MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 chromosome

Total Repeats: 107757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010994	CAG	2	6	191603	191608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889810
4502	NC_010994	GTT	2	6	191645	191650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190889810
4503	NC_010994	GCCG	2	8	191668	191675	0 %	0 %	50 %	50 %	190889810
4504	NC_010994	GCG	2	6	191792	191797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_010994	CCG	2	6	191818	191823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_010994	CG	3	6	191832	191837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_010994	GGC	2	6	191849	191854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_010994	A	6	6	191922	191927	100 %	0 %	0 %	0 %	190889811
4509	NC_010994	GCA	2	6	192017	192022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889811
4510	NC_010994	T	6	6	192023	192028	0 %	100 %	0 %	0 %	190889811
4511	NC_010994	AAACG	2	10	192117	192126	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4512	NC_010994	GA	3	6	192136	192141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_010994	CAG	2	6	192253	192258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889812
4514	NC_010994	GGCA	2	8	192444	192451	25 %	0 %	50 %	25 %	190889812
4515	NC_010994	GGC	2	6	192495	192500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889812
4516	NC_010994	CGC	2	6	192507	192512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889812
4517	NC_010994	CGC	2	6	192606	192611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_010994	AAG	2	6	192628	192633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_010994	CAG	2	6	192666	192671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889813
4520	NC_010994	GTC	2	6	192672	192677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889813
4521	NC_010994	TGG	2	6	192685	192690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190889813
4522	NC_010994	ACGTCG	2	12	192796	192807	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190889813
4523	NC_010994	GAG	2	6	192817	192822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889813
4524	NC_010994	GTT	2	6	192856	192861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190889813
4525	NC_010994	AGCGC	2	10	192872	192881	20 %	0 %	40 %	40 %	190889813
4526	NC_010994	CAT	2	6	192906	192911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889813
4527	NC_010994	TTC	2	6	193036	193041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_010994	GC	3	6	193075	193080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_010994	CG	3	6	193081	193086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_010994	GAA	2	6	193202	193207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190889814
4531	NC_010994	AAG	2	6	193224	193229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190889814
4532	NC_010994	GAA	2	6	193257	193262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190889814
4533	NC_010994	GCA	2	6	193279	193284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889814
4534	NC_010994	GATCTG	2	12	193322	193333	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	190889814
4535	NC_010994	GCA	2	6	193363	193368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889814
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4537	NC_010994	GCC	2	6	193482	193487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889814
4538	NC_010994	GTC	2	6	193488	193493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889814
4539	NC_010994	CGCC	2	8	193579	193586	0 %	0 %	25 %	75 %	190889814
4540	NC_010994	GCC	2	6	193589	193594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889814
4541	NC_010994	GC	3	6	193595	193600	0 %	0 %	50 %	50 %	190889814
4542	NC_010994	CGG	2	6	193651	193656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889814
4543	NC_010994	CTC	2	6	193679	193684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889814
4544	NC_010994	TCGA	2	8	193767	193774	25 %	25 %	25 %	25 %	190889814
4545	NC_010994	GAA	2	6	193775	193780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190889814
4546	NC_010994	CGCA	2	8	193790	193797	25 %	0 %	25 %	50 %	190889814
4547	NC_010994	TTC	2	6	193827	193832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889814
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4549	NC_010994	CGCC	2	8	193974	193981	0 %	0 %	25 %	75 %	190889814
4550	NC_010994	CGA	2	6	193982	193987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889814
4551	NC_010994	GC	3	6	193994	193999	0 %	0 %	50 %	50 %	190889814
4552	NC_010994	GCC	3	9	194003	194011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889814
4553	NC_010994	CAT	2	6	194012	194017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889814
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4555	NC_010994	GCC	3	9	194066	194074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889814
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4557	NC_010994	GCC	2	6	194087	194092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889814
4558	NC_010994	GCA	2	6	194103	194108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889814
4559	NC_010994	GCC	2	6	194127	194132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889814
4560	NC_010994	CCG	2	6	194272	194277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889814
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4562	NC_010994	CGC	3	9	194393	194401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_010994	CTT	2	6	194414	194419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889815
4564	NC_010994	GTC	3	9	194423	194431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889815
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4568	NC_010994	GCA	2	6	194493	194498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889815
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4570	NC_010994	CTG	2	6	194513	194518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889815
4571	NC_010994	GCG	2	6	194628	194633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889815
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4603	NC_010994	ACTTC	2	10	195682	195691	20 %	40 %	0 %	40 %	190889815
4604	NC_010994	GCC	3	9	195734	195742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889815
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4608	NC_010994	TGA	2	6	195904	195909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889815
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4615	NC_010994	GC	3	6	196223	196228	0 %	0 %	50 %	50 %	190889815
4616	NC_010994	TCG	2	6	196288	196293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889815
4617	NC_010994	TC	3	6	196330	196335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4618	NC_010994	AAGC	2	8	196340	196347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4619	NC_010994	GCG	2	6	196432	196437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_010994	TA	3	6	196438	196443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4622	NC_010994	GCG	2	6	196590	196595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4851	NC_010994	GCA	2	6	205612	205617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4853	NC_010994	GCG	2	6	205771	205776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4854	NC_010994	CAC	2	6	205863	205868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4855	NC_010994	GC	3	6	205945	205950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4856	NC_010994	A	6	6	206001	206006	100 %	0 %	0 %	0 %	190889822
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4860	NC_010994	ATT	2	6	206203	206208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190889822
4861	NC_010994	ACG	2	6	206236	206241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889822
4862	NC_010994	CCCG	2	8	206264	206271	0 %	0 %	25 %	75 %	190889822
4863	NC_010994	CCTGC	2	10	206324	206333	0 %	20 %	20 %	60 %	190889822
4864	NC_010994	TCC	2	6	206421	206426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889822
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4987	NC_010994	GGC	2	6	211563	211568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4988	NC_010994	ATC	2	6	211600	211605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4989	NC_010994	GCC	2	6	211615	211620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4990	NC_010994	GTT	2	6	211625	211630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4991	NC_010994	C	6	6	211632	211637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4992	NC_010994	GCG	2	6	211687	211692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889824
4993	NC_010994	CAC	2	6	211701	211706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190889824
4994	NC_010994	GCC	3	9	211753	211761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889824
4995	NC_010994	CGA	2	6	211791	211796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889824
4996	NC_010994	GGCG	2	8	211805	211812	0 %	0 %	75 %	25 %	190889824
4997	NC_010994	GAC	2	6	211851	211856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889824
4998	NC_010994	AGCA	2	8	211878	211885	50 %	0 %	25 %	25 %	190889824
4999	NC_010994	AGA	2	6	211934	211939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190889824
5000	NC_010994	GGC	2	6	211965	211970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889824

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