MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 chromosome

Total Repeats: 107757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_010994	TCG	2	6	170327	170332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889787
4003	NC_010994	CGGC	2	8	170352	170359	0 %	0 %	50 %	50 %	190889787
4004	NC_010994	GAC	2	6	170371	170376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889787
4005	NC_010994	TCT	2	6	170415	170420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889787
4006	NC_010994	CGA	2	6	170436	170441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889787
4007	NC_010994	CG	3	6	170451	170456	0 %	0 %	50 %	50 %	190889787
4008	NC_010994	GATC	2	8	170487	170494	25 %	25 %	25 %	25 %	190889787
4009	NC_010994	GC	3	6	170525	170530	0 %	0 %	50 %	50 %	190889787
4010	NC_010994	CGAC	2	8	170547	170554	25 %	0 %	25 %	50 %	190889787
4011	NC_010994	ATG	2	6	170564	170569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889787
4012	NC_010994	CGT	2	6	170571	170576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889787
4013	NC_010994	TGCG	2	8	170624	170631	0 %	25 %	50 %	25 %	190889787
4014	NC_010994	GCT	2	6	170655	170660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889787
4015	NC_010994	CAT	2	6	170670	170675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889787
4016	NC_010994	CG	3	6	170715	170720	0 %	0 %	50 %	50 %	190889787
4017	NC_010994	TCG	2	6	170729	170734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889787
4018	NC_010994	CGG	2	6	170735	170740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889787
4019	NC_010994	ATG	2	6	170741	170746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889787
4020	NC_010994	CGA	2	6	170766	170771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889787
4021	NC_010994	TCG	2	6	170837	170842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889787
4022	NC_010994	GCG	2	6	170903	170908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889787
4023	NC_010994	CGG	2	6	170926	170931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889787
4024	NC_010994	GCG	2	6	170960	170965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889787
4025	NC_010994	AAT	2	6	171009	171014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190889787
4026	NC_010994	CGA	2	6	171027	171032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889787
4027	NC_010994	GCC	2	6	171119	171124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889787
4028	NC_010994	CG	3	6	171180	171185	0 %	0 %	50 %	50 %	190889787
4029	NC_010994	ACTG	2	8	171226	171233	25 %	25 %	25 %	25 %	190889787
4030	NC_010994	GGC	2	6	171328	171333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889788
4031	NC_010994	GC	3	6	171356	171361	0 %	0 %	50 %	50 %	190889788
4032	NC_010994	GTC	2	6	171379	171384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889788
4033	NC_010994	CATCCG	2	12	171480	171491	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190889788
4034	NC_010994	CGA	2	6	171495	171500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889788
4035	NC_010994	GAT	2	6	171630	171635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889788
4036	NC_010994	ATCG	2	8	171643	171650	25 %	25 %	25 %	25 %	190889788
4037	NC_010994	CTT	2	6	171690	171695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889788
4038	NC_010994	CGT	2	6	171720	171725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889788
4039	NC_010994	CGA	2	6	171801	171806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889788
4040	NC_010994	GAT	2	6	171817	171822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889788
4041	NC_010994	CTC	2	6	171912	171917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_010994	CTG	2	6	171925	171930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_010994	TAA	2	6	171946	171951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_010994	A	6	6	171950	171955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_010994	TCA	2	6	171980	171985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_010994	CGCGG	2	10	172057	172066	0 %	0 %	60 %	40 %	190889789
4047	NC_010994	AT	3	6	172097	172102	50 %	50 %	0 %	0 %	190889789
4048	NC_010994	GGA	2	6	172128	172133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889789
4049	NC_010994	TCG	2	6	172149	172154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889789
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4051	NC_010994	GAT	2	6	172253	172258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889789
4052	NC_010994	GAC	2	6	172259	172264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889789
4053	NC_010994	CGC	2	6	172371	172376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889789
4054	NC_010994	GCT	2	6	172418	172423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889789
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4056	NC_010994	GCT	3	9	172460	172468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889789
4057	NC_010994	CTT	2	6	172469	172474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889789
4058	NC_010994	CAA	2	6	172505	172510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190889789
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4060	NC_010994	TCGG	2	8	172527	172534	0 %	25 %	50 %	25 %	190889789
4061	NC_010994	CG	3	6	172546	172551	0 %	0 %	50 %	50 %	190889789
4062	NC_010994	CGG	2	6	172622	172627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889789
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4080	NC_010994	CGT	2	6	173288	173293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889789
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4085	NC_010994	GCATCC	2	12	173497	173508	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190889789
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4091	NC_010994	GAG	2	6	173767	173772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889789
4092	NC_010994	GCAT	2	8	173775	173782	25 %	25 %	25 %	25 %	190889790
4093	NC_010994	CGCC	2	8	173794	173801	0 %	0 %	25 %	75 %	190889790
4094	NC_010994	CGC	2	6	173812	173817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889790
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4096	NC_010994	CGAT	2	8	173877	173884	25 %	25 %	25 %	25 %	190889790
4097	NC_010994	CGC	2	6	173905	173910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889790
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4099	NC_010994	GCGT	2	8	174039	174046	0 %	25 %	50 %	25 %	190889790
4100	NC_010994	CGGA	2	8	174158	174165	25 %	0 %	50 %	25 %	190889790
4101	NC_010994	TCG	2	6	174195	174200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889790
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4104	NC_010994	CCG	2	6	174352	174357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889791
4105	NC_010994	GGC	2	6	174393	174398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889791
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4108	NC_010994	ATT	2	6	174510	174515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190889791
4109	NC_010994	TGA	2	6	174524	174529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889791
4110	NC_010994	CGGC	2	8	174568	174575	0 %	0 %	50 %	50 %	190889791
4111	NC_010994	CAT	2	6	174585	174590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889791
4112	NC_010994	CGAG	2	8	174647	174654	25 %	0 %	50 %	25 %	190889791
4113	NC_010994	CTT	2	6	174759	174764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889791
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4119	NC_010994	GCC	2	6	174955	174960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889791
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4121	NC_010994	CGC	2	6	175044	175049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889791
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4242	NC_010994	CGG	2	6	180645	180650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889797
4243	NC_010994	GCC	2	6	180667	180672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889797
4244	NC_010994	TCA	2	6	180710	180715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889797
4245	NC_010994	CGA	2	6	180726	180731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889797
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4247	NC_010994	TCG	2	6	180803	180808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889797
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4253	NC_010994	GCT	2	6	181147	181152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889798
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4274	NC_010994	GCT	2	6	181822	181827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4275	NC_010994	CAG	2	6	181840	181845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4276	NC_010994	CAG	2	6	181913	181918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889799
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4283	NC_010994	CTG	2	6	182218	182223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4286	NC_010994	CTG	2	6	182347	182352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889800
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4294	NC_010994	TCGCA	2	10	182730	182739	20 %	20 %	20 %	40 %	190889801
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4318	NC_010994	GAC	2	6	183629	183634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4339	NC_010994	CG	3	6	184547	184552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4340	NC_010994	GCT	2	6	184636	184641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889803
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4347	NC_010994	CAA	2	6	185011	185016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190889803
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4349	NC_010994	TGT	2	6	185221	185226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4350	NC_010994	CGT	2	6	185291	185296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889804
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4354	NC_010994	GAG	2	6	185423	185428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889804
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4358	NC_010994	CGAG	2	8	185536	185543	25 %	0 %	50 %	25 %	190889804
4359	NC_010994	GCC	2	6	185550	185555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889804
4360	NC_010994	CGA	2	6	185581	185586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889804
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4362	NC_010994	GCA	2	6	185692	185697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889804
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4484	NC_010994	CGA	2	6	190831	190836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889810
4485	NC_010994	CGA	2	6	190861	190866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889810
4486	NC_010994	CGC	2	6	191006	191011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889810
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4490	NC_010994	CAG	2	6	191234	191239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889810
4491	NC_010994	TTG	2	6	191241	191246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190889810
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