MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 24783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010997	AGC	2	6	20599	20604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_010997	ACT	2	6	20605	20610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_010997	GAA	2	6	20639	20644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_010997	GGCC	2	8	20689	20696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_010997	GCCT	2	8	20765	20772	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
506	NC_010997	CTC	2	6	20791	20796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_010997	CGG	2	6	20836	20841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894362
508	NC_010997	AAG	2	6	20882	20887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894362
509	NC_010997	TGC	2	6	20898	20903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894362
510	NC_010997	GGT	2	6	20974	20979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894362
511	NC_010997	CCT	2	6	21000	21005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894362
512	NC_010997	TTC	2	6	21029	21034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894362
513	NC_010997	CTG	2	6	21053	21058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894362
514	NC_010997	GCA	2	6	21062	21067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894362
515	NC_010997	GCC	2	6	21071	21076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894362
516	NC_010997	TCG	2	6	21105	21110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894362
517	NC_010997	GC	3	6	21142	21147	0 %	0 %	50 %	50 %	190894362
518	NC_010997	AGG	2	6	21159	21164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894362
519	NC_010997	GGCG	2	8	21244	21251	0 %	0 %	75 %	25 %	190894362
520	NC_010997	GAC	2	6	21305	21310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894362
521	NC_010997	CGG	2	6	21370	21375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894362
522	NC_010997	CGA	2	6	21423	21428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894362
523	NC_010997	AGA	2	6	21567	21572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894362
524	NC_010997	A	8	8	21654	21661	100 %	0 %	0 %	0 %	190894363
525	NC_010997	TTG	2	6	21689	21694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894363
526	NC_010997	TCG	2	6	21794	21799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894363
527	NC_010997	CGG	2	6	21810	21815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894363
528	NC_010997	ACCC	2	8	21832	21839	25 %	0 %	0 %	75 %	190894363
529	NC_010997	ACG	2	6	21896	21901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894363
530	NC_010997	ATC	2	6	21953	21958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894363
531	NC_010997	GCA	2	6	21977	21982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894363
532	NC_010997	GTG	2	6	22015	22020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894363
533	NC_010997	CGA	2	6	22026	22031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894363
534	NC_010997	GAC	2	6	22041	22046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894363
535	NC_010997	CGA	2	6	22047	22052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894363
536	NC_010997	CCTG	2	8	22096	22103	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
537	NC_010997	TCG	2	6	22183	22188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894364
538	NC_010997	CGG	2	6	22219	22224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894364
539	NC_010997	GCC	2	6	22274	22279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894364
540	NC_010997	GCC	2	6	22340	22345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894364
541	NC_010997	GCG	2	6	22389	22394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894364
542	NC_010997	CAG	2	6	22551	22556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894364
543	NC_010997	GCC	2	6	22658	22663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894364
544	NC_010997	GAT	2	6	22754	22759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894364
545	NC_010997	ATC	2	6	22806	22811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894364
546	NC_010997	TCG	2	6	22890	22895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894364
547	NC_010997	GCC	2	6	22896	22901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894364
548	NC_010997	CGG	2	6	22942	22947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894364
549	NC_010997	CAG	2	6	22976	22981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894364
550	NC_010997	GCC	2	6	22991	22996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894364
551	NC_010997	CCGG	2	8	23029	23036	0 %	0 %	50 %	50 %	190894364
552	NC_010997	CGC	2	6	23063	23068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894364
553	NC_010997	TCT	2	6	23101	23106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894364
554	NC_010997	CGA	2	6	23128	23133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894364
555	NC_010997	CGG	2	6	23189	23194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894364
556	NC_010997	GCCG	2	8	23200	23207	0 %	0 %	50 %	50 %	190894364
557	NC_010997	GAA	2	6	23219	23224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894364
558	NC_010997	CGG	2	6	23276	23281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894364
559	NC_010997	GA	3	6	23418	23423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_010997	TGC	2	6	23466	23471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_010997	CG	4	8	23520	23527	0 %	0 %	50 %	50 %	190894365
562	NC_010997	CGT	3	9	23548	23556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894365
563	NC_010997	CGA	2	6	23601	23606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
564	NC_010997	GAC	2	6	23614	23619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
565	NC_010997	CCAGAT	2	12	23626	23637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190894365
566	NC_010997	CGT	2	6	23740	23745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894365
567	NC_010997	GCC	2	6	23750	23755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894365
568	NC_010997	C	6	6	23754	23759	0 %	0 %	0 %	100 %	190894365
569	NC_010997	CATC	2	8	23764	23771	25 %	25 %	0 %	50 %	190894365
570	NC_010997	AGC	3	9	23840	23848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
571	NC_010997	CGA	2	6	23925	23930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
572	NC_010997	CAC	2	6	23932	23937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894365
573	NC_010997	GAC	2	6	23941	23946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
574	NC_010997	GGA	2	6	23997	24002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894365
575	NC_010997	CGA	2	6	24096	24101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
576	NC_010997	TGATC	2	10	24147	24156	20 %	40 %	20 %	20 %	190894365
577	NC_010997	AGG	2	6	24185	24190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894365
578	NC_010997	AG	4	8	24246	24253	50 %	0 %	50 %	0 %	190894365
579	NC_010997	GCC	2	6	24260	24265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894365
580	NC_010997	AGC	2	6	24284	24289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
581	NC_010997	CGG	2	6	24306	24311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894365
582	NC_010997	CGG	2	6	24399	24404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894365
583	NC_010997	CGGCC	2	10	24426	24435	0 %	0 %	40 %	60 %	190894365
584	NC_010997	TGC	2	6	24461	24466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894365
585	NC_010997	AAC	2	6	24476	24481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894365
586	NC_010997	GC	3	6	24486	24491	0 %	0 %	50 %	50 %	190894365
587	NC_010997	GCG	2	6	24515	24520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894365
588	NC_010997	TCC	2	6	24563	24568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_010997	GC	3	6	24656	24661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_010997	GAT	2	6	24705	24710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_010997	TTG	2	6	24712	24717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_010997	AGTTT	2	10	24749	24758	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
593	NC_010997	CTG	2	6	24862	24867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_010997	ATC	2	6	24882	24887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_010997	CAGCGG	2	12	24961	24972	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_010997	GACTT	2	10	24980	24989	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
597	NC_010997	CAA	2	6	24998	25003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_010997	TGA	2	6	25018	25023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_010997	CGA	2	6	25061	25066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_010997	CG	3	6	25076	25081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_010997	GAT	2	6	25095	25100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_010997	CAG	2	6	25139	25144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_010997	CAG	2	6	25146	25151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_010997	CGC	2	6	25156	25161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_010997	CG	3	6	25164	25169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_010997	GC	3	6	25176	25181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_010997	TCC	2	6	25300	25305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_010997	CAAC	2	8	25339	25346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_010997	AAG	2	6	25505	25510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_010997	TGC	2	6	25514	25519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_010997	CAA	2	6	25596	25601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_010997	GCAG	2	8	25671	25678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
613	NC_010997	GCA	3	9	25689	25697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_010997	GCT	2	6	25706	25711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_010997	AG	3	6	25740	25745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_010997	CATCGC	2	12	25797	25808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
617	NC_010997	AAG	2	6	25890	25895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_010997	AGA	2	6	25985	25990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_010997	GGAG	2	8	26002	26009	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
620	NC_010997	TGCG	2	8	26086	26093	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_010997	ATG	2	6	26150	26155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_010997	ACC	2	6	26196	26201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_010997	GCAGC	2	10	26208	26217	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
624	NC_010997	GGA	2	6	26285	26290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_010997	GCAT	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_010997	CCT	2	6	26333	26338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_010997	TCG	2	6	26343	26348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_010997	TGA	2	6	26498	26503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_010997	CGC	2	6	26688	26693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_010997	CGC	2	6	26696	26701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_010997	GAA	2	6	26752	26757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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