MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 24783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010997	CGA	2	6	214543	214548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894550
5002	NC_010997	TGC	2	6	214673	214678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894551
5003	NC_010997	CAT	2	6	214741	214746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894551
5004	NC_010997	AGGC	2	8	214826	214833	25 %	0 %	50 %	25 %	190894551
5005	NC_010997	GCG	2	6	214836	214841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894551
5006	NC_010997	CGGA	2	8	214887	214894	25 %	0 %	50 %	25 %	190894551
5007	NC_010997	GCC	2	6	215090	215095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894551
5008	NC_010997	CGA	2	6	215097	215102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894551
5009	NC_010997	GCG	2	6	215105	215110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894551
5010	NC_010997	GGC	3	9	215149	215157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894551
5011	NC_010997	GTCC	2	8	215199	215206	0 %	25 %	25 %	50 %	190894551
5012	NC_010997	CG	3	6	215219	215224	0 %	0 %	50 %	50 %	190894551
5013	NC_010997	TCGG	2	8	215255	215262	0 %	25 %	50 %	25 %	190894551
5014	NC_010997	CGG	2	6	215319	215324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894551
5015	NC_010997	TCGC	2	8	215414	215421	0 %	25 %	25 %	50 %	190894551
5016	NC_010997	GGT	2	6	215433	215438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894551
5017	NC_010997	CCG	2	6	215453	215458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894551
5018	NC_010997	CGA	2	6	215487	215492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894551
5019	NC_010997	GCA	2	6	215497	215502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894551
5020	NC_010997	GGC	2	6	215503	215508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894551
5021	NC_010997	GCC	2	6	215524	215529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894551
5022	NC_010997	CGA	2	6	215553	215558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894551
5023	NC_010997	GCA	2	6	215564	215569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894551
5024	NC_010997	GCC	2	6	215576	215581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894551
5025	NC_010997	CCG	2	6	215585	215590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894551
5026	NC_010997	GCC	2	6	215596	215601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894551
5027	NC_010997	GACA	2	8	215631	215638	50 %	0 %	25 %	25 %	190894551
5028	NC_010997	GCGA	2	8	215660	215667	25 %	0 %	50 %	25 %	190894551
5029	NC_010997	TCG	2	6	215685	215690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894551
5030	NC_010997	ACAG	2	8	215700	215707	50 %	0 %	25 %	25 %	190894551
5031	NC_010997	CGC	2	6	215751	215756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894551
5032	NC_010997	TC	3	6	215761	215766	0 %	50 %	0 %	50 %	190894551
5033	NC_010997	GC	3	6	215871	215876	0 %	0 %	50 %	50 %	190894551
5034	NC_010997	GCG	2	6	215949	215954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894551
5035	NC_010997	CG	3	6	215960	215965	0 %	0 %	50 %	50 %	190894551
5036	NC_010997	GAGG	2	8	215974	215981	25 %	0 %	75 %	0 %	190894551
5037	NC_010997	GCC	2	6	216026	216031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894551
5038	NC_010997	ACT	2	6	216062	216067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894552
5039	NC_010997	CAT	2	6	216078	216083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894552
5040	NC_010997	CCGC	2	8	216116	216123	0 %	0 %	25 %	75 %	190894552
5041	NC_010997	GCC	2	6	216186	216191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894552
5042	NC_010997	TCA	2	6	216197	216202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894552
5043	NC_010997	CCGA	2	8	216343	216350	25 %	0 %	25 %	50 %	190894552
5044	NC_010997	GGC	2	6	216369	216374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894552
5045	NC_010997	GGCC	2	8	216434	216441	0 %	0 %	50 %	50 %	190894552
5046	NC_010997	GAA	2	6	216462	216467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894552
5047	NC_010997	CCGA	2	8	216571	216578	25 %	0 %	25 %	50 %	190894552
5048	NC_010997	CGA	2	6	216581	216586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894552
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5050	NC_010997	CCT	2	6	216740	216745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894552
5051	NC_010997	TTG	2	6	216778	216783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894552
5052	NC_010997	GC	3	6	216808	216813	0 %	0 %	50 %	50 %	190894552
5053	NC_010997	CCTT	2	8	216862	216869	0 %	50 %	0 %	50 %	190894552
5054	NC_010997	GCG	2	6	216955	216960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894552
5055	NC_010997	GCT	2	6	216981	216986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894552
5056	NC_010997	T	6	6	217062	217067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_010997	TAG	2	6	217088	217093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_010997	AAG	2	6	217110	217115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_010997	AGA	2	6	217116	217121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_010997	CCG	2	6	217242	217247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894553
5061	NC_010997	TTC	2	6	217264	217269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894553
5062	NC_010997	AAG	2	6	217275	217280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894553
5063	NC_010997	CTTCG	2	10	217287	217296	0 %	40 %	20 %	40 %	190894553
5064	NC_010997	GCG	2	6	217334	217339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894553
5065	NC_010997	GAA	2	6	217392	217397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894554
5066	NC_010997	CGG	2	6	217410	217415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894554
5067	NC_010997	GTC	3	9	217430	217438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894554
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5069	NC_010997	CGGCG	2	10	217526	217535	0 %	0 %	60 %	40 %	190894554
5070	NC_010997	GGC	2	6	217638	217643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894554
5071	NC_010997	CTG	2	6	217701	217706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894554
5072	NC_010997	GGC	2	6	217712	217717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894554
5073	NC_010997	GGCT	2	8	217746	217753	0 %	25 %	50 %	25 %	190894554
5074	NC_010997	GCT	2	6	217760	217765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894554
5075	NC_010997	GGA	2	6	217797	217802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894554
5076	NC_010997	TCGG	2	8	217803	217810	0 %	25 %	50 %	25 %	190894554
5077	NC_010997	CAT	2	6	217832	217837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894554
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5079	NC_010997	CGGC	2	8	217867	217874	0 %	0 %	50 %	50 %	190894554
5080	NC_010997	GCCA	2	8	217908	217915	25 %	0 %	25 %	50 %	190894554
5081	NC_010997	CAT	2	6	217940	217945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894554
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5087	NC_010997	GC	3	6	218204	218209	0 %	0 %	50 %	50 %	190894555
5088	NC_010997	TGCC	2	8	218419	218426	0 %	25 %	25 %	50 %	190894555
5089	NC_010997	GC	3	6	218522	218527	0 %	0 %	50 %	50 %	190894555
5090	NC_010997	GCCCGC	2	12	218579	218590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894555
5091	NC_010997	TCG	2	6	218598	218603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894555
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5093	NC_010997	CG	3	6	218713	218718	0 %	0 %	50 %	50 %	190894556
5094	NC_010997	TGG	2	6	218773	218778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894556
5095	NC_010997	CGG	2	6	218796	218801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
5096	NC_010997	CGG	2	6	218822	218827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
5097	NC_010997	CGGCG	2	10	218893	218902	0 %	0 %	60 %	40 %	190894556
5098	NC_010997	ACC	2	6	218903	218908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894556
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5105	NC_010997	TCG	2	6	219185	219190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894556
5106	NC_010997	TG	3	6	219216	219221	0 %	50 %	50 %	0 %	190894556
5107	NC_010997	CGG	3	9	219291	219299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
5108	NC_010997	TCG	2	6	219314	219319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894556
5109	NC_010997	GCT	2	6	219324	219329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894556
5110	NC_010997	GGC	2	6	219360	219365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
5111	NC_010997	TCG	3	9	219383	219391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894556
5112	NC_010997	CTT	2	6	219396	219401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894556
5113	NC_010997	CGG	2	6	219402	219407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
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5120	NC_010997	GCC	2	6	219799	219804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894557
5121	NC_010997	AGCC	2	8	219828	219835	25 %	0 %	25 %	50 %	190894557
5122	NC_010997	GAC	2	6	219860	219865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894557
5123	NC_010997	ATC	2	6	219896	219901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894557
5124	NC_010997	TTC	2	6	219920	219925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894558
5125	NC_010997	GCC	3	9	219944	219952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894558
5126	NC_010997	GCA	2	6	219996	220001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894558
5127	NC_010997	GCC	2	6	220147	220152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894558
5128	NC_010997	GTC	2	6	220195	220200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894558
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5131	NC_010997	GCC	3	9	220264	220272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894558
5132	NC_010997	CGGG	2	8	220326	220333	0 %	0 %	75 %	25 %	190894558
5133	NC_010997	GCC	3	9	220453	220461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894558
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5135	NC_010997	TTG	2	6	220526	220531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894558
5136	NC_010997	GCTGC	2	10	220579	220588	0 %	20 %	40 %	40 %	190894558
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5139	NC_010997	CTT	2	6	220732	220737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894558
5140	NC_010997	CATA	2	8	220819	220826	50 %	25 %	0 %	25 %	190894558
5141	NC_010997	TGC	2	6	220846	220851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_010997	CCG	3	9	220884	220892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5143	NC_010997	CGA	2	6	221024	221029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894559
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5159	NC_010997	GCC	2	6	221479	221484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5160	NC_010997	AAGTC	2	10	221496	221505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5161	NC_010997	CGG	2	6	221546	221551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5162	NC_010997	GTC	3	9	221579	221587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5163	NC_010997	ATC	2	6	221619	221624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894560
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5185	NC_010997	TGC	2	6	222481	222486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5186	NC_010997	TCGG	2	8	222578	222585	0 %	25 %	50 %	25 %	190894561
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5230	NC_010997	TCC	2	6	224567	224572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5231	NC_010997	GT	3	6	224776	224781	0 %	50 %	50 %	0 %	190894563
5232	NC_010997	CGA	2	6	224786	224791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894563
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5235	NC_010997	CGA	2	6	224927	224932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894563
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5239	NC_010997	CAG	2	6	225309	225314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894563
5240	NC_010997	GC	3	6	225324	225329	0 %	0 %	50 %	50 %	190894563
5241	NC_010997	GAGGGA	2	12	225356	225367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5243	NC_010997	GAG	2	6	225411	225416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_010997	GCA	2	6	225442	225447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894564
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5365	NC_010997	TGC	2	6	231222	231227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5483	NC_010997	GCA	2	6	235768	235773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894573
5484	NC_010997	GAT	2	6	235796	235801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894573
5485	NC_010997	G	6	6	235823	235828	0 %	0 %	100 %	0 %	190894573
5486	NC_010997	CGGC	2	8	235878	235885	0 %	0 %	50 %	50 %	190894573
5487	NC_010997	TGCG	2	8	235888	235895	0 %	25 %	50 %	25 %	190894573
5488	NC_010997	GCC	2	6	235902	235907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894573
5489	NC_010997	ACG	2	6	235935	235940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894573
5490	NC_010997	CGA	2	6	235948	235953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894573
5491	NC_010997	GCT	2	6	236115	236120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894573
5492	NC_010997	GCGG	2	8	236147	236154	0 %	0 %	75 %	25 %	190894573
5493	NC_010997	ATG	2	6	236259	236264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894573
5494	NC_010997	TCG	2	6	236283	236288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5495	NC_010997	GCCT	2	8	236315	236322	0 %	25 %	25 %	50 %	190894574
5496	NC_010997	TGGC	2	8	236388	236395	0 %	25 %	50 %	25 %	190894574
5497	NC_010997	GC	3	6	236446	236451	0 %	0 %	50 %	50 %	190894574
5498	NC_010997	GTC	2	6	236603	236608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894574
5499	NC_010997	GAGC	2	8	236609	236616	25 %	0 %	50 %	25 %	190894574
5500	NC_010997	CGG	2	6	236677	236682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894574

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