190894520
119	NC_010997	GGTGC	2	10	183321	183330	0 %	20 %	60 %	20 %	190894520
120	NC_010997	GCGCG	2	10	183393	183402	0 %	0 %	60 %	40 %	190894520
121	NC_010997	TCGTC	2	10	187266	187275	0 %	40 %	20 %	40 %	190894524
122	NC_010997	CTGCT	2	10	189273	189282	0 %	40 %	20 %	40 %	190894526
123	NC_010997	CAGCG	2	10	190258	190267	20 %	0 %	40 %	40 %	190894527
124	NC_010997	AGCCG	2	10	190593	190602	20 %	0 %	40 %	40 %	190894527
125	NC_010997	GCCCG	2	10	192782	192791	0 %	0 %	40 %	60 %	190894530
126	NC_010997	TGCGG	2	10	193638	193647	0 %	20 %	60 %	20 %	190894531
127	NC_010997	CGATC	2	10	194496	194505	20 %	20 %	20 %	40 %	190894532
128	NC_010997	CTCGG	2	10	194773	194782	0 %	20 %	40 %	40 %	190894532
129	NC_010997	AAAGG	2	10	195336	195345	60 %	0 %	40 %	0 %	190894533
130	NC_010997	GGGCA	2	10	198164	198173	20 %	0 %	60 %	20 %	190894535
131	NC_010997	CATCG	2	10	199502	199511	20 %	20 %	20 %	40 %	190894536
132	NC_010997	GCTCT	2	10	202839	202848	0 %	40 %	20 %	40 %	190894539
133	NC_010997	CACAA	2	10	204185	204194	60 %	0 %	0 %	40 %	190894540
134	NC_010997	TGCTC	2	10	204446	204455	0 %	40 %	20 %	40 %	190894541
135	NC_010997	GGGCA	2	10	206131	206140	20 %	0 %	60 %	20 %	190894542
136	NC_010997	GGTCA	2	10	206960	206969	20 %	20 %	40 %	20 %	190894543
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149	NC_010997	GCCGC	2	10	229345	229354	0 %	0 %	40 %	60 %	190894567
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