MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia pickettii 12J chromosome 2

Total Repeats: 32396

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010678	GCG	2	6	196404	196409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926126
5002	NC_010678	GGCG	2	8	196432	196439	0 %	0 %	75 %	25 %	187926126
5003	NC_010678	CCA	2	6	196447	196452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926126
5004	NC_010678	CAGCG	2	10	196476	196485	20 %	0 %	40 %	40 %	187926126
5005	NC_010678	CCAT	2	8	196536	196543	25 %	25 %	0 %	50 %	187926126
5006	NC_010678	CAAT	2	8	196597	196604	50 %	25 %	0 %	25 %	187926126
5007	NC_010678	CCG	2	6	196653	196658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926126
5008	NC_010678	CACG	2	8	196674	196681	25 %	0 %	25 %	50 %	187926126
5009	NC_010678	CTG	2	6	196685	196690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926126
5010	NC_010678	CCA	2	6	196694	196699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926126
5011	NC_010678	GTC	2	6	196727	196732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926126
5012	NC_010678	AGG	2	6	196741	196746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187926126
5013	NC_010678	CGG	2	6	196763	196768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926126
5014	NC_010678	TGGC	2	8	196803	196810	0 %	25 %	50 %	25 %	187926126
5015	NC_010678	GGT	2	6	196822	196827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187926126
5016	NC_010678	GCG	2	6	196837	196842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926126
5017	NC_010678	CG	5	10	196891	196900	0 %	0 %	50 %	50 %	187926126
5018	NC_010678	GCG	2	6	196926	196931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926126
5019	NC_010678	CGGC	2	8	196933	196940	0 %	0 %	50 %	50 %	187926126
5020	NC_010678	GCCG	2	8	196994	197001	0 %	0 %	50 %	50 %	187926126
5021	NC_010678	CACC	2	8	197002	197009	25 %	0 %	0 %	75 %	187926126
5022	NC_010678	CGG	2	6	197015	197020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926126
5023	NC_010678	GGCG	2	8	197151	197158	0 %	0 %	75 %	25 %	187926126
5024	NC_010678	TGC	2	6	197200	197205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926126
5025	NC_010678	GCC	2	6	197217	197222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926126
5026	NC_010678	GGC	2	6	197337	197342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926127
5027	NC_010678	GC	4	8	197341	197348	0 %	0 %	50 %	50 %	187926127
5028	NC_010678	TCG	2	6	197368	197373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926127
5029	NC_010678	CGC	2	6	197392	197397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926127
5030	NC_010678	GTT	2	6	197414	197419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187926127
5031	NC_010678	CGGGG	2	10	197420	197429	0 %	0 %	80 %	20 %	187926127
5032	NC_010678	CGGC	2	8	197492	197499	0 %	0 %	50 %	50 %	187926127
5033	NC_010678	GTCG	2	8	197553	197560	0 %	25 %	50 %	25 %	187926127
5034	NC_010678	ACGC	2	8	197615	197622	25 %	0 %	25 %	50 %	187926127
5035	NC_010678	GCG	2	6	197629	197634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926127
5036	NC_010678	CGG	2	6	197645	197650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926127
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5038	NC_010678	GCG	2	6	197780	197785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926127
5039	NC_010678	GCA	2	6	197816	197821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926127
5040	NC_010678	GCA	2	6	197840	197845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926127
5041	NC_010678	GC	3	6	197898	197903	0 %	0 %	50 %	50 %	187926127
5042	NC_010678	ACGTC	2	10	198005	198014	20 %	20 %	20 %	40 %	187926127
5043	NC_010678	TCT	2	6	198020	198025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187926127
5044	NC_010678	GGC	2	6	198035	198040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926127
5045	NC_010678	CAG	2	6	198051	198056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926127
5046	NC_010678	GCT	2	6	198089	198094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926127
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5049	NC_010678	GCA	2	6	198152	198157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926127
5050	NC_010678	CA	3	6	198178	198183	50 %	0 %	0 %	50 %	187926127
5051	NC_010678	GC	5	10	198225	198234	0 %	0 %	50 %	50 %	187926127
5052	NC_010678	AGG	2	6	198235	198240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187926127
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5054	NC_010678	CG	3	6	198278	198283	0 %	0 %	50 %	50 %	187926127
5055	NC_010678	GGT	2	6	198300	198305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187926127
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5057	NC_010678	GGC	2	6	198382	198387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926127
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5059	NC_010678	GC	4	8	198473	198480	0 %	0 %	50 %	50 %	187926127
5060	NC_010678	CGC	2	6	198554	198559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926127
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5064	NC_010678	CG	3	6	198655	198660	0 %	0 %	50 %	50 %	187926127
5065	NC_010678	CAG	2	6	198681	198686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926127
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5071	NC_010678	CCG	2	6	198880	198885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926127
5072	NC_010678	CGA	2	6	198914	198919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926127
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5074	NC_010678	CAGA	2	8	199057	199064	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5075	NC_010678	CGC	2	6	199092	199097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_010678	GC	3	6	199116	199121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_010678	GC	3	6	199178	199183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_010678	A	7	7	199245	199251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5080	NC_010678	ATCG	2	8	199289	199296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_010678	ACGAT	2	10	199297	199306	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5082	NC_010678	CAACC	2	10	199327	199336	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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5084	NC_010678	CCGA	2	8	199488	199495	25 %	0 %	25 %	50 %	187926128
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5094	NC_010678	CGGC	2	8	199951	199958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_010678	GCCG	2	8	199962	199969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_010678	GTC	2	6	200030	200035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5119	NC_010678	GGCGT	2	10	201056	201065	0 %	20 %	60 %	20 %	187926129
5120	NC_010678	CGG	3	9	201118	201126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926129
5121	NC_010678	GCC	2	6	201143	201148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926129
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5123	NC_010678	GCT	2	6	201181	201186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926129
5124	NC_010678	ACC	2	6	201275	201280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926129
5125	NC_010678	GC	3	6	201414	201419	0 %	0 %	50 %	50 %	187926129
5126	NC_010678	TCG	3	9	201444	201452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926129
5127	NC_010678	GT	3	6	201480	201485	0 %	50 %	50 %	0 %	187926129
5128	NC_010678	ACG	2	6	201506	201511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926129
5129	NC_010678	ATC	3	9	201524	201532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926129
5130	NC_010678	ATC	2	6	201573	201578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926129
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5132	NC_010678	CG	3	6	201719	201724	0 %	0 %	50 %	50 %	187926130
5133	NC_010678	CCG	2	6	201806	201811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926130
5134	NC_010678	GCA	2	6	201873	201878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926130
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5137	NC_010678	CGAT	2	8	201960	201967	25 %	25 %	25 %	25 %	187926130
5138	NC_010678	GCA	2	6	201978	201983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926130
5139	NC_010678	ACC	2	6	202016	202021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926130
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5141	NC_010678	AGC	2	6	202145	202150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926130
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5145	NC_010678	GC	3	6	202263	202268	0 %	0 %	50 %	50 %	187926130
5146	NC_010678	GCA	2	6	202299	202304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926130
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5149	NC_010678	GCA	2	6	202356	202361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926130
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5154	NC_010678	GGC	2	6	202434	202439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926130
5155	NC_010678	CTG	2	6	202447	202452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926130
5156	NC_010678	CTG	2	6	202468	202473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926130
5157	NC_010678	CG	4	8	202510	202517	0 %	0 %	50 %	50 %	187926130
5158	NC_010678	ACC	2	6	202535	202540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926130
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5161	NC_010678	CAT	2	6	202634	202639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5163	NC_010678	CGG	2	6	202728	202733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5164	NC_010678	TGC	2	6	202736	202741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5165	NC_010678	GT	3	6	202843	202848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_010678	GCA	2	6	202863	202868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5167	NC_010678	TGCG	2	8	202926	202933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5168	NC_010678	GCT	2	6	202937	202942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5170	NC_010678	GCCA	2	8	203078	203085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5171	NC_010678	T	9	9	203091	203099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5172	NC_010678	GCAT	3	12	203118	203129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5173	NC_010678	CTG	2	6	203177	203182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5175	NC_010678	CGAC	2	8	203220	203227	25 %	0 %	25 %	50 %	187926131
5176	NC_010678	CGGG	2	8	203234	203241	0 %	0 %	75 %	25 %	187926131
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5187	NC_010678	GC	3	6	203851	203856	0 %	0 %	50 %	50 %	187926132
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5194	NC_010678	GA	3	6	204040	204045	50 %	0 %	50 %	0 %	187926133
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5201	NC_010678	AAAAC	2	10	204377	204386	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5202	NC_010678	CG	3	6	204392	204397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5203	NC_010678	CGGCG	2	10	204471	204480	0 %	0 %	60 %	40 %	187926134
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5224	NC_010678	CGA	2	6	205267	205272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926135
5225	NC_010678	ACG	2	6	205300	205305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926135
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5230	NC_010678	CAG	2	6	205604	205609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926135
5231	NC_010678	CGCC	2	8	205639	205646	0 %	0 %	25 %	75 %	187926135
5232	NC_010678	CG	4	8	205670	205677	0 %	0 %	50 %	50 %	187926135
5233	NC_010678	TTC	2	6	205691	205696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187926135
5234	NC_010678	CAGGAT	2	12	205718	205729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187926135
5235	NC_010678	TGCCCG	2	12	205753	205764	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187926135
5236	NC_010678	GAT	2	6	205766	205771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187926135
5237	NC_010678	CAG	2	6	205781	205786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926135
5238	NC_010678	GAA	2	6	205901	205906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187926135
5239	NC_010678	CAG	2	6	205919	205924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926135
5240	NC_010678	GTC	2	6	205967	205972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926135
5241	NC_010678	CGG	2	6	205978	205983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926135
5242	NC_010678	TGC	2	6	205984	205989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926135
5243	NC_010678	CAG	2	6	206012	206017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926135
5244	NC_010678	CTTCA	2	10	206021	206030	20 %	40 %	0 %	40 %	187926135
5245	NC_010678	CGGC	2	8	206068	206075	0 %	0 %	50 %	50 %	187926135
5246	NC_010678	GTT	2	6	206077	206082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187926135
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5248	NC_010678	GCCGC	2	10	206192	206201	0 %	0 %	40 %	60 %	187926135
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5370	NC_010678	CCA	2	6	211313	211318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926138
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5373	NC_010678	CG	3	6	211394	211399	0 %	0 %	50 %	50 %	187926138
5374	NC_010678	TGG	2	6	211463	211468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187926138
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5382	NC_010678	TGG	2	6	211685	211690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187926138
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5471	NC_010678	AT	3	6	214918	214923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5472	NC_010678	GGC	2	6	214947	214952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5473	NC_010678	GAA	2	6	214986	214991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5479	NC_010678	CTGGC	2	10	215395	215404	0 %	20 %	40 %	40 %	187926142
5480	NC_010678	GCA	2	6	215405	215410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926142
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5482	NC_010678	TGCCC	2	10	215441	215450	0 %	20 %	20 %	60 %	187926142
5483	NC_010678	CGG	2	6	215498	215503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926142
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5485	NC_010678	ATG	2	6	215537	215542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5486	NC_010678	CTC	2	6	215563	215568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5487	NC_010678	TCA	2	6	215725	215730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926143
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5489	NC_010678	GC	3	6	215790	215795	0 %	0 %	50 %	50 %	187926143
5490	NC_010678	TGG	2	6	215827	215832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187926143
5491	NC_010678	CGG	2	6	215851	215856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926143
5492	NC_010678	CGC	2	6	215863	215868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926143
5493	NC_010678	GC	3	6	215873	215878	0 %	0 %	50 %	50 %	187926143
5494	NC_010678	ACC	2	6	215904	215909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926143
5495	NC_010678	CG	3	6	215916	215921	0 %	0 %	50 %	50 %	187926143
5496	NC_010678	GGA	2	6	215936	215941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187926143
5497	NC_010678	ACG	2	6	215950	215955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926143
5498	NC_010678	GCC	2	6	216000	216005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926143
5499	NC_010678	AGCA	2	8	216085	216092	50 %	0 %	25 %	25 %	187926143
5500	NC_010678	TGCG	2	8	216135	216142	0 %	25 %	50 %	25 %	187926144

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