MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 3755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010263	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010263	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010263	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	165932553
4	NC_010263	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	165932553
5	NC_010263	AACT	2	8	3302	3309	50 %	25 %	0 %	25 %	165932554
6	NC_010263	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	165932554
7	NC_010263	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	165932554
8	NC_010263	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	165932554
9	NC_010263	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	165932554
10	NC_010263	TAAA	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010263	ATAA	2	8	6891	6898	75 %	25 %	0 %	0 %	165932556
12	NC_010263	ATTT	2	8	7680	7687	25 %	75 %	0 %	0 %	165932557
13	NC_010263	CTGT	2	8	8116	8123	0 %	50 %	25 %	25 %	165932558
14	NC_010263	CCTC	2	8	9845	9852	0 %	25 %	0 %	75 %	165932560
15	NC_010263	CAAT	2	8	9892	9899	50 %	25 %	0 %	25 %	165932560
16	NC_010263	ATTA	2	8	10889	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010263	ATTA	2	8	11103	11110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010263	ATCT	2	8	11409	11416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010263	TTTA	2	8	11714	11721	25 %	75 %	0 %	0 %	165932565
20	NC_010263	GATT	2	8	12158	12165	25 %	50 %	25 %	0 %	165932566
21	NC_010263	AAAT	2	8	12166	12173	75 %	25 %	0 %	0 %	165932566
22	NC_010263	AATT	2	8	12193	12200	50 %	50 %	0 %	0 %	165932566
23	NC_010263	TTAA	2	8	12374	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010263	ATGA	2	8	13071	13078	50 %	25 %	25 %	0 %	165932567
25	NC_010263	TAAA	2	8	14094	14101	75 %	25 %	0 %	0 %	165932568
26	NC_010263	TAAA	2	8	14253	14260	75 %	25 %	0 %	0 %	165932568
27	NC_010263	TCAT	2	8	14374	14381	25 %	50 %	0 %	25 %	165932568
28	NC_010263	CTTT	2	8	14508	14515	0 %	75 %	0 %	25 %	165932568
29	NC_010263	TTAG	2	8	14750	14757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010263	GCAA	2	8	14849	14856	50 %	0 %	25 %	25 %	165932569
31	NC_010263	TCTT	2	8	14926	14933	0 %	75 %	0 %	25 %	165932569
32	NC_010263	AGTA	2	8	15184	15191	50 %	25 %	25 %	0 %	165932570
33	NC_010263	GCTT	2	8	15710	15717	0 %	50 %	25 %	25 %	165932571
34	NC_010263	AATT	2	8	16059	16066	50 %	50 %	0 %	0 %	165932571
35	NC_010263	TTGC	2	8	16332	16339	0 %	50 %	25 %	25 %	165932571
36	NC_010263	AATA	2	8	16683	16690	75 %	25 %	0 %	0 %	165932572
37	NC_010263	TCTA	2	8	17150	17157	25 %	50 %	0 %	25 %	165932572
38	NC_010263	ACGT	2	8	17573	17580	25 %	25 %	25 %	25 %	165932572
39	NC_010263	CTTG	2	8	17688	17695	0 %	50 %	25 %	25 %	165932572
40	NC_010263	AGTA	2	8	18754	18761	50 %	25 %	25 %	0 %	165932574
41	NC_010263	ATTA	2	8	18779	18786	50 %	50 %	0 %	0 %	165932574
42	NC_010263	AATA	2	8	18823	18830	75 %	25 %	0 %	0 %	165932574
43	NC_010263	CTTT	2	8	18868	18875	0 %	75 %	0 %	25 %	165932574
44	NC_010263	TAAA	2	8	19059	19066	75 %	25 %	0 %	0 %	165932574
45	NC_010263	AGAT	2	8	19247	19254	50 %	25 %	25 %	0 %	165932574
46	NC_010263	TAAA	2	8	19412	19419	75 %	25 %	0 %	0 %	165932575
47	NC_010263	AGTA	2	8	19812	19819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010263	AAAC	2	8	19862	19869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010263	TAAA	2	8	19937	19944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010263	TTAT	2	8	20135	20142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010263	GTAA	2	8	21039	21046	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
52	NC_010263	AGAT	2	8	21293	21300	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
53	NC_010263	AGCA	2	8	21412	21419	50 %	0 %	25 %	25 %	165932577
54	NC_010263	AAAT	2	8	21455	21462	75 %	25 %	0 %	0 %	165932577
55	NC_010263	AATG	2	8	21656	21663	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
56	NC_010263	ATTA	2	8	21957	21964	50 %	50 %	0 %	0 %	165932577
57	NC_010263	ATAG	2	8	22005	22012	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
58	NC_010263	ATAG	2	8	22017	22024	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
59	NC_010263	CGTT	2	8	22435	22442	0 %	50 %	25 %	25 %	165932577
60	NC_010263	TAGT	2	8	22882	22889	25 %	50 %	25 %	0 %	165932577
61	NC_010263	AAGC	2	8	23622	23629	50 %	0 %	25 %	25 %	165932577
62	NC_010263	TAAA	2	8	23947	23954	75 %	25 %	0 %	0 %	165932577
63	NC_010263	AAGT	2	8	24457	24464	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
64	NC_010263	AAGT	2	8	24544	24551	50 %	25 %	25 %	0 %	165932577
65	NC_010263	TTCA	2	8	25093	25100	25 %	50 %	0 %	25 %	165932577
66	NC_010263	AATA	2	8	25586	25593	75 %	25 %	0 %	0 %	165932577
67	NC_010263	TAAA	2	8	25732	25739	75 %	25 %	0 %	0 %	165932577
68	NC_010263	ACTA	2	8	25868	25875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010263	ATGT	2	8	26531	26538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010263	TTAT	2	8	26585	26592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010263	AGCA	2	8	26659	26666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_010263	TAAT	2	8	27460	27467	50 %	50 %	0 %	0 %	165932579
73	NC_010263	AAGA	2	8	27612	27619	75 %	0 %	25 %	0 %	165932579
74	NC_010263	AAAT	2	8	27704	27711	75 %	25 %	0 %	0 %	165932579
75	NC_010263	ATTA	2	8	27732	27739	50 %	50 %	0 %	0 %	165932579
76	NC_010263	TAAA	2	8	28579	28586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010263	AGGA	2	8	28637	28644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010263	TAAA	2	8	28669	28676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010263	GCTA	2	8	28679	28686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010263	TCTA	2	8	29428	29435	25 %	50 %	0 %	25 %	165932583
81	NC_010263	ATTT	2	8	29472	29479	25 %	75 %	0 %	0 %	165932583
82	NC_010263	TGTC	2	8	29536	29543	0 %	50 %	25 %	25 %	165932583
83	NC_010263	TAAT	2	8	29926	29933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010263	ATAC	2	8	30133	30140	50 %	25 %	0 %	25 %	165932585
85	NC_010263	ATAA	2	8	30557	30564	75 %	25 %	0 %	0 %	165932585
86	NC_010263	CACT	2	8	30651	30658	25 %	25 %	0 %	50 %	165932585
87	NC_010263	TATT	2	8	31475	31482	25 %	75 %	0 %	0 %	165932587
88	NC_010263	AATT	2	8	33109	33116	50 %	50 %	0 %	0 %	165932589
89	NC_010263	TACC	2	8	33199	33206	25 %	25 %	0 %	50 %	165932589
90	NC_010263	GTTA	2	8	33581	33588	25 %	50 %	25 %	0 %	165932589
91	NC_010263	AAAC	2	8	35004	35011	75 %	0 %	0 %	25 %	165932591
92	NC_010263	TTAG	2	8	35180	35187	25 %	50 %	25 %	0 %	165932591
93	NC_010263	TTGC	2	8	35475	35482	0 %	50 %	25 %	25 %	165932591
94	NC_010263	TTCC	2	8	35715	35722	0 %	50 %	0 %	50 %	165932591
95	NC_010263	TGTT	2	8	36183	36190	0 %	75 %	25 %	0 %	165932592
96	NC_010263	TTGT	2	8	36789	36796	0 %	75 %	25 %	0 %	165932594
97	NC_010263	TATT	2	8	36868	36875	25 %	75 %	0 %	0 %	165932594
98	NC_010263	GTAA	2	8	36879	36886	50 %	25 %	25 %	0 %	165932594
99	NC_010263	AATG	2	8	37651	37658	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010263	GTTT	2	8	38165	38172	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010263	ATAA	2	8	38660	38667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010263	AACA	2	8	38757	38764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010263	TAAA	2	8	39859	39866	75 %	25 %	0 %	0 %	165932597
104	NC_010263	CTTG	2	8	40701	40708	0 %	50 %	25 %	25 %	165932599
105	NC_010263	CTGA	2	8	40709	40716	25 %	25 %	25 %	25 %	165932599
106	NC_010263	ATTG	2	8	40887	40894	25 %	50 %	25 %	0 %	165932599
107	NC_010263	TAAA	2	8	41043	41050	75 %	25 %	0 %	0 %	165932601
108	NC_010263	ATTT	2	8	41148	41155	25 %	75 %	0 %	0 %	165932601
109	NC_010263	ATTA	2	8	41314	41321	50 %	50 %	0 %	0 %	165932600
110	NC_010263	ATTA	2	8	41371	41378	50 %	50 %	0 %	0 %	165932600
111	NC_010263	TGCT	3	12	41494	41505	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010263	GCTT	2	8	41621	41628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010263	TTTA	2	8	41661	41668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010263	ATTA	2	8	42102	42109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010263	TAAT	2	8	42395	42402	50 %	50 %	0 %	0 %	165932604
116	NC_010263	ATTA	2	8	42465	42472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010263	AAAT	2	8	42568	42575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010263	GAAA	2	8	42779	42786	75 %	0 %	25 %	0 %	165932605
119	NC_010263	ATTT	2	8	42823	42830	25 %	75 %	0 %	0 %	165932605
120	NC_010263	ACAA	2	8	43090	43097	75 %	0 %	0 %	25 %	165932605
121	NC_010263	AAAT	2	8	43294	43301	75 %	25 %	0 %	0 %	165932606
122	NC_010263	TACC	2	8	44648	44655	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_010263	AAAC	2	8	44656	44663	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010263	TAAT	2	8	44732	44739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010263	ATTT	2	8	44759	44766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010263	ATTA	2	8	44767	44774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010263	AAAT	2	8	44786	44793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010263	ATGA	2	8	44989	44996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010263	TAAC	2	8	45179	45186	50 %	25 %	0 %	25 %	165932608
130	NC_010263	ATTC	2	8	45608	45615	25 %	50 %	0 %	25 %	165932609
131	NC_010263	ATGT	2	8	45964	45971	25 %	50 %	25 %	0 %	165932610
132	NC_010263	ATTT	2	8	46123	46130	25 %	75 %	0 %	0 %	165932610
133	NC_010263	TTAC	2	8	46202	46209	25 %	50 %	0 %	25 %	165932610
134	NC_010263	ATCA	2	8	46879	46886	50 %	25 %	0 %	25 %	165932611
135	NC_010263	TGCC	2	8	47189	47196	0 %	25 %	25 %	50 %	165932611
136	NC_010263	TATC	2	8	47748	47755	25 %	50 %	0 %	25 %	165932611
137	NC_010263	TTAA	2	8	47771	47778	50 %	50 %	0 %	0 %	165932611
138	NC_010263	AGTA	2	8	48877	48884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010263	ATAC	2	8	49095	49102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010263	TTGC	2	8	49240	49247	0 %	50 %	25 %	25 %	165932614
141	NC_010263	TGTT	2	8	49609	49616	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010263	AAGT	2	8	49646	49653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010263	CTTG	2	8	50113	50120	0 %	50 %	25 %	25 %	165932615
144	NC_010263	ATCT	2	8	50692	50699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010263	TGCT	2	8	50865	50872	0 %	50 %	25 %	25 %	165932617
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