MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 chromosome

Total Repeats: 107757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010994	GGCCG	2	10	21430	21439	0 %	0 %	60 %	40 %	190889664
502	NC_010994	GCA	2	6	21470	21475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889664
503	NC_010994	CCG	2	6	21481	21486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889664
504	NC_010994	ATC	2	6	21591	21596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889664
505	NC_010994	GCGAT	2	10	21685	21694	20 %	20 %	40 %	20 %	190889664
506	NC_010994	GATC	2	8	21695	21702	25 %	25 %	25 %	25 %	190889664
507	NC_010994	TGC	2	6	21719	21724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889664
508	NC_010994	ATG	2	6	21727	21732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889664
509	NC_010994	GCC	2	6	21812	21817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889664
510	NC_010994	TCG	2	6	21826	21831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889664
511	NC_010994	TCG	2	6	21847	21852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889664
512	NC_010994	CGAA	2	8	21895	21902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
513	NC_010994	A	6	6	21915	21920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_010994	CCGA	2	8	22014	22021	25 %	0 %	25 %	50 %	190889665
515	NC_010994	CGC	2	6	22036	22041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889665
516	NC_010994	ACCTTG	2	12	22125	22136	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190889665
517	NC_010994	TTC	2	6	22157	22162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889665
518	NC_010994	ATC	2	6	22176	22181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889665
519	NC_010994	CGA	3	9	22213	22221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889665
520	NC_010994	ATT	2	6	22256	22261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190889665
521	NC_010994	GCT	2	6	22288	22293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_010994	GGA	2	6	22299	22304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_010994	GGTGC	2	10	22329	22338	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
524	NC_010994	GCG	2	6	22474	22479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
525	NC_010994	CGG	2	6	22544	22549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
526	NC_010994	GAC	2	6	22577	22582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889666
527	NC_010994	CGAT	2	8	22605	22612	25 %	25 %	25 %	25 %	190889666
528	NC_010994	GCC	2	6	22776	22781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
529	NC_010994	CTC	2	6	22814	22819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889666
530	NC_010994	CGG	2	6	22820	22825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
531	NC_010994	GCA	2	6	22843	22848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889666
532	NC_010994	GCA	2	6	22855	22860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889666
533	NC_010994	AGCG	2	8	22875	22882	25 %	0 %	50 %	25 %	190889666
534	NC_010994	GCG	2	6	22909	22914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
535	NC_010994	GCC	2	6	22928	22933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
536	NC_010994	TTCGTC	2	12	22934	22945	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190889666
537	NC_010994	GAT	2	6	22946	22951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889666
538	NC_010994	GGC	2	6	22998	23003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
539	NC_010994	CG	3	6	23044	23049	0 %	0 %	50 %	50 %	190889666
540	NC_010994	GCTCC	2	10	23075	23084	0 %	20 %	20 %	60 %	190889666
541	NC_010994	GCC	2	6	23142	23147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
542	NC_010994	ATC	2	6	23184	23189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889666
543	NC_010994	GTT	2	6	23204	23209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190889666
544	NC_010994	CGC	2	6	23218	23223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
545	NC_010994	GAC	2	6	23234	23239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889666
546	NC_010994	CGG	2	6	23248	23253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
547	NC_010994	AGC	2	6	23274	23279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889666
548	NC_010994	CTC	2	6	23288	23293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889666
549	NC_010994	GC	3	6	23312	23317	0 %	0 %	50 %	50 %	190889666
550	NC_010994	CAGG	2	8	23364	23371	25 %	0 %	50 %	25 %	190889666
551	NC_010994	CGG	2	6	23375	23380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
552	NC_010994	ATGCGT	2	12	23420	23431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190889666
553	NC_010994	GCC	2	6	23444	23449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
554	NC_010994	TCGAGC	2	12	23556	23567	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190889666
555	NC_010994	TCG	2	6	23634	23639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889666
556	NC_010994	GCC	2	6	23680	23685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
557	NC_010994	CCG	2	6	23688	23693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
558	NC_010994	CAG	2	6	23702	23707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889666
559	NC_010994	GC	3	6	23708	23713	0 %	0 %	50 %	50 %	190889666
560	NC_010994	GGA	2	6	23749	23754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889666
561	NC_010994	CCG	2	6	23773	23778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
562	NC_010994	CG	3	6	23777	23782	0 %	0 %	50 %	50 %	190889666
563	NC_010994	CGTT	2	8	23787	23794	0 %	50 %	25 %	25 %	190889666
564	NC_010994	CGG	2	6	23800	23805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
565	NC_010994	GA	3	6	23880	23885	50 %	0 %	50 %	0 %	190889666
566	NC_010994	CGG	2	6	23908	23913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
567	NC_010994	TCC	2	6	23928	23933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889666
568	NC_010994	CGC	2	6	24025	24030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
569	NC_010994	GC	3	6	24042	24047	0 %	0 %	50 %	50 %	190889666
570	NC_010994	GCACCA	2	12	24079	24090	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	190889666
571	NC_010994	CGA	2	6	24130	24135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889666
572	NC_010994	GC	3	6	24154	24159	0 %	0 %	50 %	50 %	190889666
573	NC_010994	CCG	2	6	24176	24181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
574	NC_010994	GCG	2	6	24192	24197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
575	NC_010994	GC	3	6	24199	24204	0 %	0 %	50 %	50 %	190889666
576	NC_010994	CCG	2	6	24250	24255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
577	NC_010994	CG	3	6	24349	24354	0 %	0 %	50 %	50 %	190889666
578	NC_010994	TCG	2	6	24378	24383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889666
579	NC_010994	CGG	2	6	24400	24405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
580	NC_010994	GGA	2	6	24434	24439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889666
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582	NC_010994	CT	3	6	24483	24488	0 %	50 %	0 %	50 %	190889666
583	NC_010994	TCG	2	6	24540	24545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889666
584	NC_010994	GCGA	2	8	24606	24613	25 %	0 %	50 %	25 %	190889666
585	NC_010994	TCG	2	6	24654	24659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889666
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589	NC_010994	TTC	2	6	24780	24785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889666
590	NC_010994	GC	3	6	24889	24894	0 %	0 %	50 %	50 %	190889666
591	NC_010994	GCG	3	9	24897	24905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
592	NC_010994	GCG	2	6	24922	24927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
593	NC_010994	CCT	2	6	25066	25071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889666
594	NC_010994	C	6	6	25083	25088	0 %	0 %	0 %	100 %	190889666
595	NC_010994	GCC	2	6	25124	25129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
596	NC_010994	CT	3	6	25168	25173	0 %	50 %	0 %	50 %	190889666
597	NC_010994	CGC	2	6	25222	25227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
598	NC_010994	CTG	2	6	25229	25234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889666
599	NC_010994	CGG	2	6	25237	25242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
600	NC_010994	GCG	2	6	25253	25258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889666
601	NC_010994	CGA	2	6	25276	25281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889666
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604	NC_010994	CAG	2	6	25382	25387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889666
605	NC_010994	GC	3	6	25394	25399	0 %	0 %	50 %	50 %	190889666
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608	NC_010994	TCG	2	6	25428	25433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889666
609	NC_010994	GCA	2	6	25480	25485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889666
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611	NC_010994	GCC	2	6	25555	25560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
612	NC_010994	CCG	2	6	25613	25618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889666
613	NC_010994	ATCGTC	2	12	25625	25636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190889666
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617	NC_010994	TCGG	2	8	25884	25891	0 %	25 %	50 %	25 %	190889666
618	NC_010994	CTCA	2	8	25904	25911	25 %	25 %	0 %	50 %	190889666
619	NC_010994	CGC	3	9	25913	25921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889667
620	NC_010994	GAT	2	6	25964	25969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889667
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622	NC_010994	TGC	2	6	25993	25998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889667
623	NC_010994	GCA	2	6	26039	26044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889667
624	NC_010994	GCGG	2	8	26115	26122	0 %	0 %	75 %	25 %	190889667
625	NC_010994	TTG	2	6	26131	26136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190889667
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627	NC_010994	GC	3	6	26227	26232	0 %	0 %	50 %	50 %	190889667
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