MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 1755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010683	CAG	2	6	47417	47422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930868
1002	NC_010683	CGG	2	6	47446	47451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930868
1003	NC_010683	GC	3	6	47506	47511	0 %	0 %	50 %	50 %	187930868
1004	NC_010683	TGCG	2	8	47550	47557	0 %	25 %	50 %	25 %	187930868
1005	NC_010683	CCCG	2	8	47558	47565	0 %	0 %	25 %	75 %	187930868
1006	NC_010683	GGC	2	6	47594	47599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930868
1007	NC_010683	AGC	2	6	47634	47639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930868
1008	NC_010683	GC	3	6	47638	47643	0 %	0 %	50 %	50 %	187930868
1009	NC_010683	GCGT	2	8	47659	47666	0 %	25 %	50 %	25 %	187930868
1010	NC_010683	GTT	2	6	47737	47742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930868
1011	NC_010683	GGC	2	6	47768	47773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930868
1012	NC_010683	GC	3	6	47840	47845	0 %	0 %	50 %	50 %	187930868
1013	NC_010683	CCA	2	6	47875	47880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930868
1014	NC_010683	CGG	2	6	47905	47910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930868
1015	NC_010683	CG	3	6	48011	48016	0 %	0 %	50 %	50 %	187930868
1016	NC_010683	AGT	2	6	48027	48032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930868
1017	NC_010683	GGC	2	6	48038	48043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930868
1018	NC_010683	GCG	2	6	48044	48049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930868
1019	NC_010683	GCG	2	6	48060	48065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930868
1020	NC_010683	CTTG	2	8	48088	48095	0 %	50 %	25 %	25 %	187930868
1021	NC_010683	ACG	2	6	48105	48110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930868
1022	NC_010683	GCC	2	6	48144	48149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930868
1023	NC_010683	GTTGC	2	10	48230	48239	0 %	40 %	40 %	20 %	187930868
1024	NC_010683	ATG	2	6	48240	48245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930868
1025	NC_010683	GA	3	6	48256	48261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010683	GCCC	2	8	48280	48287	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1027	NC_010683	GC	3	6	48389	48394	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
1028	NC_010683	TGA	2	6	48441	48446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930869
1029	NC_010683	GC	3	6	48486	48491	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
1030	NC_010683	ATC	2	6	48493	48498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930869
1031	NC_010683	GCG	2	6	48502	48507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930869
1032	NC_010683	TCGGTG	2	12	48521	48532	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187930869
1033	NC_010683	GGGTGC	2	12	48535	48546	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	187930869
1034	NC_010683	TCG	2	6	48554	48559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930869
1035	NC_010683	CG	3	6	48581	48586	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
1036	NC_010683	CTG	2	6	48592	48597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930869
1037	NC_010683	TCG	2	6	48737	48742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930869
1038	NC_010683	ACC	2	6	48746	48751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930869
1039	NC_010683	GC	3	6	48785	48790	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
1040	NC_010683	GAT	2	6	48829	48834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930869
1041	NC_010683	CCT	2	6	48843	48848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930869
1042	NC_010683	GGCGCA	2	12	48876	48887	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	187930869
1043	NC_010683	GT	3	6	48899	48904	0 %	50 %	50 %	0 %	187930869
1044	NC_010683	TCG	2	6	48917	48922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930869
1045	NC_010683	CCTT	2	8	48959	48966	0 %	50 %	0 %	50 %	187930869
1046	NC_010683	TGG	2	6	48990	48995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930869
1047	NC_010683	CGG	2	6	49061	49066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930869
1048	NC_010683	GTC	2	6	49069	49074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930869
1049	NC_010683	ACG	2	6	49100	49105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930869
1050	NC_010683	GTT	2	6	49153	49158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010683	CTCG	2	8	49171	49178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_010683	GCGG	2	8	49205	49212	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_010683	G	7	7	49211	49217	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010683	GGGTG	2	10	49260	49269	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010683	CGT	2	6	49300	49305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_010683	C	6	6	49314	49319	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1057	NC_010683	G	6	6	49353	49358	0 %	0 %	100 %	0 %	187930870
1058	NC_010683	TG	3	6	49380	49385	0 %	50 %	50 %	0 %	187930870
1059	NC_010683	GC	3	6	49436	49441	0 %	0 %	50 %	50 %	187930870
1060	NC_010683	GCG	2	6	49446	49451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930870
1061	NC_010683	CG	3	6	49466	49471	0 %	0 %	50 %	50 %	187930870
1062	NC_010683	TGC	2	6	49553	49558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930870
1063	NC_010683	TCG	2	6	49562	49567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930870
1064	NC_010683	GCTG	2	8	49609	49616	0 %	25 %	50 %	25 %	187930870
1065	NC_010683	GCA	2	6	49686	49691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930870
1066	NC_010683	GCCCG	2	10	49697	49706	0 %	0 %	40 %	60 %	187930870
1067	NC_010683	AAGCG	2	10	49707	49716	40 %	0 %	40 %	20 %	187930870
1068	NC_010683	ACG	2	6	49765	49770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930870
1069	NC_010683	A	7	7	49784	49790	100 %	0 %	0 %	0 %	187930870
1070	NC_010683	CAT	2	6	49902	49907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_010683	AGC	2	6	49984	49989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_010683	GT	3	6	50127	50132	0 %	50 %	50 %	0 %	187930871
1073	NC_010683	GAT	2	6	50184	50189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930871
1074	NC_010683	TGG	2	6	50221	50226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930871
1075	NC_010683	AGCTGA	2	12	50282	50293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187930871
1076	NC_010683	TTGG	2	8	50304	50311	0 %	50 %	50 %	0 %	187930871
1077	NC_010683	ATG	2	6	50343	50348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930871
1078	NC_010683	GTC	2	6	50356	50361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_010683	GCA	2	6	50364	50369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_010683	T	6	6	50422	50427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010683	TCGA	2	8	50499	50506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_010683	CAT	2	6	50541	50546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930872
1083	NC_010683	GTTTG	2	10	50556	50565	0 %	60 %	40 %	0 %	187930872
1084	NC_010683	CAG	2	6	50572	50577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930872
1085	NC_010683	CAC	2	6	50685	50690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930872
1086	NC_010683	AC	3	6	50753	50758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_010683	GCA	2	6	50782	50787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_010683	T	6	6	50816	50821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_010683	GCC	2	6	50825	50830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_010683	GC	3	6	50832	50837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_010683	CTT	3	9	50859	50867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930873
1092	NC_010683	GAGC	2	8	50871	50878	25 %	0 %	50 %	25 %	187930873
1093	NC_010683	CGC	2	6	50883	50888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930873
1094	NC_010683	CGG	2	6	51005	51010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930873
1095	NC_010683	CGA	2	6	51077	51082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930873
1096	NC_010683	GCT	2	6	51139	51144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930873
1097	NC_010683	GCC	2	6	51145	51150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930873
1098	NC_010683	CGCC	2	8	51154	51161	0 %	0 %	25 %	75 %	187930873
1099	NC_010683	TCG	2	6	51184	51189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930873
1100	NC_010683	TCA	2	6	51459	51464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930874
1101	NC_010683	CAGCG	2	10	51531	51540	20 %	0 %	40 %	40 %	187930875
1102	NC_010683	GC	3	6	51587	51592	0 %	0 %	50 %	50 %	187930875
1103	NC_010683	ATC	2	6	51604	51609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930875
1104	NC_010683	GC	3	6	51676	51681	0 %	0 %	50 %	50 %	187930875
1105	NC_010683	TAAT	2	8	51685	51692	50 %	50 %	0 %	0 %	187930875
1106	NC_010683	GTC	2	6	51721	51726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930875
1107	NC_010683	TTC	2	6	51843	51848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930876
1108	NC_010683	TCG	2	6	51849	51854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930876
1109	NC_010683	GC	3	6	51858	51863	0 %	0 %	50 %	50 %	187930876
1110	NC_010683	TGC	2	6	51874	51879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930876
1111	NC_010683	TGT	2	6	51892	51897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930876
1112	NC_010683	ACG	2	6	51906	51911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930876
1113	NC_010683	TCT	2	6	51913	51918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930876
1114	NC_010683	AGGT	2	8	51972	51979	25 %	25 %	50 %	0 %	187930876
1115	NC_010683	ACGA	2	8	51994	52001	50 %	0 %	25 %	25 %	187930876
1116	NC_010683	CAC	2	6	52019	52024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930876
1117	NC_010683	GC	3	6	52066	52071	0 %	0 %	50 %	50 %	187930876
1118	NC_010683	CG	3	6	52114	52119	0 %	0 %	50 %	50 %	187930876
1119	NC_010683	GCC	2	6	52125	52130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930876
1120	NC_010683	CG	3	6	52140	52145	0 %	0 %	50 %	50 %	187930876
1121	NC_010683	CGG	2	6	52153	52158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930876
1122	NC_010683	CCG	2	6	52161	52166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930876
1123	NC_010683	GACGGT	2	12	52181	52192	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187930876
1124	NC_010683	GGC	2	6	52288	52293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930876
1125	NC_010683	GCG	2	6	52294	52299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930876
1126	NC_010683	TGGA	2	8	52324	52331	25 %	25 %	50 %	0 %	187930877
1127	NC_010683	GC	3	6	52335	52340	0 %	0 %	50 %	50 %	187930877
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1129	NC_010683	GCC	2	6	52430	52435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930877
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1380	NC_010683	GC	3	6	64021	64026	0 %	0 %	50 %	50 %	187930890
1381	NC_010683	AGC	2	6	64031	64036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930890
1382	NC_010683	CGC	2	6	64136	64141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930890
1383	NC_010683	CAT	2	6	64198	64203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930890
1384	NC_010683	GGA	2	6	64230	64235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930890
1385	NC_010683	CTG	2	6	64258	64263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930890
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1391	NC_010683	GC	3	6	64704	64709	0 %	0 %	50 %	50 %	187930891
1392	NC_010683	GC	3	6	64715	64720	0 %	0 %	50 %	50 %	187930891
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1411	NC_010683	CGA	2	6	65549	65554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930893
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