MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 1755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010683	GCC	2	6	23307	23312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930850
502	NC_010683	CAA	2	6	23333	23338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930850
503	NC_010683	ATCA	2	8	23367	23374	50 %	25 %	0 %	25 %	187930850
504	NC_010683	GCT	2	6	23381	23386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930850
505	NC_010683	TCA	2	6	23524	23529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930850
506	NC_010683	ATG	2	6	23566	23571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930850
507	NC_010683	AG	3	6	23693	23698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_010683	CAT	2	6	23710	23715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010683	C	7	7	23771	23777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
510	NC_010683	CTG	2	6	23804	23809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_010683	GCA	2	6	23884	23889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_010683	ACCA	2	8	23996	24003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_010683	CA	3	6	24002	24007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_010683	ATCT	2	8	24017	24024	25 %	50 %	0 %	25 %	187930851
515	NC_010683	TAC	2	6	24057	24062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930851
516	NC_010683	TTC	2	6	24099	24104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930851
517	NC_010683	TCT	2	6	24238	24243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930851
518	NC_010683	CAC	2	6	24278	24283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930851
519	NC_010683	GAC	2	6	24437	24442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_010683	GCG	3	9	24543	24551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930852
521	NC_010683	CCAT	2	8	24552	24559	25 %	25 %	0 %	50 %	187930852
522	NC_010683	AAC	2	6	24645	24650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930852
523	NC_010683	CGA	2	6	24810	24815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
524	NC_010683	TGC	2	6	24827	24832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930852
525	NC_010683	ACTC	2	8	24865	24872	25 %	25 %	0 %	50 %	187930852
526	NC_010683	CTC	2	6	24907	24912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930852
527	NC_010683	CTC	2	6	24964	24969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930852
528	NC_010683	ATCG	2	8	25024	25031	25 %	25 %	25 %	25 %	187930852
529	NC_010683	GAT	2	6	25134	25139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930852
530	NC_010683	CCT	2	6	25145	25150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930852
531	NC_010683	GC	3	6	25168	25173	0 %	0 %	50 %	50 %	187930852
532	NC_010683	ACA	2	6	25216	25221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930852
533	NC_010683	CGA	2	6	25254	25259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
534	NC_010683	AAAG	2	8	25347	25354	75 %	0 %	25 %	0 %	187930852
535	NC_010683	GCA	2	6	25358	25363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
536	NC_010683	CAC	2	6	25385	25390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930852
537	NC_010683	GGA	2	6	25443	25448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930852
538	NC_010683	CGA	2	6	25501	25506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
539	NC_010683	TCG	2	6	25652	25657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930852
540	NC_010683	ACCC	2	8	25679	25686	25 %	0 %	0 %	75 %	187930852
541	NC_010683	CGA	2	6	25761	25766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
542	NC_010683	GGT	2	6	25769	25774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930852
543	NC_010683	GCC	2	6	25847	25852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930852
544	NC_010683	GCC	2	6	25864	25869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930852
545	NC_010683	GTT	2	6	25899	25904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930852
546	NC_010683	GC	3	6	25977	25982	0 %	0 %	50 %	50 %	187930852
547	NC_010683	CA	3	6	26053	26058	50 %	0 %	0 %	50 %	187930852
548	NC_010683	CGA	2	6	26073	26078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930852
549	NC_010683	GAT	2	6	26132	26137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930852
550	NC_010683	GC	3	6	26141	26146	0 %	0 %	50 %	50 %	187930853
551	NC_010683	CTG	2	6	26151	26156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930853
552	NC_010683	CG	3	6	26180	26185	0 %	0 %	50 %	50 %	187930853
553	NC_010683	ACA	2	6	26442	26447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930853
554	NC_010683	CG	3	6	26517	26522	0 %	0 %	50 %	50 %	187930853
555	NC_010683	CTG	2	6	26527	26532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930853
556	NC_010683	TGGCAA	2	12	26609	26620	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187930853
557	NC_010683	CAAG	2	8	26671	26678	50 %	0 %	25 %	25 %	187930853
558	NC_010683	CGC	2	6	26679	26684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930853
559	NC_010683	TCGC	2	8	26719	26726	0 %	25 %	25 %	50 %	187930853
560	NC_010683	CAG	2	6	26750	26755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930853
561	NC_010683	CACC	2	8	26851	26858	25 %	0 %	0 %	75 %	187930853
562	NC_010683	TCC	2	6	26866	26871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930853
563	NC_010683	TG	3	6	26947	26952	0 %	50 %	50 %	0 %	187930853
564	NC_010683	GTCG	2	8	26988	26995	0 %	25 %	50 %	25 %	187930853
565	NC_010683	CCATGG	2	12	27062	27073	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187930853
566	NC_010683	GCG	2	6	27138	27143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930853
567	NC_010683	CGT	2	6	27172	27177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930854
568	NC_010683	GT	3	6	27176	27181	0 %	50 %	50 %	0 %	187930854
569	NC_010683	CCT	2	6	27242	27247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930854
570	NC_010683	GCA	2	6	27271	27276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930854
571	NC_010683	CAT	2	6	27336	27341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930854
572	NC_010683	CTGC	2	8	27414	27421	0 %	25 %	25 %	50 %	187930854
573	NC_010683	TCGAC	2	10	27456	27465	20 %	20 %	20 %	40 %	187930854
574	NC_010683	CGA	2	6	27515	27520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930854
575	NC_010683	TGG	2	6	27601	27606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930854
576	NC_010683	GAT	2	6	27615	27620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930854
577	NC_010683	CATC	2	8	27632	27639	25 %	25 %	0 %	50 %	187930854
578	NC_010683	GCG	2	6	27755	27760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930854
579	NC_010683	CAC	2	6	27771	27776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930854
580	NC_010683	CCT	2	6	27791	27796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930854
581	NC_010683	TCC	2	6	27922	27927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930854
582	NC_010683	CGT	2	6	27939	27944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930854
583	NC_010683	TCG	2	6	28070	28075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930854
584	NC_010683	CTG	2	6	28189	28194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930855
585	NC_010683	GCT	3	9	28200	28208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930855
586	NC_010683	ACG	2	6	28213	28218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930855
587	NC_010683	CGC	2	6	28219	28224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930855
588	NC_010683	AGC	2	6	28237	28242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930855
589	NC_010683	CG	3	6	28265	28270	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
590	NC_010683	TCT	2	6	28326	28331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930855
591	NC_010683	CG	3	6	28336	28341	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
592	NC_010683	CGC	2	6	28357	28362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930855
593	NC_010683	GTCTG	2	10	28467	28476	0 %	40 %	40 %	20 %	187930855
594	NC_010683	AGT	2	6	28530	28535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930855
595	NC_010683	GGT	2	6	28722	28727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930855
596	NC_010683	CG	3	6	28730	28735	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
597	NC_010683	CGT	2	6	28794	28799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930855
598	NC_010683	GCT	2	6	28902	28907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930855
599	NC_010683	GCG	2	6	28946	28951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930855
600	NC_010683	CGG	2	6	29097	29102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930855
601	NC_010683	ATCG	2	8	29161	29168	25 %	25 %	25 %	25 %	187930855
602	NC_010683	ATG	2	6	29219	29224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930855
603	NC_010683	GGAT	2	8	29280	29287	25 %	25 %	50 %	0 %	187930855
604	NC_010683	CAG	2	6	29313	29318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930855
605	NC_010683	CAAC	2	8	29359	29366	50 %	0 %	0 %	50 %	187930855
606	NC_010683	CGT	2	6	29415	29420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930855
607	NC_010683	GGC	2	6	29427	29432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930855
608	NC_010683	ACA	2	6	29577	29582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930855
609	NC_010683	GCA	2	6	29651	29656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930855
610	NC_010683	CAG	2	6	29692	29697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930855
611	NC_010683	TTC	2	6	29737	29742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930855
612	NC_010683	CTG	2	6	29781	29786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930855
613	NC_010683	CAA	2	6	29835	29840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930855
614	NC_010683	CG	3	6	29861	29866	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
615	NC_010683	TA	3	6	29899	29904	50 %	50 %	0 %	0 %	187930855
616	NC_010683	TGC	2	6	29928	29933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930855
617	NC_010683	AGA	2	6	29948	29953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930855
618	NC_010683	TGTC	2	8	30108	30115	0 %	50 %	25 %	25 %	187930856
619	NC_010683	TGC	2	6	30130	30135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930856
620	NC_010683	TC	3	6	30327	30332	0 %	50 %	0 %	50 %	187930856
621	NC_010683	GGT	2	6	30389	30394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930856
622	NC_010683	CAG	2	6	30430	30435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930856
623	NC_010683	CGT	2	6	30486	30491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930856
624	NC_010683	CAG	2	6	30517	30522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930856
625	NC_010683	ACC	2	6	30560	30565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930856
626	NC_010683	GTC	2	6	30588	30593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930856
627	NC_010683	CA	3	6	30653	30658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_010683	CCA	2	6	30679	30684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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630	NC_010683	CA	3	6	30768	30773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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