MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010263	ATTG	2	8	159277	159284	25 %	50 %	25 %	0 %	165932726
4002	NC_010263	ATG	2	6	159285	159290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932726
4003	NC_010263	AT	4	8	159293	159300	50 %	50 %	0 %	0 %	165932726
4004	NC_010263	A	7	7	159308	159314	100 %	0 %	0 %	0 %	165932726
4005	NC_010263	TA	3	6	159338	159343	50 %	50 %	0 %	0 %	165932726
4006	NC_010263	TA	4	8	159436	159443	50 %	50 %	0 %	0 %	165932726
4007	NC_010263	GATA	2	8	159446	159453	50 %	25 %	25 %	0 %	165932726
4008	NC_010263	T	6	6	159468	159473	0 %	100 %	0 %	0 %	165932726
4009	NC_010263	ATA	2	6	159507	159512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932726
4010	NC_010263	TAG	2	6	159529	159534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932726
4011	NC_010263	ATTT	2	8	159583	159590	25 %	75 %	0 %	0 %	165932726
4012	NC_010263	CAA	2	6	159597	159602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932726
4013	NC_010263	TGG	2	6	159611	159616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932726
4014	NC_010263	TTA	2	6	159633	159638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932726
4015	NC_010263	GAT	2	6	159832	159837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932727
4016	NC_010263	TTTA	2	8	159900	159907	25 %	75 %	0 %	0 %	165932727
4017	NC_010263	ACTT	2	8	159996	160003	25 %	50 %	0 %	25 %	165932727
4018	NC_010263	A	6	6	160005	160010	100 %	0 %	0 %	0 %	165932727
4019	NC_010263	TA	3	6	160012	160017	50 %	50 %	0 %	0 %	165932727
4020	NC_010263	GAA	2	6	160033	160038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932727
4021	NC_010263	GGCG	2	8	160045	160052	0 %	0 %	75 %	25 %	165932727
4022	NC_010263	TAA	2	6	160062	160067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932727
4023	NC_010263	TA	3	6	160101	160106	50 %	50 %	0 %	0 %	165932727
4024	NC_010263	AAC	2	6	160125	160130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932727
4025	NC_010263	ATC	2	6	160232	160237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932727
4026	NC_010263	ACCT	2	8	160238	160245	25 %	25 %	0 %	50 %	165932727
4027	NC_010263	AT	3	6	160246	160251	50 %	50 %	0 %	0 %	165932727
4028	NC_010263	GTAAAA	2	12	160303	160314	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	165932727
4029	NC_010263	AACA	2	8	160322	160329	75 %	0 %	0 %	25 %	165932727
4030	NC_010263	AAG	2	6	160349	160354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932727
4031	NC_010263	GCA	2	6	160366	160371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932727
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4033	NC_010263	GCC	2	6	160463	160468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932728
4034	NC_010263	GAAGT	2	10	160517	160526	40 %	20 %	40 %	0 %	165932728
4035	NC_010263	TTA	2	6	160598	160603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932728
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4037	NC_010263	ACT	2	6	160652	160657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932728
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4039	NC_010263	TAT	2	6	160675	160680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932728
4040	NC_010263	ATT	2	6	160808	160813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932728
4041	NC_010263	TGA	2	6	160831	160836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932728
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4043	NC_010263	ATT	2	6	160877	160882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932728
4044	NC_010263	T	6	6	160942	160947	0 %	100 %	0 %	0 %	165932728
4045	NC_010263	GCTT	2	8	160968	160975	0 %	50 %	25 %	25 %	165932728
4046	NC_010263	AT	3	6	161023	161028	50 %	50 %	0 %	0 %	165932728
4047	NC_010263	GAC	2	6	161069	161074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932728
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4050	NC_010263	AGAA	2	8	161142	161149	75 %	0 %	25 %	0 %	165932728
4051	NC_010263	TAG	2	6	161226	161231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932728
4052	NC_010263	AG	4	8	161237	161244	50 %	0 %	50 %	0 %	165932728
4053	NC_010263	T	6	6	161324	161329	0 %	100 %	0 %	0 %	165932728
4054	NC_010263	ATTT	2	8	161343	161350	25 %	75 %	0 %	0 %	165932728
4055	NC_010263	AAT	2	6	161381	161386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932728
4056	NC_010263	TTG	2	6	161444	161449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_010263	ATA	2	6	161500	161505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_010263	AAT	2	6	161527	161532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_010263	ATA	2	6	161537	161542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932729
4060	NC_010263	AGT	2	6	161581	161586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932729
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4062	NC_010263	ATGCA	2	10	161649	161658	40 %	20 %	20 %	20 %	165932729
4063	NC_010263	TTA	2	6	161673	161678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932729
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4067	NC_010263	TGA	2	6	161950	161955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932729
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4072	NC_010263	AGCA	2	8	162136	162143	50 %	0 %	25 %	25 %	165932730
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4091	NC_010263	TCA	2	6	162755	162760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932731
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4099	NC_010263	T	8	8	163076	163083	0 %	100 %	0 %	0 %	165932732
4100	NC_010263	AT	3	6	163090	163095	50 %	50 %	0 %	0 %	165932732
4101	NC_010263	CAATAT	2	12	163181	163192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	165932732
4102	NC_010263	TTA	2	6	163271	163276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_010263	AT	4	8	163281	163288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_010263	TAA	2	6	163336	163341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932733
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4107	NC_010263	CTA	2	6	163435	163440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932733
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4109	NC_010263	TGG	2	6	163481	163486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932733
4110	NC_010263	AT	3	6	163492	163497	50 %	50 %	0 %	0 %	165932733
4111	NC_010263	GCT	2	6	163518	163523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932733
4112	NC_010263	ATTGAG	2	12	163533	163544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932733
4113	NC_010263	TA	3	6	163559	163564	50 %	50 %	0 %	0 %	165932733
4114	NC_010263	TA	3	6	163586	163591	50 %	50 %	0 %	0 %	165932733
4115	NC_010263	TTCG	2	8	163610	163617	0 %	50 %	25 %	25 %	165932733
4116	NC_010263	TAA	2	6	163620	163625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932733
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4118	NC_010263	ATT	2	6	163646	163651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932733
4119	NC_010263	TAA	2	6	163654	163659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932733
4120	NC_010263	TG	3	6	163672	163677	0 %	50 %	50 %	0 %	165932733
4121	NC_010263	CTA	2	6	163686	163691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932733
4122	NC_010263	TAA	2	6	163696	163701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932733
4123	NC_010263	A	7	7	163700	163706	100 %	0 %	0 %	0 %	165932733
4124	NC_010263	T	6	6	163711	163716	0 %	100 %	0 %	0 %	165932733
4125	NC_010263	TA	3	6	163723	163728	50 %	50 %	0 %	0 %	165932733
4126	NC_010263	TAA	2	6	163736	163741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932733
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4499	NC_010263	CCT	2	6	178373	178378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932748
4500	NC_010263	GCA	2	6	178415	178420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932748

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