MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 19567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010263	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932550
2	NC_010263	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932550
3	NC_010263	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932550
4	NC_010263	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932550
5	NC_010263	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932550
6	NC_010263	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932550
7	NC_010263	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932550
8	NC_010263	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932550
9	NC_010263	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932550
10	NC_010263	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932550
11	NC_010263	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932550
12	NC_010263	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010263	TGT	2	6	940	945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010263	ATA	2	6	1196	1201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932551
15	NC_010263	TGA	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932551
16	NC_010263	GTA	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932551
17	NC_010263	CAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932551
18	NC_010263	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932551
19	NC_010263	TCT	2	6	1503	1508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932552
20	NC_010263	ATA	3	9	1767	1775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932552
21	NC_010263	GTA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932552
22	NC_010263	TGA	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932552
23	NC_010263	GAA	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932552
24	NC_010263	AAT	2	6	2020	2025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932552
25	NC_010263	AAG	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932552
26	NC_010263	TTA	2	6	2075	2080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932552
27	NC_010263	CAA	3	9	2138	2146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932552
28	NC_010263	CGG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165932553
29	NC_010263	AGC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932553
30	NC_010263	ATA	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932553
31	NC_010263	ATA	2	6	2573	2578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932553
32	NC_010263	TAA	2	6	2604	2609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932553
33	NC_010263	ATG	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932553
34	NC_010263	TAT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932553
35	NC_010263	TTA	2	6	2868	2873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932553
36	NC_010263	CTC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932554
37	NC_010263	ATT	2	6	3076	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932554
38	NC_010263	ATT	2	6	3089	3094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932554
39	NC_010263	AAG	2	6	3161	3166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932554
40	NC_010263	ATT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932554
41	NC_010263	AAT	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932554
42	NC_010263	AGA	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932554
43	NC_010263	AGA	2	6	3390	3395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932554
44	NC_010263	AGC	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932554
45	NC_010263	TGC	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932554
46	NC_010263	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932554
47	NC_010263	GTT	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932554
48	NC_010263	GAG	2	6	3685	3690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932554
49	NC_010263	TAT	2	6	3846	3851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932554
50	NC_010263	GCA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932554
51	NC_010263	AGA	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932554
52	NC_010263	CTA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932554
53	NC_010263	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932554
54	NC_010263	TTA	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932554
55	NC_010263	TGT	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932554
56	NC_010263	ATA	2	6	4343	4348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932554
57	NC_010263	GGC	2	6	4594	4599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165932554
58	NC_010263	GCA	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932554
59	NC_010263	GAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932554
60	NC_010263	AAG	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932554
61	NC_010263	AAT	2	6	4759	4764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932554
62	NC_010263	GAA	2	6	4765	4770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932554
63	NC_010263	TAA	2	6	4785	4790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932554
64	NC_010263	CTA	2	6	4809	4814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932554
65	NC_010263	GAG	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932554
66	NC_010263	AAG	2	6	5201	5206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932554
67	NC_010263	ACG	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932554
68	NC_010263	ATA	2	6	5237	5242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932554
69	NC_010263	ATT	2	6	5288	5293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932554
70	NC_010263	TAA	2	6	5310	5315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932554
71	NC_010263	GAT	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932554
72	NC_010263	TGC	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932554
73	NC_010263	ATT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932554
74	NC_010263	TGC	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932554
75	NC_010263	CTA	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932554
76	NC_010263	AGT	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932554
77	NC_010263	CGC	2	6	5582	5587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932554
78	NC_010263	TTG	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932554
79	NC_010263	TTA	2	6	5647	5652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932554
80	NC_010263	ATA	2	6	5669	5674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932554
81	NC_010263	TAA	2	6	5738	5743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932554
82	NC_010263	ATA	2	6	5761	5766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932554
83	NC_010263	GAA	2	6	5767	5772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932554
84	NC_010263	ATA	2	6	5815	5820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932554
85	NC_010263	ATG	2	6	5848	5853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932554
86	NC_010263	GTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010263	CTT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932555
88	NC_010263	TCA	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932555
89	NC_010263	ATA	2	6	6129	6134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932555
90	NC_010263	TGT	2	6	6211	6216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932555
91	NC_010263	GAT	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932555
92	NC_010263	AAC	3	9	6263	6271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932555
93	NC_010263	CAA	2	6	6314	6319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932555
94	NC_010263	TAT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010263	TTC	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010263	CTA	3	9	6468	6476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932556
97	NC_010263	ATT	2	6	6515	6520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932556
98	NC_010263	TTC	2	6	6581	6586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932556
99	NC_010263	ATC	2	6	6732	6737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932556
100	NC_010263	ATT	2	6	6786	6791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932556
101	NC_010263	TAC	2	6	6842	6847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932556
102	NC_010263	ATT	2	6	6848	6853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932556
103	NC_010263	ATT	3	9	6899	6907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932556
104	NC_010263	TCA	2	6	6919	6924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932556
105	NC_010263	CCG	2	6	6927	6932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932556
106	NC_010263	TAT	2	6	6973	6978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932556
107	NC_010263	ATT	2	6	6987	6992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932556
108	NC_010263	TAC	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932556
109	NC_010263	GTA	2	6	7212	7217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932556
110	NC_010263	CTT	2	6	7429	7434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932557
111	NC_010263	TAG	2	6	7441	7446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932557
112	NC_010263	AGC	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932557
113	NC_010263	CTA	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932557
114	NC_010263	TCT	2	6	7693	7698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010263	AAT	2	6	7736	7741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010263	GCT	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010263	GAC	2	6	7830	7835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010263	CAA	3	9	7849	7857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010263	ATA	3	9	7920	7928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932558
120	NC_010263	ATA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932558
121	NC_010263	GCC	2	6	7967	7972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932558
122	NC_010263	ATA	2	6	8130	8135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932558
123	NC_010263	TAG	2	6	8233	8238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932558
124	NC_010263	ATT	2	6	8258	8263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932558
125	NC_010263	ACG	2	6	8364	8369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932558
126	NC_010263	TCG	2	6	8370	8375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932558
127	NC_010263	TGT	2	6	8403	8408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932558
128	NC_010263	CTC	2	6	8437	8442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932558
129	NC_010263	TAT	2	6	8473	8478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932558
130	NC_010263	TAA	2	6	8485	8490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932558
131	NC_010263	CAA	2	6	8554	8559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932558
132	NC_010263	ATT	2	6	8571	8576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932558
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261	NC_010263	CAT	2	6	16618	16623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932572
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